Plasmodium yoelii: PY17X_0419100
Help
Entry
PY17X_0419100 CDS
T01035
Name
(RefSeq) nucleoporin NUP221, putative
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3790831
NCBI-ProteinID:
XP_022811592
UniProt:
A0A4V0KGU4
LinkDB
All DBs
Position
4:join(822660..828317,828420..828650,828868..828990)
Genome browser
AA seq
2003 aa
AA seq
DB search
MYMQNSSSNNVFGSYNNQGNNLNKGLFGNAGNPSSLTNTNTSNLFGGSKPQQTNNMMVNK
NLFSMGTTTSGLDGNKSIYDSMNNQSNLGNKNLFGTSTVNNNSMQSGGGMVRNNLFMNTN
NQNNLNMKNIFDSGSNLNNAQGTNLSNKGLFGGLQQNNQSSSGGNLFGNLSSQTNSGSIY
SGLSSGANQNKGTGLFGTSGNTNQVSSTSSLFGGTSTMGQNKLGGVFGNLQSTDQNAQNS
GNTTNSLFGGMSGNQLKPMSTGSNLFGGMSTNTTTNTGTSNLFGNNNAASGMNQNKPGGF
FGNLQGSNQGTTGSSMFGNSSNAASGMSQNKPGGFFGNLQGSNQGTTGSSMFGGMSSGMN
QNKPGGLLGNLQSPNQGTTGTTTSSSIFGNSASGMNQNRGTTLFSGMSNTGTSTTNTTNN
LFGGTSTMGQNKLGGVFGNLQSTDQNAQNSGNTTNSLFGGMSGNQLKPMSTGSNLFGGMS
TNTTTNTGTSNLFGNNNAASGMNQNKPSSNIFGSLSSTTQPTGTTTSGSSTTGNIFGSTQ
TANQGMGSNVFGSSMGMNQNKFGNIFGGTNTNQSSTMSSTFGNTGLGTSGISSTSALGSG
TNTSTGLGGGLGISSSGIGGTGTNTGMNISNLTNTTGGTTTGISTSSGSSNLFGGLSSTS
NTNTMSLGDNKNLFGSKPGFSLGTGTNISGQSSTNLGLGTNLGSGLLSPSMNTTTSSVLG
TNLGSSSTGSTNLLTGLTGGIGSSSTLGLGTTTSPTIGLSSSSSNILGSTNNVLNNTSLS
SNLLSSGSGMNQTGISFLGDKNLIGGNQGNMQNNLLTVDGKDKGNDLLTNKLNINKESSE
NLIKTTKFDDDLIISKKKEDIFNKAYDDENDISNDEMNLIKNQDGTFYNYINLIINDNIN
DIQKTTFSLLNDHDSLMWDNFKSSIFKNFVDYLVNFKQKKNQKIIKSNVLDLDQHEFQIL
IWLYNINSYKIDFIPFKSFYYLLLSDTNLNYSKMFISNSDKSILPRNFVEINDHYYMNYK
SYFLKSQINKHHDNYSTLNRDGIGNSSNGGVSGNSISIGMNNSVLDIDSIYKQILKDILN
SLLNMNLSITKENIKKKEKEEYYENGDINNKNNGNCGSSYIYENLLLNYLFGTLQHLHDK
FYKLEISNYLSKDLNQIDEYFVDTKSNEIFSYCYDNFYKNEMDKENCTIHFFFYLVNIMF
RCGNYIGLIQIIKNDEFIKNLNIDSYLNDFIILLIRILLLIYNQSNEISIFENMKIDIDC
SDIFKKKIHMSNLINFFHSILYLCSNNIYAYDLLCILFSDIFYKKGNMYTNREKKIEMKN
IFYYVQKKKRNSNYVDNNSDRNSSNEDNYDSGGDNNNIGRGSNSTNINKGGKGKGNERKG
FFLDVFTNMLHKSKKSKDDEDEPFGTMEINEEIEKLNRESMNTSNTEMLGITNKYSYNFE
YCNIETSIWIELSLFLSKNFDLYGSKFQENFDILDTNLSYYNYDDDNNAFLNDTKHRRDM
INSKIEELFISISNCIINENREYFSVCSKLRVDDVINNFIIVDGKISEKVKSNVFKVLRT
NFLLYIKLFYYLLLVGNIYVTVGFLSCISNNIQRILLVLTIFLHKNNVFENSKLNNIKIK
TLGFLKLKTDNSTILYNSKDINDNVSTGSDNMNLILLSMNNIDIPFDYFLLRNNNINILL
KASYLLNLKTNISIKLLKSIVQENQGILLNESIIGHINNDGNIFYGKLHDFLFLFKNKVK
SRRNIKCFFLMYYVLYKKKFYNSNILRKIRKDIDNEYHYKCRNFKFVQNKNINTLNKISL
DNSIINVHSSILYKISQFYSILAYFANQRKNYIVSFICYYILNDEQSAINSLLRIYNDEL
IYYYFNNEKEYGYIRKCAFRFYHLAKNMWPSNVKLESIEQKSYLILSILFMKKKMFEEAF
AIFSLALIPDNMLEKLSTADYYNIDLSSNFLVTLRELCKKNYKISELVDQSMVRSVIKFL
LPIKDKLDAQVVESINYLGSLSF
NT seq
6012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatatgcaaaattcatcgtcaaataatgtttttggatcatacaataaccaagggaat
aatttaaataaaggtttattcggaaatgcaggaaacccatctagtttaacaaatacaaac
acctccaatttatttgggggatcgaaaccacagcagacaaacaatatgatggtaaataaa
aatttatttagtatgggaacgactacaagtggattagatggaaataaaagtatatatgat
agtatgaataatcaatcgaatttaggtaataaaaatttatttggtacatcaactgtaaat
aataatagtatgcaaagcggaggaggtatggttaggaataatttatttatgaatacaaat
aatcaaaataatttaaatatgaaaaatatttttgatagtggttcgaatttaaataatgca
caagggaccaatttaagtaataaaggactttttggaggtttacaacaaaacaatcaaagt
tcatcaggtgggaatttatttggtaacttatcttctcaaacaaattcaggaagtatatat
agtggcttatcatctggagcaaatcaaaataaaggtactggactatttggtacttctgga
aatacaaatcaagtatcatcaacaagcagtttatttggggggacttcaactatgggtcaa
aataaattaggtggagtatttggtaatttacaatcaacagatcaaaatgctcaaaatagt
gggaatactactaatagtttatttggtggcatgtcaggaaatcaattaaagcctatgagt
acaggtagtaatctttttgggggtatgtcaacaaatactacaacaaatactggaacaagt
aatttatttggaaataataatgctgcttcaggaatgaatcaaaataagcctggtgggttt
tttggaaatttacaagggtcaaatcaagggactactggtagtagcatgtttggaaattct
agtaatgctgcttcaggaatgagtcaaaataagcctggtggtttttttggaaatttacaa
gggtcaaatcaagggactactggtagtagtatgtttggtggtatgagctctggtatgaat
caaaacaagcctggtggacttttaggaaatttacaaagcccaaatcaaggaactacaggt
actactacgagtagtagtatatttggtaattctgcttctggaatgaatcaaaatagagga
actacattattttctggtatgtctaataccggtacaagtactactaatacgacaaataat
ttatttgggggtacttcaactatgggtcaaaataaattaggcggggtatttggtaattta
caatcaacagatcaaaatgctcaaaatagtgggaatactactaatagtttatttggtggc
atgtcaggaaatcaattaaagcctatgagtacaggtagtaatctttttgggggtatgtca
acaaatactacaacaaatactggaacaagtaatttatttggaaataataatgctgcttca
ggaatgaatcaaaataagccaagtagtaacatatttggatcattgtcatcaacaacccaa
ccaactggtacgactacaagtggtagtagtactactggtaatatatttggtagtacacaa
acagcaaatcaaggtatgggaagtaatgtttttggatcatccatgggaatgaatcaaaat
aaatttggtaatatttttggaggaacaaatactaatcaaagcagtacaatgagtagtaca
tttggaaatactggacttggaacatcaggaatatcatcaacttcagctttagggtctggt
acaaatacttcaactgggttaggaggtggattaggaatatcaagtagtggtataggaggg
acagggacaaatactggtatgaacatttccaatcttactaatactacaggtggtacaact
actggtatttctactagtagtggtagtagtaatttattcggaggtttaagttcaacttcg
aatacaaatacaatgtctttaggtgataataaaaatttatttggatctaaaccaggtttt
agtcttggtactggaactaatatttcagggcaaagtagtacaaatttaggtttgggaaca
aatttaggaagcgggttattaagcccaagtatgaatacaacgacaagtagtgtattaggt
acaaatcttggtagtagtagtactggaagtacaaatttattaactggtttaactgggggt
ataggaagtagtagtaccctaggacttggaacaacaacatcaccaactattggacttagt
agtagtagtagtaatattttaggtagtactaataatgtattaaataatactagtttaagt
tcgaatttattaagtagtggttctggtatgaaccagacaggaatatcatttttaggtgat
aaaaatttaataggggggaatcaaggaaatatgcaaaacaatttattaacagtagatggg
aaagataaaggtaatgatttgttaacaaataaattgaatataaataaagaaagtagtgaa
aatttgattaaaacaacaaaatttgatgatgatttaataattagtaaaaaaaaggaagat
atatttaataaggcatatgatgatgagaatgatattagtaatgatgaaatgaatttaata
aaaaatcaagatggtacattttataattatataaatttaataataaatgataatataaat
gatattcaaaaaacaacattttctttactaaatgatcatgattctttaatgtgggacaat
tttaaaagtagcatttttaagaattttgttgattatttagttaattttaaacaaaaaaaa
aatcaaaagattataaaaagtaatgtattagatttagaccaacatgaatttcaaattttg
atatggttatataatataaattcatataaaatagattttataccttttaaaagtttttac
tatttattgttaagtgatacaaacttaaattattctaagatgtttattagtaattctgat
aaaagtattttgcctagaaattttgttgaaattaatgatcattattatatgaattataaa
agttattttttaaaatctcaaataaataagcatcatgataattacagtacattgaataga
gatgggataggaaatagtagtaatggtggtgttagtggaaattcgatatcgattggtatg
aataactctgttttagatatcgattcaatatataaacagatattaaaagatatattaaat
agtttattaaatatgaacttgagtataactaaagagaatattaaaaaaaaagaaaaagaa
gaatattatgagaatggtgatataaataataaaaataatgggaattgtggaagtagttat
atatatgagaatttattattaaattatttatttggtacattacaacatttacatgacaaa
ttttataaacttgaaataagcaactatttatcaaaagatttgaatcagatagacgaatat
tttgttgataccaaatctaatgaaatattttcatattgttatgacaatttttataaaaat
gaaatggataaagaaaattgtactattcatttttttttttatcttgttaatattatgttt
agatgtggtaattatattggtttaatacagataataaagaatgatgaatttattaaaaat
ttaaacatagatagttatttaaatgattttattatattgttaataagaatattattatta
atatataaccaaagtaatgaaataagtatatttgaaaatatgaaaatagatatagattgt
agtgatatttttaagaaaaaaattcacatgtctaatttaattaatttttttcattcgatt
ctttatttatgttcaaataatatatatgcatatgatttgctttgtatattattttcggac
atattttacaagaagggaaatatgtatacaaatagagaaaaaaaaattgaaatgaaaaat
atattttattatgtacagaaaaaaaaaagaaatagtaattatgttgataataatagtgat
cgaaatagtagtaatgaagataactatgatagtggaggagataataataatattggtcga
ggtagtaatagtactaatattaataagggaggaaaaggtaaaggaaatgagcgtaaaggt
ttttttttagatgtctttacaaatatgttacataaatctaaaaaatcaaaagatgatgaa
gatgagccatttggaactatggaaataaatgaagaaattgaaaaactcaacagagaaagt
atgaatacaagtaatactgaaatgttaggtataactaataaatatagttataattttgaa
tactgtaatattgaaacaagtatatggatagaattaagcttatttttatcaaaaaatttt
gatctttatggtagtaaatttcaagaaaactttgatatccttgatacaaatttaagttat
tataattatgatgatgataacaatgcatttttaaatgatacaaaacatagacgagatatg
ataaatagtaaaatagaagaattatttatttctatttcaaattgtattataaatgagaat
agagaatatttttcagtgtgttcaaaattgcgtgttgatgatgttataaacaattttatt
attgttgatggaaaaatatcagaaaaggttaaaagtaatgtatttaaggttttgagaaca
aattttttattatatataaaactattttattatcttttattagtagggaatatatatgta
acagttgggtttctatcatgtatatcaaataacattcaaagaatattattggttttaact
atatttttgcataaaaataatgtttttgaaaatagcaaattaaataatataaaaataaaa
acattaggatttttaaaattaaaaactgataatagtacaattctttataattcaaaagat
attaatgataatgtttcaacaggttcagacaatatgaatttaatacttttaagtatgaat
aatatagatataccatttgactattttttgcttcgaaataataatataaatatattatta
aaagctagttatttacttaatttaaaaacaaatataagtattaaattattaaaaagcata
gtacaagaaaatcaaggaatattattaaatgagtcaataataggtcatattaacaatgat
ggaaatatattttatggaaaattacatgattttttatttttatttaaaaataaagtaaaa
agccgaagaaatataaaatgtttttttttgatgtattatgtattatataaaaaaaaattt
tataatagtaatattttgaggaaaattagaaaagatattgataatgagtatcattataaa
tgtagaaatttcaaatttgttcaaaataaaaatattaacacattgaataaaatatcttta
gataattcaattataaatgttcattcttcaattttgtataaaatatctcaattctattca
atattagcatattttgcaaatcaaagaaaaaattatatagtatcatttatatgttattat
atattaaatgatgagcaaagtgccataaattctttgttgagaatatacaatgacgagctt
atatattattattttaataacgagaaggaatatggatatattcgaaagtgtgcttttcga
ttttaccatttggcaaagaatatgtggccttcaaatgtgaagcttgagtcaatcgaacaa
aaatcatatttaattttgagcatcttatttatgaaaaaaaaaatgtttgaagaagcattt
gctattttttcactagctttaatacctgataatatgttagaaaagctttcaactgcagat
tattataacattgacttatcatcaaactttttagtaactttaagagaattatgtaaaaaa
aattacaagataagtgaattagttgatcaatcaatggttcgttcagttattaaatttttg
ttgcctattaaagacaaattagatgctcaagttgtggaaagtattaactatttaggatcc
ttaagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system