Quillaja saponaria (soapbark tree): O6P43_003170
Help
Entry
O6P43_003170 CDS
T09778
Name
(GenBank) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
qsa
Quillaja saponaria (soapbark tree)
Pathway
qsa03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
qsa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
O6P43_003170
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
qsa03019
]
O6P43_003170
Messenger RNA biogenesis [BR:
qsa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
O6P43_003170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Laminin_G_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KAJ7979813
UniProt:
A0AAD7QE47
LinkDB
All DBs
Position
2
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEHFSIYGDVLQTAVMRDKITGKPRGFGFVVFADPAVL
DSVLQVKHTIDGRTVDAKRALSREDQQSSVTVRAGNPNSARSTGGGASIRTKKIFVGGLP
PTLTEEEFRQYFEAYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDAEDAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGAGGRMGGGVGGGYQGYGSSGGNSNSYDGRMDSNRYIQTQGTGGGF
PPYGSSGYSATGYGYGPANNGVGYGGYGSYGGPSTGYGGPSGATYGNPNVPNAGYASGPP
GATRTSWSSQAPSGYGSMGYGNTAPWGAPSGGAGSGGGGLGSVPSGQSPSGGTGYGNQGY
GYGGYSGSDSSYGNQGAYGAVGGRSGSVPNSNAGGPGSGELQGSGSGYMGSGYGDTNGNS
GYGNAPWRSDPTQGGYGGGYGGAQARQAQQQ
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggtaagctttttattggtgggatttcatgggagacatccgaggat
aagctaaaggagcattttagcatctatggtgatgtgctacagactgcagtaatgagggac
aagatcactgggaaacccagaggttttgggttcgtagtatttgcagatccggctgtcctt
gatagcgttcttcaagttaagcacactatcgatggaagaacggtagatgccaagagagcc
ttatcaagagaagaccagcaaagctctgtcactgtcagagctggaaatcctaattctgct
aggagtacaggtggtggtgcaagtatcagaaccaaaaagatatttgttggaggattgcct
cctactttgactgaagaagaatttcgtcagtattttgaagcttatggccatgtaaccgat
gttgtagtcatgtatgatcagaatacaggacgcccacgtggatttggttttatttctttt
gatgctgaagatgcagttgacagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatggtaag
caagtagaagtaaagcgggcgcttcctaaagatgccaatcctggtgctggtggccgtatg
ggtggtggagttggtggtggttatcagggctatgggtcatctggtggtaattcaaattca
tatgatggtcgtatggattctaataggtacattcaaacccaaggtactggaggtggcttt
ccaccttatggttcttcaggatacagtgctactgggtatgggtatggtcctgctaacaat
ggtgttggttatggtggttatggaagttatggtggtcctagtactggatacggtggacct
tctggtgcaacatatgggaatccaaatgtccctaatgctggttatgccagtggtccacct
ggtgctactagaacttcatggagctctcaagctccatctggttatggttctatgggctat
gggaatactgctccctggggtgctccaagtggtggtgctggatcaggtggcggcggcctg
ggttctgtaccttctggtcaatctccaagtggagggactggatatgggaatcaaggttat
gggtatggtgggtatagtggcagtgatagctcttatgggaatcaaggtgcatatggtgca
gttggagggcgttctgggagtgtcccaaatagtaatgctggtggtccaggaagtggggaa
ctacagggcagtggtagtggctatatgggaagtggctatggtgacacaaatgggaattcg
ggttatggaaatgcaccatggagatctgacccaacacaaggtggttatggtggtggctac
ggtggtgctcaggcccgacaggcccagcaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
