Plasmodium yoelii: PY17X_1444400
Help
Entry
PY17X_1444400 CDS
T01035
Name
(RefSeq) DNA helicase 60, putative
KO
K12823
ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Pathway
pyo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PY17X_1444400
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pyo03041
]
PY17X_1444400
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pyo03009
]
PY17X_1444400
Enzymes [BR:
pyo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PY17X_1444400
Spliceosome [BR:
pyo03041
]
Complex A
U1 snRNP components
U1 related factors
PY17X_1444400
Complex B
PY17X_1444400
Ribosome biogenesis [BR:
pyo03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
PY17X_1444400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
Cas3-like_C_2
Utp25_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3789619
NCBI-ProteinID:
XP_724294
UniProt:
A0A078KC70
Q7RHE2
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(1710568..1712715)
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MRKILKFRSINCRTGDKLCLLKKLIHTKNELSQIHCKNNKIGNGIISHQELKIGYLQVIN
NIRNQSICTENKVKDDNNSASHLNETINDINNADTKLNYNILNENELKDDIDNDFDKEDN
DIKYDGNNNSNLGDTKFEDNEFENYNKFNRYERKNNKEDDENGFINYKNNVNSRNERGNY
QKKNNYNLRNDYDNNTDNNMDDYNNNYMKRDDHNSKYSRNLNNSDRYSKLGDNLKDIEWN
KIKVKIERQNLFNVNDNKLKKLSNEEIQNELKKNNIYVNKDLVLNNFITNFSDLDFHESI
LNYLNEKFKEPTAIQKITWPIALSGKDLIGVAETGSGKTLAFVLPCLMHILKHKQKEMEE
NGVEPIKNNEVKLSENDNNDNNYDPDFEKEFQNDDSENRKTYGLILLPTRELCMQVLNEI
KNFESELNLKAVAVYGGVPKYFQINNIKKGADIIVATPGRLLDYLENGIINLLRCIYVVI
DEADRLLDMGFEKQLRKIMTQINKNKQLLFLTATWPEQVRKLAYDFCSFDPVKIQIGKSE
LTANKNIEQQVIVSSSIDLKKKLLDWLKDNYENNKILIFCDTKRNCDNLCKELRYHQYNS
LSIHGDKQQRERDRILNNYKNDRCNILVATDVASRGLDIKNISIVINYDIPNTIEDYIHR
IGRTGRAGNKGKSILFFPYDYYVPQKQRFAKELVKLLNKTNQQVPKELREIVSTR
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaagatattaaaattcagatcaattaattgccgtacaggtgataaattgtgttta
ctaaaaaaattgatacacacaaaaaatgagttatcacaaattcattgtaaaaataataaa
atagggaatggtataattagccatcaagaattaaaaattggatatttacaagtaataaat
aatataagaaatcaaagtatatgtactgaaaataaagtcaaagatgataataattcagct
agccatttaaatgaaacaataaatgatataaataatgccgatacaaaattaaattataat
atattaaatgaaaatgaattaaaagatgatatagacaatgattttgataaagaggataat
gatataaaatatgatggaaataacaactcaaatttgggtgatacaaaatttgaagataac
gaatttgaaaattataacaaatttaataggtatgaaaggaaaaataataaagaggatgat
gaaaatggatttattaattataaaaataatgttaatagtagaaacgaaagaggaaattat
caaaaaaaaaataattataatttaagaaatgattatgataataatacagataacaacatg
gatgattataataacaattatatgaaaagagatgaccataattcgaaatattcgagaaat
ttaaacaactcggatagatattcaaaattaggagataatttaaaagatatagaatggaat
aaaataaaagtaaaaatagaaagacaaaacttatttaatgttaatgataataagttaaaa
aaattatcaaatgaagaaatacaaaatgaactaaaaaaaaataatatatatgtaaataaa
gatttagtattaaataattttataaccaatttttcagatttagattttcatgaatcaata
ttaaattatttaaatgaaaaatttaaggaaccaacagctattcaaaaaattacatggcct
atcgctttgtcaggaaaagatttaataggagttgctgaaacaggaagtggaaaaacctta
gcatttgttttgccatgtcttatgcatatattgaaacataaacaaaaagaaatggaagaa
aatggggttgaacctataaaaaataatgaagtaaaattatctgagaatgataataatgac
aataattatgatcctgattttgaaaaagaatttcaaaatgatgatagtgaaaatcgtaaa
acatatggattaattttattaccaacacgagaattgtgtatgcaagtattaaatgaaatt
aaaaatttcgagagcgaattaaatttaaaagctgttgcagtatatggaggtgtaccgaaa
tatttccaaattaataatataaaaaaaggagccgatataattgttgcaactccaggaaga
cttcttgattatttagaaaatggaatcataaatttattaagatgcatctatgtagttatt
gatgaagcagacagattacttgacatgggatttgaaaaacaattaagaaaaataatgaca
caaattaataaaaataaacaattattatttttaacggcaacatggcctgaacaagttaga
aagcttgcatatgatttttgttcatttgatccagtaaaaattcaaatcggaaaaagtgaa
ttaacagcaaataaaaatatagagcaacaagtaatagttagctcatcaattgatttaaaa
aaaaaattactcgattggttaaaagataattatgaaaataataaaattctaatcttttgt
gatacaaaaagaaattgtgataatttatgtaaagaattacgatatcatcaatataatagt
ttatcaatacatggagataaacaacaaagagaaagggatagaatattaaataattataaa
aatgatagatgtaatatattagtagcaaccgatgtagcatcaagggggttagatattaaa
aatatttcgattgttattaattatgatataccaaatacgattgaagattatattcataga
attggacgtacaggtagagcaggtaataaaggaaaatctatattattttttccatatgat
tattatgttccacaaaaacaaagatttgcaaaagagttggtaaaattgttaaataaaaca
aatcaacaagttcctaaagaacttagagaaattgtaagtacacgatga
DBGET
integrated database retrieval system
