Pseudoalteromonas sp. Xi13: EJ103_02940
Help
Entry
EJ103_02940 CDS
T10490
Name
(GenBank) alpha-amylase
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
pxsi Pseudoalteromonas sp. Xi13
Pathway
pxsi00500
Starch and sucrose metabolism
pxsi01100
Metabolic pathways
pxsi01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pxsi00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EJ103_02940
Enzymes [BR:
pxsi01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
EJ103_02940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase_C
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZN31741
LinkDB
All DBs
Position
1:662380..664386
Genome browser
AA seq
668 aa
AA seq
DB search
MKLNKMITTAGLSLGLTLPSLVSAAPTTFVHLFEWNWQDVAQECEQFLGPKGYAAVQVSP
PNEHITGSQWWTRYQPVSYQLQSRGGNRSQFIDMVNRCNAAGVDIYVDTLINHMAAGSGT
GTAGNTFGNKQYPIYSPQDFHESCSINPEDYGNNRYRVQNCELVGLADLNTSSNYVQNIL
AAYINDLQAMGVKGFRFDAAKHVAASDIQSLMAKINGSPVVFHEVIDQGTEAVAASEYLS
TGLVTEFKYSTQLGNTFRNGSLAWLSNFGEGWGFMPSSSAVVFVDNHDNQRGHGGAGNVI
TFEDGRLYDLANVFMLAYPYGYPKVMSSYDFHGDTDAGGPSVPVHNNGNLECFASNWKCE
HRWSYIAGGVDFRNNTADNWVVTNWWDNTHNQIAFGRGSSGHMAINKEDSTLNATIQTDM
APGQYCNVLKGELLGNATSCSGEVITVNSNGTINLNVAPWDAIAIHKNAKLTQEAVPNNS
DWQRTVIFINAQTQSGQDMFVRGGIDHTYANTNLARNCQTTNVECAMPIRHNNLKNNTTT
PWKANDNYLDWYGIEQGQSSEAQGTAMDWTTNVWPSEYGAQKSVAVDGFGVTPLNIWGEH
YWMLDVDMDCSKAVNGWFELKAFIKNGQEWEGDISQANTPYTSTNHMAQCGKINMFEFNR
SSVEVRDF
NT seq
2007 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactgaataaaatgatcaccactgcaggtcttagcttaggtttaaccttaccaagt
ttagtatcggctgcgcctacaacatttgtgcatttatttgaatggaattggcaagatgta
gcccaagaatgtgagcagtttttaggaccaaaagggtacgctgctgtacaggtgtctccg
cctaacgagcatattacaggtagccaatggtggactcgctatcaacctgtgagctaccaa
ctacaaagccgaggcggtaaccgttcgcaatttatagatatggttaatcgctgtaacgcc
gcaggcgtcgatatatatgttgatacattaataaaccatatggcagccggcagtggtacg
ggcactgctggtaacacttttggtaataaacaataccctatttatagcccacaagatttt
cacgaaagttgctctattaacccagaagattacggtaataaccgttatcgcgtgcaaaac
tgtgagctagtagggctggccgatttaaacacttcttcaaattatgtgcaaaatatatta
gcggcatatattaatgatcttcaagctatgggtgttaaaggttttaggtttgatgctgct
aaacatgttgctgcaagtgatattcaaagtttaatggcaaaaataaatggctcgccagtg
gtgtttcatgaggtgatagatcaaggtactgaagcggttgcagcctcagagtatttaagt
acagggctagttaccgagtttaaatacagtacgcagcttggtaatacctttagaaatggc
tcgcttgcatggttaagtaattttggtgaaggctggggctttatgccaagttcatcagct
gtggtatttgtagataaccacgacaatcagcgcggccatggtggtgcaggtaatgtaatc
acctttgaagatggccgtttatacgacctagccaacgtatttatgttggcatacccgtat
gggtatccaaaagtaatgtcgagttatgattttcacggcgatacagatgcgggtgggcca
agtgtaccggtgcacaataatggtaatttagaatgttttgcaagtaactggaagtgtgag
catcgttggtcttatattgcgggtggtgtcgattttagaaataacacagccgacaactgg
gtagtaacaaattggtgggataacacccataaccagattgcatttggacgtggtagctca
ggtcatatggcaattaataaagaagactcaacgcttaatgcaacaattcaaacagatatg
gcgcctggacagtactgcaatgtgttaaaaggcgagcttttgggtaatgctactagctgt
agcggtgaagtaataacagttaatagcaacggcaccatcaatttaaatgtagcgccatgg
gatgcaatagcaattcataaaaatgctaaattaacccaagaggcagtgcctaataatagc
gactggcaaagaaccgttatttttattaatgctcaaacacaaagcggacaagacatgttt
gtacgcggtggtatagatcacacctatgcaaatacaaaccttgctagaaactgccaaaca
acaaatgttgaatgtgctatgccaattcgccataacaatctaaaaaacaataccacaacg
ccttggaaagcaaacgataactacctagattggtatggaattgaacaaggccaaagcagt
gaagcgcaaggtactgccatggattggactacaaatgtttggccaagtgaatatggcgcc
caaaaatcggtagcagtagatggctttggtgttacaccccttaatatatggggcgaacac
tattggatgcttgatgttgatatggattgcagtaaagccgttaacggatggtttgaatta
aaagcatttataaaaaatggccaagagtgggaaggcgatataagccaagcaaataccccc
tatacaagtactaaccatatggcacagtgcggcaaaattaatatgtttgaatttaaccgc
tcaagtgtagaggtacgtgacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
