KEGG   Paulownia witches'-broom phytoplasma: HGD80_02480
Entry
HGD80_02480       CDS       T09302                                 
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
  KO
K18888  ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
pwp  Paulownia witches'-broom phytoplasma
Pathway
pwp02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pwp00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    HGD80_02480
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pwp02000]
    HGD80_02480
Transporters [BR:pwp02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    HGD80_02480
SSDB
Motif
Pfam: ABC_membrane ABC_tran SMC_N AAA_22 AAA_21 RsgA_GTPase AAA_29 AAA_23 AAA MMR_HSR1 NTPase_1 T2SSE AAA_14 Dynamin_N AAA_30 Zeta_toxin AAA_18 nSTAND3 AAA_16 DUF87 FtsK_SpoIIIE NACHT AAA_24 ATP_bind_1 AAA_28 cobW
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYC30706
LinkDB
Position
complement(471542..473386)
AA seq 614 aa
MSSLSRNCQIPKFRGCCMKRILRYLKPFKKQINLGLFLILVSSLFNVFLFYFEGRFITDK
IQNYYKDKNSFSVPFFGNDIMSYIIFILCINLFLYFVVVMCRVFFNKMLISSIHQGMRDL
RQDVQKKIHRLPIKYFDSNTLGNIMSRMTNDIEVISNALQQSFSIMLAAFLMIVMIVCFM
FVLHLFLGIIVFMMIPFSFYAIYKVFTKSQKIFIQRFDSSGNHHGFLQEKYTGYKEIILY
NQQNTVIEEFSYQSKYLEKLVFKSNFLSGLTSPIVCLFTHFTLIAVSMMGFFLIEGHNIP
LFLTKLGVGVIGIGLFRCFLQFVWRLGNPIIEIGHMSVLLQSANAASRRVFAFLNEIEEA
PEVLKPQVIANPQGEVVFENVSFGYNKRDMLLRNINFVAKPGQTIAIVGPTGSGKSTLIN
LLMRFYDINAGSIKVDGVDIRELKKDNLRTIFGMVLQDTWFFKDTIWQNIKYGKQDATDE
EVIQAAKQAQVNYFINTKPNGYQMQINEEADNLSQGEKQLITIARTILSNPKILILDEAT
SNVDTRIEILLQQAIQKLIQNKTAFVIAHRLSTIVNADKILVLHRGAIIEQGTHQELLNY
KGFYYKLYQSQFQK
NT seq 1845 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtcttctttatcaagaaattgccaaatcccaaaatttagaggttgttgtatgaaaaga
attttgagatatttaaaaccttttaaaaaacaaattaatttagggcttttcttaattttg
gtatcttccctttttaatgtttttttgttttattttgaaggtagatttattactgataaa
attcaaaattattataaagataaaaattccttttctgttcctttttttggcaatgatatt
atgtcttatattatctttattttatgtattaatttatttttatattttgttgttgttatg
tgtcgtgtcttttttaataaaatgttaatttcatctattcatcaagggatgagagatttg
cgtcaagatgtgcaaaaaaaaattcatcgtttacctattaaatactttgattctaatact
ttaggaaatattatgagtcggatgacaaatgatattgaagttatttctaatgccttgcaa
caatctttttctattatgttagctgcttttttaatgattgtaatgattgtttgttttatg
tttgttttacatctttttttaggtattattgtctttatgatgattcctttttccttttat
gctatttataaagtatttactaaatcacagaaaatctttattcaaaggtttgattcatca
gggaatcatcatggttttttacaagaaaaatatactggatataaagaaattattttatat
aatcaacaaaatacagttattgaagagtttagttatcaaagtaagtatttagaaaagtta
gtttttaaatctaattttttgtctggtttaacttcaccaattgtatgtttatttactcat
tttactttaattgcagttagtatgatgggattttttttgattgaaggacataatatacct
ctttttttaactaaattaggagtaggagttattggaataggactttttagatgtttttta
caatttgtttggcgtttaggaaatcccattattgaaataggtcatatgtcagttttatta
caatctgctaatgctgcttctagaagggtatttgcttttttaaatgaaattgaagaagct
cctgaagtgctcaaacctcaagttattgccaatcctcaaggagaagttgtttttgaaaat
gtttcttttggttataataaaagagatatgttattaaggaatattaattttgttgccaag
ccaggacaaaccatagctattgtaggtcctacaggttcaggtaaatctactttaattaat
cttttaatgcgtttttatgatattaatgcagggtctattaaagttgatggagttgatatt
cgcgagttaaagaaagataatttaagaactatttttggaatggtattacaagatacttgg
ttttttaaagatactatttggcaaaatattaaatatggtaaacaagatgcaactgatgaa
gaagtaatacaagcagccaaacaagctcaagttaattattttattaatactaagcctaat
ggttatcagatgcaaattaatgaagaagcagataacttatcacaaggagaaaaacaatta
attactattgcaaggactattttaagtaatcctaaaatattaattttggatgaggctact
tctaatgtagatactagaattgaaattttgttacaacaagccattcaaaagttaattcaa
aataaaactgcttttgttattgctcatagattgtctactattgttaatgctgataagata
ttagtgcttcatagaggggctattattgaacaaggaacacatcaagaattattaaattat
aaaggattttattataaactatatcaaagtcaatttcaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system