Pleurodeles waltl (Iberian ribbed newt): 138296666
Help
Entry
138296666 CDS
T10800
Symbol
TDRD15
Name
(RefSeq) tudor domain-containing protein 15
KO
K18405
tudor domain-containing protein 1/4/6/7
Organism
pwl Pleurodeles waltl (Iberian ribbed newt)
Brite
Chromosome and associated proteins [BR:
pwl03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
piRNA pathway
138296666 (TDRD15)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TUDOR
DUF4537
SGF29_Tudor
Dis3l2_C_term
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
138296666
NCBI-ProteinID:
XP_069092108
LinkDB
All DBs
Position
5:1674278610..1674497869
Genome browser
AA seq
2033 aa
AA seq
DB search
MDSIPLLPQFPLDMDLKISVIECKPKEVLVEFQGQYNAEFEFDYHILQKELQNVPKVKDN
VVIGDFCLVEDKNSMEWHRGRIVEKKGEMYEVFLIDTGSVLKADITHIASACGEIFQLPP
KIVCGIFSNILPPEEKWSSKAINYFSSLLGIHLKGHVQAILPSQVVLLEVPKVIDDLVKL
SLAQYVDRDTFILIVEILKDFPIGSIQKQIPDLLQQKHIQADYIETIPTFQQIVDHLRPC
LSVDTTEKVKITAAVSPLQFHCRISPWIQELEHLTSAMFLHYEAISKEAVCDHFGLLCAA
KRKDGQWHRGVIQQLLSDDKLKVWFMDFGYSEAVPSKSVHKLEPEFRLLPMMSFPCALSC
LSLQNENHRIFQIGEFKRALLGQTILVHVDKYCKEEHLYHVTLHNKNLLIPSPGQHENKL
PRLRSPKSPYKIFSNEEAKKICHEKPSEVEVIAPQEIERDLNKNELDLQVGYPRMNMKID
SVYIAYVQYVLNPSNFWVRIDDQEAAYLKMVKNIGEKYAMCEDCDMLLENPQPGMLCCAR
YSKDMNFYRAVISEVHDMEITVYFLDFGNTETVPDGHVKKLFTEFHDFPAVAMCCTLAHA
FSLEEVWVKSATDFFKNAVFGKPLLVHVLGKQTEKYVVDLHLTNTSEEPNVVTLMVQAGY
AEYWESTPDCSPLPKAGSMPVSDLKGVKLTKNTSIQIGQMSTKTKQQSVLLKEIGVSEKT
FSTPSSSGNIFSKKMITLRDKELTCHYDQHVFKPGSVIEVICSNMCSPGGFWCQLQAQSE
ALVSLMTQIQIHYSVQGEPYEVGKMACVAKRLVDGKWYRASVIQQISTKEVDVIFIDYGF
QERVKVEDLKSITPDFLILEGQAFRCSLYNLVEPLNADPVNWTKEACAGFRCFLDSASSG
SLKCTVYSLMLVRPNILCNVVDLETPSHSAKQFLIDKGYAHLFDYSKPLSPSISPFTFMY
SSFNIKIGSEEEMYITHIYSPTKFYCQLVRNSETIDALMSRVAQIGNSVVPSRDSSLRLC
IAKYFEDGNFYRAIACPMQSSSHLMVYFVDFGNKQVVERQEVVPIPEEATDLIFTPMQAL
KCYLSGLTDTLPPVEVVKWFEENCLGKILKAVIISREMDGRLSLELYDGCLKINKKVKEL
MKMHLAYCAEVQEKANSNVITKIKHGSHIPGYVGMDCESEGSKNTDTFQNKDEIKSEGSQ
YTSNLLSLSTGTDSFNGSFNKTPDSHSSDFRTQFVSTTSMVTSRKFGKSQQECRNSLQPQ
YTNLPKPNIKSNSEVLGYVSHVNSPSNFYIHLAEDEHFIVQIAEELNSQSLSLIHSKEET
FKAGDLVMAEYEKDSALYRAVVKQVKSGEMFDVEFIDYGNSSVLCRSKLYNLPVKFLTTP
RLAHPAFLTGIRFAKPDGAAFMANVPNNFKELLISSEPVRFNFVQEYEHGWEVNINCDMT
VGEKFLPFQEVLVPENILLSKTKEQSLSMSVLKQSPKVNTATLPDVCDKANIQVLGVEQA
NVCYIPNQAVPSGQLEKVKLSSISDCGTFYVTLLARENQSTHLSGLIDNAANLTENSLPV
GSIKDGIMCLTKSEKSLKWFRAEVKEIFSEEKMMLVVFVDNGRTEKVPMSNAKKLNGNLK
SIPKQTVACKWVWLKKTERRFFKSIMNSLTSQVLKILFLRYLKAISTWEVEILVGDVLLM
QYSGVAPCPTVKNEPLNLEDSPSVPVQSVHSIPWITRSSGKSYLGFACAATDPFNFFVQL
EDSFDIMTELCVLLYDLPDNLPTLPLEQVTPGSHCLMKCDLKEQWCRAEVSDVSADFVLL
TFIDFGCSFQVPPKDMDKLRMIPENISCLPRLAYPCTLSEVVPVNLEKWTEKAIHYFQNY
LNEKELQIQFKNYQHGLTLDVDISHERSNLADDLIAAGHAVRSKRKTPDFDAPLSTKPSG
NSRKPFKMTWAKNNALRLSDIKPGTSKTTFSENSRLDNLKHSSTALNVVNLRDESNTYNS
KKDGKRVNCPQQSNKERIQDPAQASTSTLRGLSAASKVITRTNRTQKASGEVW
NT seq
6102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattccatacctctgctgccacaatttccattagatatggaccttaagatatctgta
attgagtgcaaaccaaaggaggtgttagttgaatttcagggccaatacaatgctgaattt
gaatttgactaccacatattacagaaagagctacagaatgttcccaaggtaaaagacaat
gttgtgattggcgacttttgcttagtggaagataaaaattctatggaatggcacagagga
agaattgtggaaaaaaaaggagaaatgtatgaggttttcctcatagatactggaagtgtt
ttgaaagctgatattacccacattgcatctgcgtgtggtgaaattttccagctgcctcca
aaaatagtttgtggtattttttccaacatacttccaccggaggaaaaatggagctcaaag
gctataaattatttttcatcactcctaggaatacacttgaaaggccatgtccaagctatt
ttacccagtcaagttgtcctccttgaagtaccaaaagtcattgatgatttagtcaaattg
agtttagcacagtatgttgatagagatacatttattcttattgtagagatattgaaggac
tttccaattgggtccatccaaaagcaaataccagatttacttcaacagaaacacattcaa
gcagattacatagagactattccaacctttcaacaaattgtggatcatttgcgaccttgt
ctctctgtagacacgacagagaaagtcaagataactgctgctgttagcccacttcaattt
cactgccgaatttcaccttggattcaagagctagaacatttaacatcagctatgttctta
cattatgaagccattagtaaagaagctgtgtgtgaccattttggattgttgtgtgctgcc
aagcggaaagatggacagtggcacagaggagttatacaacagctcctttctgatgataaa
ttgaaagtgtggtttatggactttgggtacagtgaagcagtgccttccaagtctgtccac
aagcttgagccagaatttcgtttacttccaatgatgtcatttccatgtgctttatcttgt
ctatctttgcaaaacgaaaatcacaggattttccaaattggcgaatttaaacgtgcttta
ttagggcaaactattttagtacatgtagacaagtattgtaaggaagaacatttatatcat
gttactttacacaataaaaacctactaattccttctccaggtcagcatgaaaataagttg
ccccgattgcggtcccctaaatctccctataaaatcttctctaatgaggaagcaaaaaaa
atatgtcatgagaaaccttctgaagtggaggttattgctcctcaagaaattgagagagac
ttaaataaaaatgaattggatttacaagtggggtatcccagaatgaacatgaaaatagat
tctgtgtatatagcttatgttcagtatgtactaaatccctctaacttttgggttcgaatt
gatgatcaggaggctgcatatttaaaaatggtcaaaaatattggggaaaagtatgccatg
tgcgaagattgtgacatgcttcttgaaaatccacagcctggcatgctctgttgtgcacga
tatagcaaggacatgaacttttaccgagctgttatatctgaagtgcatgatatggaaatt
acagtttactttttagattttggcaacactgaaaccgtccctgatggtcatgtgaaaaag
ctgtttacagaatttcatgacttcccggcagtggctatgtgctgcacacttgcccatgca
ttctctcttgaagaagtgtgggtaaagagtgcaactgacttctttaaaaatgcagtattt
ggaaaaccactcttggttcacgtacttggaaaacaaactgaaaagtatgttgtagacctc
caccttacaaacacttctgaggaaccaaatgttgttacactgatggttcaggctggatat
gctgagtattgggagtccactccagattgttctcctctgcccaaagcaggaagcatgcct
gtatcagacttaaaaggagtgaaactcacaaagaacacatcaatccaaatcggtcaaatg
agcacaaagactaaacaacaaagtgtattgttaaaagaaattggtgtatcagaaaaaaca
ttttctactccttccagttcaggaaatattttttcgaaaaagatgattactttaagagat
aaagaactcacatgccattatgatcaacatgtttttaaacccggatcggttattgaagtt
atttgttctaacatgtgctcaccaggagggttttggtgccaattacaggctcaatctgag
gcattggtaagcttaatgacgcaaatacaaattcactacagtgttcaaggagagccatat
gaagttggaaagatggcctgtgttgctaagcgtttggtggatggaaagtggtacagagca
tctgtaattcaacaaatctcaacaaaagaagtagatgtaatttttatagattatggtttc
caagaaagagttaaagttgaagacctgaaaagcatcacccctgattttctcattctggaa
ggtcaggcattccgatgcagcctttataatctagtagagcccttaaatgcagatccagtg
aattggactaaagaggcatgtgcaggcttcagatgtttccttgattcagcaagtagtggt
tcactgaagtgcacagtttactccctaatgcttgtgaggcctaacatcctatgcaatgtg
gttgatttagagactccttctcatagtgcaaaacagtttctcatagataaaggctatgct
catttgtttgattattcaaaaccactttcaccttctatttcaccttttacttttatgtac
tcctcatttaacattaaaataggaagtgaagaggaaatgtatataactcacatatacagc
ccaacaaaattttactgtcaacttgttagaaacagtgaaactatagatgctttgatgagt
agggttgcacagattggcaactcagttgttccttctagagacagcagtttaagactctgt
atagcaaagtattttgaagatggtaacttttacagagcaattgcatgcccaatgcaatca
tcgtcacatttaatggtatactttgtagactttggaaacaagcaagtagtagaaagacag
gaagtagtgcctattccagaagaagccacagatttaatattcacacctatgcaagctttg
aagtgttacctctctggtctcacagatactttgcctcctgtagaagtagtgaagtggttt
gaagaaaactgtttggggaagattctgaaggcagttatcatatctagggaaatggatggg
cgactgtctttggaactttatgatggatgtctaaagataaataaaaaagttaaagaactg
atgaagatgcatttggcttattgtgcagaagtgcaagagaaagccaatagtaatgtaatt
actaaaataaaacatggtagtcacattccagggtatgtaggaatggattgtgaaagtgag
gggtccaaaaatacagacacttttcaaaataaagatgaaatcaaaagcgaaggtagtcaa
tatacaagtaatcttctgagtctgagcacaggcacagatagttttaatggttctttcaat
aaaacaccagacagtcattccagtgattttagaacgcagtttgtttcaaccacaagcatg
gtgacatcaaggaaatttggtaagtctcagcaagaatgtaggaattccttacagccacaa
tatactaatcttcctaagccaaatattaaatcaaattctgaggtgttgggctatgtgtct
cacgtaaatagtccatcaaatttctacatccatcttgcggaggatgaacattttattgta
cagatcgcagaagagcttaattctcagtctctcagtctgattcattctaaggaagaaacg
ttcaaggcaggtgatcttgtcatggcagagtatgaaaaagattctgctttatatagagca
gttgttaaacaggtgaagtcaggtgaaatgtttgatgtagagtttatagactatggcaat
tcatcagttttatgtcgatcaaaattgtacaaccttccagtaaaattcctaaccactcca
agacttgcacacccagcatttcttactggaattaggtttgccaagcctgatggagctgct
tttatggctaatgtcccaaacaatttcaaagaattacttatcagcagtgaacctgttcgt
tttaattttgttcaggagtatgaacatgggtgggaagttaacataaattgtgacatgact
gttggtgagaaatttctgcccttccaagaggtccttgtgccagagaacatcctattaagc
aagaccaaagaacaaagcttaagtatgtctgtgctaaagcaatcccccaaagtcaacaca
gccactttgcctgatgtatgtgacaaagcaaatatacaggtgcttggtgttgaacaagct
aatgtctgctatattccaaatcaagctgtaccttctgggcagttagaaaaagtaaaattg
agcagcatttcagattgtggcactttctatgtaacattactcgcaagagaaaaccaatca
acacacttgtctgggctaattgataatgcagcaaatttaacagaaaattcactgcctgta
ggaagtatcaaagatggaatcatgtgtttgacaaaatctgaaaaaagccttaaatggttt
agggctgaagtgaaggaaatattctctgaagagaagatgatgttagttgtgtttgttgat
aatggtagaactgaaaaagtgcccatgtctaatgcaaagaaattaaacgggaatctgaaa
agcatacctaaacaaacagttgcttgcaaatgggtatggcttaaaaaaactgaaaggcgt
ttcttcaaatctataatgaactcattaacctctcaagtcttgaaaatcctttttctgcga
tacttgaaagccatttctacgtgggaagttgagattctggtaggtgacgtactacttatg
cagtattcaggtgtggctccatgtcctacagtgaaaaatgaaccactcaacttggaggac
tctccttcagttccagtacaatccgttcattctattccatggattacacgcagcagcggt
aaatcataccttggatttgcatgtgcagccacagaccctttcaatttctttgttcagttg
gaagactcatttgacatcatgactgagttgtgtgtgctactgtatgacttaccagataac
ttgccaacattaccattggaacaagtcactcctggttctcactgcttaatgaagtgtgac
ttgaaagaacagtggtgcagagcagaggtgtctgatgtttccgctgactttgtgttacta
acatttatcgactttggatgttcttttcaagtaccgccaaaggacatggataaattaaga
atgattccagaaaatatttcttgtttaccaagactagcctatccatgcactttaagtgaa
gtagtccctgttaatttagaaaaatggacagaaaaagcaatccattactttcagaattac
ttgaatgaaaaagaacttcagatacaatttaagaattaccagcatggccttacactggat
gtggatatttcgcatgaacgaagcaatttagcagatgatcttatagctgctggccatgct
gtccggtcaaaacgaaagacccctgattttgatgcacctcttagcacaaaacccagtggt
aactctagaaagccatttaagatgacttgggcaaaaaataatgctttaagactttcagat
attaaacctggaacttccaagactaccttttcagagaattctcgtctggacaatctgaaa
catagtagcaccgctttaaatgttgtgaatctaagagatgaaagtaatacatacaacagt
aaaaaagatggtaaaagagttaattgccctcagcagtcaaataaagaaagaattcaagac
ccagctcaagcttctacttctaccttacgtggcttgtctgcagcttctaaagtaattacc
agaacaaatagaacacaaaaggcgagtggagaagtttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
