Pseudoalteromonas xiamenensis: J5O05_16575
Help
Entry
J5O05_16575 CDS
T07215
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
pxi
Pseudoalteromonas xiamenensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pxi02000
]
J5O05_16575
Transporters [BR:
pxi02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
J5O05_16575
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTH71371
UniProt:
A0A975DGD7
LinkDB
All DBs
Position
3422073..3425768
Genome browser
AA seq
1231 aa
AA seq
DB search
MKNRQLRKLFTLFGYSLVALATIVFCVVFTIPGNKAIVWVVNHTISGVTISQLEHRFYDD
EPFTLSYHSEDVDLELTDLAIDLTPRGIVNWKIRATLGQGSVKTHNNRAVKSSENSENGS
VSLITLPNVFIDLNVLVDKFNYEDQNNHLQIKHTEFEASIKPSEVNIKHINIADIALQQN
KNADEPEQTRLTKVPKLALPASLPIAFDVFLNAASVEQIRVTSKSENSEAAPLIIRSFMA
NIALTDHVASVKNTSLSIDDGSISISGSGSLSEVDFHAQIKGYDHTLTAELKGPWNAVNL
SLTSETIHEGMLLARVNPLEDNWPFQAKLNVGTWQDLPFITLPEVSALTGTVELAGQVDG
YQGNASLSAMHEKLGELSLQTTFSGSLTQFSSAATLIESDFVNAKADFNLGFEKSLSLEG
GIQWQNLKVAKFVPYQTDLSGKFEFQLNNSDKGYSIDVKDFSAEGNVEGLPLDAKLSASV
NENYDVNIRSLNAKFGQSEVSLSGRVADKLEIKGDWDIDLSPTSSLPYTLKGKGSLNVNG
TRVLPRLFLDATFAQISSPDFELNDVIAFVDFNEKGKEALNVRFETHNGLVQDIKIDSIT
ANALGTLKEQNISINVQTELGDIQSNIAGTYASNRWHATLSQSALKLNGHDFIQSETADL
IVAKEGDFTVSPMCFKSGKDMFCLDSKRDSAAQLFNANVKLDNINLAIVKDFMPKDIDIL
GHLSGKASFQAKGNQETSLFANLTSEKTTVLVSQEGILNAVDLGTIDLDVKGRGAKINVQ
LQNTLSPLGRIFANIETQLGQTKPSLNAELALNRINLGYLDPMLTQLLNREFKLQGDLSG
DLKVQGEIESPQIFGDLRVTGLAAQNERSPVKLSDSELVITLNGQTMKLHGALKDLDAGT
LNLDGDVNWQDALNLAMHINGKSFWLRPQEGVEFKVDTDVHLDWAGDQATLKGKVTVPYG
RIAIKSLPEDAIAVSSDQVFVDEAELETESLPVKYDISLQVSVVDDVKIDSFGLKSYLNG
NLLINKQNDTPLVGSGELSLVQGQFRAFGQDLIISKGQVGFSGALDKPFLHVNAIRNPQT
TQDGVIAGVQLTGLATEPVLTVYSEPAMDQAQALSYLLNGRPLGGDDADKSVLLANLLIS
QGLGRSEGLLQKVGSGVGLQDVNVGTKGSGVDTQVELTGFLTPSVQVRYSVGVFDSLSEI
AVRYQIMSKLYVEITSGLYNSIDLLYRFDWE
NT seq
3696 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataggcagttaagaaagctatttactttatttgggtatagtctcgttgcactg
gcgacaatcgtattttgtgttgtttttacaattcctggcaacaaagcaatagtttgggtc
gtcaatcacaccatatctggcgttaccatttctcaattagaacaccgtttctatgacgat
gaaccttttacactttcctatcacagcgaagacgtagacctggaacttacggatcttgct
atcgatctcacgcctcgtggaatagttaactggaaaatccgagctacgttaggtcaaggt
agtgttaagactcacaataaccgagcagttaaatcaagtgaaaatagcgaaaacggatcg
gtatcgctcattacactgccaaatgtttttatcgacttgaatgttttggtggataagttc
aattatgaagaccaaaacaaccatttgcagatcaagcacaccgagtttgaagcaagtata
aagccatcagaagtaaatattaagcacatcaacattgcagacattgcgctacagcaaaat
aaaaacgccgacgagcctgaacaaactaggctcacaaaagtgcctaaattagcgcttcct
gcgtcgctgcccattgcgtttgatgttttcttgaacgcagcatctgttgagcagatccgc
gtcacatcgaaaagtgaaaatagtgaagctgctccgctcataatacgttctttcatggcc
aatattgcacttacggaccatgttgcgagtgttaaaaatacctcgttgagtattgatgat
ggttcaatttcgattagcggatctggttcattatctgaggtggatttccatgcacagata
aaaggatatgatcacacccttacagcagaacttaagggtccttggaacgccgtcaatctg
tctttaacaagcgagacaatccatgagggaatgctgcttgcccgtgtaaacccgcttgaa
gacaattggccatttcaagcgaagctaaacgttggtacttggcaggatctgccttttatc
acattgccagaggtgagtgcgctaacgggaaccgttgaactggcaggccaagttgacggc
tatcaaggaaatgcaagtttgtcagccatgcacgaaaagcttggtgagttgtctttacaa
acgactttttcaggttcacttactcagttttcatcagccgccacactgattgaaagtgat
ttcgtgaatgcaaaagctgactttaacttgggattcgagaaaagcctaagtcttgagggc
ggtatacaatggcaaaaccttaaagttgctaaatttgtaccttatcagactgatttatca
ggaaaattcgagtttcaacttaataactctgataaaggctattctattgatgtcaaagac
ttctcggcagaaggtaatgtggaagggttgcctctggacgcgaaactgagtgcgtcggta
aatgaaaactacgacgttaatattcgctctttaaatgcaaagtttgggcaaagcgaagtg
tccttgtcaggccgagtggctgataaattagagatcaaaggcgattgggacatcgattta
agccctacgtcctctttaccttacacgttgaaagggaaagggtcgctaaacgtgaatggt
acacgcgttctgccacgcctttttctagatgcgacctttgcacagatttcatcacctgat
tttgagcttaatgatgttatagcctttgttgattttaatgagaaaggcaaagaagcactg
aatgtgcgattcgaaacgcataacgggttagtccaagacattaaaattgattcaatcacg
gccaatgcgttaggtacgttgaaagaacagaatattagtatcaatgtccaaacagagttg
ggtgatattcagtcaaatattgcaggtacttatgcgtcaaatcgatggcatgccacgctg
agtcaatcggccttaaaactaaatggacacgattttattcaaagcgaaacggcagatctg
attgttgcaaaagaaggggattttaccgtatcacctatgtgctttaaatcaggtaaagat
atgttctgcttagattcgaagcgcgatagtgccgcgcagttatttaatgcaaatgtgaag
ttggataacatcaatttagccatcgttaaggacttcatgcctaaggatattgatatactg
gggcatttatcgggcaaggcaagtttccaggcgaaaggcaatcaagaaacgtcattgttc
gctaatttaacgagtgagaaaacaacggtcttggtgtcacaagaaggtattttaaatgcg
gttgatttaggtacgattgatttagatgtaaaaggcagaggcgcgaagataaatgtccaa
ctgcaaaatacgttgagtcctttaggtcgtattttcgcaaatattgaaacgcagcttggc
caaaccaaaccatcgcttaatgcggagcttgcacttaaccgcattaatttaggctaccta
gacccaatgcttactcagctactcaatcgtgaatttaaattacaaggtgatttatcaggt
gatctaaaagtacagggagagattgagtctccacagatctttggcgatttgcgtgtcaca
ggtcttgctgcacaaaatgaacgaagtcctgtaaaactcagtgactcagagcttgtcatt
acgctcaatgggcaaaccatgaaattacatggtgcacttaaagacctagatgcaggaaca
ctcaacctagacggtgatgtaaattggcaagacgctttaaacctagccatgcatatcaac
ggtaagtcgttctggctgcgtccacaagaaggtgttgagtttaaagttgataccgatgtc
cacctagattgggccggagatcaagcgacgttaaagggtaaagtcaccgttccgtatgga
cgcattgccatcaagtcgttaccagaagatgcaattgctgtttcctcggatcaagtgttt
gtagatgaagctgaattggaaactgaatcgttaccggtaaagtacgatatctcactgcag
gtgtcggtcgtggatgatgtaaaaatcgattctttcggccttaaaagctatctaaatggt
aatctattgatcaacaagcaaaacgatacaccattagtggggagtggtgaactgtcttta
gtacaaggtcaatttcgagcgtttggacaagacttaattatcagtaaaggtcaagttggc
tttagtggtgcattagataaacctttcttacacgtaaatgcgattcgtaatccacaaaca
acccaagatggtgttattgctggagtacagctaacaggtcttgcgacagaacctgtatta
accgtgtattcggagccagcaatggaccaagcgcaggcgttatcctacctattaaatgga
agaccattaggtggtgatgatgcggataaaagcgtgttactcgcaaacttgttgataagt
caaggactcggccggagtgagggcttattacaaaaagtgggaagcggggttggtttacaa
gatgtaaatgtcggcactaaaggatcaggcgtcgatacacaagttgagttgacaggtttt
ctaacgccaagtgtgcaggtaaggtacagtgtaggggtgtttgattcgttgagtgaaatc
gccgttcgctaccagattatgtccaaattgtatgttgaaattacgagcggtttatacaac
agtatcgacctactgtaccgttttgattgggaatag
DBGET
integrated database retrieval system
