KEGG   Plasmodium yoelii: PY17X_0420800
Entry
PY17X_0420800     CDS       T01035                                 
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase DDX60, putative
  KO
K20103  ATP-dependent RNA helicase DDX60 [EC:5.6.2.7]
Organism
pyo  Plasmodium yoelii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pyo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pyo03019]
    PY17X_0420800
Enzymes [BR:pyo01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.7  DEAD-box RNA helicase
     PY17X_0420800
Messenger RNA biogenesis [BR:pyo03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Exosome cofactors
     PY17X_0420800
SSDB
Motif
Pfam: DEAD ResIII AAA_22 Helicase_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 3801309
NCBI-ProteinID: XP_022811598
UniProt: A0A077Y4T4
LinkDB
Position
4:join(899631..906449,906619..907059)
AA seq 2419 aa
MILANNVYKVPKLKDLKNLRIAENDSISRYSFVNKFEENELEDIENIINNKDISIDNKIE
LFYSKLNSSIHDIFRIIADYTSLYIINGEGLLIHVCMLLSKFYLFQNEEDQNILSFNNSL
NISSIIYYIEKVLRDFALCNSNFHIIFFNVFNLFFEKETKLFENYNILRNAFIIHCKKNL
IPYYIFDNWYNDNNYNIYIIKYKPLFMFVEDSSSFLYLFNKFYVSEVDEKNELDDNITLS
KEREVDEKTNNNNDKILDGEKNRKEYLKKKKIYDYYNEEIREISLCFYFLLINNILRDIK
SVLFFNVEIEKNTVNAFSINYKMINFKIVEKLNEESTLLFERNVYQNVDIKESIAYENSN
YTQINISQSIKDYDLLYNDEKNYSKEELELLELFSVNVKSDNINLKNVVLNVFYSKIKET
IIKGDEKKDFTFLAVKLIFMHNYLIEKLNMKNLNCIPDIDKMGKDYCSYNFIKSQIEGYV
LSYLNIYNLILKSLQGYMYCDILQNIRNTDILHFFNSSIIHNLISFISYKIRENIYVINY
EDFSFEDTDFFEKSFKNVVGNDDMPFFPINFEFLLNCTNLLPKNETNVVEGNDIENSKIE
NDNKIDENPIKNPNQCKNEISNDNKIFNVNLINIKNEFIENFFHIDNKSNEIERNTNDII
NENNKGQEIKYKVNYVDKCIEYDNEFFELCGLLHITQREEVYDIYRRYVKMSKNSRISKV
RKEDERNVLRGQQKEERRNAIIAKYFYISSLHHPIIISENHPWLKYYIYNIDKLYNYLKN
EENKKVINMRMKRIFEETFLKENTPSICDKKNKKIKNQQNYIKMFEVLDDISGDDSNLDN
DGENNKGKKGQKEKEEKKNIKGGNSNQLTRKDEILKRKELSNEKKIYEVDLERYNVLEAK
INKLSSNNNYSEMNTWSLDIISGFNRLVDVYNFNNVSNLIKNATLQLKVSMKVLSNMFDI
IMHTKLKNVKTNKQKSDAIRSVMLIYKLVNEIFNKFKEHLTEKDIVQLQTVLLSLGFRNS
SYNLFEEYIKIRVKQLEEENNNDVEEDKTGKNKKNVKGKEKTKLKGGAKGGKSKDEEKLG
LDKIKKKGREESNSEVGVKISDRKELKELYKYKIESVKTYSELKIDEDKEHEFQLYYMYY
LLDRTTGNIKDKRVLFTLDTWQYNILNLVDRRKSILVSCPTSSGKTFICYYVMDKVLRLN
NDSVVVYVAPNDTLALQVFHEVNGRFNTKSYSKYGENKLCSYLTDKYAQDKALEAQIVII
LPSVLENILLSYYSMGENTGLETKVSKFISRIEYIIFDEIHCIGDKEFYGPQIENIIHLT
TCPFLALSATIGNIKYFYDWLKNVMIKKGKNEKDLHLIKFYERFSDLVLYVYTNRNLHHL
NPLACYNYRDILYKGINKDFYCNPREIYEIIMLLFELARKKQFYDLVEFLEPSFYFKYTR
CINKKQFIYYMHSVKEMIIYLIQNKYITSSDYDMFIHMLLSNYLKNTDVSRGEKKEEETQ
NKKKEVEKREVAKEDDSSSDSDEENKQITSMQSTTKHLYKRKVQDDAPKEKLFQELYKNV
VLDEKYYLNKSNDLVKYTETVNVEQEYLDSGNLIELLKHLEDVNFLPCIVFNFERKELED
MTINLINELMRRQHDKYYGTDERAFNTKMENKLRQERYENLLKQREMLLKIKTVSRNQRL
EQNLDKDYLDMLNEDEIPEPPIDISEEYDGDFYFCNRKVYHNYVFEIEDLIKDAERAIEG
RKNKDILIEGLKRGIGLHYEVLPYKFTIIVESLFRLGYIKIIFSNKNLSLGINIPCKSII
FTGHTYELNSLLFKQTSGRAGRRGFDLYGNIIIWNINFKNLKRLITCPLQTLSGTYCVNF
TNICRSMLLYNCLKKYREMEEIAHRNKAIVNKPSKKKKKEETMSVAEKEEIFEKNRFINI
NYFSRVNGILSLFYNTLYYINAFHDENNKTLEDRESNSIVEDIKGGVNKTIKGDNASQNT
NNCDVICESDYLNFRKEEFLEYKEKDISSDFINRKYEYNELICEIIENKKKNKYISIFEN
QKNLKELSFMIKIHFLIYINILVEMEALDDDGNVINLTELSILLKKECDNNFLLTHLLRK
RIIHNLIGDDVFLSYSNSEVSLQKIIDCITFEKNYSRNAIVDDTSRGKFILLFILSHFIN
KIKENKIALTNILINYNNKSRNRLELFSHKYFPLLHTLPKSVQNHVNNLEKLILNNLINY
SIIIISKLKLWSRKKTYLLPYTQLYIFEEHPSSNLVDIFNNTNSEFINYYKEKVDDYNIR
SPFLAPLYKNDKFDNLCELLYTSLIDLDMKKNMIPDIMEDYVYFYKFENGLIKEEKACLK
NSYMIDYFLHGKYYVLRNKNKLGQYTWYIIDRFIDSLKNIENYLYEIKREKDFSNDVFYT
CLSSMKDILQKHFKSINSE
NT seq 7260 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattttagctaataatgtttataaagttcctaaactaaaagacctgaaaaacttgagg
atagcagaaaatgatagtataagtagatattcgttcgttaacaaatttgaggaaaatgaa
ttagaagatatagaaaacataataaataataaggatataagtatagataataaaatagag
ttgttttattccaagttaaacagtagtatacatgatatatttaggataatagcagattat
actagtttatatattataaatggggaaggtttattaattcatgtttgtatgttattatct
aagttttatttatttcaaaatgaagaagatcaaaatattcttagttttaataatagcttg
aatattagtagtataatatattatattgaaaaggtgttaagggattttgctttatgtaat
tcaaattttcatataatattttttaatgtttttaatttgttttttgaaaaagaaacaaaa
ttattcgaaaattataatatcttaagaaatgcatttataattcattgtaaaaaaaatttg
attccttattatatttttgataattggtataatgataataattataatatatacattata
aaatataaacctttatttatgtttgttgaagacagttcttcttttttatatttgtttaat
aaattttatgtaagcgaagttgatgaaaaaaatgaattagatgataatataacattatca
aaggaaagggaagttgacgaaaaaacgaataacaacaatgataaaattttagatggagaa
aaaaatcgtaaggaatatttgaaaaaaaaaaaaatatatgattactacaatgaagaaatt
agagaaatatcgctttgtttttattttcttttaattaacaatatattaagagatataaaa
tctgtgctttttttcaatgtggagattgagaagaatactgtgaatgccttttctataaat
tataagatgataaattttaaaatagttgagaaattaaatgaagaatcaacgttactattt
gaaagaaatgtgtatcaaaatgttgatattaaagaaagtatagcttatgagaatagtaat
tatacacagataaatatatcacaaagtataaaggattatgatttgttgtataatgatgaa
aaaaattatagtaaagaagaattagaactgcttgaattattttcagtaaatgtgaaatca
gataacattaatttgaaaaatgtggtattaaatgtgttttactccaaaattaaagaaaca
attataaagggtgatgagaaaaaggattttacatttttagctgtgaaacttatatttatg
cataattatttaatagaaaaattaaatatgaaaaatttaaattgtatacctgatatagac
aaaatgggtaaagattattgcagttataattttataaaatcacaaatagagggatatgta
ttatcttatttaaatatttataatttaatattgaaaagtttacaaggatatatgtattgt
gatattttgcaaaatattagaaatacagatatattgcacttttttaattcttcaataatt
cataatttaataagttttataagttataaaataagagaaaatatttatgtaattaattat
gaggatttttcatttgaagatacagatttttttgaaaaatcatttaaaaatgtagtagga
aatgatgacatgccattttttccaattaattttgaatttttactaaattgcactaattta
ttgcctaaaaatgaaacaaacgttgtagaaggaaatgatatagaaaatagtaagattgaa
aatgataacaaaatagatgaaaatcctattaaaaatccaaatcaatgcaaaaatgaaata
tcaaatgataataaaatattcaacgttaacttgataaacattaaaaatgagtttatagag
aatttttttcatattgataataagtcaaatgaaatcgaaagaaatactaacgatataata
aatgaaaataataaaggtcaagaaattaagtataaagtaaattatgtagataagtgtata
gaatatgataacgaattttttgagttgtgtggattattacacattacacagagagaagaa
gtatatgatatttataggcgttatgtaaaaatgtcaaaaaattcgagaatatcaaaggta
agaaaagaagatgaaagaaatgtattacgaggacaacaaaaagaagaaaggcgaaatgct
ataattgcaaaatatttttatattagctcattacatcacccaattattatatcagaaaat
catccatggttgaaatattatatatataatattgataaattgtataattatttaaaaaat
gaagaaaataaaaaagtaattaatatgaggatgaaaagaatatttgaagaaacatttttg
aaagaaaatacaccaagtatttgcgataaaaaaaataaaaaaattaaaaatcagcaaaat
tacattaaaatgtttgaagttttagatgatataagtggtgatgatagtaaccttgataat
gatggggaaaataataaaggcaaaaaagggcaaaaagaaaaggaagaaaaaaaaaatatt
aaaggaggaaattcaaatcaattaactcgcaaagatgaaattttaaaaagaaaagaattg
tcaaatgaaaaaaaaatatatgaagtagatttagaaagatataatgtattagaagcaaaa
ataaataaactgagtagcaataataattattctgaaatgaatacatggtcattagatata
atatcaggctttaatagattagtagatgtatacaattttaataatgttagtaatttaata
aaaaatgcaactcttcaacttaaggttagtatgaaagttttaagtaatatgtttgatatt
attatgcacacaaaattaaaaaatgtcaaaactaataaacagaaatcagacgcaattaga
agtgtaatgctaatttataaattggttaatgaaatttttaacaaatttaaagaacatcta
actgaaaaagatattgttcagttgcaaactgttttattatcacttgggtttagaaatagt
agttataatttatttgaagaatatattaagataagggtgaaacaactagaagaagaaaat
aataatgatgtcgaagaagataaaacgggtaaaaataaaaaaaatgtaaaaggaaaagaa
aaaacaaaattgaaaggtggagcaaaaggtggaaaaagcaaggatgaggaaaaattgggc
ctagataagataaaaaaaaaaggaagagaagaaagtaattcagaggttggagtaaaaata
tctgataggaaagaattaaaagaactttataaatataaaatcgaatcagtaaaaacatac
agtgaattaaaaatagatgaagataaagaacatgaattccaattatattatatgtactat
ttattagatagaacaacaggaaacataaaagataaacgtgttttatttactttagatact
tggcaatataatatattaaatttagtagatcgaagaaaaagtatactagtttcttgccca
actagtagtggtaagacgtttatttgttattatgttatggataaagtattaagattaaat
aatgatagtgtagttgtatatgttgccccaaatgatacattagctttacaagtatttcat
gaagtaaatggaagatttaatacaaaaagttattcaaaatatggggaaaataaattatgc
tcatatttaacagataaatatgcacaagataaggcattagaagctcaaatagttataata
ttacctagtgttttagaaaatattttattatcttattattcgatgggtgaaaatactggt
ttagagacaaaagtatctaaatttattagtagaattgaatatataatttttgatgaaatt
cattgtattggagataaagaattttatgggccacaaattgaaaatatcattcatttaaca
acttgcccatttttagcattatctgctactattggtaatataaaatatttttatgattgg
ttaaaaaatgttatgataaaaaagggaaaaaatgaaaaagatttgcatttaattaaattt
tatgaaagattttcagatttggttttatatgtatacactaatagaaatttgcatcactta
aacccattggcttgttataattatagagatatattatataaaggtattaataaagatttt
tattgcaatcctcgagaaatatatgaaattataatgttattatttgaattagctagaaaa
aaacaattttatgatttagtagaatttttagaaccttcattttatttcaaatatacacga
tgtataaataagaaacagtttatatattacatgcacagtgtaaaagaaatgataatatat
ttaatacaaaataaatatattactagttcagactatgatatgttcatacacatgttgtta
tcaaattatttgaagaatactgatgtatcgcgaggagaaaagaaagaagaggaaacacaa
aataaaaaaaaagaggtagagaaaagggaagtggccaaagaagatgatagtagtagtgat
agtgatgaagaaaataagcaaataacaagtatgcaaagtacaacgaaacatttatataag
cgaaaagtacaagatgatgcaccaaaagaaaaattatttcaggaattatacaaaaatgtt
gtattggatgaaaaatattacttaaacaaatcaaacgatttagtaaaatatactgaaact
gtaaatgttgaacaagaatatttagatagcggtaatttaatagaattattaaaacatttg
gaagatgtaaattttttaccatgcattgtttttaattttgaaagaaaagaattagaagat
atgactatcaatttgattaatgaacttatgagaaggcaacatgataaatactatggaact
gatgaaagggcatttaatactaagatggaaaataagctacgacaagaaagatatgaaaat
ttattaaagcaaagagaaatgttattaaaaataaaaacagtatctagaaaccaaagatta
gaacaaaatttagataaagattatttagatatgttaaatgaagatgaaataccagaacct
cctatagatatttcagaagaatatgatggtgatttttatttttgtaatagaaaagtatat
cacaattatgtttttgaaatagaagatttaataaaggatgcagaaagagcaatcgaagga
agaaaaaataaggacatattaattgaaggtttaaaaagaggtataggtttacactatgaa
gttttaccttacaaatttacaattatagttgaatctttatttagattaggatacattaag
ataatatttagtaataaaaatttgtccttaggaataaatattccttgtaaatctattata
tttactggacatacttatgaattaaattctcttttgtttaaacaaacttctggaagagct
ggtcgacgtgggtttgatttatatggtaacataataatatggaatattaattttaagaat
ttaaaaagattaattacgtgccctttacaaacactttcaggtacttattgtgttaatttt
acaaatatatgtagaagtatgttattatataattgcttgaaaaaatatagagaaatggaa
gaaattgcacatagaaataaagctatagtaaataaaccaagtaaaaagaagaaaaaagaa
gaaactatgagtgtagctgaaaaggaagaaatttttgaaaaaaacagatttatcaatatt
aactattttagtagagttaatggtatattaagtttgttttacaatactttgtattatata
aatgcgttccatgatgaaaataataaaacattagaggatagagaaagcaattcaattgtt
gaagatataaaaggtggagtaaataaaacaataaagggtgataatgcatcacaaaacaca
aataattgtgatgtaatttgtgaaagtgattatttaaattttcgaaaagaagaattttta
gaatataaagaaaaagatatatcatccgattttatcaatagaaaatatgaatataacgaa
ttaatttgcgaaattattgaaaataagaagaaaaacaaatatatatcaatttttgaaaac
cagaaaaatttaaaagaactatcttttatgataaaaattcattttcttatatatataaac
attcttgttgaaatggaagcattagatgatgatggcaatgtaattaatttaactgaatta
tctatattattaaaaaaggaatgcgataataactttttattaacacatttacttagaaaa
cgaattatacataatcttataggagacgatgtatttttatcgtactcaaatagtgaagta
tctttacaaaaaataattgattgcataactttcgaaaaaaattattctcgaaatgcaata
gtagatgacacatcaagagggaaatttatcttattgtttattctttctcattttattaat
aaaataaaagaaaataaaatagctttaaccaatatattaatcaattataataataaaagt
agaaatcgattggaattatttagtcataaatatttccctcttttacacacacttccaaaa
tctgtacaaaatcatgttaataatttagaaaagctcatattaaataatttaataaattat
tcaataataattataagcaagctaaaattgtggagtagaaaaaaaacatatttacttcca
tatactcagttatacatatttgaggagcatccctcttcgaatttggttgacattttcaat
aacacaaattcagaattcataaattattataaagaaaaggttgacgattacaatataaga
tcccctttcttggcccccctttataaaaacgataaattcgataatttatgtgaattactt
tacacatctctaattgatttggatatgaaaaaaaatatgattccagatataatggaagat
tatgtttatttttataagttcgaaaatggattaataaaagaggaaaaagcatgcttaaaa
aactcatatatgatagattatttcttacacggaaagtattacgttttaagaaacaaaaat
aaactaggacaatatacttggtatattatagatagatttattgactctttaaaaaatatt
gaaaattatttatacgaaattaagagagaaaaggatttctcaaatgacgttttttacacg
tgtttaagttcaatgaaggacattttacaaaagcattttaaatctattaactcagaataa

DBGET integrated database retrieval system