Plasmodium yoelii: PY17X_0110800
Help
Entry
PY17X_0110800 CDS
T01035
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K15172
transcription elongation factor SPT5
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Pathway
pyo03250
Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09125 Information processing in viruses
03250 Viral life cycle - HIV-1
PY17X_0110800
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pyo03021
]
PY17X_0110800
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pyo03019
]
PY17X_0110800
Transcription machinery [BR:
pyo03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Transcription elongation factors
PY17X_0110800
RNA polymerase I system
PY17X_0110800
Messenger RNA biogenesis [BR:
pyo03019
]
Eukaryotic type
mRNA processing factors
3' end processing
DRB sensitivity inducing factor (DSIF) complex
PY17X_0110800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spt5-NGN
KOW
KOW4_SPT5
KOW5_SPT5
KOW2_Spt5
SH3_KIN17_C
KOWx_SPT5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3830305
NCBI-ProteinID:
XP_731079
UniProt:
A0A078K591
Q7RJZ3
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(509911..513504)
Genome browser
AA seq
1197 aa
AA seq
DB search
MEKNSEEEEVGLFNEEGNMPHEKEQDEEDEDGEVKDGEVKDDEVKDDEEDEEGEEGEDEG
VKDSDEDISQSKKKRKKTNNTVSYIDNEADEEDDEYNDDDDDIDYEKITGNRTGNKKRKV
GKNKYVSTFLDTEAQVGDEEEEEEYASSYVDEFEEAKRLEKKKLYETKLKSGTNHLAQAI
NKLSQRYENEKDLKDGATDDETLTDEEMSEDEEYFDETEGLNAFDSPKMWLIKLFKNGAE
RHLAMGIYYKYMKLQSSEFNIKGIYVSDDLKGYIYIEADSLYMLKRFLLGFKFINLNDIS
IVPVQELTSIFAMSHSKVVIPKVNEYVRIKRGVYANDIGQIFEVHEKGIYAIVRLIPRIL
YDKYNNSKKDQYDNVGISTSVNKNNSTIHYDSTNNNLDQIYPLMDKMNTNNQMHNVNNAI
VPLSGEKLSAIDEALQIRRKKKKERPLKKLFDRDEIEQIGGVIEHGPYPGTIKYQNNIFE
ENGYLLKKMNIKYLISENANITLTEIRDFNKNNTNEEDINLHISKSFINKNSLHLFKKGE
RVKIMKGELFNLIGTITNINENVLSVNPDNLAKEFKFLPTDVTKYFTEGDNVTVINGLHK
GKSGLISLLDYKENIALIFSPSLNTEFRSSIQDLTGTISSSSNTVEGLGGVNTLNGFSIG
DLIELNDRQIGVLTYIDKNKHIRVLTNSNKILHTTIGSITYKRSAIGQICKDENGNIIQS
KDTIQLIKGAHKNKTAIVSYIWKNKIFAKINKKIEDNGFVVVDCENCLLSGNVNEKKKII
TQHNLFRNNNMQRKNTFQSFIGKTVKILSGVYKGLLADVIDAERDEFTLLLKIKPKTIRQ
KRIECAIADAYKDDKLFDDKNTEKKKDGINKTNDTYFKGKFNYESKYDKNKTLEEDEERR
KTSFNLPFYNDVNEYKNYDKKKNDRKYEKNYNDGYNSYSSHTNKSNYYDDEKKKKKHDNS
NKKYHQYDEHENNNWKYSSHNKIHENDTYHNNSNDKNYKSGENMDDYYTSNKNGNTEQRN
VNRFHNEKDKKYEKKKTSPTNSEYKKNDNLHEYHQTESQNNLNKINNENNFYKNQTDEKK
NQNNKGNSDWIISGVIIKIVTPGLFYNEIGRISEVIKKGSYIILKIETDKTSFNIVSEAV
IPLKPSKPNDEVIAILDGGKISQGTVIDILNDNKVEISTINGNINCDMQHVFLYKKV
NT seq
3594 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaaatagcgaagaagaagaggttggactttttaacgaggaagggaatatgcca
catgaaaaagaacaagacgaagaagatgaagatggcgaagtaaaagatggcgaagtaaaa
gatgatgaagtaaaagatgatgaagaagatgaagaaggtgaagaaggtgaagatgaagga
gtaaaagatagtgacgaagatatatctcaatcgaaaaaaaaacgaaaaaaaacaaataat
acagtatcctatatagataatgaagcagatgaagaagatgatgaatataacgatgacgat
gatgatattgactatgaaaaaataactggaaatagaacagggaacaaaaaaagaaaagta
ggaaaaaataaatatgtttctacatttttagatacagaagcacaagtaggagatgaagaa
gaagaagaagaatatgcaagttcatatgtagacgaatttgaagaagctaaaagattagaa
aaaaaaaaattatatgaaaccaaattaaaaagtggaacaaatcatttagctcaagcaatt
aataaattatcacaaagatatgaaaatgaaaaagatctaaaagatggtgcaacagatgat
gaaactttaacagatgaagaaatgtcagaagatgaagaatattttgatgaaactgaaggt
ttaaatgcttttgatagccctaaaatgtggttaatcaaattatttaaaaatggtgctgaa
agacatctagctatgggcatatattataaatatatgaaactacaatctagcgagtttaat
attaaaggtatatatgtatctgatgatttaaagggttatatatatatagaagctgatagt
ttatatatgttaaaaagatttcttttagggtttaaatttattaatttaaatgatatttct
attgttccagtacaagaattgacatctatatttgctatgtcacattctaaagtggttata
ccaaaagttaatgaatatgtaagaataaaaaggggtgtatatgcaaatgatattggtcaa
atttttgaagttcatgaaaaaggaatatatgctattgttcgtttaataccgagaatatta
tatgataaatataataactcaaaaaaagatcaatatgacaatgtaggtatatccacatct
gttaataaaaataattctactattcattatgatagtacaaataataatttggatcaaata
tatccattaatggataaaatgaatacaaacaatcaaatgcataatgtaaataatgcaatt
gttcctttatcgggtgaaaaattaagtgctatagatgaagcattacaaattcgaagaaaa
aaaaaaaaagaaagaccccttaaaaaattatttgatagagatgaaatcgaacaaatagga
ggagtaattgaacatggaccatatcctggaactattaaatatcaaaataatatatttgaa
gaaaatggatatttattaaaaaaaatgaatataaaatatttaattagcgaaaatgcaaat
ataacattaacagaaatacgagactttaacaaaaataatacaaatgaagaagatataaat
ttacatataagtaaatcttttataaataaaaattctttacatttatttaaaaaaggagaa
agagtaaaaattatgaaaggtgaattatttaatttaataggtacaataactaatattaat
gaaaatgtattaagtgtgaatccagataatttagctaaagaatttaaatttttgccaaca
gatgtaaccaaatattttacagaaggagataatgtaactgttataaatggtttacataaa
ggtaaaagtgggttaatatctttattagattataaagaaaatattgctcttatattttca
ccttcattaaatacagagtttcggtcatcaatacaagatttgacaggaacaatcagcagt
agtagtaatactgttgaaggtttaggaggtgttaatactttaaatggtttctcaatcgga
gatttaatagaattaaatgatagacaaattggtgtattaacatatatagataaaaataag
catattcgtgtattaacaaatagtaataaaattttacacacaaccataggatcaattaca
tataaaagatctgctattgggcaaatatgtaaagatgaaaatgggaatattattcaatca
aaagatactatacaattaattaaaggtgcacataaaaataaaacagcaattgttagttat
atatggaaaaataaaatttttgcaaaaataaataaaaaaattgaagataatggttttgta
gttgttgattgtgaaaattgtttacttagtggaaatgttaatgaaaaaaaaaaaataata
acacaacataatttattcagaaataataatatgcaaagaaaaaatacttttcaatcattt
attggaaaaacagttaaaatattatcaggggtatataaaggtcttttagcagatgttata
gatgctgaaagagatgaatttaccttacttttaaaaattaaacccaaaactatacgacaa
aaaagaatagaatgtgcaatagcagatgcatataaagatgataaactttttgatgataaa
aatacagaaaagaaaaaagatggtataaataaaacaaatgatacttattttaaaggaaaa
tttaattatgaatcaaaatatgataaaaataaaactttggaagaagatgaagaaagaaga
aaaacgagttttaatctaccattttataatgatgttaatgaatataaaaattatgataaa
aaaaaaaatgacagaaaatatgaaaaaaattacaatgatggatataatagctattctagt
catacaaataaatctaattattatgatgatgaaaaaaaaaaaaaaaaacatgataattca
aataaaaaatatcatcagtatgatgaacatgaaaataataattggaaatattcttcacat
aataaaatacatgaaaatgatacatatcataataattctaatgataaaaattataaaagt
ggagaaaatatggatgattattatacatcaaataaaaatggaaatactgaacaaagaaat
gttaatcgatttcataacgaaaaagataaaaaatatgaaaaaaaaaaaacaagtccaacc
aattcagaatataaaaaaaatgataatttacatgaatatcatcaaacagaaagtcaaaat
aatcttaacaaaataaataatgaaaataatttttataaaaatcaaacagatgaaaaaaaa
aatcaaaataataaaggaaactcagattggataatatcaggtgtaattataaaaattgta
acacctggattattttataatgaaataggaagaatatcagaagttatcaaaaaaggttca
tatattatactcaaaattgaaacagataaaacatcttttaacatcgtttcagaagctgtg
attccattgaaacctagtaagccaaacgatgaagttattgccattttagatggagggaaa
attagtcaagggactgttattgatatattaaatgataataaagtggagatttccactata
aatggaaatataaactgcgacatgcaacatgtttttttgtataaaaaggtgtga
DBGET
integrated database retrieval system
