KEGG   Quercus lobata (valley oak): 115958292
Entry
115958292         CDS       T07350                                 
Name
(RefSeq) pumilio homolog 4
  KO
K17943  pumilio RNA-binding family
Organism
qlo  Quercus lobata (valley oak)
SSDB
Motif
Pfam: NABP PUF PUF_NOP9 COG5_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 115958292
NCBI-ProteinID: XP_030932555
UniProt: A0A7N2MDQ5
LinkDB
Position
8:54946600..54955488
AA seq 1028 aa
MATGSSIDDGLQGADGNFEDGLQSELELILHQQRNQNVMNRERVMNMYRSGSAPPTVEGS
LTAVGSLFGNPDFREIGGSISNKIGGLSEDEIRSHPAYLSYYYSHENINPRLPPPLMSKE
DWRIAQRFQAGGSSLGGIGDWRKQKLADNGDSSSLFSMQPGVSVQQAENDLMELRNASRR
NLSRQSSSQWLNSSPDSSAGFSSTGLGARRKSFADILQEGLDRPTPLPRSLSRPTSRNSF
GDILDTKGMADPHPAGVSNGVESIEGLHFGAAPMVGVKNHNTTVSHTFAPAVGSSLSRSK
TPELQVVGRTACPGLPPVGSSRVSPIEKKNVVGLAVQNDRSSGVTDLTDIVANFSGLNLS
KSKNANEVSHLQSLLQLDYDNQPDFMLNMPNGHNQSLQQKLTDQSNAEKFSLTNNYIDLA
RKNGIVTNLNNSEISSDVNLPKQTSSAASLYSNVNSSGFGSSEASNFHHQSTNIPSMDFG
SHVPGAYTVNEKFNSAINGHIDAALTAPGDGQLLHRPRNQVGPDLHSPAMDPRFIQYLQR
TSDYVTHAVASPSDPSRGRNYFGTSHGDLEGAQQAYLEALLAKQKQQYELSHLGKSGGFN
HGYYGNPSYGFGMPYPGNPMVNAVLPSVGSGSPGFQNEQFSHFTSMMRSSMGGSIGPWLS
DGNMEGRFASPLLLDEFKTNKTRSFELSDIIDHVVEFSTDQYGSRFIQQKLETATAEEKA
KIFPEITPHARILMTDVFGNYVIQKFFEHGLESQRKELASQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQ
KALEVVGVDQQTQMVAELDGSIMKCVRDQNGNHVIQKCIECVPQDRIQFIISAFYGQVVA
LSTHPYGCRVIQRVLEHCNDPNTQQIIMDEIMQSVCILAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHER
SAIISKLAGQIVKMSQQKFASNVVEKCLTFGGPDERQLLVNEMLGSTDENEPLQIMMKDP
FGNYVVQKVLETCDDQSLELILSRIKVHLNALKRYTYGKHIVSRVEKLITTGERRIGLST
SFSSPSSS
NT seq 3087 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaactgggagtagcatagatgatggcttgcaaggagctgatgggaatttcgaagat
ggtttgcagagcgagcttgaattgattctgcatcagcagcggaatcagaatgttatgaat
cgagaaagggttatgaatatgtataggagtggcagtgctccgccaacagttgaggggtcg
ctaactgctgttggtagtctttttgggaaccctgattttagagagattggtggtagtata
agtaataagattgggggtttatctgaggatgagattcgctcccatcctgcttatctttcg
tattattattctcatgagaatattaacccgagactgcccccgccattgatgtcaaaagag
gattggcggattgcacaaaggtttcaggccggtgggtcttcgttagggggaattggggac
tggaggaagcagaagttggccgataatggcgatagttcatcgttgttttcaatgcagcca
ggtgtgtctgtgcaacaggcagagaatgatctgatggaattgaggaatgccagtcgaagg
aatctctctaggcagtcttcatctcagtggctcaatagcagtccagatagttcggctgga
ttctcaagcactgggcttggtgcaaggaggaagagtttcgctgacattcttcaggaagga
ctggatcgacctactcccttgcctaggagcctgtcacgtcccacaagtcgtaattctttt
ggtgatattttggacactaaaggaatggctgatccccatccagcaggggtaagtaatgga
gtggagtctatagagggcttgcattttggagctgctcccatggttggagttaaaaatcat
aatactacagtttctcatacttttgcccctgctgtgggttcatctttgtcaagaagcaaa
acccctgaactgcaagttgttgggaggacagcttgtcctggacttcccccagttgggagc
agtagagtttcccctattgagaaaaagaatgttgttggcttggctgtccaaaatgatcgg
tcttctggtgtgactgaccttactgatattgtggccaatttttccggcttgaacctctca
aaaagtaaaaatgcaaatgaagttagtcatttgcagtctctacttcagcttgattatgac
aatcagcctgattttatgctcaacatgcccaatggtcataatcagagtctgcagcagaaa
ctcactgaccagtctaatgctgaaaagttttctttgactaacaactacatagatttagct
aggaaaaatggaattgtaacaaaccttaacaattctgagataagttccgatgttaactta
cccaaacaaacatcttctgctgccagtctttactcaaatgtcaattcttcaggatttgga
agttcagaagcatcaaattttcatcaccaaagtacaaatattccaagtatggactttggt
agccatgttcctggtgcttatacagtaaatgaaaagttcaattctgcgattaatggccat
attgatgcagctttgactgctcctggagatggacaattattgcatagaccaagaaatcaa
gtagggcctgaccttcattctccagctatggacccacgttttattcagtacttgcaaaga
acttctgattatgtgacgcatgctgtagctagtccaagtgatccatctcgggggaggaat
tattttggcacttcacatggagacttggagggagctcagcaagcgtaccttgaggcattg
cttgctaaacagaaacaacaatatgagttgtcacatttaggtaaatctggtggttttaat
catgggtactatgggaatccatcatatggttttggcatgccatatccaggaaacccaatg
gtaaatgctgtacttccttctgttggatctgggagtccagggtttcagaatgagcaattt
tcacactttacttctatgatgagaagctcaatgggaggatccattgggccatggctttca
gatggtaatatggaaggaagatttgcgtcacccttattattagatgagttcaagaccaac
aagaccaggtcttttgaactttcagacattattgatcatgtggttgagttcagtacggat
cagtatggaagtcgctttattcagcagaaattagaaacagccacagcagaagaaaaggcc
aagatttttcctgagatcactcctcatgctcgtatcttgatgaccgatgtctttgggaat
tatgtcatacaaaagttttttgagcatggcttggaaagccaaagaaaggagttagcgagc
caactgactggtcatgttttgacccttagtctccaaatgtatggttgcagagtgattcag
aaggccttggaggtggttggtgtagatcagcagacacaaatggtggcagagcttgatggt
tcaatcatgaaatgtgttcgtgatcaaaatggtaatcatgttattcaaaagtgcatagag
tgcgtccctcaagatcgaattcagtttatcatctcagccttctatgggcaagttgtggca
ctttccacccacccttatggttgccgcgttattcagagggtcttggaacattgcaatgat
cctaacactcaacagattatcatggatgaaatcatgcaatctgtatgtattcttgcacaa
gatcaatatgggaactatgttattcagcacgtccttgaacatggtaaaccacatgaacgg
tctgctattattagcaagcttgcaggacagattgtaaagatgagtcagcagaaatttgct
tctaatgtggtggagaagtgcttgacttttggtggtcctgatgagcgtcaacttttggtg
aatgagatgcttggttccactgatgaaaatgaacccttgcagatcatgatgaaggaccca
tttggaaactatgttgtacaaaaggttcttgagacttgtgatgaccagagtcttgagttg
attctttcacgcatcaaggttcacttgaatgccttgaagaggtatacctatggtaaacat
atagtttctcgtgttgagaagctcatcacaactggagaaaggcgaatagggttgtcaacc
tctttctcttccccatcctcttcctga

DBGET integrated database retrieval system