Quillaja saponaria (soapbark tree): O6P43_028205
Help
Entry
O6P43_028205 CDS
T09778
Name
(GenBank) Pumilio-like protein
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
qsa
Quillaja saponaria (soapbark tree)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KAJ7947619
UniProt:
A0AAD7KX23
LinkDB
All DBs
Position
12
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMLGGNEGSFGDEFEKEISMLLREQRRQEADDQERELNLYRSGSAPPTVEGS
LSAVGGLFGGSGGGGAAAAFSEIAAAKNGNGFASEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNPRLPP
PLLSKEDWRFAQRLKGGASVLGGIGDRRKVNRVDDNGARSLFSTPPGFNLRKQKPEIETD
KLRGSAEWGGDGLIGLPSLGLGSKQKSLAEIFQDDLGQATSVTGLPSRPASRNAFDENVE
FVGSAEDELAQLCSDSTPTDPLRSGSTVQGSSATQNICPPSSYTYAAALGSSLSRSTTPD
PQLVARAPSPCLTPIGGGRVGSSDKRGVTNPDSFNGLPSGVNESTDLVAALSGMDLSSDG
ANHMPSQPEQDVDNHQRYLFGLHGGKSNGNGLDINNLTLDRQVGLQKSPLRSNNSYLKGS
PKPTFNGGGGLPAHYQQLDGTNSSFTNYGLSGYAVDPALASMMVSQLGTGNLPPLFENVA
AASAMAAPGMDSRILGGGLASGAAASAGHNLGRMGNQITGSALQAPFVDPMYLPYMRPSE
YAAAQLTALNDPSVDRNYLGNSYLNLLELQKAYVGSLLSPQKSQFNVPLGGKSGSFNHHG
YYGNPTYGVGMSYPGSPVANTVMPNSPVGSGSPIRHGELNMRFPSGMRSLAGAGDVMGPW
HLDAGCNMDESFASSLLEEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATAE
EKNMVYQEIMPQALALMTDVFGNYVVQKFFEHGLTSQRRELANNLYGHVLTLSLQMYGCR
VIQKAIEVVDLDQKIKMVQELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDAIQFIVSTFFDQ
VVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDPKTQNKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKP
HERSAIIKELAGNIVQMSQQKFASNVVEKCLAFGGLSERQLLVNEMLGSTDENEPLQAMM
KDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIA
AQAAQPA
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggaagaagaccgatgcttggaggtaacgagggatcttttggggat
gaattcgagaaagagataagtatgttgcttcgcgagcagcgtaggcaagaggcagatgat
caagaacgcgagctcaatttgtatagaagtggatcagcacctccaactgttgagggttcc
ttgagtgcagtcggtggattatttggtggcagcggcggcggcggtgctgctgctgccttc
tctgagattgctgcggctaaaaatggaaatgggtttgcatcagaggaggagctcaggtcg
gatcctgcttatctttcgtattattactcgaatgtgaatttgaatccacggcttcctcct
cctttgttgtcaaaggaggattggaggtttgcgcaaaggctaaaaggcggagcttcagtg
ttgggtgggatcggagataggagaaaagttaacagggttgacgataatggtgctagatca
ttgttttcaacgcctccaggatttaacttgaggaaacaaaagcctgagattgagactgac
aaattacgaggttcagctgagtggggtggcgatggactgattggtttgccaagtttagga
cttgggagcaaacaaaagagccttgcagaaatttttcaggatgacttagggcaagcaact
tcagtcactgggcttccttctcgtccagccagccgtaatgcttttgatgaaaatgttgag
tttgtaggttctgctgaagatgagctggctcagttgtgcagtgactctacacctactgat
cctttaagatctgggtcaactgttcagggatcatctgcaacacaaaatatttgcccacca
tcttcttatacttatgctgctgctttgggttcttccttgtcaagaagcaccactcctgat
ccccagcttgttgctagggcccccagtccatgtcttacaccaattggaggcgggagagtt
ggatcctcagataagagaggtgttaccaatccagattcatttaatggtcttccatctggt
gtcaacgagtccactgatctggtagctgcattatccggaatggacttgtcatcagatggt
gcaaaccatatgccatctcagcctgaacaggatgttgataatcaccagagatatcttttt
ggcttgcatggtggtaagagtaatgggaacgggttagacattaacaacttgaccttggat
aggcaagtggggctacaaaaatctcctttacgttctaataactcgtacttgaagggatcg
cctaagcccacctttaatggtggaggtgggttacctgctcattaccagcagttagatggt
acaaattcatcttttaccaactatggcttaagtggatatgccgtagatccagcattggcg
tccatgatggttagccaacttggcactggtaatctgccacccttgtttgaaaatgttgca
gctgcatcagcaatggcagcccctggaatggactctagaattcttggaggaggtttggct
tctggagctgctgcatctgcaggacataatcttggtagaatggggaatcaaattacaggt
agtgctcttcaggccccgtttgttgatcctatgtatcttccgtatatgaggccatcggag
tatgctgcagcacaacttactgcgcttaacgatccctctgtggataggaactacttagga
aattcatacttgaatttacttgagcttcagaaagcttatgttggatctctgctgtctcct
cagaagtcacagttcaatgttccattaggtggtaaatcaggcagctttaatcatcatggt
tactatggaaatcctacttatggtgttggtatgtcttaccctggaagtccagtggcaaac
actgttatgcctaactccccagttggatctggtagtcctatcaggcacggtgaactcaat
atgcgttttccttctgggatgagaagtttagctggagctggagatgtcatgggaccttgg
cacctggatgctggatgtaacatggatgaaagctttgcatcctctttactggaagagttt
aaaagcaataaaaccaaatgttttgagctttcagaaattgctggtcatgttgttgaattc
agtgcggatcaatatgggagccgattcattcaacaaaaacttgaaacagcaacggctgaa
gaaaagaacatggtttatcaggaaatcatgccccaagctcttgctttgatgactgatgtc
tttggtaactatgtggtccagaagttctttgaacatggacttacttctcaaagaagagaa
ttggccaacaatctatatggccatgtgctgacacttagccttcagatgtatggttgccgg
gtgatccagaaggcaatagaagtcgttgatctggatcagaaaataaaaatggttcaagag
cttgatggtcatgtcatgcggtgtgtacgtgatcagaatgggaaccatgttattcagaaa
tgtatcgagtgtgttcctgaagatgcaattcagtttattgtctcaactttctttgatcaa
gttgtgaccctttcaactcatccatatgggtgtcgggttatacagagagtactggagcac
tgtaaggacccgaaaacacagaataaggttatggatgagattttaggagctgttagcatg
ttggcacaagatcagtatggcaattatgttgttcagcacgtactggaacatggaaagcct
catgagcgctctgctatcataaaggaattagctggaaacatagttcaaatgagtcagcaa
aagtttgcctccaatgttgtggagaagtgtttggcctttggaggtctttctgaacgccaa
ttattggtgaatgagatgcttggctctacagatgaaaatgagcctcttcaggcaatgatg
aaagatcaatttgcaaactacgtcgtacagaaagtgctagagacatgtgacgaccaacaa
cgcgagctgattctttcacgaattaaagttcatttgaatgcattgaagaaatacacttac
ggaaaacatattgttgcccgagtagagaaacttgttgctgctggagaaaggagaattgct
gctcaggctgcccagcctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system