Plasmodium yoelii: PY17X_1018600
Help
Entry
PY17X_1018600 CDS
T01035
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein Msh2
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Pathway
pyo03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
PY17X_1018600
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pyo03400
]
PY17X_1018600
DNA repair and recombination proteins [BR:
pyo03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
PY17X_1018600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_II
DUF7309
MutS_IV
AAA_27
Tocopherol_cycl
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3800207
NCBI-ProteinID:
XP_727998
UniProt:
A0A077YG04
Q7R8N0
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(845064..847499)
Genome browser
AA seq
811 aa
AA seq
DB search
MENNETVEINNDEILCLFIDTKKYQKTIGVCFYNYLKCEFLMTEFIDNGYFTALESLFIQ
KRPCKCFFNSTTDLVDEEKVLNLFKMCNIEPILTDKKKYDITNLKEELKLIIPQNDDIRN
YDKHLELENASKCLMVLINYLKFKEDEDINYQCSINIYNMNLYMRLDKAAITALNILPNK
KNTHSYNNNTSLLKFLDKCNTSIGSKKLVSWITQPLTNALEINQRLNIVETFIDEDDIRN
SVFCNYLKRIPELDKLNHYLKEINKNNDIRVNSKYNEEMILKDIVKLYYAILDFKQIYFL
LVSINGKHKETLNEILIKPLHDILNKFSKFLDMIEMTIDLKEIEENKVYLISKHFDSELE
QIYNEKSALMKKIKNHKEDVEKDLFSDKHDRRNKKAMREDIRLIECNTNGFLFRVCKKDC
PLVQQQKKKYLPIRMNKNEFLFTTNTLKNLCREYEHCLSIYNTLQSEIVKKTICAVSTYT
PVIEKFIDVVSTLDVLVSFSVVCYNSPFTYVRPALVKNGENVIMKKSRHPLLELQHNISN
FIPNDIHMNKNKSRLIIVTGPNMGGKSTYIRQIAIICILAQIGMFVPCDFCEIPIFTQIM
CRVGASDFQLKGISTFLSEMIEASAIIKNADNNSLIIVDELGRGTSTYEGLGISWSIGKY
ILDNIKCFCLFATHFHEMSNIAYQCEGVINRHIETIIDQKNKKICFLYEIKDGASNKSYG
VNVAEIAKLPKDVIQKAYEKVEELESAENKYYLKEKLNIDTSSSTNEKYKNNISNYVKIK
DEINYIFSSKDESEFIKRFISKKTYLKELTI
NT seq
2436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaataacgaaacagttgagataaacaatgatgaaatattatgcttatttatagat
acgaagaagtatcagaaaacgataggtgtttgtttttataattatttaaaatgtgaattt
ttaatgactgaatttattgacaatggatattttactgccttagaatcattgtttatacag
aaaagaccatgtaagtgtttttttaatagtacgactgatttagttgatgaagaaaaggtt
ttaaatttatttaagatgtgtaatatagaacctattttaacagataaaaaaaaatatgat
ataacaaatttaaaagaagaattgaaattaataataccacaaaatgatgacattcgaaat
tacgataaacatttagaattagagaatgcaagtaaatgtttaatggtgttaataaattat
ttaaaatttaaagaagatgaagatataaattatcaatgtagtattaatatatataatatg
aatttatatatgagattagataaggccgctattactgcattaaatattcttccaaataaa
aaaaatacgcatagttataataataatacaagcttattaaaatttttagataaatgcaac
acttctattggatctaaaaaattagtttcttggataacacagccattaacaaatgcttta
gaaattaatcaaagattaaatattgttgaaacatttatagacgaagatgatatacgtaat
agcgttttttgtaactatttaaaaaggatacctgaattagataaattaaatcattaccta
aaagaaataaataagaataacgatatcagagtaaattctaaatataatgaagaaatgata
ttaaaagatattgtaaaactatattatgcaattttagattttaaacaaatatatttttta
ttagtatctattaatggaaaacataaagaaacattaaatgaaattcttattaaaccatta
catgatatattaaataaattttcaaaattcttagatatgatcgaaatgactattgattta
aaagaaattgaagaaaataaagtttatttaatttcaaaacatttcgattcagaactagaa
caaatatataatgaaaaaagtgcattaatgaaaaaaattaaaaatcataaagaagatgtc
gaaaaagatttattttctgataaacatgatagacgtaataaaaaagcaatgagagaagac
attagattaatagaatgtaatactaatggattcttatttcgagtgtgtaaaaaagattgt
cctttagttcaacaacaaaaaaaaaaatatttaccaatacgtatgaataaaaacgaattt
ttatttacaacaaatactttaaaaaatttatgtagagaatatgaacattgtttaagtatt
tataatacattgcaatcagaaattgtaaaaaaaacaatatgtgctgtatctacatatacc
cctgtaattgaaaaatttatagatgtagtatctacgttagatgtgttagtatcattttct
gttgtttgttataattcaccttttacatatgttagaccagcattagttaaaaatggagaa
aatgttattatgaaaaaatcgagacatccattattagaattacaacataatataagtaat
tttatacccaatgatatacatatgaataaaaacaaaagtagattaataatagttacagga
cccaacatgggaggaaaaagtacatatatcaggcaaatagctataatatgtatattagca
caaataggaatgtttgttccatgtgatttttgtgaaatacctatttttactcaaattatg
tgtcgagtaggtgcatctgattttcaattaaaaggaatttcaactttcttatcagaaatg
atagaagcatcagcaattataaaaaatgctgataataattcactaattatcgttgacgaa
ttaggtagaggaacatctacatatgaagggttaggaataagttggtctattggaaaatat
attttagataacataaaatgtttttgtttattcgctactcattttcatgaaatgtcaaac
atagcttatcaatgcgaaggtgttattaacagacatatcgaaacaataattgatcaaaaa
aacaaaaaaatatgctttctatacgaaattaaagatggtgcatctaataaaagttatggt
gtaaatgtagctgaaatagctaaacttcctaaagatgttatacaaaaggcatatgaaaaa
gtagaagaattggaatctgctgaaaataaatactatttaaaagaaaaattaaatattgac
acttcctctagcaccaatgaaaaatataaaaataatatttccaattacgtgaaaattaaa
gatgaaattaattatatattttcttcgaaagatgaaagtgaattcatcaaacgatttata
tccaaaaaaacgtatctcaaggagctcaccatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
