Rickettsia amblyommatis Ac37: AL573_00730
Help
Entry
AL573_00730 CDS
T04237
Name
(GenBank) Surface protein Sca1
Organism
rab
Rickettsia amblyommatis Ac37
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA61336
LinkDB
All DBs
Position
complement(117598..123726)
Genome browser
AA seq
2042 aa
AA seq
DB search
MNKLTEKHLLKKSRFLKYSLLASISVGAIIAIPFEGMAMSKEAFRVDLSNKLLNNLSQLN
GHKDTTKTPKQIGTVIVPEPEINTYTPSEIREMKTSNKPTTSNPLKDVSVEDHYKVVAHS
KADVGKARKVRPINRHKTFVGTEKTEQSHNTYTPEPIEQMPQKPEIIITASSPTVSPASN
SFVTAPNTPNTTLTSPEHYTTAPGTPSSTPATPYQPAPDSKPSDSLGANTPPNSKAAQRL
SFSSSDPQQQIVQSSSQVKLEVPSEPTFVPLPIKKSSTEIAAGVVSNISRVNEMIGIKLT
EVTQAINNTTDKKNKKPLQKLHTQLTSAQKTTEALKSRAEKIETKIKIGKNKDKIKKLEK
ELTSKNNEADRLFQKIEKIDIPANTVSIKSQETVPVTTTSTKVSAFQAQQARINEAQQGV
LVQNQQHIAAKKTKKQRQAEDKKRTEREKTKQEAQKQLSEIKKQEKAIKTAADKAKEVAA
SAKEETSRTALRAMQGKVNGYSEQLSHGVQRILGEQPEDEEGYLVPIKVQQQPYTVMLPS
QEIEGPKSMDSDLGSLSSGTLGKETDEDVGFYSGWGNMPYTQAANVDSSLEGDLVLGMLQ
QQIQENRSKVYGQLPSHSKDIYEAKASQYINYLNSIQPNQSNQAQIDGVIDSLATEMSKL
SADQFNQKLGEVAHLASIKAYDGLFSKLYEIQQARVPETQKVYEPAEIYQSYEENLRKSG
TPVLSRSSSAKSVISSNFEAKSALLQTTTTDESLRSDKNWKNLAPYSSSPKLDKRELEYL
DLAGDAFVQNLKQPDTLTIETLGLITPTQNTTAAKSDSSRKNNVSGSIPEIQQLQSEKMR
TETLGVQNDLGLDLHSQEGRFDSGFRSVESQNLSSAYDCDQLSASWDAAYNQRMNTNAPH
ETLTEESTYSVSSKKKQGNIKKSIVSKVRSILQTNDAENRKRKRDEETSKQRTVDQEGGF
GHAWGNENHKESSLSGFTKKATQLISLLDAKRAEILQTTSLSQKNKLALKKIENDYQEAI
KISQELQQVLIRKPEDIKAYNAKAEKKLDAIKSRADKHFNNIETDADVGFNPNWGNSHSM
PTANMNSLPKNLAVTPPINVGSLYHSPQAQQFREDHKNVIISAIDSISSSGVSKESIDPT
ITKSLPYLDNDQYQEVVLRVDKVHDINTRGYLLNKLKQLEASKVRELTDVDASTYNTAPP
EILKEAEALLDRSQGRLNLVDSTIKKGTQPLSNLSTIHASVSYENLASKTIYKTEQPKPS
ISYKNTSKQKLPISLLRSAKLDKKLDYLDLEDKLLKVEDARIVKEQQAIAKLNQYQDPEN
LEFKRLAIEALDLPSKESQLKEKRKAIEAVFSLNEEYPSTDVSISRSYSIGDISSLVSDA
ESNLSRSPSVSGLEDLNNSNVMKLGELKSKHEKIANDYKAKELELDTLNHDDPKFKKLRL
EVSEISKEKIWLEEEIKHLDTESKPKVTESKPVFSCASSVGSINSLSNGDDLSSRDVVTP
VDTLTIKIDKDYVDAYIRVLSNKIQEIEELPGLSSRSEELNHIKEAMAYISNRIQDVEEL
DEKMLLAINARLQEHDEKISSLLLEKYTGEGATGILAQLLLQDMLVSDGKSESTLPAGDE
EQEDTEVSRQLSSLPALASSNECALALSDDREKECLALGDGSEEEESYDSGFEEEEETIG
QLSNSDGDNLKITEVDTAVPLEQEAKKEMQTQISENAPTLNQAKVVNTIVNNMIRNRLDA
SMNMSNNMVAVGAGDEEESHIKRGLWMRGMYGTNNHGRVDNMTGYRGTNKGATIGFDAEI
DNNIVGIAYSNVHSVFKFKNSKNNDKELINSHVVSIYGQKELPKNFALQALVSASKNFIK
DKTTYSYGNTKIRSNVKHRNHSYNAEALLNYNYLLQSKLVITPNIGLRYGKSRDGVYNET
SINVQEIALTMKENNIFAGIVGTKVTVPLKDALKFNNLGLTFQGVVEHNFKEKTQRINRV
VKIFDNTFKHDYLIPKQPKTSYNLGTGVIGSIKNTTISLDYSYYLNKHYRSHQGSVKLKV
NL
NT seq
6129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagttaacagaaaaacatttactaaaaaaatcaagatttttaaaatattctctg
cttgcctctatttcagtaggagcaataattgcaataccttttgagggtatggcgatgagt
aaagaagcatttcgtgtcgacctcagtaataaattgttgaataacttgtcacaattaaac
ggacacaaagatacaacaaagacccctaagcagataggcacagtaattgtaccggaaccg
gaaataaacacatatactccatctgaaataagagaaatgaaaacatctaacaaacctacg
acatctaatccattaaaagatgtttctgtagaggatcattataaagtggtagcacatagt
aaggctgatgtcgggaaagcaagaaaagtacgaccaattaatagacacaaaacatttgta
ggcactgaaaaaacagaacaaagtcacaatacttatactcctgaaccgatagaacaaatg
cctcaaaaaccagagattataataacagcgtcttcgcctactgttagcccagcttcaaat
agttttgtcactgcacctaatacaccaaatactaccctgacatcacctgaacattatact
acggcacctggtactccatcatcaacaccggcgaccccgtatcagcctgctccagattct
aaaccaagtgatagtttaggagctaatacaccaccaaactcaaaggcagcacaaagatta
tcgtttagcagtagcgacccgcaacaacagatagtgcaatctagctcacaggttaaacta
gaagttccttcggagccgacatttgtaccgttgcctataaaaaaaagcagtactgaaatt
gcagcaggagtggtaagtaatatatcacgagttaatgagatgataggaatcaagttaact
gaagtaacacaggctattaataataccacagataaaaaaaataaaaaaccattgcagaag
ttgcatacgcagctaacttcagcacaaaaaacaacagaagcactcaagtcaagagctgaa
aagatagaaacaaaaatcaaaataggtaaaaataaagataaaataaagaaacttgaaaaa
gagttaacaagtaaaaacaatgaagcagatagattatttcagaaaatagaaaaaatagat
attccagcaaatacagtttcgataaaatcgcaggaaacagttccggttacaacgacgtca
accaaagttagtgcgtttcaagcacagcaagcaagaattaatgaggctcagcaaggtgta
ttagtacaaaatcaacaacatattgctgcaaaaaaaacaaaaaagcagcgacaagcagag
gataagaaaagaacagaaagagaaaagacaaaacaagaagcacaaaagcagttatcagaa
ataaagaaacaagaaaaagctataaaaacggcagcagataaagctaaagaagtagctgct
agtgcgaaagaagaaacaagtagaacggcattacgagccatgcaaggtaaagtgaatggt
tattctgaacaattaagtcatggggttcagagaattttaggtgaacaaccagaggatgaa
gaggggtacttagtgccaataaaagttcagcagcaaccttatacagtaatgttgccgagt
caagaaatagagggccctaaaagtatggattcagacttggggagcttatcaagcggcact
ttaggtaaagaaacagatgaagatgtcggattttattcaggttggggaaatatgccgtat
acgcaagctgctaatgtggatagttcattagaaggtgatctggtgttaggtatgctgcag
cagcaaatacaagaaaatcgttcaaaagtatatggacagcttccaagtcattcaaaagat
atttacgaggctaaggcttcacaatacattaattatttgaatagcatacagccaaatcaa
tcaaatcaagctcaaatagatggtgtaatagatagtttagcgacagaaatgagcaagtta
agtgcggatcaatttaatcaaaaattaggtgaggttgcacatcttgccagtataaaggca
tatgacggtttgttctcgaaattatatgaaattcagcaagctagagttccggaaactcaa
aaagtatatgagccagcggaaatatatcagtcttatgaagagaatttaaggaaaagcggt
actccagtattatcacgctcgtcttcagctaaaagtgtaatatcatcaaattttgaagca
aaatcagcattgttgcaaacaacaactacagatgaaagcttgagatctgacaaaaattgg
aaaaatcttgcaccatattcttcaagtccaaaacttgacaaaagagaattagaatattta
gatttagctggtgacgcgttcgttcagaatctaaaacaacctgatacgttaactatagaa
actcttggtttaataacgccaacacaaaatacaacggctgctaaaagtgactcatcgagg
aaaaataatgtaagtggaagtattccggagatacaacaactgcaatcagaaaaaatgcgt
accgaaactttaggtgtgcagaatgatctagggctagatttacattcacaagaaggacgt
tttgattcaggctttaggagtgtggaaagtcaaaatttgtcgtcagcctatgattgcgat
caactatcagcgagttgggatgcagcgtataaccaaagaatgaatacaaatgcacctcac
gaaactttaactgaagaaagtacctattcagtttctagtaagaaaaaacaaggtaatata
aaaaagagcattgtgtcaaaagtaagatcaattttgcaaacaaatgatgcagagaacaga
aaaaggaaaagagatgaagaaacctcaaagcaaagaacagtagatcaagagggaggattt
ggccacgcttggggaaatgagaatcataaggagtctagtttaagtggattcacaaaaaag
gcaactcagcttataagccttttagatgcaaagagagccgaaatactgcaaacaaccagt
ctttcacaaaaaaataaattagctttaaagaaaatagaaaatgattaccaagaagcaatt
aaaatctctcaagaattacagcaggtattaatacgcaaaccggaagatataaaagcatat
aatgcaaaagcagaaaaaaaattggatgctattaaaagcagagcagataaacactttaat
aatatagaaacagatgcagatgttggatttaatccaaattggggaaatagccattctatg
ccgactgctaatatgaatagcttaccaaaaaatttagctgtaaccccacctataaatgta
gggtcactatatcactctccgcaagctcaacaatttcgagaagatcataaaaatgttata
ataagtgctatagattccataagctcttcaggagtatctaaggaatcaatagatccaaca
ataaccaaatctttaccttatttagataatgatcaatatcaagaagtagtattaagggtt
gataaagttcatgatataaatacacgcggttatttattaaacaaacttaaacaactagaa
gcatcaaaagtaagagaacttacagatgtagatgcttcaacatataatactgcaccccct
gagatactaaaagaagctgaagctttacttgatagatcacaaggtagactaaatttggtt
gatagtactattaaaaaaggtacacagccattatctaatttatctactatacatgcgtcg
gttagttatgagaatttagcatcaaaaacaatatataaaacagagcaacctaagccatct
ataagttacaagaatactagtaaacaaaaattacctatatcattactcagaagtgccaag
cttgacaagaaattagattatttggatttagaagataaactattaaaagtagaggacgct
agaatagttaaggaacagcaagctattgccaaattgaatcaatatcaagatccagaaaac
ctagaatttaagcggttagctatagaagcactagacttaccttcaaaagaatcacaatta
aaagaaaaaaggaaagccatagaagcagtattttctttaaatgaagagtatccaagcaca
gatgtatcaatatcacgttcctattcaattggtgacataagcagtttagttagtgatgca
gaatcaaatctatctcgttcaccttcggttagtggcttagaggatttaaacaattctaat
gttatgaaattaggggaattaaaatctaaacatgaaaaaatagccaatgattataaagct
aaggaattggagttagatactttaaatcacgatgatccaaaatttaagaagttaaggctc
gaagtatctgagatatcgaaagaaaagatttggttagaagaggagataaagcatctagat
actgaatctaaacctaaggtaactgagagtaagccggtattttcatgtgcatcttcagtt
ggtagtataaacagcttatctaatggtgatgatttgagtagtcgtgatgttgtaactccg
gtagatactctaactataaaaattgataaagattatgtagatgcctatataagagtatta
agcaataaaatacaagaaatagaagaattgcctggcttaagttctagaagtgaggaactt
aatcatattaaagaagcaatggcttatataagtaatcgtatacaggatgtagaggaatta
gatgaaaaaatgcttttagcaataaatgcacgattgcaagaacatgatgaaaaaatttct
tcgttacttctagagaagtatacaggcgaaggagctacaggtattcttgctcagttattg
ttacaagacatgttagtgtcggatggtaaatcagaatctaccttacctgcaggagatgaa
gaacaagaagacacagaagtaagtagacaattatcttcattacctgcacttgcatcaagt
aatgagtgtgcattagcattaagtgacgatagagaaaaggaatgtttagcattaggcgat
ggtagcgaagaggaagaaagttatgattcagggtttgaagaggaagaagaaacaataggg
caattatccaattccgatggggataatcttaaaataacggaagttgatacggctgttcct
cttgaacaggaagcaaaaaaagaaatgcaaacgcaaatttcagaaaacgctcctacttta
aatcaagcgaaagttgttaatactattgtaaataatatgattcgtaacagattagatgca
tctatgaatatgtctaataatatggtagcagtaggagctggtgatgaagaagagtctcat
ataaaaagaggtttgtggatgcgtggtatgtacggcactaataatcatggacgcgttgac
aatatgaccggttatagaggtactaacaaaggtgctactatcgggttcgatgctgaaatc
gacaataatatcgtaggtatagcttatagtaatgttcattcagtatttaaatttaaaaat
agtaaaaataatgataaagaacttattaatagtcatgtggtttctatttacggacaaaaa
gaattaccgaagaattttgcactacaagctttagtatctgcttctaaaaactttattaaa
gataaaacaacttattcatatggtaatactaaaattagaagtaatgtaaaacatcgtaat
catagttataatgcggaagcattactgaattataattatcttttgcagagcaagctcgtt
attaccccgaatatcggcttaagatacgggaagtcacgagacggggtatataatgaaacc
agtattaacgtacaagaaatagctcttacaatgaaagagaataatatatttgccggaatt
gtcggtactaaagtcacagtacctttaaaagatgctctaaaatttaataatttaggtcta
acattccaaggagtggtagaacataattttaaagagaaaacccaaagaataaatagagtt
gttaaaatatttgataatacattcaaacatgattatctaataccgaagcaaccgaaaaca
tcctataatttaggaacgggtgttataggcagtatcaaaaatactactatttcgttggat
tatagttattatctaaataaacattatagaagtcatcaaggtagtgttaagcttaaggta
aacctataa
DBGET
integrated database retrieval system
