Candidatus Phytoplasma ziziphi: CWO85_00270
Help
Entry
CWO85_00270 CDS
T05675
Symbol
der
Name
(GenBank) ribosome biogenesis GTPase Der
KO
K03977
GTPase
Organism
pzi
Candidatus Phytoplasma ziziphi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pzi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pzi03009
]
CWO85_00270 (der)
Ribosome biogenesis [BR:
pzi03009
]
Prokaryotic type
GTPases
CWO85_00270 (der)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
FeoB_N
KH_dom-like
GTP_EFTU
Dynamin_N
AIG1
RsgA_GTPase
Roc
Ras
PduV-EutP
MMR_HSR1_Xtn
ATP_bind_1
nSTAND3
SRPRB
RNA_helicase
ABC_tran
AAA_14
AAA_24
AAA_29
Guanylate_kin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYJ00981
UniProt:
A0A660HLP3
LinkDB
All DBs
Position
complement(37643..38965)
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MNFKVAIIGRPNVGKSSLFNRILNKRLAIVYEEAGTTKDRIYAEATWLNQKFFIIDTGGI
VFDNVPLIQQIKHQAELAISESNLIIWVTDGQTTTLTKEELEITKMLYSSHKKVIIAVNK
IDNLNLYENVYEFYSLGFSDIIGISTQHGIGIGKLLDKVVSYLPRNKKIENDETEDLRFC
LVGRTNVGKSTLTNALLSQERMIVSELPGTTTDAVDTIFEKNNQRYHIIDTAGMRRKKKF
YEKHEKYSFLRALDAIQRSDIVCFLLDISYNITEQDRNIAAIIFNYSKPCIIVLNKWDLL
EPSDKDIKKFELMVKTEFKFFNHVPIVFLSAKNIKRIHTLFQALDKVFNNYKQTFSSHLL
NDILHEATQINPPSFFNQGKAKFYYLKQTATKCPEFVCLVNDPKFIHFSYERYLKNQLRL
NLELSGIPLKIIFKKKEVFL
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttaaagtagctattataggaagacctaatgtaggcaaatcaagcttatttaat
cgtattttaaataaaagattagcgattgtttatgaagaggccgggacgactaaagatcgt
atttatgctgaagctacatggttaaatcaaaaattttttattattgatactggaggaatt
gtttttgataatgttcctttaattcaacaaattaaacatcaagccgaattagctatttct
gaatctaatttaattatttgggttactgatggtcaaactactacattaactaaagaagaa
ttagaaataaccaaaatgttatatagtagtcataaaaaagttattatagctgttaataaa
atagataatttaaatttatatgaaaatgtttatgaattttattctttgggatttagtgat
atcataggaattagtacacaacatggaattggtatcggtaaattattagataaagttgtg
tcttatttgccacgtaataaaaaaatagaaaatgatgaaacagaagatttaagattttgt
ttagtaggtcgtactaatgttggaaaatctactttaactaatgccttgttgtcgcaggaa
agaatgattgtatctgaattaccagggactacaactgatgccgttgacactatatttgaa
aaaaataatcaaagatatcatataatagataccgctggtatgcgaagaaaaaaaaaattt
tatgaaaaacatgaaaagtatagttttttaagagctttggatgctattcaaagaagcgat
attgtttgttttttgttagatataagttataatattaccgagcaagatagaaatatcgct
gctattatttttaattattcaaaaccttgtattattgttttgaataaatgggatttatta
gaaccttctgacaaagacataaaaaaattcgaattaatggttaaaacagaatttaaattt
tttaatcatgttccaatagtgtttttatctgcgaaaaatataaaaagaattcatactttg
tttcaagctttagacaaagtttttaataattataaacaaactttttcttctcatttatta
aatgatattttacacgaagctactcaaattaatcctccatctttttttaatcaaggtaaa
gccaaattttattatttaaaacaaacagctacgaaatgtccagaatttgtttgtttagtt
aatgatcctaaatttattcatttttcttacgaaagatatttaaaaaatcaattaagatta
aatttagaattgagcggaattcctttgaaaataatttttaaaaagaaagaagtttttttg
taa
DBGET
integrated database retrieval system