Quercus suber (cork oak): 112033157
Help
Entry
112033157 CDS
T05868
Name
(RefSeq) pumilio homolog 6, chloroplastic
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
qsu
Quercus suber (cork oak)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
PUF_NOP9
NABP
CPL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112033157
NCBI-ProteinID:
XP_023921706
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
983 aa
AA seq
DB search
MATESPIRMSETSGKWPTHKEAVTFVASSASMAAEELGLLLKGRGFQVSGRDAVPNRSGS
APPSMEGSFLSQQTHNLNASLESLNNAFKNFESEEQMRSDPAYVAFYCANINQNPRLPLP
LTSSENRRLVRHIGSFGNNWMLASMDDSGNGSLRMSHGPLSTHKEESEDDQSPQKPYDDR
VDGTSGFWAGQDVASLGGQHKNVVDLIQEDFPRTPSPVYSQSNLLSQGVVDEAVDHDALI
GTSNGVSSTLGSDDRRISSDSDPLAAPTSSSSSHDRTGRADVNDSDVTAMESQMKSLNIS
NLPNSENQKSQEQWQYSGQNNLLQHQVHQQQSNLSQAQSAKSRVISQGVNCAYIGVDQVL
HNPSKFAEVQPVLQSSGFTPPLYTSAAAYMASTNPFYPNLQAPGLYSPQFVGGYAVNPAA
VPPYIAGYPPNGAVPVVVDGAAGPSYTAQTSGVSTGGNVAHGADVQHLSKLFGQFGFPLQ
GSFGDPIYMQYHQHPYGEAYSGIAGQLDPLASRGGVNIGNQASVLDSQRGSNNAGYLEDH
KFGHQINGGPSHFNPGRGGMMSPSYYGSPSNMGFVMQYPNSPLASPVLPGSPVGGTSIPG
GRNEMRFAPGSGRNAGVYPGWQGQRGFESFGDPKIYNFLEELKSGKGRRFELSDIVGHIV
EFSADQHGSRFIQQKLESCTGEEKASVFKEVLPHASKLMTDVFGNYVIQKFFEYGSPEQR
KELANQLTGQVLPLSLQMYGCRVIQKALEVIEPEQKAQLVRELDGHVMRCVRDQNGNHVI
QKCIESVPTERIGFIISAFRDQVAMLSMHPYGCRVIQRVLEHCTNELQCQFIVDEILESV
CTLAQDQYGNYVTQHVLERGKPHERSQIIRKLSGHIVQLSQHKFASNVIEKCLEYGGPTE
RELLIGEIFGHNEGTDNLLTMMKDQFANYVVQKILEICSDNQRAVLLARVRVHAHALKKY
TYGKHIVARFEQLFGEENPVAGS
NT seq
2952 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacagagagtcctattagaatgtcagaaactagtggaaaatggcccacccataag
gaggctgtgacatttgtggcatcatctgctagtatggcagcagaggagttgggattgctt
ctcaagggccgtgggtttcaagtcagtgggagggatgctgtccctaatcgaagtggaagt
gcacccccaagcatggaaggttcatttttgtcccagcaaacccacaacttgaatgcaagc
ttggaaagtctgaacaatgcttttaagaactttgagtctgaggaacaaatgcgttctgat
ccagcttatgtagctttttactgtgccaatatcaaccagaatccccggcttcctttgccc
cttacctcatcagagaatcgccgtctggtacgccatattggtagttttggaaataactgg
atgttggcttctatggatgatagtggcaatggctccttgcgtatgtctcacggacccctt
tctactcacaaggaagagtctgaagatgatcagtcacctcaaaagccttatgacgatcgg
gtagatgggacaagtgggttttgggctgggcaggatgtggcttcattggggggccaacac
aagaatgtggttgatttaatacaggaagattttccccgcactccatcacctgtatatagt
cagtctaacttgttaagtcaaggagtagtggatgaagcagttgaccatgatgcccttatt
ggcacatcaaatggtgtttcatctactcttggttcagatgatagaaggatatcatcagat
tctgatcctttagctgcgcctacttcaagctcatcatctcatgatcgtacaggaagagcg
gatgttaatgattcagatgttaccgctatggaatctcaaatgaagtctcttaatatatcc
aaccttccaaattcagaaaatcaaaaaagtcaagaacaatggcagtatagcggccagaat
aacttgttgcaacaccaggtacaccaacaacaaagcaatttatctcaagctcaatctgcc
aagtctcgagtgatatctcaaggtgtaaactgtgcatacattggtgtggatcaggttctc
cataatcctagcaagtttgcggaggtacagcccgtgctacagtcatctgggttcacacct
ccactctatacttccgcagcagcctacatggcttcaacaaaccctttttaccctaatctc
caggccccgggcttatattccccacagtttgtaggtggatatgctgtgaatcccgcagct
gttcctccatatattgctggataccctcccaatggtgctgtccctgttgttgttgatgga
gctgctggtccaagctatactgctcaaacatctggggtttcaactgggggaaacgttgca
catggagctgatgtgcaacatttaagcaagttatttggacaatttggttttccactacaa
ggttcttttggtgatcctatatacatgcaataccatcaacatccttatggagaggcatat
agtggtattgctggtcagcttgatccattggcatctagaggtggtgttaatattgggaac
caggcgagtgttcttgattcacagagaggatccaacaatgctggttatttggaggaccac
aaattcggtcatcagataaatggaggcccaagtcattttaacccaggaagaggggggatg
atgagtcctagctattatggaagcccttcaaacatgggttttgtgatgcagtacccgaac
tcaccacttgctagtccagttttaccaggatctcctgtaggtgggaccagtattccgggg
ggcagaaatgaaatgagatttgctccgggctctggtagaaatgctggtgtttatcctgga
tggcaaggtcaaaggggctttgagagttttggcgaccccaaaatatataattttctggaa
gagttaaaatcaggcaaaggccgaagatttgagctatctgatattgtaggtcatattgtt
gaattcagcgcggatcaacatgggagtcgatttattcagcagaagttggaaagttgtact
ggtgaagagaaggcatctgtatttaaagaagttctcccacatgcttccaagctaatgact
gatgtatttggtaactatgttattcagaagttttttgagtatggaagccctgagcagaga
aaggaacttgctaatcaactcacaggtcaggtgttgcctttaagtctgcagatgtatggc
tgtcgtgtaatccaaaaggcacttgaggttattgagcctgaacagaaagcacagcttgtc
cgagagctggatggacatgttatgagatgtgttcgtgatcaaaacggaaatcatgtaata
cagaagtgcattgagagtgttccaacagagagaattgggtttataatatctgcttttcgt
gatcaagttgcgatgctttctatgcatccttatggttgccgtgtcatacagagagtttta
gagcattgtacaaatgagctgcagtgtcagtttatagtggatgagattttggagtctgtt
tgtactcttgctcaagaccagtatggcaattatgtcacccagcatgtactggagagggga
aagcctcatgaaagaagccagattataagaaagttgtcaggacatattgtacaactgagc
cagcataaatttgcatcaaacgttattgagaaatgtttggagtatggtggccccactgaa
cgagaactattaattggggagatttttgggcataatgaaggaactgataatttattgaca
atgatgaaggaccaatttgcaaattatgtggtccagaagattcttgaaatatgttctgat
aatcagcgggctgtattgcttgctcgcgtaagagttcatgctcatgctttgaagaaatac
acttacgggaaacacattgttgctcgatttgaacagctatttggagaagaaaatccagta
gctggatcgtga
DBGET
integrated database retrieval system