Quercus lobata (valley oak): 115955454
Help
Entry
115955454 CDS
T07350
Name
(RefSeq) anaphase-promoting complex subunit 1 isoform X1
KO
K03348
anaphase-promoting complex subunit 1
Organism
qlo
Quercus lobata (valley oak)
Pathway
qlo04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
qlo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
115955454
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
qlo04121
]
115955454
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
qlo03036
]
115955454
Ubiquitin system [BR:
qlo04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
APC/C
Other subunits
115955454
Chromosome and associated proteins [BR:
qlo03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid separation proteins
APC/C complex
115955454
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANAPC1
APC1_C
Apc1_MidN
APC1_3rd
PC_rep
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115955454
NCBI-ProteinID:
XP_030929436
LinkDB
All DBs
Position
8:63300831..63325629
Genome browser
AA seq
1822 aa
AA seq
DB search
MSVGVRRLTVLGEFKPFGLIAEALDGKPADNVTDKYDYFLFDPEVARERDESGEQHASGS
AFSDRSDHELFIRGSRIIWTIGSRVFKRFTLPSPIIKVCWCRLGNMAEALLCVLQIESLT
IYNTSGEVVSITLPRTIASIWPLPFGLLLQQAAEVHSPTHIPFSCSSPLLGVRDVHRRRR
ETSHSPQHNLNFLSGSDYNCKGDTGSISSHLILKDPLEEPQLTFIEERGKLNIMKEFDER
TIWTSDQIPLMASYNKGKMQHSVWVAEAVNSNLELANSSSADVVPAGVLQKQFSFRRIWQ
GKGAQTAASKVFLATDNDAAPVICFLHQEQKKLLSVRLQSVEINNEILFDIKPDMSWSIP
AVAAEPVIVTRPRVKVGQLPYADIFVLNPENALLLYSGKQCLCRYMLPSCLSKSQASLNL
DFPDTSSVSHDLKIIGLADAVEGRINVIVNNGQMFRCVFRRSPSSLLADDCITAMAEGLS
SSFYGHFLGLLWKDGDSAYLSNADSSVNLEWDSFCTIITQMCKSSVGTQDSVNSVPQSSW
EFLISSKFHKNYELNLITGTSCEMSLDVLGFLPRSHSDATQSLQKSFYSEVLMECLDSLH
AVYESLKLDILRKRDLELLAVLLCNIANFLGEESYLDHYVRDFPSISKKFGMDMTSCSWK
IPPSLFRWLENCLQHGSSVANIDDLPYLICKDGSPVVSWARKIVSFYSLLSGAKRIGKKL
STGVYCNIAMGSHCTHEELTVLAMVGENFGLQQLDSLPSGVSLPLRHALDKCRESPPSDW
PAAAYVLLGREDLALSCLACSCKSRELETQTNVNLISMSTPYMLHLHPVTIPSAVSDTIG
LESTKFEDTDSVDGSMTDGMEHIFNSSTQLRYGRDLRLNEVRRLLCSTRPVAIQTAVNPS
ASDQDLQQAQLWNLAQRTTALPFGRGAFTLATIYTLLTEAFTVPKLVLAGRLPAQQNATV
NLDPNLRNIQEIKSWPEFHNAVAAGLRLAPLQGKMSRTWIIYNKPEEPNAVHAGLLLALG
LHGYLRVLNLTDIYQYYQQEHESTTAGIMLGLAASYRGTMQPGISKSLYLHIPSRHPSSF
PELELPTLLQSAALMSVGLLYEGSAHPQTMQILLGEIGRRSGGDNVLEREGYAVSAGFSL
GLVALGRGGDTLGCIDSMVDRLFHYIGGKEARNERSLFLSLLTEEQNRGTAQMMDGTSVN
VDVTAPGATIALALMFLKTESEAIMSKLSIPNTRFDLQYVRPDFIMLRVIARNLIMWSRI
HPSKDWIQSQIPEIIQNGVKGLRDDFGDIDDMDAEAFVQAYVNIVAGACISLGLRFAGTK
NGNAQELLYEYAVYFLNEIKPVSATSGNTFPKGLSHYIDRGTLEICLHLIVLSLSVIMAG
SGHLQTFRLLRFLRSRNSADGHANYGIQMAVSLAIGFLFLGGGMRTFSTSNSSVAALLIT
LYPRLPTGPNDNRCHLQAFRHLYVLATEARWIQTVDVDTGLPVYAPLEVTTRETELYAET
SFCEVTPCLLPERAVLKTIRVCGPRYWSQVIDLCPEDRPWWTFRDKNNPFNSGVLYIKRK
VGACSYVDDPVGCQSLLSRAMHKVFGLTSSTTFDPSISSGSGPGSITVDQLVSTFSSDPS
LIAFAQLCCDPSWNSRSDVDFQEFCLQVLFECVSKDRPALLQVYLSLYTTIASMADQVMS
GTVVLSDSIFISSLKLALTYTEALLSGRLTTSRGGIVQSKFIGSLRKRVDELLNFSPGLK
DDFCNYLNSGKWPIMESEREKSAILLSWYLQWFGVPAPFVIKTAAERIKPKLMSSSLTPF
LRLLFPSTHINAIGEIDKFLSC
NT seq
5469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccgtcggggttcgccgcctcacagtgctcggcgagttcaagccctttggcttaatc
gccgaagccctggacggaaagcccgccgataatgtcactgacaagtacgattactttctc
ttcgaccccgaggtcgctcgggaaagagacgaatccggcgaacaacacgcttcgggctcc
gcgtttagcgatcggagcgatcacgagcttttcatcagagggagccggataatatggaca
ataggttcaagagtatttaagagattcaccttgccctccccaattatcaaggtgtgctgg
tgtcgtctgggtaatatggctgaagctcttctctgtgtcttacaaattgagtctttaaca
atctacaacacatcaggtgaggtagtatctattacgcttcctcgtaccattgcatcgata
tggcctcttccatttggtttattacttcagcaggcagctgaagtgcattcaccaacacat
attcctttttcatgttcaagtcctttattaggtgtacgcgatgtacaccgtcgtaggaga
gagaccagtcatagcccacaacataatctcaattttctgagtggatctgattataattgt
aagggagacactggttcaatatcttcacatctaattctgaaagatccactggaggaacca
cagttgacttttattgaagagagaggaaagttgaacataatgaaggaatttgatgaaaga
acaatatggactagtgatcagattcctctgatggcatcatacaacaaaggaaagatgcaa
cactcggtctgggttgcagaagcagttaattcgaaccttgaattggcaaatagtagttca
gctgatgtagttcctgctggtgtattacaaaaacaattctctttccgtagaatatggcag
gggaagggtgcccagacagctgctagtaaggtttttctggcaactgataatgacgcagct
cctgtaatttgttttcttcaccaagagcaaaagaagttgttgtctgtacggctacaaagt
gttgaaattaataatgagattctctttgatataaaacctgacatgagctggagcatacct
gcggttgcagctgaacctgtgattgtcacgcgccctagggttaaagtgggacagctaccg
tatgcagacatctttgtcttgaatccagaaaatgcccttcttctttattcaggaaagcaa
tgcctgtgtaggtatatgttaccttcgtgtttgagtaaaagtcaagcttcgcttaatttg
gattttccggacacatcatctgtgtcccatgacttaaagattatcggattggctgatgct
gttgagggacgtatcaatgtaatagtaaataatgggcagatgtttcgatgtgtatttcga
agaagcccatcatctttgttggcagatgactgcatcacagcaatggctgaagggctcagt
tccagtttctacggtcattttctgggtcttctttggaaagatggcgactctgcctattta
tcaaatgctgattctagtgttaatttagaatgggactcattctgtactattattactcaa
atgtgtaaaagctctgttggcactcaagattctgtaaattcggtgccacagtcatcttgg
gagtttcttattagcagcaaatttcacaagaactacgaacttaacttgattactggaact
tcttgtgagatgtcacttgatgtgctgggatttttacctaggtcacattcggatgctaca
caaagtttgcaaaaatcattttactctgaagtattgatggagtgtttggattctctgcat
gcagtttatgagagtctaaaactggatattcttcgcaaaagggacttggagcttctggcg
gttctattgtgtaatattgccaatttcctgggtgaggaaagctatttagatcattatgtt
cgtgattttcctagtatttctaagaaatttgggatggacatgacttcctgctcctggaaa
attcctcccagtttattccgatggcttgaaaactgtttgcaacatggaagtagcgttgct
aatattgatgatctaccatatttaatttgtaaagacgggagtcctgttgtaagttgggcc
cggaagatagtttccttttatagcttattatctggtgctaaacggattgggaaaaagctt
tcaactggtgtttactgtaacattgccatgggatcacattgcacacatgaggagctcaca
gttttggcaatggttggggaaaattttggactgcaacagctagactcactgccatctggt
gtatcccttcctttgcgacatgcattggataagtgtcgggaatctcctccctccgactgg
cctgcagctgcatatgttcttcttggtcgagaagatttggctttgtcttgcttggcatgc
tcatgcaaatcaagggaacttgagacgcaaaccaatgtgaatttgatctctatgtctaca
ccttacatgctacatttgcatccagttacaattccttctgcagtttctgatacaattggg
ttggaaagtaccaaatttgaagataccgattctgttgatgggtctatgacagatggtatg
gagcatatcttcaactctagcacacagttgagatatggtcgtgatctgcgattgaatgag
gttcgacgccttttgtgctctacaagacctgtggcgattcaaacagctgttaaccctagt
gcctctgatcaggacctccaacaggctcagctatggaaccttgctcagaggaccactgct
cttccttttggtcggggggcatttactcttgcaaccatatatactctgttaacagaggcc
tttacagttccgaagcttgttttagcaggtcggttgcctgcccaacaaaatgcaactgtt
aatctagacccgaacttacgaaatattcaagaaattaaatcttggcctgagtttcacaat
gctgttgctgctggactaaggctggccccccttcaggggaaaatgtcaagaacttggata
atatataacaaacctgaggaaccaaatgctgttcatgctgggcttcttcttgcattagga
ttacatggatatttgcgtgttttgaatcttactgacatataccagtattatcagcaggaa
catgagagcacaactgcaggaataatgcttggcctggcagcttcttataggggaacaatg
caaccggggatatcaaaatctctttatcttcacataccttctcgtcatccatcttccttt
ccagagttggagttaccaacccttctgcagtcagcagcattaatgtcagttggacttctt
tatgaagggtcagcacatccacaaacaatgcagattttattgggtgaaattggtcgtaga
agtggaggtgataacgtacttgaaagggagggttatgcagtttcggcaggattttcattg
ggtcttgttgcattgggtcggggtggagacacacttggttgcatagactcaatggttgat
cgattgttccactatattggtggcaaagaagctcgtaatgaacgatctcttttcttgtcc
ctattaacagaggaacaaaatcgtggaactgctcagatgatggatggaacatcagtaaat
gttgatgttacagcaccaggagctacaattgctcttgctttaatgtttttaaagactgaa
tcagaggcaattatgtcaaagctttctatacctaatacgcgttttgacttgcaatatgtg
aggcctgacttcataatgcttcgtgtcattgctcggaatttgataatgtggagcaggatt
catccttctaaagattggattcagtcccagattcctgaaattatccaaaatggtgtcaag
ggccttagggatgattttggtgatattgatgatatggatgcagaagcgtttgtccaggct
tatgttaatatagtggctggagcatgtatttctcttgggttaaggtttgctggtacaaag
aatggaaatgcacaggaattactctatgaatatgctgtctacttccttaatgagatcaag
cctgtttctgctacaagtggaaacaccttcccaaagggattgtctcattacattgatcgg
ggcacattagagatatgccttcacctaattgttctctccctctctgtgattatggctggt
tctggacatctacaaacctttcgattgttgagatttctccgcagcagaaattctgctgat
gggcatgccaattatggtattcagatggcagtaagcttagcaatcggcttcttgtttctt
gggggaggaatgcggacattttcaacaagcaacagctctgttgctgctttactgatcact
ctttatccgcgcttgcctactggaccaaatgacaatcgatgccaccttcaggcattccgg
catttgtatgtccttgcaacggaggctcgctggatccagacagttgatgttgatactggt
ctaccggtgtatgctcctcttgaagttacaactagggaaactgaactttatgcagaaaca
agtttttgtgaggttaccccttgccttctgccagaacgtgctgttctgaagacaatacgt
gtttgtggccctcggtactggtctcaagtaatagatctttgccctgaagatagaccttgg
tggactttcagggacaagaataacccattcaattctggtgttctgtatatcaaacgaaag
gttggagcttgttcatatgttgatgatcctgtaggctgtcagtctcttctgtcacgagca
atgcacaaggtatttggcttgacaagttcaacaacatttgatccaagtattagcagtggc
agtggacctggttccattacagttgatcagttggtcagtaccttctcatctgatcctagc
ttaattgcttttgcacagctctgctgtgacccttcctggaatagcagatccgatgttgat
ttccaggaattttgcttgcaagtattatttgagtgtgtgagtaaggacagaccagctctt
ctacaggtgtatttgtcactttatacaacaattgcgtctatggctgatcaggttatgagt
ggtactgttgttttaagtgactcaatctttatctctagtctaaagcttgcactaacctac
actgaggctctgttgagtggaagattgaccacttctagaggtggcattgttcaatctaaa
tttatagggtctcttaggaagagggtggatgagctcctaaatttttcgccaggattgaag
gatgatttttgtaattatttgaactctgggaaatggcctattatggaatctgagagagag
aaaagtgcaatacttctttcatggtaccttcagtggtttggagtaccggctccatttgtg
attaagacagcagcagagagaatcaaacctaagctcatgtcatcatctttaactcccttc
ttgcgtttgttatttccaagcactcacatcaatgctattggtgagatagataagttcttg
tcttgttag
DBGET
integrated database retrieval system
