Plasmodium yoelii: PY17X_1453000
Help
Entry
PY17X_1453000 CDS
T01035
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Pathway
pyo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PY17X_1453000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pyo03019
]
PY17X_1453000
03041 Spliceosome [BR:
pyo03041
]
PY17X_1453000
Messenger RNA biogenesis [BR:
pyo03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
PY17X_1453000
Spliceosome [BR:
pyo03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
PY17X_1453000
Complex C
PY17X_1453000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_M
TPR_2
HAT_PRP39_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3800253
NCBI-ProteinID:
XP_728044
UniProt:
A0A077YCH3
Q7RQX2
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(join(2096843..2096975,2097130..2097218,2097378..2097503,2097611..2097685,2097833..2100178))
Genome browser
AA seq
922 aa
AA seq
DB search
MDELGNVYDCDLLFNDNDEDDINLEKDENNCEDTTRLVNEENESYLKNIDFDIKNNMDKI
STQYLFLYINTYKEKNIKNVKKLYNLKFYDIHLRKDEYPLLETKHNVIEYCIKELINKEN
EKNKFDTIQNNDNNTNYKDEEDKYYLLKIYETILKHFPYSFKIWYYYIKDSIEMVSDIYY
NNKKEYEKINKIFEKCLLYLYNFKSIYIMYIQFLYIQRNVKKIREVFNKSLQNVCLNQHE
DIWNYQLKFISKIDSKLINYEYIKRYVTIYPEQVIFLFNHYIKYKMHKQALSTFFYILNN
DDINFDLGDKTKYDLYKEIFNLINSSKTLNNDVMEILRKNLDIFKNYENITSLYILLANN
FVYEGRWNKAMDIYEEGISESYSINDFSVLFDNYIETLKILIDLKIRNHDGNNIVQLANK
NDQEEETDEDENEMNISDDFIIDLYMDKINYLLDKRKIYIADIKLKNNKNNVYAWLNKIE
IIDNENEKINIFNQCLKYFQDNDYIGKLSDVYITYAYYYYNNNNYKDSVNVFKKAIEDKN
IKNLNEMANIFCSWIELEILEQNYNEALQIARSSIDFDKNNNFDKKGLQIVSYNSDRNSI
RKDNTTYGFQNVQNKFNLKNSIKLVCLVLDMEINYGTVETALCMFDLLYHSKSITIKMVL
SFANYLYEQKYFNECFKVYEKAISIFHYPYLYPIYVNYINKYIERYKDKNISYVRELFKQ
AIYGTDNKTYVPKEFSKYIFLMYISFEENYGFLKKSLSIYKEAIPFLEEQDKIKFYKVFI
SKISKSYGIHKAREAFEEAIQTLTDDQAREICLLYIDMEYKLNEYDRVRALYVYTAQFTN
PLKFPKFFQDWREFEALYGNEHTFRDMIRIKRSVRSMFTNSNSASFKDKHEETEEGKIED
TKRKLMEIIENETGENKKLKKK
NT seq
2769 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgaattaggaaatgtatatgattgtgatttattgtttaacgataatgatgaagat
gatataaatttagaaaaggatgaaaataattgtgaggatacaacaagattggtaaatgag
gaaaatgaaagctacttgaaaaatatcgattttgatataaaaaataacatggacaaaatt
tcaacacaatatttatttttatatataaacacatataaagaaaaaaatataaaaaatgta
aaaaaattatataatttaaaattttatgatatacatttaagaaaagatgaatatcctctc
ttggaaaccaaacacaatgttatagaatattgtattaaagaattaataaataaagaaaat
gaaaaaaataaatttgatactatccaaaacaatgataacaatactaattataaagatgaa
gaagataaatattatctactaaaaatatatgaaactattttaaaacattttccatatagc
tttaaaatatggtattattatataaaggatagtattgaaatggttagtgatatatattat
aataataaaaaagaatatgaaaaaataaataaaatttttgaaaaatgtcttttatattta
tataattttaaaagtatatatattatgtatatacaatttttatatattcaaagaaatgta
aaaaaaataagagaagtttttaataaatctttacaaaatgtatgtctaaatcaacatgaa
gatatatggaattatcaattaaaatttatatcaaaaatagatagcaaattaattaattat
gaatatataaaaagatatgttacaatatatcctgaacaagtcatatttttatttaatcat
tatattaaatataaaatgcataaacaagctttaagcacatttttttatatattaaataat
gatgatataaattttgatttaggagataaaactaaatatgatttatataaagaaatattt
aatttaattaattcatctaaaacgttaaataatgatgttatggaaattttaagaaaaaat
ttggatatttttaaaaattatgaaaatattacttctctatatattttattggctaataat
tttgtttatgaaggaagatggaataaagctatggatatatatgaagagggaatatctgaa
tcgtattctattaatgatttttctgtactttttgataattatatagaaaccttgaaaatt
ttaatagatcttaaaatacgaaatcacgatggaaataatattgtccagctagccaataag
aatgatcaagaagaagaaactgatgaggatgaaaacgaaatgaatatttctgatgatttt
attattgatttatatatggataaaataaattatttactggataaaagaaaaatatacatt
gcagatataaaacttaaaaataataaaaataatgtatatgcatggttaaataaaatagaa
attatagataatgaaaatgaaaaaatcaatatatttaatcagtgtttaaaatattttcaa
gataatgattatattgggaaattaagtgatgtatatattacttatgcttattattactat
aataataataattacaaagattcggtaaatgtttttaaaaaagctatagaagataaaaat
attaaaaatttgaatgaaatggcaaatatattttgttcatggattgaattggaaatttta
gaacaaaattacaatgaagcattacagattgctagatcatctattgattttgataaaaat
aataattttgataaaaaaggattgcaaatagttagttacaactctgatcgaaattcaatt
agaaaagataatacaacttatggttttcaaaatgtacaaaataaatttaatttaaaaaat
tctataaaattagtatgtttagtattagatatggaaataaattatggaactgttgaaaca
gctttatgtatgtttgacttattatatcattctaaaagtattacgattaaaatggttttg
tcatttgctaattatttatatgaacaaaaatattttaatgaatgttttaaagtatatgaa
aaagctatttcaatttttcattatccatatctatatccaatttatgttaattatattaat
aaatatattgaaagatataaagataaaaatatttcgtatgtacgtgaattatttaaacaa
gccatatatggaactgataataaaacatatgtgcctaaagaattttcaaaatacattttt
ttaatgtacatttcgtttgaagaaaattatggatttttgaaaaaatcgttaagtatttac
aaagaggctattccatttttggaggagcaggataaaattaaattttacaaagtgtttatt
tcgaagatatccaagtcttatggaattcacaaagctagagaggcatttgaagaggctatt
caaacgctaacggatgaccaagctagagaaatttgcttgctgtatattgatatggaatac
aagttaaatgaatatgatcgagtaagagcactttatgtatacactgctcagtttacaaat
ccattgaaattccccaaatttttccaggattggagagaatttgaagcattgtatggaaat
gagcacacatttagagatatgataagaattaaaagaagtgtgcggagcatgtttacaaat
tcaaatagtgcttcatttaaggataagcatgaggaaacagaagaagggaaaatagaagat
acgaaaagaaaattaatggaaattattgaaaatgaaacaggtgaaaataaaaaattaaaa
aaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system