Plasmodium yoelii: PY17X_0607700
Help
Entry
PY17X_0607700 CDS
T01035
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase, subunit beta
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Pathway
pyo03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PY17X_0607700
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pyo03021
]
PY17X_0607700
Enzymes [BR:
pyo01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PY17X_0607700
Transcription machinery [BR:
pyo03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
PY17X_0607700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3806976
NCBI-ProteinID:
XP_729674
UniProt:
A0A078KDI6
Q7RNH0
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(402952..407196)
Genome browser
AA seq
1414 aa
AA seq
DB search
MKEIIKIKGKKHMENEDEESEKKNSENNFSNSKEEGSNGNIIKIKDEHKEEKKEDEYFKD
EIRQNFDNTCDDSKYIKNFTIQTGYKKGDNTMNELIDELNTNKNIKKQENIILDDEINIR
GEITSYGKNDNINIQNQFAKDEKKINDQIDVLLKNSENYTNIHNKNIGGDKNYNSLNSEK
KKKKINISAEFEEKINFEEFSKNTNYNCNPDLLTKEKDLIDLVVKNSKHNKSIYENSKSI
NTLNEKWKLLPAYLKVKGLVKQHIESYNYFIKREIKTIMNATTNKIIKSDIDEHFYLEFL
DISVGRPSIEENMIESNLTPQICRQRDLTYSAPIYVDVEYIKGNSIVTKNNVEIGRLPVM
LRSDICVLNNKNENELMKLGECPYDPGGYFIVKGTERVLLMQEQLSKNRIIVEMDIKHNI
CATITSTTAESKSRCAIVYKNNKLYLKHNSFTEDIGVCIILRAMGYESDQEIFQMIGSHK
MYLNGILLSLYDLYTENIKTNLDALLYIGKKIRPRLLAKGFFSSMKEKQVKNEKDIIEEG
LDFLSRVLLSHIQQKSKYDFRNKARCICLMIRRVLDSANNKNELDDKDYYGNKRLELAGQ
LISLLFEDLYKRFYFTLKKQIDQTLSKYMQSSYNSKLKNNSSIGGNNNFSDNSYPDVFRN
LPKDIITRGMQTAISTGNWNIKRFKMEKSGVSQVLSRLSFIACIGMMTRLNSQFEKGRKV
SGPRALQPSQWGVLCPCDTPEGESCGLVKNLALMTHVTNDNDNNENLIEILYTLGVEDSD
SLTGEEMYKEGVFFVVLNGILLGVHRKPHKFMKRIRCLRRFGKIGEFVSIYDNFLHNAIY
ISTDGGRLCRPLIIVENGKSKLLNSHIKALESGEINFFDLLKSSVIEWIDVNEQNNLLIA
LNEKDINLNTTHLEIDPLTILGVVAGLIPYPNHNQSPRNTYQCAMGKQAIGSIGYNQFIR
CDTLLYLLIYPQKPLVKSKTIEFINFEKLPAGQNAIVSVMSFCGYDIEDAIVMNKSSIDR
GFGRCMSLRKHFIELKKYFNGSNDIVLPSPLSISKQQQMQKKTGKESNDNLANTKEDPRK
TINSELKKYHSLDADGVVSIGYLLKEGQVYVNKYSPINVKDHVKDMSKLDLNDFKLSEVK
YKSVYPSYVDKIIFTENGEGLKIYKIIMRQSRLPELGDKFSSRHGQKGVVGLLVNQEDMP
FTESGICPDLIMNPHGFPSRMTVGKLLELVSSKSAVLDGEYKYGSIFSGTPFEEAAEVLF
RYGFNWSCKELLYSGLTGEPLETYIFMGPIYYQKLKHMVQDKIHARSRGPRQLLTRQPTE
GRSKEGGLRLGEMERDCLIAYGVSNLLLERLMLSSDVCDAYICEDCGMMGYDSCCTFCKK
YDKNVVVKMPYACKLLFQELQTMNVFPKIIVKET
NT seq
4245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaggaaataataaaaataaaagggaaaaaacatatggaaaatgaagatgaagagagt
gaaaaaaaaaatagtgaaaataatttttcaaattcaaaagaggaagggtcaaatgggaac
ataattaaaataaaagatgaacataaagaagaaaaaaaagaagatgaatattttaaggat
gaaataagacaaaattttgataatacatgtgatgatagtaaatatataaaaaattttaca
atacaaactggttataaaaagggagataatacaatgaatgaattgatagatgaattaaat
acaaataaaaatataaaaaaacaagaaaatataattcttgatgatgaaataaatataaga
ggggaaattacttcatatggaaaaaatgataatataaatatccaaaatcaatttgctaaa
gatgaaaaaaaaataaatgatcaaattgatgtactattaaaaaatagtgaaaattatact
aatatccataataaaaatataggaggtgataaaaattacaacagtttaaatagtgaaaaa
aaaaaaaaaaaaattaacattagtgctgaatttgaggaaaaaataaattttgaagaattt
tcaaaaaacacaaattataactgtaatccagatttattgacaaaagaaaaagatctaata
gatcttgttgtaaaaaattcgaaacataataaaagcatttatgaaaattctaaaagcata
aatacattaaatgaaaaatggaaattattaccagcatatttaaaagtgaaaggtttggta
aagcaacatattgaatcatataattattttataaaaagagaaataaaaacaataatgaat
gcaacaacaaataaaattataaaatcagatattgatgagcatttttatttggaattttta
gatatatctgttggaagaccatctatagaagaaaatatgatagaatcaaatttaactcct
cagatatgtagacaaagagatttaacatattctgctccgatatatgtagatgtagaatat
attaaaggtaatagtattgttacaaaaaataatgtcgaaattggaagattaccagttatg
ttaagaagtgatatatgtgtattaaataataaaaatgaaaatgaattaatgaaattaggc
gaatgcccatatgatcctggaggatattttattgtaaaaggaactgaaagagtattatta
atgcaagaacaattatcaaaaaatcgaattattgttgaaatggatataaaacataatata
tgtgctactattacatctactacagcagaatctaaaagcagatgtgctattgtttataaa
aataataagttatatttaaaacataattcattcacagaagatataggggtttgtattatc
cttcgagctatgggttatgaaagtgatcaagaaatatttcaaatgattggatctcataaa
atgtatttaaatggcatattactttctttatatgatttatatacagaaaatataaaaaca
aatttagatgcattattatatataggtaaaaagattcgaccaagattattagctaaaggg
ttttttagttcaatgaaagagaaacaggtaaaaaatgaaaaagatataattgaagaaggg
ctagattttttaagtcgtgttttattatcacatatacagcaaaaaagtaaatatgatttt
cgaaacaaagctagatgcatctgtcttatgattagaagagtgttggatagtgcaaataat
aaaaatgaattagatgataaagattattatggtaataaaagattagaattagctggacaa
ttaatatcattactttttgaagatttatataaaagattttattttactttaaaaaaacaa
attgatcaaacattgagtaaatatatgcaaagtagttataactcgaaattgaaaaataat
agtagtattggtggaaataataatttctctgataattcttatccagatgtgtttagaaat
ttaccaaaagatatcataacaagaggaatgcaaacagctatatctactggaaattggaac
ataaaaagatttaaaatggaaaaaagtggggtatctcaagtgctttctcgtttatcattt
attgcatgtataggtatgatgacaagattgaactctcaatttgaaaaaggccgaaaagtt
agtggccctagagctttgcaaccatctcaatggggagtattatgtccttgtgatacacct
gaaggggaatcatgtgggttggtaaaaaatttagcattaatgacacatgtaacaaatgac
aatgataacaatgagaatctaatagaaattctctatacattaggagtagaagatagtgat
agtttaactggtgaagagatgtataaagagggtgttttttttgttgtattaaatggtata
ttattaggggttcatagaaaacctcataaatttatgaaaagaattagatgcttaagaaga
tttggaaaaataggagagtttgtgtcaatatatgataattttttacataatgcaatttat
atatcaactgatggaggtagattatgtagaccattaataattgtcgaaaatggaaaatct
aaattattaaattcacatattaaagcattagaatctggagaaataaatttttttgattta
ttaaaaagttccgtaatagaatggatagatgtaaatgaacaaaataatttattaatagct
ttaaatgaaaaagatattaatttaaatacaacacatttagaaattgatccattaacaatt
ttaggagtagtagcaggattaataccctatccaaaccataaccagagtcctagaaataca
tatcaatgtgctatgggaaaacaagctataggttctattggatataatcaatttattaga
tgtgatacacttttgtatttgttaatatacccccaaaaaccattagtaaaatctaaaact
attgaatttattaattttgaaaaactcccagctggacaaaatgcaattgtatctgttatg
agcttttgtggatatgatattgaagatgcaatagttatgaacaaatcatcaatagatcga
ggattcggtagatgcatgtctttaagaaaacattttatagaattaaaaaaatattttaac
ggttccaatgatatagttctcccttctcctctttctataagcaaacaacaacaaatgcaa
aaaaaaactggtaaggaatcaaacgataatttagcaaacacaaaagaagatcctagaaaa
actataaatagtgaattaaaaaaatatcattcattagatgcagatggagttgtatctata
ggttatttattaaaagagggtcaagtatatgtgaataaatattcgccaataaatgtaaaa
gatcatgtaaaagatatgagcaaattagatttaaatgattttaaattaagtgaagtaaaa
tacaaaagtgtttatccttcatatgttgataaaataatatttacagaaaatggagaaggg
ttaaaaatatataaaattattatgagacaatctagattaccagaattaggtgataaattt
agttcacgacatggacaaaaaggtgttgttggattattggtaaatcaagaagatatgcca
tttacagaatcaggaatatgtcctgatttaattatgaaccctcatggatttccttctcgt
atgacagtaggtaaacttcttgagctcgtttcatctaaatctgctgttctagatggggaa
tataaatatggttcaatttttagtggaacaccatttgaagaagcagctgaagttttgttt
agatatggttttaattggtcatgtaaagaattattatattctggactaacaggagagcca
ttagaaacatatatatttatgggtccaatatattatcagaaattaaaacatatggttcaa
gataaaattcatgctagatctcgagggcctagacaattattaacacgacaaccaactgaa
ggtcgatcaaaagaaggaggattaagacttggcgaaatggaaagagattgcttaattgca
tatggtgttagtaatttattacttgaaaggcttatgttaagtagtgatgtttgtgatgct
tatatttgtgaggattgtggaatgatgggttatgattcgtgttgcacattttgtaaaaaa
tatgacaaaaatgttgttgtcaaaatgccatatgcctgtaaacttcttttccaggagtta
cagactatgaatgtattcccaaaaattattgtgaaggaaacataa
DBGET
integrated database retrieval system