Paenibacillus xylanexedens: BS614_16775
Help
Entry
BS614_16775 CDS
T04676
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pxl
Paenibacillus xylanexedens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
DUF7507
DUF7619
bMG10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APO45504
LinkDB
All DBs
Position
3726039..3732749
Genome browser
AA seq
2236 aa
AA seq
DB search
MIFIPLVVRSTVNATGAITFTGNTLGLSRSETAGVPGTQDSIGGFTTTNTSLQYGTYPLG
TTSLYQSNSSAAILTLPAGSTVLYAELIWGGSYINGTVNLSAAINNPVTFITPAGTSSVT
PDPLTYNQFDLGGGAAGYVRSANVTTLVQSGGAGTYITGAVVGTIVITNDSTANHAGWTL
GVIYQNPNLPFRNMSLRAGGVLVQSTSPPVVTTLTGFATPLSGVLGGRILFSAQEGDANR
TGDQALFGPTSATSVALSGPNNLAANFFASQINGDTGALNTTGTFGTRNQINGAPGTNII
GGRQGWDITNVDVSARLINNQSSAVLTLTTSGDAYIVNANAIQVDINAPKITLAKATVAS
GAVAGDSILYSVTVTNAGTASAASVVLSDSLPAGLTFIPGSVTVAGVSRPTLDVTAGIPL
GSLTLSSSVVVTYRALIGQDASILQLVNSANAAFTFQSVAGGPVITGVIPSNNSTLTVYS
PNLSIVKSASTTNVSVGSQVTYTLQVNNGGNVAANVILTDNIPSGSSYVAGSFRLNGTVI
AGANPATGVNLGSIPAGSANTVTFQVLVTSLPTPPTLVDQATASYSFNSPDGRTITGNIA
SNTLTIPVTLPNVTTVKSASVTDVAVGETFTYTVVTSNLGIEAINNVILTDLLPVGTSFV
PGSVTVRGTVVPSANPISGVSVGTLTVGSSATVTFQVNVQSLPASGSLINRAVVSYSSGS
FTGISNSNTITTPVYQAVIGINKSASQTNATLGDQLAYTLVVTNSGNIATQVNVTDTIPA
GLTFVPNSVTVNGTARPGTSPLTGITLGTLLPGATATVVFRATLTTLPTPPTLENQGTAS
YTYQLPSGRNLSGSSLSNIVRISASAPNISLSKTVNTPDATVGDVLTYTVVATNAGISAV
QNLVISDAPSGSEFVPGSVTINGSAVTSASPVAGIAVGTLNSSSSVTVTYQTRVNSVPST
GLVSNRANAAFTSGSFNGVSSSISVNTPIFLPVIQVVKSASTTSLTVGDTFNYTIQINNT
GNIAATVTLTDPIPAGAVFSTNSVIINGVPTPGVSPVAGINLGTIAAGSGATVTFVATVT
SLPDARQLINQAVASFAYTLPSGRTIAGLSSSNTITIPVSLPNVTIVNSDNVEYGVVGDV
IRYTSVIRNNGTVAVNNVVYVNPLPSNTPFVPGSVIVNGTSFPLSNPTAGIPIGTLAPGA
EVTVTFEVTITMPIPSQINNQSTVSFTSGSFSGSSSSNTTQTPVIQPQISLVKTANTVNA
TVGDTVVYTVTVSNAGNLEANVTATDTIPAATTLVANSVVVSGVPQPGATPAAGIPVGIV
AAGATAVVTFAVVVDSLPSPQQLSNFATSSFTFTPPDGRTLTGSATSNTLTFPVSSPNVA
VVKSTASTAATVGDTVTYSILVTNSGIAPVNNIQFSDPIPAGASFVTGSVTVNGVAQPGA
NPAGGISLGTLGPGTSATVTFSIRVDAIPPSNQLSNRSTVSFTSGTFSSTTFSNTVVTPV
YQPILSAQKTASTQNATVGDTVSYTITVSNQGNYGAQINLTDNLPAGTILVPNSVIVNGQ
PLPAGSPATGIPAGNVAPGATTTITFSVVVDTLPSPQQLVNQATVALSYTLPDGRNITGS
VLSNVLTITVSAPDVDVVKSTTSTAVSVGDVVTYSIAVTNNGIATVNNVVFTDAVPTSTV
LAPTGVFVDGVLRPGANPSTGITLGSIAPGVTVTVVFSVQVTALPASAVLNNQSTVSFTS
GVFSATTFSNTVTTPVYQPILSAVKTGDQTIATVGDTVVYSIAISNAGNYGASVTLTDTI
PAGTELVPNSVIINGASAPGADPASGIPLGVVSTTTLVTFSVVIVTLPLSQSITNQASAT
FSYTLPDGRTLGGTITSNALNIQVSAPNVSVVKTTPVIDAVVGDTIVYEMVVTNEGIDPV
NNIVITDPINPATTFVTGSVLVDGVPRALANPALGIALGSLAPGASIAVSYAVRVNTLPT
PPQVSSQSSVSFTSGVFSGAAYSNTVVTPIYQPIIAVTKTGSTSNATIGDTITYSFAINN
SGNLDAILTLTDNIPNGAVLLPNSVLIDGVPQPGANPETGIAVGTIPSGGTVIVTVTLEV
TVDTLPQDQQLVNQAVANYTFSPPDGRLLTGTVSSNVLVIPVSAPNVVVAKSTSAIDAVV
GDVITYTVVVTNSGIEVVNNVVMVDPVPVGTVFVPGSVTVDGVPRPTGNPNTGITLGSIA
AGASVTVTFRVEVVVI
NT seq
6711 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattttcattcctcttgtcgttcgttcaaccgttaatgctacgggagcaattacattt
acaggaaatacgcttggactgagtcgttcggaaacagcaggggtacccggaacacaggac
agtattggaggttttaccacaaccaacaccagcctccagtacggcacctatccactggga
acgacaagcttgtatcagagcaacagttcagcagccattcttacactgcccgctggaagt
accgttctgtatgcagaattgatctggggcggcagttacatcaatggtacagtcaatctg
agtgctgccatcaacaatccggttacgtttattacacccgcagggacttccagtgtaacc
cctgacccacttacctacaatcaattcgatctgggaggcggtgctgctggctatgtacgt
tccgccaatgtgactacacttgtacaaagcgggggagccggtacatatatcaccggagca
gtggtagggactattgtaattacgaatgattccacggccaatcatgcgggatggacactt
ggggttatctatcagaatcccaatctgccttttcgcaacatgtctttacgtgcaggaggc
gtactcgttcaatccacttcaccacctgtcgttaccacattgactggatttgcaacgccc
ctttccggtgtactgggaggaagaatactgttcagtgctcaggagggcgacgcgaaccgg
accggtgaccaggcattattcgggccaacctcagctacatcggttgctttgtccgggccc
aataatctagctgcgaacttttttgcttctcagattaacggagataccggagcgcttaat
acaacaggaacgtttgggacacgaaatcagatcaacggggctccaggcaccaatattatc
ggtggacgtcaaggctgggatattaccaatgtggatgtgtcagcaagactgatcaataac
cagtcatctgcggtgttgacattaacgacctcgggggatgcctacattgtcaacgccaat
gcaattcaagttgatattaatgcgcccaagatcacattggctaaggcaacggtcgcctcc
ggtgcagttgccggggatagtattctatattcggttaccgttaccaatgcaggcactgcg
agtgcggccagtgttgttttatccgattcacttcctgcaggtcttacctttattccaggc
agtgtcacggttgcaggtgtatcccgtccaacacttgatgtgacggcaggcattccgctg
ggttcgttaactttatccagcagtgttgttgtaacctatcgagcactcatcggtcaggat
gcaagcatcctgcaactggtgaattcggccaatgcagcctttacatttcaaagtgtagca
gggggtccggtcattaccggagttattccgtccaataactccacccttacggtttattcg
ccaaacctgtccattgtgaaatcggcgagtaccaccaatgtcagtgtaggaagtcaagtc
acttatacgcttcaggtgaacaacgggggaaatgttgctgccaacgttatattgacggat
aacatcccgagtggcagctcatatgtggcaggtagcttccgactgaatggtactgtaatt
gcaggcgctaatccggcgacgggcgttaatttggggagcatcccggcaggaagtgcaaat
accgtaacctttcaggtacttgtaacaagcttgccgacaccgccaactcttgtggatcag
gcgacagcttcttattcctttaattcacctgatggtcggacgatcacgggaaacatcgcc
tcgaataccttaacaatcccggtaacattgcccaatgtgaccacggtaaaatcagcatcc
gttaccgatgttgctgtcggagagaccttcacgtacaccgtagttacaagcaacctcggt
attgaggcgattaataatgtgatcctcacggatttgctgcctgtcggtacgagctttgtc
cccggcagtgtgaccgtcagaggtacagtcgtaccttcggcgaatccaattagcggcgtt
tcggttggaacgttgacagtaggaagttctgcgacggtgacgtttcaggtgaacgtgcag
tctttgcctgcttcaggttcgttaatcaatcgagcggtagtgtcttatagctctggttcg
ttcacgggcatttccaactccaataccattacaactcctgtataccaagcggttatcggt
atcaacaagtcggcgagccaaaccaatgcgacactgggggatcagcttgcatacacactt
gtggtcacgaacagtggaaacatagcgactcaagtgaatgtgaccgatacgattccagcg
gggctgacgtttgtcccgaattcggtaaccgtgaatggtactgcgcgtcctggaacaagc
ccattaaccggaataacactgggcaccctcttgccgggagctacggctacggtggtgttt
cgcgctacactcaccacacttccgactccgccgacactggagaatcaagggactgcaagt
tatacgtaccagcttccaagtggacggaatctctcaggcagcagcttatccaatatcgtt
cgtatatctgcatcggctcccaatatttctcttagtaaaacagtaaacacaccggatgcg
acagttggagatgtgcttacgtataccgttgttgcaacaaacgcaggaattagtgcagta
caaaatctggtgatttcggatgcaccatccggctctgaatttgtcccgggtagtgtcacg
attaatggatctgctgttaccagcgcaagccccgttgcgggaattgcagtgggtacattg
aatagctcaagcagtgtaactgtgacctatcagacaagagtgaattccgttccatctacg
ggtttggttagtaaccgggccaatgcagcatttacatcaggcagttttaatggtgtttct
tcttctatatcagtaaatacccccatatttctgccagtgatccaagtggtgaagtcagca
agtacaacaagtttgacggtaggcgatacgtttaattacaccattcaaattaacaataca
ggtaatatagctgcaacggttaccttgacagatcctattccagcaggagcagtattcagc
acaaatagtgtcattattaatggcgtgcctacaccaggcgttagccccgtagcaggaatt
aatttggggacgatcgctgcgggctcaggtgcaacggtcacctttgttgcgacggttacc
agtttgccagatgcaaggcagttaattaatcaggcggttgcttcgtttgcctacacgctt
ccaagtgggagaacgattgccggtctctcgtcatcgaacaccatcactattccagtgtct
ctgcccaatgttacgattgtcaacagtgacaatgtagagtacggcgtagtcggagatgtc
attcgatacacatctgttattcgtaataacggcacagtagccgttaataatgtggtatat
gtcaatcctcttccttcaaataccccatttgtacccggaagtgtcattgtgaacgggact
tcgttcccgctctccaatccgacagccggcattccaatcggtacgttggctccaggagcc
gaggttaccgtaacttttgaggtgacgattaccatgccgattccttcacagattaacaat
cagtcgacggtcagcttcacatccggttcattttcagggtcatcatcgtccaatacgact
cagactccagtcatacagccacagatctcacttgtcaaaacggcgaatacagttaatgca
actgtaggtgatacggttgtatatacggtgacggtgagcaatgcaggtaatctggaggca
aatgttacagcgacagataccattccagctgcgactactttagtagctaacagtgttgtg
gtatctggtgtaccccaacctggagcgacgccagcagctggcattccggtaggcattgta
gcagcgggggcaacggctgttgtcacctttgccgttgttgtggattcccttccatctccg
cagcagcttagcaattttgctacatcatcctttacatttacacctccagatgggcggacg
ttgactggctcagccacttcgaatacgctcacgttcccggtctcgtcaccaaacgtcgct
gttgtcaaaagcacagcttccactgcggctacggtaggcgatacagtgacctattccatt
ctggtgactaacagtggaattgcaccagtgaacaatattcagttttcggacccgattcca
gctggagcctcctttgttacaggtagtgtcacagtgaatggggttgcgcaacctggagcc
aatccggcaggtgggatatcccttgggacattggggcccggaacgtccgcaacggtcacg
ttcagtatccgtgtcgacgcgatcccgccaagcaatcagttgagcaatcgctctacggtc
agttttacctcaggtacattctcaagcacaaccttttcaaataccgtggtcactccggtg
taccagcctattctttcagcacaaaaaacagccagtacacaaaacgctaccgttggggat
acggtcagttacacgatcaccgtgagcaatcagggaaactatggagcccagattaacctg
acagataaccttccagccggaaccatccttgttccaaatagcgttattgtgaacggtcaa
ccgctgccagcaggaagtccggcaaccggcatccccgcaggcaatgtggctcccggagct
acgaccaccattaccttttcagtagttgttgatacgctgccaagtccgcaacaactggtg
aatcaggctacggtagctctatcatatacattgccggatgggcggaacatcacggggtct
gttctatccaatgtgctgaccattaccgtatcggcaccggatgtcgatgtcgtcaaatcc
acaacttcgacggcggtatctgttggtgatgtcgtaacgtatagcatcgctgtaaccaat
aacggaattgcaacggtgaacaatgtggttttcacggatgcagtgccgacaagtaccgtt
cttgcgccaaccggcgtgtttgtcgatggtgttctgcgccctggtgccaatccttctacg
ggaataacgcttggttccatcgcacctggcgttacggtaaccgttgtatttagtgtgcag
gttacggcgctcccggcaagtgcagtgttaaacaatcagtccacggtcagctttacatca
ggtgttttctcagcgaccacattctccaatacggttacaactccggtctatcaacctatt
ctgtcggcagtcaaaacgggagatcagacgatagcaacggtaggggataccgttgtgtac
agcatcgccatctccaatgccgggaactatggggcatccgtcacgttgaccgataccatt
ccagctggaacagagcttgttccaaatagcgttattattaacggggcttctgcaccaggt
gcagatccagcttcgggtattccgcttggtgtcgtttccacaacaactctagttaccttc
tccgttgtgattgtgacgttacctttgagccagtccatcaccaatcaggcttctgctaca
ttttcgtacacattacctgatggaagaacacttggaggcacgattacgtccaacgcactc
aacattcaagtatctgctccgaatgtcagcgttgtgaagaccactccggtgattgatgct
gtggtgggcgatacgattgtatatgagatggttgtgaccaatgaaggaattgacccggta
aacaacattgtgatcaccgatccgattaacccagccaccacatttgttacaggcagtgtt
ctggtggacggcgtcccacgtgccttggccaaccctgcgctgggcatagctcttggtagt
ttggcgcctggagcatcgatagcggtatcgtatgcagttcgggtcaatacactgccaaca
ccaccacaagtgagcagtcagtcttccgtaagtttcacatcgggtgttttctcgggagca
gcgtattccaatacagttgtaacgccaatctatcagccgattattgccgtaaccaaaaca
gggagcacttccaatgcaacgattggtgacaccatcacctattcttttgccattaacaat
agcgggaatcttgatgcaattttgacattaacggacaatataccgaatggagccgtactg
cttcccaacagtgttctgattgatggtgttccacagccaggtgccaatccggagacgggt
atcgctgtgggtaccataccgtccggaggtacggttattgtaacggttaccctcgaagtg
actgtagatacgttgccgcaggatcagcaactggttaaccaggcggtggccaactataca
tttagtccacccgatggccgtctgttgacggggaccgtatcttcgaatgttctggttatc
ccggtatctgcaccaaatgttgttgttgccaaaagcacaagtgccattgatgctgttgtt
ggtgatgtaatcacctatacggttgtagtaaccaatagcggcattgaagtggtgaataat
gtggtcatggttgacccggtacctgtcggtacagtatttgtgccaggaagtgttacggtg
gatggtgtgccaagaccaacagggaatccgaatacaggcatcacgcttggttcgattgct
gcgggtgcttccgttacggttacattcagagtagaggttgtggtgatatga
DBGET
integrated database retrieval system