Quercus suber (cork oak): 111989287 Help Entry 111989287         CDS       T05868                                  Name (RefSeq) phytochrome C Organism qsu  Quercus suber (cork oak) SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c PAS_4 PAS_9 PAS_8 HisKA KOWx_SPT5 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  111989287 NCBI-ProteinID:  XP_023876840 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 1123 aa AA seqDB search MSSKSVSNKTNCSRSSSALSKHGARVVAQTPIDAKLHVDFEETKRFFDYSTSIDFNLSCS TSNVPSSTVSAYLQNMQRGSLIQPFGCIIAVDDENFSVLAYSENAPEMLDLAPHAVPSIE QQEALTFGTDVRTLFRSSGATALQKAANFGEVNLLNPILVHCKTSGKPFYAILHRIDVGL IIDLEPVNPADVPVTAAGALKSYKLAAKAISKLQSLPSGNISLLCDVLVKEVSDLTGYDR VMVYKFHEDEHGEVVAESRRPDLEPFLGLHYPATDIPQASRFLFMKYKVRMICDCLAPPV KVIQDKRLSQPLSLCGSTLRSPHGCHAQYMANMGSIASFVMSVTINEDDNEVESDQQKGR KLWGLIVCHHTSPKFIPFPLRYACEFLIQVFGVQINKEVELAVQLREKHILRTQTVLCDM LLRDAPVGIVTQSPNVMDLVKCDGAALYYRKKIWLLGVTPTEAQIRDIAEWLLEYHNGST GLSTDSLMEAGYPAASVLGDEVCGMAAVRITSKDFLFWFRSHTAKEIKWGGAKHDPGDKD DGRKMHPRSSFKAFLEVVKQRSRPWEDVEMDAIHSLQLILRGSLQDEIVDESKIIVNVPL VDDRIQRVDELRAVTSEMVRLIETAAVPILAVDGSGSINGWNTKSAELTGLSVEQAIGMS LIDLVSDDSVEVVKNLLNLASQGIEEQNIEIKLKTFGPQENNGPVILVVNACCSRDTKEN VVGVCFIGQDVTGQKVIWDKYTRIQGDYVGIMRSPSALIPPIFMTDEHGRCLEWNDAMQK LSGLRREEATERMLLGEVFTVKNFGCRVKDHDTLTKLRILLNGVIAGHDADKLLFGFYDR LGNYVEALLSANKRTDAEGRITGALFFLHVASPELQYAMQVQRISGKAEADSIKKLSYFR QEISKPLNGIMFMQNLMGSSNLSKEQKQLIKTSSLCQEQLAKVVDDTDIERIEECYMEMS SGEFNLGEALEVVINQVMILSQERQVQVIRDSPAEVSSMNLYGDNLRLQQVLSDFLANAL HFTPAFEGSSIAFRVIPRKERIGMKMHIVHLEFRITHPAPGIPEDLIQEMFHHNYGVSRE GLGLYICQKLVKIMNGTVQYLREAERSSFIILIEFPLVCPIDQ NT seq 3372 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtcatcaaaatcagtttcgaacaagacgaattgctctaggagcagttctgctctatca aagcatggggctcgtgtagttgcacagacgcccatcgatgcaaagcttcatgtggacttt gaagagaccaaacggttttttgattactccacttcaattgacttcaacctgtcatgttcc actagtaatgtcccctcctccactgtgtcagcttatctccaaaatatgcaaagaggaagc ctcattcaaccgtttggttgcatcattgctgtggatgacgaaaatttctctgttcttgcc tatagtgaaaatgcccctgaaatgttggacttagctccacatgctgttccaagcattgag cagcaagaagctctcacttttggaacagatgttcgaacactctttcgctcctcgggtgcg actgctttgcagaaagcagccaattttggtgaagtaaatcttcttaatcccatattggtt cattgtaaaacctcaggtaagccgttttatgcaattctgcaccgaattgatgttgggtta attatagatttggaaccagtgaatccagctgatgtgcctgtgactgctgctggggcgttg aaatcttataagctagcagccaaagccatctcaaaattgcagtccttgccaagtgggaat atatcattgttatgtgatgttttagttaaggaagtaagtgatttgacaggttatgatcgt gttatggtgtataaatttcatgaagatgagcatggggaagttgtagctgagagccgcaga cctgacttggaaccttttcttggtttgcattacccggctactgacataccacaagcttca agatttctattcatgaaatacaaagttaggatgatatgtgattgtttggcacctccagtg aaggtaattcaagacaagagattgtctcagccattgagcctttgcggatctacattgaga tctcctcatggttgtcatgcacagtatatggcaaatatgggttccattgcatcttttgta atgtctgtgactatcaatgaagatgacaatgaggtggagagtgatcagcagaagggaaga aaattgtggggcttgattgtttgtcatcacacaagtcctaagtttattccatttcctttg aggtatgcctgtgagttcttgattcaagtttttggtgtacagatcaacaaagaagtggag ttggctgttcaactgagggagaagcatattttgcgaactcaaactgtgctttgtgacatg ctccttagagatgctcctgtaggtattgtcactcaatcacctaatgtaatggatcttgtt aagtgtgatggagctgcactatactacaggaaaaaaatttggttgcttggggtcacccca acagaggcacaaattagagatatagctgaatggcttcttgagtaccataatgggagcaca ggtttaagtactgatagccttatggaagctggctacccagctgcttcagttcttggagat gaagtttgtgggatggcagctgttaggattacttcaaaggatttcctgttctggttccgg tcccacactgcaaaggaaatcaagtggggtggtgcaaaacatgaccctggtgacaaggat gatggaagaaagatgcaccccaggtcgtcattcaaggcttttctggaggtagttaagcag cgtagtcggccttgggaagatgtggaaatggatgccatccattcattgcagctgatattg cgaggatctttgcaagatgagattgtggatgagtccaagatcattgtgaacgttccattg gttgatgacaggatacagagagtggatgaattgcgtgcggtcacaagtgaaatggttcgc cttattgaaacagctgcagtccccatattggctgttgatggctctggtagtataaatggg tggaataccaaatcagctgaactaacaggactgtctgtcgagcaagccattggtatgtcc ttaattgatcttgtctccgatgattcggttgaagtggtgaagaatctgctcaacttagct tcacaaggaatagaagagcaaaatattgaaatcaaacttaaaacattcggtcctcaagaa aacaacggtcctgtaatattggtagttaatgcatgttgcagccgggacacaaaagaaaat gttgtaggggtttgctttattggccaagatgtcacaggacaaaaggtgatttgggacaaa tatactcgtatccaaggtgattatgttggaatcatgcggagcccttctgcacttattcct ccaattttcatgactgatgagcatggccgatgcttggaatggaatgatgcaatgcagaaa ttatctggtttgaggagggaagaagcaactgagcggatgcttcttggggaagttttcaca gtaaaaaattttggttgtcgggttaaagatcatgacacattgaccaagcttaggatacta cttaatggggtaattgctggccatgatgccgataagttgttatttggattctatgatcga ttgggtaattatgttgaagcattactttctgcaaacaaaaggactgatgcagagggaagg attactggggctttgttctttttgcatgtggctagtccagaacttcaatatgctatgcag gtgcagagaatatcaggaaaggctgaagctgatagcatcaagaaattgtcatattttcgt caggaaatcagcaagcctttgaatgggattatgtttatgcagaatctaatgggatcctct aatttaagtaaagagcagaagcaactaataaagacaagctcattgtgtcaggaacaatta gccaaggtggttgatgatactgatattgaaagaattgaggaatgctacatggaaatgagc tctggtgaattcaaccttggggaagctcttgaagttgtcataaatcaagttatgattttg agccaggagcgccaggtgcaggtcatccgtgattcacctgctgaagtttcatcaatgaac ttatatggagacaacttgaggcttcagcaagttctttcagattttttggctaatgcactc cacttcacccctgcattcgaaggatcctctattgcattcagagtgattccaaggaaggag cgtatagggatgaaaatgcacattgtccatcttgaatttaggatcacccatccggcacct gggattccagaagatctaattcaggagatgtttcaccacaactatggtgtctcaagggaa gggcttggcctatacatttgccagaagcttgtgaagatcatgaatggcactgtacaatat ctgagagaggcagagagatcatcctttataattcttatagaattcccattggtttgtccc attgaccaatga

DBGET integrated database retrieval system