Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear): 103930273
Help
Entry
103930273 CDS
T03446
Name
(RefSeq) phytochrome A-like
KO
K12120
phytochrome A
Organism
pxb
Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear)
Pathway
pxb04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxb00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
103930273
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HATPase_c
HisKA
PAS_4
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103930273
NCBI-ProteinID:
XP_009337858
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MSSSRPSDSSSNPGRSRHSARIIAQTTVDAKIHADFEESGSSFDYSNSVRIGSSVGGDQQ
PRSDKVTTAYLHNIQKGKTIQPFGCLLALDEKTFKVIAYSANAPEMLTTVSHAVPSVGDS
PVLGIGTDIRTIFTAPSASALHKALGFGEVSLLNPILVHCKTSGKPFYAITHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAIARLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
TYKFHDDDHGEVVSELTKPGLEPYLGLHYPSTDIPQAARFLFMKNKVRMIVDCGAKHVKV
FQDEKLPLDLTLCGSTLRAPHSCHLEYMKNMNSIASLVMAVVVNEGDDEVRDPDSVPPQK
RKRLWGLVVCHNTSPRFVPFPLRYACEFLTQVFAIHVNKEIEMEDQMVEKNILRTQTLLC
DMLLRDAPLGIMSQSPNVMDLVKCDGAALLYKNKVWRLGMTLSDFQLHDIASWLSEYHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALALGDVVCGMAAVWITSKDVLFWFRSHTAAEIRWGGAKHETGE
KDDGSKMHPRSSFKAFLEVVKTRSLPWKDYEMDAIHSLQLILRNAFKDVETTLEANTKAI
NVRLSDLKLEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVDGLVNGWNTKIDELTGLPVDEA
IGKHLLTLVEDSSTSAVKKMLDSALHGKEEQNIQFEIKTHGSRADLGPISLVVNACASRD
IRENVVGVCFVAQDITGQKNVMDNFTRIEGDYKAIVQNPSPLIPPIFGTDEFGWCSEWNS
AMTKLTGWKREEVMDKMLLGEVFGINMACCPLKSQESFVNLGIVLNHAMTGQVSEKVPFG
FCARNGKHIECLLCVSKKVNSEGSVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRLSEQTAVKRLKEL
SYIRRQIRNPLAGIIFSRKMMEDTELGAEHQQLLHTSAQCQHQLNKILDDSDLDTIIEGY
LDLEMVEFTLHEVLNAAVSQVMIKSNAKSIRIVHNAAEDIMTETLYGDSLRLQQVVADFL
AVSVSFMPTGGQLTIEAKLTKDQLGQSVQLVHLELRITHAGGGIPEGLLNQMFGNNGDIS
EEGISLLISSKLVKLMNGEVRYLREEGKSTFMISVELAVANKM
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcttctagacctagtgactcatcaagcaatccagggcggtctagacacagcgct
agaatcattgctcagacaactgttgatgcaaagattcatgccgattttgaggaatcgggt
agttcctttgactactcgaattcagtgcgtatcggcagttcagttggtggagatcaacaa
cctaggtccgacaaagtgaccactgcttatctccataacatacagaaaggcaagacgatc
caaccgtttggatgcttgctagccttggatgagaagactttcaaggtcattgcatacagt
gcgaatgctcctgaaatgctgaccacggtcagtcatgcagtcccaagcgttggggactcc
cctgtccttggcataggaacagatataagaacaattttcactgcccctagtgcctccgca
ctgcataaggccctcggatttggagaggtttctctcttaaatcccatcttagttcattgc
aagacctctggcaagcctttctatgcaataactcatcgagtaacgggcagtttgatcatt
gactttgagccggtgaagccttatgaagtgcctatgactgctgctggggcgctgcaatca
tacaagcttgctgccaaagcaattgccagattgcaatctttgcctagcgggagcatggag
aggctttgtgatacaatggtccaagaggtttttgaactcaccggttatgacagggtgatg
acttataaatttcatgatgatgatcacggagaagtggtctctgagcttacgaagcctggc
ctggagccatatctagggttgcattatccatccactgacatacctcaggctgcacggttc
ctatttatgaagaataaggtccgcatgattgtcgattgtggtgcgaaacatgtgaaggtg
tttcaagatgagaagcttccgctggatctcacattgtgcggttcaaccctgagagcccca
cacagttgccatttggaatatatgaagaatatgaattccatcgcatctcttgttatggca
gtagttgttaatgagggggatgacgaggtgagagatcctgattctgttccgcctcaaaaa
agaaagagactttggggtttggtagtatgccataatacaagtccaagatttgttcctttc
cctctcaggtatgcctgtgagtttttaactcaagtgtttgccatccatgtcaataaggag
atagagatggaagatcagatggttgagaagaacatcctgcgcacccaaacgctgttgtgt
gatatgctgttacgagatgcacccttaggtattatgtcacagagccctaatgttatggat
ctagtgaaatgtgatggagctgccctattgtacaagaacaaggtatggagacttggaatg
actctgagtgactttcagcttcatgacatagcttcatggctctccgagtaccatatggat
tctacgggtttgagtacagatagcttgtatgacgcaggattccctggggctcttgctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagctgtgtggataacttccaaggacgtgctcttttgg
tttcgatcccacactgctgcagaaattcgatggggtggtgcaaaacatgaaaccggtgag
aaagatgatggttctaaaatgcaccctagatcatcattcaaggctttccttgaagttgtc
aagacgaggagcttgccttggaaggactatgaaatggatgcaattcattctttgcagctt
attctgaggaatgctttcaaagatgttgaaaccaccttggaagcaaacaccaaagcaatt
aatgtaaggcttagtgacctcaaacttgaagggatgcaagaactggaagctgtgacaagt
gagatggtccgtttaattgaaacagccacggttccaattttggctgttgatgttgatggg
ctggttaatgggtggaatacaaaaatcgatgagttaactggtcttcctgttgatgaagca
atcggaaagcatttgctcacactcgtggaggattcttcgactagcgcggtgaagaaaatg
ttggactcagcattgcatggcaaagaggaacaaaacatccaattcgagataaaaacacat
ggttctagggctgatcttggtcccatcagcttagttgtgaatgcttgtgcaagtagagac
attcgggaaaatgttgtgggggtgtgttttgtggcacaggatatcactggtcagaagaat
gtgatggacaatttcacccggatcgagggtgattacaaagcaattgtacaaaaccctagc
cccttgattcccccaatatttggtacagatgaatttggctggtgttctgagtggaattca
gcaatgacaaagttaacagggtggaaacgagaggaggtaatggataaaatgcttctggga
gaggtttttgggatcaacatggcatgttgtcctctcaagagccaagaatctttcgtaaat
cttggtattgtacttaaccatgccatgacaggtcaggtgtccgaaaaggtcccctttggt
ttctgtgctcgtaatggaaaacacatagaatgcctgctgtgcgtgagtaagaaagtgaac
agtgagggctcagtcactggggtcttttgcttcttgcagcttgctagcccagagctgcaa
caagcacttcatgtccagcgcttatcagaacaaactgctgtgaagagattgaaggaattg
tcttatattagaaggcagatccggaatcctttagccggtataatattttctcggaaaatg
atggaggatactgagttgggagcagaacatcaacagcttctgcatacgagcgcccagtgc
cagcaccagctcaacaaaatactggatgattcagatcttgataccatcattgagggctac
ctggacctggagatggtcgagtttacattgcatgaagtactgaatgccgctgtcagtcaa
gtcatgattaagagcaatgccaagagcatccgcattgtccacaatgcagcggaagatatc
atgactgagacgttatatggggatagtcttaggcttcaacaagtcgtagctgatttctta
gcggtatcagttagttttatgccaactggaggccagcttactatcgaagctaagttgacc
aaagatcagttaggacaatccgttcagctcgtgcatttggagctcaggatcacacacgcc
ggtggtgggattccagaaggattgctgaaccagatgtttggaaacaacggagacatatct
gaggagggcattagcctgctcatcagcagtaaacttgtgaagctcatgaatggagaagta
cggtatcttagggaagaaggcaagtcaaccttcatgatatccgtagaactcgccgtggca
aacaagatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
