Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear): 103958964
Help
Entry
103958964 CDS
T03446
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pxb
Pyrus x bretschneideri (Chinese white pear)
Pathway
pxb03015
mRNA surveillance pathway
pxb03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
103958964
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103958964
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pxb03041
]
103958964
Spliceosome [BR:
pxb03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
103958964
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103958964
NCBI-ProteinID:
XP_018505819
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
457 aa
AA seq
DB search
MAGIYGQGGDGAPPTYGSSGGGGYGGSGGYGGGSGGYGGGGGGGSYGGSGGGGYGGGGRG
GGGGGRGGGYQGDRGGGGRGGDRGGGGRGGRGGSGRDGDWLCPNPGCGNSNFARRVECNK
CGTPSPSGASGDRGSGGGYNRGGSGGGYGGGNRGGRGGNYDGGRSGNYEGGKSSSYDGGR
GTSYDSRGGGGSRGGSYGGSQGRDDGGYGQVPPSAPPSYGAAGGNYAPSYNASYGTDAVP
PPTSYTGGPGSYPPSYGGPAGGYGGDGLGDARGGGRGGPPAKYDGGYSAGGRGGYGSAAT
EAPAKVKQCDQNCDDTCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWP
YNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYDLRGYKISVGMAERSAPRPSFEQ
GSGGGGRGGYGGGDRRNSYRDGGADRHQHGGNRSRPY
NT seq
1374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggaatctacggtcaagggggcgatggtgcccctccgacatacggatctagcggc
ggcggtggctatgggggttctggcggatacggaggcggttctggtggttatggaggtggt
ggtggaggcgggagctatggtggaagcggtggtggtggatatgggggtggtggacggggc
ggtggcggtggtggccgaggtggaggatatcaaggcgaccgtggtggtggaggcagaggt
ggcgaccgtggtggtggcggcagaggcggccgcggtggcagtggaagagatggtgattgg
ctgtgtcctaatccaggctgtgggaattcaaactttgcaagaagagttgagtgtaataag
tgtggcacgccctctccttcgggtgccagtggtgatcgtggcagtggtggtggttataac
agaggaggaagtggtgggggctacggtggtggtaaccgtggtggtaggggtggtaattat
gatgggggtcgaagtggtaactatgaaggaggtaaaagtagcagttatgatggaggcaga
ggcactagttatgacagtagaggcggtggtggtagtagaggtggttcttatggtggtagt
caaggaagagatgatggtgggtatggtcaggttcctccaagtgctccaccgtcctatggt
gcagctggaggcaattacgcaccatcttacaatgctagttatggaacagatgcagttccg
cctcctacaagctatactggtggacctggatcatatcccccatcttatggtggtcctgca
ggtggttatggtggtgatggtctaggtgatgcaaggggtggtgggcgtgggggccctcca
gctaaatatgatggtggatacagtgctggtggtcgtggtggatatggcagtgctgctacg
gaagccccagctaaggtgaagcagtgcgaccagaattgtgatgatacttgtgacaatgct
agaatctacatatcaaacttaccaccagatgttaccgttgacgaacttcagcagctcttt
ggaggcattggacaagtgggaagaatcaagcagaaacgtggctataaggatcaatggccc
tataatatcaaaatatacacagacgagtctggaaaaaacaaaggcgacgcatgtttagcc
tatgaagatccctctgctgcacattcagctggtggattttacaatgattatgacttaagg
ggctataagatcagtgttggaatggcggagagatcagctccaaggccttcgtttgaacaa
ggcagtggtggtggcggtagaggtggatatggtggcggtgacaggcgcaacagttataga
gatggtggagctgatagacatcagcacggcggaaaccgttcgcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
