Pistacia vera (pistachio): 116109142
Help
Entry
116109142 CDS
T07386
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
pvy
Pistacia vera (pistachio)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116109142
NCBI-ProteinID:
XP_031251230
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MMPDISVRSSMFKSPDYVEDLGKLIREQKQQQQQQQQQTSVNTATSATDLEKELNIYRSG
SAPPTVEGSLSSIGGLFKQLGNNKGGFSSEEELRADPSYVNYYYSNVNLNPRLPPPLLSK
EDWRFTQRLRGGGEVGGIGDRRKGNGSLFAVQPGFGGSDEENGGAGGGGGGEWGGDGLIG
LPGLGLGSRQKSIAEIIQQDDINHAAPVSRHPSRPASRNAFEDGVETSETQFAHLHHDLA
TIDALRSGANKQGLPAVQNVGASASHSYASALGASLSRSTTPDPQLVARAPSPRIPPVGE
GRGSMDKRNVGVQNSLNGVSSSLNESVELAAVLSGLNLSTDDMVDQENHSRSQNQHEIDD
RHSLFNLQSDANHMTQNSYLNKSEPGHFQLHSASHSTKGSYSNMGKSSGLGIGMNNNSFM
ADVHKPALSSANSYLKGPSIPTLNGGGSSPSQPQMVGNMNSAFSNFSLNGFAMNPSSPPM
MGSPMGSGALPPLFESAAAASAMGANGLDSRSLGTNLGLGPNIMAAAAELQNINRLGNHT
SGNALQMPLMDPLYVQYLRSNEYAAAQVAALNDPAMDVNNSYMDLLGLQKAYLGALLSPQ
KSQYGVPYLGKSGSLNHNFYGNPAFGLGLQYPGSPLLPNSPVGSGSPVRHGERNMRFSSG
MRNLSGGVMGPWHSEGGGGLDESFASSLLDEFKSNKAKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSR
FIQQKLETATADEKNMVFHEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFFEHGTAAQIRELADQLTGH
VLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTQMVTELDGQIMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPED
SIQFIVSTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDAKTQSIMMDEILASVCMLAQDQYGN
YVVQHVLEHGKPHERSAIIKKLTGQIVQMSQQKFASNVIEKCLTFGTPAERQTLVNEMLG
SIDENEPLQVMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARV
EKLVAAGERRISIMTPHPA
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgccagatatttcagtacgatcatccatgtttaagagccctgattacgttgaagat
ttaggcaagctgattcgtgaacaaaagcagcagcagcagcaacaacaacaacaaacatca
gtcaatactgcaactagtgcgactgatcttgagaaagaactcaatatttatcgaagtggg
tcagccccaccaactgttgaaggttctttaagctcaataggtggtttgttcaagcaactt
gggaacaacaaaggtggcttctcgagtgaggaggagttgagggctgatccatcgtatgta
aattattattactctaatgtcaacttgaatccaaggttgcctccacctttgttgtccaag
gaggattggaggtttacacaaaggctgagaggaggtggagaagtgggagggattggtgat
aggaggaagggaaatgggtcgctttttgcggtgcagccggggtttggagggagcgatgag
gagaatggtggagctggtggtggcggtggaggagagtggggaggagatgggttgattggg
ttgcctgggttggggttgggaagtaggcagaagagcattgcagagatcattcagcaggat
gatataaatcatgcagcccctgtctcaaggcatccttctcgtcctgcgagccgcaatgca
tttgaggatggtgttgagacttctgaaacccagtttgctcatctgcatcatgatttggca
accattgatgctttgcgttctggtgcaaataagcagggtctgcctgctgtacaaaatgtt
ggtgcatcagcttctcattcttatgcatctgctttaggtgcttccttgtcgagaagcacc
acacctgatccacaacttgtagctagggctcccagtcctcgcattccaccagttggagaa
gggaggggtagcatggataaaagaaatgtcggcgttcaaaactcattaaatggtgtttct
tcaagtttgaatgagtctgtggagctagcagctgttttgtctggcctgaatctgtcaacg
gatgatatggtagatcaagagaatcattcacggtcacaaaatcaacatgaaattgatgat
cgccatagtctcttcaatttgcaaagtgatgcaaaccacatgacacaaaattcatactta
aataagtcggaacctgggcattttcaactgcattccgcttcccactctactaagggatct
tattcaaatatgggtaaaagcagtgggcttgggattggtatgaacaacaattctttcatg
gctgatgtgcataagcctgctttgtcatctgccaactcatacctaaaaggaccctccatt
ccaactctaaatggtggaggaagttcaccttctcaacctcaaatggttggcaacatgaat
tctgcattttcgaactttagtttaaatgggtttgcaatgaatccttcatcgccacccatg
atgggaagcccgatgggaagtggtgctttgccaccgttatttgaaagtgctgctgccgcc
tctgcaatgggagcaaatggtctggactctagatcattggggacaaatttgggtttagga
ccaaatataatggcagcagcagcagaattgcagaacattaatagactggggaatcacact
tctggaaatgctcttcagatgcctctgatggacccattgtatgttcagtacttgagatca
aacgaatatgctgcagcacaggttgcagctctcaatgaccccgcaatggacgttaataat
tcatatatggatttgcttggactccagaaagcttacctaggagcactgctgtcacctcaa
aaatctcagtatggtgtaccctatcttggtaaatccggtagcttgaatcataatttctat
ggcaatcctgcatttggtcttggccttcagtatcctgggagtccccttcttccaaattct
cctgttggatcgggtagtcctgtcaggcatggggagcgtaatatgcgcttttcttctggg
atgaggaatctatctgggggtgtcatgggaccttggcactcagaaggtggtgggggcttg
gatgaaagttttgcatcctctttattggatgagtttaaaagcaacaaagctaaatgcttt
gaactgtcagaaattgctggtcatgttgttgagttcagtgcggatcagtatggaagtcgg
tttattcaacagaagcttgaaactgccacagcagatgagaaaaatatggttttccatgag
atcatgccccaagcactatcattaatgactgatgtgtttggtaattatgtgattcaaaag
ttttttgagcatggaactgctgctcaaataagagaacttgctgaccaattaactgggcat
gtgctgactcttagtctccagatgtatggttgtcgagtgatccagaaggcaatagaagtc
gttgaattggaccagcagactcaaatggtgacagagcttgatggtcaaatcatgcgttgt
gttcgtgatcagaatgggaaccacgtcatccagaaatgtattgaatgtgtacctgaagat
tctatccagttcattgtttcaacattttatgaccaagttgtgacactgtctactcatcct
tatggttgtcgtgtcatacagagagtcctggagcattgccatgatgcaaaaacccaaagt
ataatgatggatgagattctggcgtcagtttgcatgttggcacaagatcaatatgggaat
tatgttgtacagcatgtactggagcatggaaaaccccacgagcgctcagcaataattaaa
aaattaactgggcagattgttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgttatagag
aagtgtttaacttttggaactcctgcagaacgccagaccctggtgaatgagatgctcggt
tcaattgatgaaaatgaacctcttcaggtgatgatgaaagatcagtttgcaaactatgtt
gtacagaaggtgctggaaacttgtgatgaccagcaacttgaacttattctcaaccgaata
aaggttcacttgaatgctttgaagaaatatacttatgggaagcatatagttgcacgtgta
gagaaacttgttgcagccggggaaaggagaattagcattatgactccacatcctgcgtag
DBGET
integrated database retrieval system
