Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear): 103927038
Help
Entry
103927038 CDS
T03446
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pxb
Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear)
Pathway
pxb03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103927038
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pxb03019
]
103927038
Messenger RNA biogenesis [BR:
pxb03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
103927038
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103927038
NCBI-ProteinID:
XP_009334212
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEYFSNYGDVLQTVVMRDKTSGRPRGFGFVVFVDPAVL
DRVLQDQHTIDGRTVEAKRALSREEQQTTGRVGNAYPTRSAGSGGNVRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFREYFEAYGHVTDVVVMYDQSTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRSMGGGQGGGGAAGGGYQGYGASAGNPNSYDGRMDSNRYMQSQS
TGGGFPPYGSSGYSAPGYGYGPTSNGIGYGSYGSYGGANTGYGGPAAAAYGNPNAANAAY
ASGPPGAPRSAWSSQGPSGYGAMGYGNTAPWGVSSGSAGTGSGGPGSAPAGQSPSAAAGY
GTQGYGYGGYSATDASYANPSGYGAVGGRSGSVPNNNVGAPGGEQGSAGGYGGSGYGDSN
GNAGYGNAGWRSDPSQASGNYGAPANGGQVGYGGGYGSAQARQSQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattccgatcaggggaagctttttattggtgggatttcatgggagacctccgaggat
aagcttaaagagtacttcagcaactacggcgacgttttgcagacggtggtcatgagggat
aagacctccggccgccccaggggttttgggtttgtggtttttgtagatcctgctgttctc
gatagggttcttcaggatcagcacaccatcgatggtagaacggttgaggctaagagagcc
ctatcaagagaggagcagcaaactactgggagagttggaaatgcttatcctactagaagt
gctggaagtgggggaaatgttaggaccaagaagatatttgttggagggttgccccccact
cttagtgaggaaggattccgtgaatattttgaagcttatggccatgtaactgatgtagta
gtaatgtatgaccaaagtaccggacgtcctcgtgggtttgggtttatttcatttgacact
gaagaagctgttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatgggaagcaagtg
gaagttaagcgggctcttcctaaagatgccaacccaggtgggggtagccgtagcatgggt
ggtggtcaaggtggcggaggtgctgctggaggtggttatcaaggctatggggcatctgct
ggtaacccaaattcatatgatggtcgaatggactccaacaggtacatgcaatcgcagagt
actggaggtgggtttccaccttatggttcttctgggtatagcgcacccggttacgggtat
ggtcctaccagtaatggaattggctatggcagttatggaagttatggaggtgctaatact
ggttatggaggtccagcagctgctgcatacggaaaccctaatgctgcaaatgctgcttat
gctagtggtcctccaggtgcccctagaagtgcatggagctctcaaggtccctctggatat
ggtgctatgggttatgggaatactgctccttggggtgtttcaagtggcagtgcaggtaca
ggaagtggtggccctggttctgcacctgctggtcaatcacctagtgcagcggctgggtat
ggaactcaagggtatggttatggtgggtatagtgcaacagatgcatcctatgcaaatcca
tctggatacggtgctgttggaggacgttcggggagtgtcccaaataacaatgttggtgct
ccaggtggggagcaaggtagtgctggtggctatggtggaagtggctatggcgattcaaat
ggaaatgcaggttatggaaatgctggttggagatctgatccatcacaagcttctggaaat
tatggtgctccggcaaatggtggacaagttggttatggtggtggatatggcagtgctcag
gcacggcaatcccagcagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
