KEGG   Quercus lobata (valley oak): 115954817
Entry
115954817         CDS       T07350                                 
Name
(RefSeq) phytochrome C
Organism
qlo  Quercus lobata (valley oak)
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c PAS_4 PAS_9 PAS_8 HisKA KOWx_SPT5
Other DBs
NCBI-GeneID: 115954817
NCBI-ProteinID: XP_030928623
UniProt: A0A7N2MAQ7
LinkDB
Position
8:27961753..27970575
AA seq 1123 aa
MSSKSVSNKTNCSRSSSALSKHGARVVAQTPIDAKLHVDFEETKRFFDYSTSIDFNLSSS
TSNVPSSSVSAYLQKMQRGSLIQPFGCIIAVDDENFSVLAYSENAPEMLDLAPHAVPSIE
QQEALTFGTDVRTLFRSSGATALQKAANFGEVNLLNPILVHCKTSGKPFYAILHRIDVGL
VIDLEPVNPADVPVTAAGALKSYKLAAKAISKLQSLPSGNISLLCDVLVKEVSDLTGYDR
VMVYKFHEDEHGEVVAESCRPDLEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMRNKVRMICDCLAPPV
KVIQDKRLSQPLSLCGSTLRSPHGCHAQYMANMGSIASFVMSVTINEDDNEVESDQQKGR
KLWGLVVCHHTSPRFIPFPLRYACEFLIQVFGVQINKEVELAAQLREKHILRTQTVLCDM
LLRDAPVGIVTQSPNVMDLVKCDGAALYYRKKIWLLGVTPTEGQIRDIAEWLLEYHNGST
GLSTDSLMEAGYPAASVLGDEVCGMAAVRITSKDFLFWFRSHTAKEIKWGGAKHDPGDKD
DGRKMHPRSSFKAFLEVVKRRSRPWEDVEMDAIHSLQLILRGSLQDEIMDESKMIVNVPS
VDDRIQRVDELRVVTSEMVRLIETAAVPILAVDGSGSVNGWNTKSAELTGLSVEQAIGMS
LIDLVSDDSVEVVKNLLNSASQGIEEQNIEIKLKTFGPQENNGPVILVVNACCSRDTKEN
VVGVCFIGQDVTGQKVIWDKYTRIQGDYVGIMRSPSALIPPIFMTDEHGRCLEWNDAMQK
LSGLRREEATERMLLGEVFTVKNFGCRVKDHDTLTKLRILLNGVIAGHDADKLLFGFYDR
LGNYVEALLSANKRTDAEGRITGALFFLHVASPELQYAMQVQRISEKAEADSIKKLSYFR
QEISKPLNGIMFMQNLMGSSNLSKEQKELIKISSLCQEQLAKVVDDTDIERIEECYMEMS
SGEFNLGEVLEVVINQVMILSQERQVQVIRDSPAEVSSMNLYGDNLRLQQVLSDFLTNAL
HFTPAFEGSSVAFRVIPRKERIGMKMHIVHLEFRITHPAPGIPEDLIQEMFHHNHGVSRE
GLGLYICQKLAKIMNGTVQYLREAERSSFIILIEFPLVCPIDQ
NT seq 3372 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcatcaaaatcggtttcgaacaagacgaattgctctaggagcagttctgctctatca
aagcatggggctcgtgtagttgcacagacgcccatcgatgcaaagcttcatgtggacttt
gaagagaccaagcggttttttgattactccacttcaattgacttcaacctctcaagttcc
actagtaatgtcccctcctcctctgtgtcagcttatctccaaaagatgcaaagaggaagc
ctcattcaaccgtttggttgcatcattgctgtggatgacgaaaatttctctgttcttgcc
tatagtgaaaatgcccctgaaatgttggacttagctccacatgctgttccaagcattgag
cagcaagaagctctcacttttggaacagatgttcgaacactctttcgctcctcgggtgcc
actgcattgcagaaagcagccaattttggtgaagtaaatcttcttaatcccatattggtt
cattgtaaaacctcaggtaagccgttttatgcaattctgcaccgaatagatgttgggtta
gttatagatttggaaccagtgaatccagctgatgtgcctgtgactgctgctggggcgttg
aaatcttataagctagcagccaaagccatctcaaaattgcagtccttgccaagtgggaat
atatcattgttatgcgatgttttagttaaggaagttagtgatttgacaggttatgatcgt
gtaatggtgtataaatttcatgaagatgagcatggggaagttgtagctgagagctgcaga
cctgacttggaaccttatcttggtttgcattacccggctactgacataccacaagcttca
agatttctattcatgagaaacaaagttaggatgatatgtgattgtttggcacctccagtg
aaggtaattcaagacaagagattgtctcaaccattgagcctttgcggatctacgttgaga
tctcctcatggttgtcatgcacagtatatggcaaatatgggttccattgcatcttttgtg
atgtctgtgactatcaatgaagatgacaatgaggtggagagtgatcagcagaagggaaga
aaattgtggggcttggttgtttgtcatcacacaagtcctaggtttattccatttcctttg
aggtatgcctgtgagttcttgattcaagtttttggtgtacagatcaacaaagaagtggag
ttggctgctcaactgagggagaagcatattttgcgaactcaaactgtgctttgtgacatg
ctccttagagatgctcctgtaggtattgtcactcaatcacctaatgtaatggatcttgtt
aagtgtgatggagctgcactatactacaggaaaaaaatttggttgcttggggtcacccca
acagagggacaaattagagatatagctgaatggcttcttgagtaccataatgggagcaca
ggtttaagtactgatagccttatggaagctggctacccagctgcttcagttcttggagat
gaagtttgtgggatggcggctgttaggattacctcaaaggatttcctgttctggttccgg
tcccacactgcaaaggaaatcaagtggggtggtgcaaaacatgaccctggtgacaaggat
gatggaagaaagatgcaccccaggtcgtcattcaaggcttttctggaggtagttaagcgg
cgtagtcggccttgggaagatgtggaaatggatgccatccattcattgcagctgatattg
agaggatctttgcaagatgagattatggatgagtcgaagatgattgtgaatgttccatcg
gttgatgacaggatacagagagtggatgaattgcgagtggtcacgagtgaaatggttcgc
cttattgaaacagctgcagtccccatattggctgttgatggctctggtagtgtaaatggg
tggaataccaaatcagctgaactaacaggactgtctgtcgagcaagccattggtatgtcc
ttaattgatcttgtctccgatgattcggttgaagtggtgaagaatctgctcaactcagct
tcacaaggaatagaagagcaaaatattgaaatcaaacttaaaacatttggtcctcaagaa
aacaacggtcctgtaatattggtagttaatgcatgttgcagccgggacacaaaagaaaat
gttgtaggggtttgctttattggccaagatgtcacaggacaaaaggtgatttgggacaaa
tatactcgtatccaaggtgattatgttggaatcatgcggagcccttctgcacttattcct
ccaattttcatgactgatgagcatggccgatgcttggaatggaatgatgcaatgcagaaa
ttgtctggtttgaggagggaagaggcaactgagcggatgcttcttggggaagttttcaca
gtaaaaaattttggttgtcgggttaaagatcatgacacattgaccaagcttaggatacta
cttaatggggtaattgctggccatgatgccgataagttgttatttggattctatgatcga
ttgggtaattatgttgaagcattactttctgcaaacaaaaggactgatgcagagggaagg
attactggggctttgttctttttgcatgtggctagtccagaacttcaatatgctatgcag
gtgcagagaatatcagaaaaggctgaagctgatagtatcaagaaattgtcatattttcgt
caggaaatcagcaagcctttgaatgggattatgtttatgcagaatctaatgggatcctct
aatttaagtaaagagcagaaggaactaataaagataagctcattgtgtcaggaacaatta
gccaaggttgttgatgatactgatattgaaagaattgaggaatgctacatggaaatgagc
tctggtgaattcaaccttggggaagttcttgaagttgtcataaatcaagttatgattttg
agccaggagcgccaggtgcaggtcatccgtgattcacctgctgaagtttcatcaatgaac
ttatatggagacaacttgaggcttcagcaagttctttcagattttttgactaatgcactc
cacttcacccctgcattcgaaggatcatctgttgcattcagagtgattccaaggaaggag
cgtataggaatgaaaatgcacattgtccatcttgaatttaggatcacccatccggcacct
gggattccagaagatctaattcaggagatgtttcaccacaaccatggtgtctcaagggaa
gggcttggcctatacatttgccagaagcttgcgaagatcatgaatggcactgtacaatat
ctaagagaggcagagagatcatcctttataattcttatagaattcccattggtttgtccc
attgaccaatga

DBGET integrated database retrieval system