Quercus lobata (valley oak): 115962877
Help
Entry
115962877 CDS
T07350
Name
(RefSeq) expansin-A1-like
KO
K20628
expansin
Organism
qlo
Quercus lobata (valley oak)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
qlo00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99981 Carbohydrate metabolism
115962877
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Expansin_C
DPBB_1
EXPB1_D1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115962877
NCBI-ProteinID:
XP_030937615
UniProt:
A0A7N2MPS0
LinkDB
All DBs
Position
10:17275575..17277794
Genome browser
AA seq
248 aa
AA seq
DB search
MALVGLLFLVFLSLGSCVYGYGGGWINAHATFYGGGDASGTMGGACGYGNLYSQGYGINT
AALSTAMFNNGLSCGACFEIKCVNDPKWCLPGSVVVTATNLCPANINLPNNDGGWCNPPQ
HHFDLSQPIFEKIALYRAGIVPVAYRRVPCRKRGGIRFTINGKGNFNLVLITNVGGAGDV
HAVSIKGSRTNWQPMFRNWGQNWQSNSYLIGQALSFKVTTSDGRTVVSNNIVPAGWAFGQ
TFSGLQFP
NT seq
747 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacttgttggacttctcttcctggtgtttctctctttgggttcgtgtgtttatgga
tatggtggaggttggattaatgcccatgccactttctatgggggtggtgatgcctctggt
acaatgggtggggcttgtgggtatggaaacctatacagccagggatatgggataaacaca
gcagctttgagcacagcaatgttcaacaatggactgagctgtggggcttgttttgagatt
aagtgtgtgaatgacccaaagtggtgcctacctggttcagttgtggtcactgctacaaac
ttatgcccagcaaacatcaacctccctaacaatgatgggggttggtgcaaccctcctcag
caccattttgatctctctcagcctatcttcgaaaagattgctctatacagagctgggatt
gttcctgtggcttacagaagggtcccttgccgaaagagagggggtatcagattcaccatt
aacggcaaaggtaacttcaacctagtcttaatcaccaatgttggaggtgctggtgatgtt
catgctgtctctatcaaaggctcaagaaccaattggcaaccaatgttccgaaactggggt
cagaattggcaaagcaatagttacctcattggacaagctctctcttttaaggtcaccaca
agtgatggtcgcactgtggtttctaacaatattgtccctgctggttgggcctttggccag
acctttagtggtcttcaattcccatga
DBGET
integrated database retrieval system
