Pleurodeles waltl (Iberian ribbed newt): 138286823
Help
Entry
138286823 CDS
T10800
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pwl Pleurodeles waltl (Iberian ribbed newt)
Pathway
pwl04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pwl00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
138286823 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pwl00536
]
138286823 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pwl00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
138286823 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
138286823
NCBI-ProteinID:
XP_069083390
LinkDB
All DBs
Position
1_1:complement(712161265..713167366)
Genome browser
AA seq
2895 aa
AA seq
DB search
MPPRVPGLSPPRLLMLLGCALLGVAGQQPPFPVEERSSVLEAQDGGAAASRVRRRGQQDA
LRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSNGQISPVCG
IKSIQQCNIRCMNGGTCMEDQCQCQKGYVGTHCGQPVCDNGCQNGGRCIGPNRCACVYGF
TGPQCERDYRTGPCFTQVSHQMCQGQVTGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPQPCR
RGFIPNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTDGSFECRCPTGHKQNEATQKCEDIDEC
SIIPGICEGGECSNTVGSYFCKCPRGYVTSIDGSHCIDQRAGTCFSNLVNGHCAQELAGR
FTKMQCCCESGRCFALASIPEMCPIRGSDEYRRLCIDGAPVGGVRPGGTGGNGFGPGLNG
NGYIPGGNGFIPIPGGNGFIPVPGGNGFYPGIGGTGIGGQGTNGNGPINGGVATLNQTID
ICKQYPNLCLNGRCIPIINSYRCECNMGYKQDTEGECKDVDECASNPCTNGDCVNSPGSY
YCKCHSGFQRTPTKQACIDIDECIQNGILCKHGRCVNTEGSFQCICNAGFELTTDGKNCI
DHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFLLASNGRYCTDIDECHTPGICMNGQCINT
EGSFRCDCPPGLAIGVDGRVCVDTHMRSSCYGGIKKGVCIRPFPGAVTKSECCCASPDYG
FGEPCLPCPSRNSAEFQSLCSGGIGITVDGRDINECALDPDICANGICENLRGSYRCYCN
SGYESDTTGRNCIDIDECMVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYLFRTDTDTCEDINEC
ESNPCINGACRNNLGSFSCECSLGSKLDSTKLICIDSLKGTCWLNIQDDRCEVNINGATL
KSECCATLGAAWGSPCERCELDAACPRGFARVKGVTCEDVNECEVFPGVCPNGRCINTKG
SFHCECPVGLTLDASSRICIDIRMETCYYQWDEDECIHAVPGRFRMDACCCAVGAAWGSD
CEECPRPGDKEYEILCPRGPGFSNRGDVLTGRPFYKDINECKVFPGICTYGKCRNTIGSF
KCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNC
MDIDECERNPLLCRGGECVNTEGSFQCECPPGHELSTSGDACIDINECSLSDNLCRNGKC
VNMIGTYQCSCNSGYQATPDRQGCVDIDECSIMNGGCDNECSNSEGSYECSCIDGYALMP
DMRTCSDIDECEDSPEICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASFDMKTCIDVNECDLNPNIC
MFGECENTKGSFICHCQTGYSVKKGTTGCTDVDECEIDAHNCNAHASCFNIPGSFKCSCR
EGWVGNGIKCVDLDECANGTHQCSLNALCLNTPGSYRCACSDGFIGDGFACSDVDECAEN
INLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPAPDSRSCQDIDECSFQNICVFGTCKNLPGMFRCI
CDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCINTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDTNI
GNCYLNYGPRGDGGLSCSTEIGVGVSRSSCCCSQGKAWGNPCEICPAINSSQYNTLCPGG
EGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPTGYYLSETTRICEDIDEC
FSQPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSYCYKTHNGTSCDNDLPFN
VTKRMCCCTYNVGKAWGKPCEACPKPGTANFKNLCGTTIGFTFDIHTGKPVDIDECREIP
GICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLICEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRC
ECSSGFKLSPNGACIDRNECQEIPNVCSHGVCVDTQGSYQCICHNGFKVSQDQTMCMDVD
ECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELSHNNDCMDVDECSSFSQLCRNGHCFNEIGSF
ICLCDEGYELTVDGKNCIDVNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVEGDNCIDI
DECHEDPNICLFGSCTNVPGSFHCDCPSGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGKCSIPK
ALNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEGEVAFQDLCPYGHGTIPGMGDSREDVNECLE
SPGICANGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTGVNCVDTDECSIGEPCGNGTCTNVIGAFEC
NCYEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGAYECTCPAGYVLREDGKMCKDLDE
CSEGLHDCDSRGMLCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCMDENECRTKPGICENGRCINV
IGSYKCDCNEGFQSTPLGTECIDNRQAFCFSEVLQGMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRG
WGNQCEMCPLPGTTQYKKICPHGPGYNTDGKDIDECKVMPNLCRNGQCINTMGSYRCFCK
SGYTTDISGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNTDGSYKCACPRGYILQEDGKTCRDLDECQ
TKQHNCQFLCANTVGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGAKGICQNSPGSFSC
ECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNMLGGYRCSCPQGYIQHYQWNQCVDENE
CTNPNACGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSGCHDVNECSSSKNPCNYGCSNTEGGY
LCGCPPGYYRAGQGHCVSGLGFNRGQYLPHEEEDEDEENSLSPEGCYECTVNGYSKKDGR
KKRSLNETIDIMEPISLASLDTDVPLLMKLNVSMLNNKEHILQIMPAIEPLSNHVRYAIS
SGNEDKFFRIHQKGGLSFLHTAKRRTLPGSYKLELISVPIYKKKELEKLEEKHDDNYLLG
ELGEALRMRLHLELF
NT seq
8688 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccccctcgggtacctggcctctcgcctcccaggctgctgatgctgctggggtgcgcg
ctgctgggtgtcgccggacagcagcccccgttccccgtagaggagaggtcaagcgtcctg
gaggcacaggatgggggagccgccgccagccgggtccggagaagggggcaacaagacgca
ctcagggggccaaatgtgtgcggttctcgattccactcgtactgttgtccaggatggaaa
actcttcccgggggaaaccagtgcattgtcccaatttgcagaaatagttgtggcgacgga
ttctgttcacgacctaacatgtgtacttgctccaatggacaaatttcacccgtctgtgga
ataaaatcgatacaacaatgcaacatccgatgcatgaatggtgggacttgcatggaagat
caatgtcagtgtcagaaaggctacgtgggaacacactgtggacaacctgtctgtgataat
ggctgccagaatggtgggcgttgcattggacccaaccgatgtgcttgtgtatatggattc
actggtccacagtgtgaaagggattacagaaccggcccctgttttacccaggtcagccac
cagatgtgccagggacaggttactgggattgtatgtacgaaaaccctttgctgtgcaacc
attggccgtgcttggggtcatccctgtgaaatgtgtcctgctcagcctcagccttgtcgt
cgtggatttatcccgaacattcgaagtggtgcttgccaagatgttgatgaatgccaggca
ataccagggctttgccaaggaggaaactgcattaacacagatgggtccttcgagtgcagg
tgtccgactggccataagcaaaacgaagcaacccaaaaatgtgaagacatcgatgagtgc
tccatcattcctggcatctgtgaaggaggcgaatgctcaaacacagtcgggagctacttc
tgcaagtgtcctcgtggctatgtaacctccatagatggctcgcactgcatagatcaaagg
gcaggaacatgcttctccaatctagtcaatggccactgtgctcaagaacttgctggaagg
tttacaaaaatgcagtgctgctgtgagtctggtcgttgctttgcccttgcatccattcct
gagatgtgcccaatacgaggctcagatgaataccgccggctctgtattgacggtgctcca
gtggggggtgtcagacccggtggaacaggggggaatggatttggtccaggtttaaatgga
aatgggtacatcccaggtgggaatggatttatccctattcctggtggcaatggattcatt
cctgtccctggtggtaatggcttttaccctggcataggaggaacagggattggagggcaa
ggaactaacgggaatggaccaatcaatggaggtgttgctacacttaatcaaacaattgac
atctgcaagcaatatcctaatctttgtctcaatggccgctgcatacctattatcaacagt
taccgctgtgagtgcaacatgggctacaagcaagacacagagggagaatgtaaagatgtt
gatgagtgcgcctccaacccgtgcaccaatggagactgcgttaattcacctggttcctat
tattgcaaatgccattctgggttccaaaggactccaaccaaacaagcttgcattgatatt
gatgagtgcattcagaatggaattctttgcaaacatggccgctgtgtgaacacagaaggc
agtttccagtgtatctgtaatgcaggttttgaactaactactgatggaaaaaattgcatt
gatcatgatgaatgtgctactaccaacatgtgtcttaatggaatgtgcataaatgaagat
ggcagcttcaagtgcatctgcaaaccagggtttttacttgcatcaaatgggcgttactgt
actgatattgatgaatgccacactccagggatctgcatgaatggacagtgcataaacaca
gaaggatcatttcgctgtgactgcccaccgggccttgcgattggtgtagacggccgtgtt
tgtgtagacacccacatgcgcagctcttgctatggaggaattaaaaagggggtgtgcatc
cgcccttttcctggggctgtgactaagtccgaatgctgttgcgccagtccggattatggc
tttggagagccgtgcttaccttgtccttccagaaactcagcggaattccagagcctctgc
agtggtggaataggaatcacagttgatggaagagatattaacgaatgtgctctggatcct
gacatttgcgctaatggaatttgtgaaaatctacgtggtagctatcgttgctactgtaat
agtggatatgaatctgataccactgggcgaaactgcatcgatattgatgaatgcatggtg
aatagactcctctgtgacaatggcttgtgtcgtaacacacctggaagttacacttgcacc
tgtccgaaaggttacttattcagaacagacactgacacttgtgaagatataaacgaatgt
gaaagcaacccatgcatcaacggcgcatgtaggaacaacctgggctctttcagctgtgaa
tgctcactgggcagcaaactggactccactaaactcatctgcattgatagtttgaaagga
acgtgctggctgaacatccaggatgatcgctgtgaagtaaacattaatggagcaacgcta
aaatctgaatgctgtgcgactctgggtgctgcctggggaagtccctgtgagcgatgtgaa
ctggatgcagcctgccctaggggctttgccagggttaaaggtgttacttgtgaagatgtg
aatgagtgtgaggtcttcccaggagtttgccccaatggacgctgcatcaacaccaaggga
tcatttcactgcgagtgtcctgttggactgaccttagatgcctcaagccgcatatgcatt
gatatccgcatggagacatgctactatcagtgggatgaagatgagtgtattcacgctgtg
cctgggaggttccgcatggacgcctgctgctgcgcggttggggctgcctggggctcagac
tgtgaggaatgtccaaggcctggtgacaaagaatatgaaatcctgtgtcctcggggtcct
ggcttttccaacagaggggacgttcttactggtcgccccttctataaagatatcaatgaa
tgtaaagtgttccctggtatctgcacctatggcaaatgcaggaataccattggaagcttc
aagtgccggtgcaacagcggtttcgcattggatatggaagaaaggaactgtacagatatt
gacgaatgccgtatttcacccgacctctgcggaagtggtacatgtgtaaataccccaggc
agctttgaatgcgagtgctttgagggttacgagagcggcttcatgatgatgaagaactgt
atggatattgatgagtgtgaacggaacccattgctctgcaggggtggagaatgtgtgaac
acagaaggaagctttcagtgcgagtgcccaccgggacatgaactgtcaacttcaggcgat
gcttgcatcgatatcaatgaatgctccttaagtgataatctctgccggaatggaaagtgc
gttaacatgattggaacctatcagtgttcctgtaactcggggtaccaggccactcccgat
agacagggttgcgttgatattgatgagtgcagcataatgaatggaggctgtgacaatgaa
tgctccaactctgaaggcagctatgaatgtagctgcatcgatggatatgcgctgatgcca
gacatgaggacatgctcagatattgatgaatgcgaggacagtcctgaaatctgtgatggc
ggtcaatgcaccaacattcctggggaatatcgctgtctttgctacgatggatttatggct
tcctttgacatgaaaacatgcattgatgtgaacgagtgtgacttgaacccgaatatctgc
atgtttggagagtgcgaaaacaccaaaggatccttcatctgccactgccagaccggatat
tctgtcaaaaaggggaccacgggatgcacagacgtggacgagtgcgagattgatgcccac
aactgcaatgcgcatgcctcttgctttaatatcccaggaagcttcaaatgcagctgcaga
gaaggctgggttggcaatggcatcaaatgcgttgatcttgatgaatgcgctaatgggaca
caccagtgcagtctgaacgccctttgtttgaacacacctggatcctaccgctgtgcctgc
tctgacggcttcatcggcgatggatttgcctgctcagatgtcgacgaatgcgcagaaaac
attaatctctgtgaaaacggacagtgcttgaatgttcctggtgcttatcgctgcgagtgc
gagatgggcttcacccccgctccagacagcaggtcttgccaagatattgatgagtgctcc
ttccaaaatatttgtgtattcggtacatgcaaaaatttgccaggcatgtttcgttgtatc
tgtgatgacggctatgaactggatagaactggaggaaactgtacagatattgatgagtgt
gctgatcccattaattgtgttaatggcctgtgtatcaacactcctgggagatatgaatgt
aactgcccaccggacttccagctgaacccaactggtgttggatgtgttgataccaacatt
ggcaactgctatttgaactatggcccacgtggggatggcggtctgtcctgcagcaccgag
attggcgtcggagtcagccgttcttcctgctgctgctctcagggaaaagcctggggaaat
ccctgtgagatctgcccagccatcaatagctctcaatataacaccctttgtcctggaggt
gaaggatttcgaccaaatcctattacgatcatcttagaagacattgatgaatgccaggag
cttccaggactctgccaaggtggaaactgcatcaatacgttcggcagcttccaatgtgaa
tgtccaacaggctactacctcagtgaaacaacacgcatttgtgaagatattgacgagtgt
ttttcacagccgggtgtatgtggccctggaacatgctacaatacattggggaattacact
tgcatctgtcctcctgaatacatgcaggtcaacggtggacacaactgcatggatatgaga
aagagctattgctacaaaacccataacggaacaagctgtgacaacgaccttcccttcaat
gtgacaaagcggatgtgttgctgcacctacaacgttggcaaagcctggggaaaaccttgt
gaggcatgccccaagccgggcacggctaattttaagaatctttgtggaactaccatcggc
ttcacctttgacatccacactggcaaaccggttgatattgatgaatgcagggagattcca
ggaatatgtgcaaatggcgtttgcattaaccagattggcagcttccgctgcgagtgccca
acaggattcagctacaacgaccttctgctcatttgtgaagacatcgatgagtgcagcaat
ggtgacaatctgtgtcagcgaaatgcagactgcatcaacagtcctgggagttaccgctgt
gaatgttcttcaggcttcaagctctcacccaatggcgcctgtatagatcgcaacgagtgt
caagaaattcctaatgtctgcagtcacggggtttgcgtagatacacaaggaagctaccaa
tgtatatgtcacaatggtttcaaagtatcccaagaccagactatgtgcatggatgtcgat
gaatgcgatcgtcaaccatgtggaaatgggacttgtaaaaacaccgtgggatcgtataac
tgtctctgttacccaggattcgaactttctcataataatgactgcatggatgttgacgag
tgcagctccttcagccagctgtgcagaaacggacattgcttcaatgaaataggctctttc
atctgcctatgtgatgaaggctatgagctcacagtagatggcaaaaactgtatagatgtc
aatgagtgtgtggcacttcctggctcctgttcccctggcacttgccagaacctggaaggc
tcattcaggtgcatctgtccaccaggatacgaggtggagggtgataactgcattgacatt
gatgaatgccacgaagaccccaacatctgcctctttggctcttgcaccaatgttccagga
agcttccactgtgattgcccatcaggttttgttctgtcagacaacggacgaaggtgcttt
gatacacgccagagtttctgtttcaccaattttgaaaatggaaagtgttcgatacccaag
gcacttaacacaaccaaggcaaagtgctgctgcagtaaaatgcctggtgaaggatgggga
gatccctgtgaactgtgcccaaaagagggagaagttgctttccaggatttatgcccatat
ggtcatggaactattcctggtatgggtgattcacgtgaagatgttaatgaatgtcttgag
agtccaggtatatgtgcaaacgggcactgtataaacactgatggttcattccgatgcgag
tgccccatgggatacaaccttgattttactggagtcaactgtgtggatactgatgagtgt
tccattggtgagccatgtggaaatggcacatgcacaaatgtcattggtgcattcgaatgt
aactgctatgaaggctttgaaccaggtcctatgatgaactgtgaagatatcaatgagtgt
gctcagaaccccttgctttgtgcatttcggtgtattaacacttatggtgcttatgaatgc
acatgtcctgctggatatgtactgagagaggacggaaaaatgtgcaaagaccttgacgaa
tgctcagaggggcttcatgactgtgattcaagggggatgctctgcaagaatctcataggt
acattcatgtgcatatgcccacctggaatgactcgcaggcctgatggagaaggatgcatg
gatgagaatgaatgtcgcaccaagccaggcatttgcgaaaatggtcgctgtatcaatgtg
attggaagctacaaatgtgactgcaatgaaggatttcagtcaacccctttgggcactgag
tgtatagacaaccgccaagccttttgcttttcggaggtgttacagggaatgtgtcagatg
gcatccagcagccgtaaccttgtcaccaaatcagagtgttgctgtgatggcgggcgaggc
tggggtaaccaatgtgaaatgtgcccactccctggaactactcaatacaagaaaatctgc
ccacatggcccagggtacaacacggacggaaaagatattgatgaatgtaaagtaatgcca
aacttgtgtcgaaatggccagtgtattaataccatgggctcctacagatgtttctgcaag
tctggatacaccactgacataagtgggacatcttgtattgacttggatgaatgttcccag
tctccaaaaccatgtaactttatctgcaagaacaccgacggcagttacaagtgcgcatgc
ccacgaggctacatcctccaggaagatggaaaaacatgtagagatctcgatgaatgtcag
accaaacagcacaactgccagtttctctgtgccaacacagttgggggcttcacatgcaaa
tgtccgccaggattcacacagcaccatactgcctgcattgataataacgagtgtggctca
caaccatcactttgtggagcgaaaggaatctgtcagaacagtcctgggagcttcagctgt
gaatgtcaaagaggattttccttggacagcaccggcttgaactgcgaggatgtggatgaa
tgtgatgggaaccataggtgtcaacacggctgtcagaacatgctcggcggatacaggtgc
agctgcccacagggatacattcagcattatcaatggaaccagtgtgttgatgagaatgaa
tgcaccaaccctaatgcctgtggttcggcctcgtgctataacaccctcgggagctacaaa
tgtgcatgcccatctggcttttcctatgaccagttctccagtggatgtcatgatgtgaat
gagtgctcttcctccaagaatccttgcaactatggctgctccaacacagaaggaggttac
ctctgtggttgcccacctggctactatagagctggacaagggcactgtgtctcaggtttg
ggatttaatagaggccagtacttaccacatgaggaagaggatgaagacgaagagaattct
ctgtccccagaaggctgctatgagtgcacagtaaacgggtactccaagaaggatgggagg
aaaaagagaagcttaaatgaaacaatagacatcatggagcccatcagtttggctagcttg
gatactgatgtcccactcctgatgaagctcaacgtttccatgcttaataacaaggagcat
atcttacagatcatgccagccatagaacctctcagcaaccatgtgcgttacgccatctcc
agtggcaacgaagacaagtttttccgcatccatcagaaaggtggtctcagtttcctgcac
acagctaagagaaggactttgcctggcagttacaaattggagcttatcagcgttcccata
tacaagaagaaagagctagagaaactggaagaaaagcatgatgataactacctcttaggg
gagctgggggaagctctgagaatgaggttgcacttggagctcttctga
DBGET
integrated database retrieval system
