Quercus lobata (valley oak): 115959567
Help
Entry
115959567 CDS
T07350
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
qlo
Quercus lobata (valley oak)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
qlo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
qlo01003
]
115959567
Glycosyltransferases [BR:
qlo01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
115959567
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115959567
NCBI-ProteinID:
XP_030933869
UniProt:
A0A7N2MJ67
LinkDB
All DBs
Position
9:23769769..23775729
Genome browser
AA seq
1146 aa
AA seq
DB search
MASKSFHMSRSNLSTSSDAVSESQNKPPLPPTVTFGRRTSSGRYISYSRDDLDSELGSGE
FMNYTVHIPPTPDNQPMDPMISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESDTSHPQ
MAGAKGSSCAIPGCDANVMSDERGSDILPCECDFKICRDCYIDAVKTGGGICPGCKEPYK
NTDLDEGAVDSSGRPLPLPPPNGMSKMERRLSLMKSTKSVLMRSQTGDFDHNRWLFETRG
TYGYGNAIWPKDGGFENGKDDETTEPTELMNKPWRPLTRKLKIPAAIISPYRLLIVIRMA
VLALFLMWRINHPNNDAIWLWGMSVVCEIWFAFSWLLDQLPKLCPINRATDLNVLKDKFE
TPSPNNPTGKSDLPGIDIFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGA
LLTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHDIEPRNPESYFSLKRDPYKNKVKSDFVKDRRRVKRE
YDEFKVRINGLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKVQRQNRGDEPVEGVKIPKATWMADGTHW
PGTWLQSSSEHSKGDHAGIIQVMLKPPSEEPLLGIADDTKLIDVTDIDIRLPLLVYVSRE
KRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSQAMREGMCFMMDRGGDRL
CYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDINMRALDGIMGPVYVGTGCLFRRVALYGFDPPR
SKEHHPGCCSCCFGRSKKHSSVSNTPEENRSLRMGDSDDEEMNLSLLPKRFGNSTFLIDS
IPVAEFQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGQRVG
WIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFF
SRNNALLASPRMKLLQRIAYLNVGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLV
YLLVITLTLCMLAILEIKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKILAGIEIS
FTLTSKSGGDDVDDEYADLYVVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSTIPQWSKL
IGGVFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAISPPSSTDQIG
GSFQFP
NT seq
3441 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtctaagtccttccacatgagtagatcaaatctatcgacgtcttctgatgcggtt
tctgaatctcaaaacaagcctccactacctccaactgtgacctttggccggagaacttcc
tccggtcgttacatcagctactccagggatgatcttgatagtgagcttgggagtggtgaa
ttcatgaactatacagtacatataccaccaacccctgataaccagcctatggatccaatg
atttcacaaaaggttgaagaacaatatgtgtcgaattcactctttacaggtgggtttaat
agtgttactagagctcatctcatggacaaggtgattgagtctgatacaagccatccccag
atggctggtgcaaaaggctcttcatgtgcaattcctgggtgtgatgcaaatgtgatgagt
gatgagcgtggctcggacattctcccttgtgagtgtgatttcaaaatatgtcgggactgt
tatattgatgcagtgaaaactgggggtgggatttgtccagggtgtaaggagccttataag
aacactgatttggatgaaggagctgtggatagtagcgggcggccacttccccttcctccg
ccaaatgggatgtcaaaaatggagaggaggttgtcgttgatgaagtcaacaaagtcagtg
ttgatgaggagtcaaactggggactttgatcacaatcggtggctatttgaaacaaggggg
acttatggatatgggaatgccatatggccaaaggatgggggttttgaaaatgggaaagat
gatgaaactactgagccaacggagttgatgaacaaaccgtggaggccacttacacggaaa
ttgaagatacctgctgctattatcagcccatatcggcttctaatcgtcattcgtatggct
gttcttgcattgtttttgatgtggaggatcaaccaccccaacaatgatgcaatttggcta
tggggaatgtctgtagtttgtgagatatggtttgctttttcttggctgcttgatcaactt
cccaaactctgcccaatcaatcgtgctacagatcttaatgttttaaaggacaaatttgaa
acacctagtcccaacaaccccactggaaaatctgatctcccaggcatagatatctttgtc
tctactgcagatccagagaaagaaccaccactggtcactgcaaacactatcttatctatt
cttgcagctgattacccagttgaaaagcttgcttgctatgtttctgacgatggaggtgca
cttctaacctttgaggccatggccgaagcggcaagctttgctaatatatgggttccattc
tgtcgtaaacatgatattgagcccaggaatccagaatcttacttcagtttgaagagggat
ccttacaagaacaaagtaaagtcagattttgtcaaagatcgtagacgagtgaagcgtgag
tatgatgagttcaaggtccggatcaatggcttgcctgactctattcgccgccgttcagat
gcctatcatgctcgagaggaaatcaaggccatgaaggttcagagacagaacaggggtgat
gaaccagtagagggtgtgaagatcccaaaagcaacatggatggctgatggaactcattgg
ccagggacttggttgcaatcttcatctgagcactccaaaggagaccatgctggtataata
caggtgatgttgaaacctcccagtgaagaaccactactcggaattgctgatgataccaag
cttattgacgtcactgacattgatattcgtctcccgcttcttgtttatgtgtctcgtgag
aagcgtccaggctatgatcacaacaagaaggctggggccatgaatgccctggttcgagct
tcagctattatgtccaatggccctttcattctcaaccttgactgtgaccactatatctac
aattcccaagctatgagggagggcatgtgcttcatgatggatagaggaggtgatcgcctt
tgttatgtccagttcccccagaggtttgaggggattgatccatctgatcgatatgccaat
cacaacactgttttctttgatatcaacatgagagcccttgatgggattatgggccccgtc
tatgtcggaactggatgcctctttcgaagggtagccctttatggttttgatccacctaga
tctaaagaacaccaccctggctgctgcagttgctgctttggccgttccaaaaagcattcc
tcagtttcaaacaccccagaagagaaccgatctctgagaatgggtgattctgatgatgaa
gagatgaacctctctttgctccctaaaaggtttgggaactcaactttcctcattgattcc
atcccagtggcagagttccaaggccgtcctcttgcagatcacccagctgtgaaaaatgga
cgcccacctggtgctctcactattccccgtgagcttcttgatgcatcaactgttgcggag
gcaatcagtgttatctcatgttggtatgaagacaagacggagtggggacaacgtgttggt
tggatttatgggtcagttactgaagatgtggtcacagggtataggatgcacaataggggg
tggaaatcagtgtattgtgtgaccaagcgtgatgctttccgaggaacagctcctatcaat
cttactgataggctccatcaggtcctccggtgggctactggttcagttgagattttcttc
tcccgcaacaatgcccttcttgccagtccaagaatgaagcttctgcagagaatagcatac
cttaatgttggcatctacccctttacttccatcttcctgattgtatactgctttctccca
gcactctcacttttctctggccagttcattgtccagactctcaatgtcactttccttgtc
tacctccttgttatcactttgactctatgtatgcttgctatccttgagattaaatggtct
ggcattgagctagaggaatggtggaggaatgagcagttttggttgattggagggactagt
gctcaccttgctgctgtgcttcagggacttctaaaaatccttgctgggattgaaatttct
ttcactttgacatcaaaatcaggaggtgatgatgtggatgatgagtatgctgatctctat
gtagtcaaatggacatccttgatgataccaccaatcacaatcatgatggtcaacttaatt
gctattgctgttggatttagccgaacgatatacagtactataccacagtggagcaagtta
ataggtggtgttttcttcagtttttgggtcctggctcatctctaccctttcgccaaaggg
ctgatgggacgaagagggaggacaccaaccattgtttttgtttggtcaggactcattgca
atcactatatccctcctttgggtggcaatcagtcccccttctagcactgatcaaattgga
ggctcattccagttcccctga
DBGET
integrated database retrieval system
