Quercus lobata (valley oak): 115958292
Help
Entry
115958292 CDS
T07350
Name
(RefSeq) pumilio homolog 4
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
qlo
Quercus lobata (valley oak)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115958292
NCBI-ProteinID:
XP_030932555
UniProt:
A0A7N2MDQ5
LinkDB
All DBs
Position
8:54946600..54955488
Genome browser
AA seq
1028 aa
AA seq
DB search
MATGSSIDDGLQGADGNFEDGLQSELELILHQQRNQNVMNRERVMNMYRSGSAPPTVEGS
LTAVGSLFGNPDFREIGGSISNKIGGLSEDEIRSHPAYLSYYYSHENINPRLPPPLMSKE
DWRIAQRFQAGGSSLGGIGDWRKQKLADNGDSSSLFSMQPGVSVQQAENDLMELRNASRR
NLSRQSSSQWLNSSPDSSAGFSSTGLGARRKSFADILQEGLDRPTPLPRSLSRPTSRNSF
GDILDTKGMADPHPAGVSNGVESIEGLHFGAAPMVGVKNHNTTVSHTFAPAVGSSLSRSK
TPELQVVGRTACPGLPPVGSSRVSPIEKKNVVGLAVQNDRSSGVTDLTDIVANFSGLNLS
KSKNANEVSHLQSLLQLDYDNQPDFMLNMPNGHNQSLQQKLTDQSNAEKFSLTNNYIDLA
RKNGIVTNLNNSEISSDVNLPKQTSSAASLYSNVNSSGFGSSEASNFHHQSTNIPSMDFG
SHVPGAYTVNEKFNSAINGHIDAALTAPGDGQLLHRPRNQVGPDLHSPAMDPRFIQYLQR
TSDYVTHAVASPSDPSRGRNYFGTSHGDLEGAQQAYLEALLAKQKQQYELSHLGKSGGFN
HGYYGNPSYGFGMPYPGNPMVNAVLPSVGSGSPGFQNEQFSHFTSMMRSSMGGSIGPWLS
DGNMEGRFASPLLLDEFKTNKTRSFELSDIIDHVVEFSTDQYGSRFIQQKLETATAEEKA
KIFPEITPHARILMTDVFGNYVIQKFFEHGLESQRKELASQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQ
KALEVVGVDQQTQMVAELDGSIMKCVRDQNGNHVIQKCIECVPQDRIQFIISAFYGQVVA
LSTHPYGCRVIQRVLEHCNDPNTQQIIMDEIMQSVCILAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHER
SAIISKLAGQIVKMSQQKFASNVVEKCLTFGGPDERQLLVNEMLGSTDENEPLQIMMKDP
FGNYVVQKVLETCDDQSLELILSRIKVHLNALKRYTYGKHIVSRVEKLITTGERRIGLST
SFSSPSSS
NT seq
3087 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaactgggagtagcatagatgatggcttgcaaggagctgatgggaatttcgaagat
ggtttgcagagcgagcttgaattgattctgcatcagcagcggaatcagaatgttatgaat
cgagaaagggttatgaatatgtataggagtggcagtgctccgccaacagttgaggggtcg
ctaactgctgttggtagtctttttgggaaccctgattttagagagattggtggtagtata
agtaataagattgggggtttatctgaggatgagattcgctcccatcctgcttatctttcg
tattattattctcatgagaatattaacccgagactgcccccgccattgatgtcaaaagag
gattggcggattgcacaaaggtttcaggccggtgggtcttcgttagggggaattggggac
tggaggaagcagaagttggccgataatggcgatagttcatcgttgttttcaatgcagcca
ggtgtgtctgtgcaacaggcagagaatgatctgatggaattgaggaatgccagtcgaagg
aatctctctaggcagtcttcatctcagtggctcaatagcagtccagatagttcggctgga
ttctcaagcactgggcttggtgcaaggaggaagagtttcgctgacattcttcaggaagga
ctggatcgacctactcccttgcctaggagcctgtcacgtcccacaagtcgtaattctttt
ggtgatattttggacactaaaggaatggctgatccccatccagcaggggtaagtaatgga
gtggagtctatagagggcttgcattttggagctgctcccatggttggagttaaaaatcat
aatactacagtttctcatacttttgcccctgctgtgggttcatctttgtcaagaagcaaa
acccctgaactgcaagttgttgggaggacagcttgtcctggacttcccccagttgggagc
agtagagtttcccctattgagaaaaagaatgttgttggcttggctgtccaaaatgatcgg
tcttctggtgtgactgaccttactgatattgtggccaatttttccggcttgaacctctca
aaaagtaaaaatgcaaatgaagttagtcatttgcagtctctacttcagcttgattatgac
aatcagcctgattttatgctcaacatgcccaatggtcataatcagagtctgcagcagaaa
ctcactgaccagtctaatgctgaaaagttttctttgactaacaactacatagatttagct
aggaaaaatggaattgtaacaaaccttaacaattctgagataagttccgatgttaactta
cccaaacaaacatcttctgctgccagtctttactcaaatgtcaattcttcaggatttgga
agttcagaagcatcaaattttcatcaccaaagtacaaatattccaagtatggactttggt
agccatgttcctggtgcttatacagtaaatgaaaagttcaattctgcgattaatggccat
attgatgcagctttgactgctcctggagatggacaattattgcatagaccaagaaatcaa
gtagggcctgaccttcattctccagctatggacccacgttttattcagtacttgcaaaga
acttctgattatgtgacgcatgctgtagctagtccaagtgatccatctcgggggaggaat
tattttggcacttcacatggagacttggagggagctcagcaagcgtaccttgaggcattg
cttgctaaacagaaacaacaatatgagttgtcacatttaggtaaatctggtggttttaat
catgggtactatgggaatccatcatatggttttggcatgccatatccaggaaacccaatg
gtaaatgctgtacttccttctgttggatctgggagtccagggtttcagaatgagcaattt
tcacactttacttctatgatgagaagctcaatgggaggatccattgggccatggctttca
gatggtaatatggaaggaagatttgcgtcacccttattattagatgagttcaagaccaac
aagaccaggtcttttgaactttcagacattattgatcatgtggttgagttcagtacggat
cagtatggaagtcgctttattcagcagaaattagaaacagccacagcagaagaaaaggcc
aagatttttcctgagatcactcctcatgctcgtatcttgatgaccgatgtctttgggaat
tatgtcatacaaaagttttttgagcatggcttggaaagccaaagaaaggagttagcgagc
caactgactggtcatgttttgacccttagtctccaaatgtatggttgcagagtgattcag
aaggccttggaggtggttggtgtagatcagcagacacaaatggtggcagagcttgatggt
tcaatcatgaaatgtgttcgtgatcaaaatggtaatcatgttattcaaaagtgcatagag
tgcgtccctcaagatcgaattcagtttatcatctcagccttctatgggcaagttgtggca
ctttccacccacccttatggttgccgcgttattcagagggtcttggaacattgcaatgat
cctaacactcaacagattatcatggatgaaatcatgcaatctgtatgtattcttgcacaa
gatcaatatgggaactatgttattcagcacgtccttgaacatggtaaaccacatgaacgg
tctgctattattagcaagcttgcaggacagattgtaaagatgagtcagcagaaatttgct
tctaatgtggtggagaagtgcttgacttttggtggtcctgatgagcgtcaacttttggtg
aatgagatgcttggttccactgatgaaaatgaacccttgcagatcatgatgaaggaccca
tttggaaactatgttgtacaaaaggttcttgagacttgtgatgaccagagtcttgagttg
attctttcacgcatcaaggttcacttgaatgccttgaagaggtatacctatggtaaacat
atagtttctcgtgttgagaagctcatcacaactggagaaaggcgaatagggttgtcaacc
tctttctcttccccatcctcttcctga
DBGET
integrated database retrieval system