Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear): 103955825
Help
Entry
103955825 CDS
T03446
Name
(RefSeq) phytochrome A-like
KO
K12120
phytochrome A
Organism
pxb
Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear)
Pathway
pxb04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxb00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
103955825
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HATPase_c
HisKA
PAS_4
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103955825
NCBI-ProteinID:
XP_009366001
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1125 aa
AA seq
DB search
MSSSRPSNSSSNSGRSRHSARVIAQTTVDAKLHADYEESGSSFDYSSSVRAGSSVGGDQQ
PRSDKVTTAYLHHIQKGKTIQPFGCLLALDEKTFKVIAYSANAPEMLTAVSHAVPSVGDS
PVLGVGTDIRTIFTAPSASALHKALGFGEVSLLNPILVHCKTSGKPFYAITHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAIARLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
AYKFHDDDHGEVVSELTKPGLEPYLGLHYPSTDIPQASRFLFMKNKVRMIVDCCAKHVKV
FQDEKLPLDLTLCGSTLRAPHSCHLEYMKNMNSIASLVMAVVVNEGDDEVTDPDSVPPQK
KKRLWGLVVCHNTSPRFVPFPLRYACEFLTQVFAIHVNKEIELEEQMVEKNILRTQTLLC
DMLLRDAPLGIMSQSPNIMDLVKCDGAALLYKNKVWRLGMTPSDFQLHDIASWLSEYHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALALGDVVCGMAAVWLTSKDLLFWFRSNTAAEIRWGGAKHETGE
KDDGCKMHPRSSFKAFLEVVKRRSLPWKDYEMDAIHSLQLILRNAFKDAGTTLEANTKAI
NVRLSDLKLEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVHGLVNGWNTKIGELTGLPVDKA
IGKHLLSLVEDSSTDTVEKMLNSALHGKEEQNIQFEIKTHGSRADLGPISLVVNACASRD
IRENVVGVCFVAQDITGQKNVMDRFTRIEGDYKAIVQNPNPLIPPIFGTDEFGWCSEWNS
AMTKLTGWKREDVMDKMLLGEVFGIHMACCPLKSQESFVNLGVVLNHAMTGQVSEKVPFG
FCARNGKYIECLLCVTKKLDSEGSVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRLSEQTAVKRSKEL
SYIRRQIRNPLAGIIFSRKMMEDTELGEEQQLLLHTSAQCQNQLNKILDDSDLDTIIDGY
LNLEMVEFTLHDVLNAAVSQVMMKSNAKSIRVVQDAPEEIMTQTLYGDSIRLQQVVADFL
AVSISFVPTGGQLTIEANLTEDQLGQSVHLVHLELRITHAGGGIPEALLNQMFGNDGDIS
EEGISLLVSSKLVKLMNGDVRYLREEGKSTFMISVELAAAYKMKP
NT seq
3378 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcttcaagacctagcaactcgtccagcaattcagggcggtctagacacagtgct
agagttatcgctcagacaactgttgatgcaaagctgcatgcagattatgaggagtcaggt
agttcctttgactactcgagctcagtgcgcgctggcagttcagttggcggggatcaacaa
cctaggtctgacaaagtgaccactgcttatctccatcacatacagaaaggcaagacgatc
caaccgtttggatgcttgctagccttagatgagaagactttcaaggtcattgcttacagt
gcgaatgcccctgaaatgctgactgcggtcagtcatgcagtcccaagtgtcggggactcc
cctgttcttggcgtaggaacagatattagaacaattttcactgcacctagtgcctctgca
ctgcataaggccctaggatttggagaggtttctctcttaaatcccatcttagtccattgc
aagacctctggcaagcctttctatgcaataacccatcgagtaacgggcagtttgatcatt
gactttgagccggtgaagccttatgaagtccctatgactgctgccggggccctgcaatcg
tacaagcttgcagccaaagcaattgccagattgcagtctttgcctagtgggagcatggag
aggctttgtgatacaatggtacaagaggtttttgaactcactggttatgacagggtgatg
gcctataaatttcatgatgatgatcatggagaagtggtctctgagcttacgaagcctggc
ttggagccatatctaggtttgcattatccatccactgacatcccacaggcttcacggttc
ctatttatgaagaataaggtccgcatgattgttgattgttgtgcgaaacatgtgaaggtt
tttcaagatgagaagcttccgctggatctcacattgtgcggttcaaccctgagagcccca
catagttgtcatttagaatacatgaagaatatgaattccattgcatctcttgttatggca
gtagttgttaatgagggggatgacgaggttaccgatcctgattctgttccacctcaaaaa
aaaaagagactttggggtttggtagtatgccataatacaagtccaagatttgttcctttc
cctctcaggtatgcctgtgagtttttaactcaagtgtttgccatccatgtcaataaggaa
atagagttggaagaacagatggttgagaagaacatcttgcgcactcaaacactgttgtgt
gatatgctgttacgagatgcacccttgggtattatgtcacagagccctaatattatggat
ctggtgaaatgtgatggagctgccctattgtacaagaacaaggtatggagacttggaatg
actccgagtgacttccagcttcatgacatagcttcttggctctccgagtaccatatggat
tctacgggtttgagtacagatagcttgtatgatgcaggattccccggggctcttgctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagctgtgtggttaacttccaaggacttgctcttttgg
tttcgatccaacactgctgctgaaattcgatggggtggtgcaaaacatgaaaccggtgag
aaagatgatggttgcaaaatgcaccctagatcatcattcaaggctttccttgaagttgtc
aaaaggaggagcttgccttggaaggactatgaaatggatgccattcattctttgcagctt
attctgaggaatgcattcaaagatgccggaaccaccttggaagcaaacaccaaagcaatc
aatgtaaggcttagtgacctaaaacttgaagggatgcaagaactggaagctgtgacgagt
gagatggtccgtttgattgaaacagcgacggttcccattttggctgttgatgttcatggg
ctggttaatgggtggaatacaaaaattggcgagctaactggtcttcctgttgataaagca
atcggtaagcatttgctctcactcgtggaagattcttcgactgacacggtggaaaagatg
ttgaactctgcattgcatggcaaagaggaacaaaacatccaattcgagataaaaacacat
ggttctagggctgaccttggtcccatcagcttagttgtgaatgcttgtgcaagcagagac
attcgggaaaatgttgtgggggtgtgttttgtggcacaagatatcactggtcagaagaat
gtgatggacagattcacccggattgagggtgattacaaagcaattgtacaaaaccctaac
cccttgattcccccaatatttggtacagatgaatttggctggtgttctgagtggaattca
gcaatgacgaagttaacaggatggaaacgagaggatgtcatggataaaatgcttctggga
gaggtttttgggatccacatggcatgttgtcctctcaaaagccaggaatcttttgtaaat
cttggtgttgtcctgaaccatgccatgacaggtcaggtgtccgaaaaggttccctttggt
ttctgtgctcgcaatggaaagtacatagaatgcctgctgtgtgtgactaagaaattggac
agcgaaggctcggtcactggggtcttttgcttcttgcagcttgctagcccagagctgcaa
caagcacttcacgtccagcgcttatcagaacaaactgcagtgaagagatcgaaagaattg
tcttatattagaaggcagatccggaatcctttagccggaataatattttctcggaaaatg
atggaggatactgagttgggagaagaacaacaactgcttctgcatacgagcgcccagtgc
cagaaccagctcaacaaaatactagatgactcggatcttgataccatcattgacggctac
ttgaacctggaaatggttgaattcacattgcatgacgtactgaatgccgctgtcagtcaa
gtcatgatgaagagcaatgccaagagcatccgtgttgtccaagatgcaccggaagagatc
atgactcagactttatatggggatagtattaggcttcaacaagtcgtagctgatttctta
gccgtatcaattagttttgtgccaactggaggccagcttactatcgaagctaatttgacc
gaagatcagttaggacagtctgttcatcttgtgcatttggagctcaggatcacacacgcc
ggtggtgggattccagaagcattgctgaaccagatgtttggaaatgacggagacatatct
gaggagggcattagcctgcttgtcagcagcaaactggtgaagcttatgaatggagacgta
cgttatcttagggaagaaggcaagtcaaccttcatgatatccgtggaactcgcggctgca
tacaagatgaagccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
