Pseudoalteromonas sp. Xi13: EJ103_05760
Help
Entry
EJ103_05760 CDS
T10490
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
pxsi Pseudoalteromonas sp. Xi13
Brite
Transporters [BR:
pxsi02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EJ103_05760
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZN32267
LinkDB
All DBs
Position
1:1280027..1283701
Genome browser
AA seq
1224 aa
AA seq
DB search
MSVFKKISAAVIGVLITLAVIIFCLLFTAPGNQFIAYSANKMVHGLHIEIKKGRFLYNNP
FNVSFKNQSTDFKAQQLKIDLFWWQCDGLCIENVSARSIKLALGNAPEATQQSTSEPLAE
ITFPFNIAVKNVAINEFVLNHPSADVTVNNFTLAAKAEDATLALKSLTISDVLVKLKEQP
ASSNQATANQGQALPALPDIEFTSPLNLRVEQFDVKKVDIEQGEQTHTIENIALVLNVED
EKVNLQTLSAQYQQWQLNTELTSELAGNLPLNAKVALNSDLHQANLALSGDLSDLNINLH
TTGQYPLNLTATANLKQKNYPFELTGKVEQWLIDAQSNELKVNNVDLSASGNADDYTLSL
KAHSQLGAYPAVVLNTQLNGSLSQAQLSTLSLKANDSSAILKGNINWQKGIQADFTGSLN
SLKAQYLTDALTSNISGQLEGRFNSEGQNWHLQMDNTQLAGTLNQTPLEFASNFTLNNTL
KANIDSLYLSSGANKLTLSGQVDDTWQVDGKVTLTGNEQTNLPFVANGKADLKVRGPRLT
PAVDLSLLLDNFMYNDINVNKLALKGQLDTAADWQTDVSLNVGSAIVADQVINSVELTAT
GDKTDHQLVAAIDAEQGAAELEVTGKLNNDVWNGSLSNITLSDKKLSFSNSKKIAVMFNT
QTSDFDVSAHCWRSNKSELCINTLAQTKNLGQFNATLSNLALEELKHFLPDNMRTRGDIS
GDFAANWNEGALKTLRANLNAHDLVAVLTSEEDRFRLPIETLKVSAYTDSQTGKLEAELR
SSVLGKIATDINIDDIQNQQTLNGHLNIDKILLSDLHPFLETLEQLKGDITGNVAVAGTL
QDPLLNGELNVSDINLEGEQLPVVLQKSNVNILFDKTTATIKGNLNDTQGGKINLTGDID
WQGAQPEVNVGVNGEQFFVRAQQGVTFKVSPDLTIGLANNALKLSGEVIVPYGRVMIEEL
PEGAVQVSDDEIIVDQQTETAENVPFDYDVNLKVIVKNDVKIESFGLESKIAGDLAIKMS
QGAPIIATGELNLIDGTYLAFGQDLIISTGQIGFSGSIEQPFLNIKAIRNPDTTANDVVA
GVTLTGNVEQPTLKVFSEPAMDQAQALAYLLNGQPLGEGDSSSDAMLTQLLLSQGVSRSE
GVVSKVGETIGLSDVSLSSTGSGDNTKLEISGYVAPSLQVKYSVGVFDSLSEVAIRYQLL
SQFYVEITSGLNQNVDLLYKFDWD
NT seq
3675 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtatttaaaaaaatatccgccgccgtcatcggcgttttaatcacgcttgccgtt
attatattttgcttgttatttactgcgcccggtaatcaatttattgcttatagtgccaat
aaaatggtgcacggcttacatatcgagattaaaaaagggcgctttttatataacaacccg
tttaatgtgagttttaaaaaccaaagtacagattttaaagcgcagcagcttaaaatagat
ttattttggtggcagtgcgatggcctatgtattgaaaatgtaagtgcgcggtcaatcaaa
ctagcccttggcaatgcacccgaagccacacaacagagcacctcagagccattagctgaa
attacgtttccctttaatattgccgttaaaaatgtagcaataaacgaatttgtattaaat
catccaagtgctgatgtaaccgtaaataactttacccttgcagcgaaagctgaagatgca
accttagcactaaaaagcctaactattagtgatgtattggtaaagcttaaagagcaaccc
gcctcatctaatcaagcaacggctaatcaaggccaagcgctacctgcgttaccagatata
gaatttacatcgccccttaatttacgggtagagcagtttgacgttaaaaaggtagatatt
gagcaaggtgagcaaactcacacaatcgaaaatatagcgcttgtattaaatgtagaagat
gaaaaagttaacttacaaacgcttagcgcgcagtatcaacaatggcaattaaatacagag
ttaactagtgagcttgcaggtaacttaccattaaacgctaaagtagcgctaaacagcgac
ttgcaccaagcgaatttagcgttaagtggtgatctatctgatttaaatataaatttacac
acgactggtcagtacccattaaatttaacggcaacggctaatttaaaacaaaaaaattat
ccgtttgaacttaccggtaaagttgagcaatggttgattgacgctcaaagtaacgagcta
aaagtaaataatgttgatttatcagcttcgggtaatgcggatgattacacactaagttta
aaagcgcatagccaattaggtgcctatccagctgtagtattaaacacgcaattaaacggc
tcgcttagccaagcgcagttaagtaccttaagcctaaaagcaaacgacagtagtgcaata
ttaaaaggtaatattaattggcaaaagggcatacaagccgattttaccggttcgttaaat
agcttaaaagcacaatacttaacagatgcgcttacaagtaatatttctggccagctagaa
gggcgctttaacagcgaagggcaaaactggcacttgcaaatggataatacacaacttgca
ggtacactgaaccaaacaccgcttgaatttgcctcaaactttacacttaacaatacgcta
aaagccaacatagacagcctgtatttaagtagcggtgccaataaattaaccttgagcggg
caagttgacgacacctggcaggttgacggaaaagtaacactgacaggaaatgagcaaact
aatctgccattcgttgcaaacggtaaggccgatttaaaagttagaggaccccgtttaacc
cctgccgttgatttatcgttattactcgataactttatgtataacgacataaacgttaac
aaactcgcccttaaaggtcagctcgatacagccgcagattggcaaaccgatgtgagctta
aacgtaggctcagcaatagtcgctgatcaggtaattaatagtgttgagctaactgccact
ggcgataaaaccgaccatcagctggttgccgccatagatgcagagcaaggcgctgctgag
cttgaagtaaccggtaagctcaataatgacgtatggaatggctcgctcagtaatataacg
ctaagtgacaaaaagctcagctttagtaatagtaaaaaaattgcggtgatgtttaatacc
caaaccagcgattttgatgtgagtgcgcattgctggcgctcaaacaaaagtgagctatgt
attaatacccttgcgcaaactaaaaacttgggccaatttaatgctacgttgagcaattta
gcgcttgaagagcttaaacactttttaccagataacatgcgtacgcgtggcgatataagc
ggcgactttgctgcaaattggaacgagggcgcattaaaaacacttcgcgctaatttaaat
gcgcacgaccttgttgctgttcttacctcagaggaagaccggtttagattacccatcgaa
acgctaaaagtcagtgcctacactgattctcaaacgggtaagctagaggccgagttacgc
tcaagtgtgctaggtaaaatagccaccgacattaatattgatgatattcaaaatcagcaa
acattaaacggtcaccttaatatagataaaatattgctatcagacttacatccatttctc
gaaacccttgagcaattaaaaggcgatataacaggaaacgtggcagtagccggcactttg
caagaccctctattaaatggtgagctaaatgtcagtgatatcaatttagaaggtgagcag
ttgccggtggtattgcaaaaatctaatgtaaatattttatttgataaaaccaccgccaca
attaaaggtaatttaaacgacacccaaggcggtaaaatcaacctaaccggcgacatagat
tggcaaggcgcccagcctgaggtaaatgtaggcgttaacggcgagcagttttttgtacgc
gcgcagcaaggcgtgacgtttaaagtatcgcctgatttaactattggacttgcaaataat
gcattaaagctgtctggcgaagtgattgtgccttatggcagggtaatgattgaagagctg
ccagagggcgccgttcaagtaagtgacgatgagattattgttgatcaacaaactgaaacg
gcagaaaacgtgccgtttgattacgatgtaaatttaaaagtgattgttaaaaacgatgta
aaaatagaatcgtttggtcttgagtcgaaaatagcgggcgatttagccatcaaaatgagc
caaggtgcccctataattgccaccggcgagctaaatttaatcgatggtacgtatttagct
tttggccaagatttaattattagtactgggcaaataggctttagtggctcaattgagcaa
ccatttttaaatattaaagccatacgtaatccagacaccacagcaaacgatgttgtggct
ggtgttacgcttactggtaacgttgagcaacctaccttaaaagtgttttctgagccggca
atggatcaagcacaagcgctggcctatttactcaatgggcagccgctaggcgagggcgac
agttcaagcgatgctatgcttactcagttattgctctcacaaggggtgagccgcagtgaa
ggcgttgtatctaaagttggcgaaaccattggtttatctgatgtaagcttaagttcaacg
ggctctggcgataacactaaacttgaaatatcgggctatgtagcgcctagcttacaagtt
aaatacagcgtaggggtatttgactcgctcagcgaggtcgctattcgctatcagctgctt
tcgcagttttatgtagagatcaccagtggtttaaatcaaaatgttgatttactctataag
tttgattgggactaa
DBGET
integrated database retrieval system
