Rickettsia amblyommatis Ac37: AL573_07295
Help
Entry
AL573_07295 CDS
T04237
Name
(GenBank) outer membrane protein A
Organism
rab
Rickettsia amblyommatis Ac37
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA62275
LinkDB
All DBs
Position
complement(1399437..1406453)
Genome browser
AA seq
2338 aa
AA seq
DB search
MANISPKLFQKAIQQGLKAALFTTSTAAIMLSSSGALGVAAGVISTNNAAFNDLAAVNNW
NEITAEGVANGTPANGPQDNRAFTYGGDHTITANEAGRIITAINVAGTTPVGLNITQNTV
VGSIVTGGNLLPVTITAGKSLTLNGTNAVAANHGFDAPADNYAGLGNITLGGANAALIIQ
SVTPAKITLAGNIDGGGIITVKTDAAINGTIGNVNPAAQISVGASILSLGGAVIKATTTK
LTNDASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNTNSLATINVGAG
TAKLEGAVIKATTTKLTNDASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGN
IGNANSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNV
GVLNLNGELSQVTGNIGNANSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNDASVLTLTNANA
VLTGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNTNSLATISVGAGTATLEGAVIKATTTK
LTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNTNSLATINVGAG
TAKLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGN
IGNTNSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNV
GVLNLNGELSQVTGNIGNANSLATISVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANA
VLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNTNSLATINVGAGTAKLEGAVIKATTTK
LTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNANSLATINVGAG
TATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGN
IGNTNSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLRGAIDNTTGGDDV
GVLNLNGELSQVTGNVGNTNSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANA
VLRGAIDNTTGGDNVGVLNLNGELSQVTGNIGNTNSLATINVGAGTATLEGAVIKATTTK
LTNAASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTAALATVNVGVGLLQ
VQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVMTGAIDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTAA
LATVNVGAGITLQAGGSLAANNIDFGVGSTLEFNGPLDGGGNTIPYYFKGAIANGNNAIL
NVNTKSLTAYHSTIGTVAEINIGAGNRFAIDASAGDVTILNAQDINFGAPDSALALSNLT
GVGVKNILLAADLVAPGANEGDVVFDGGVNGLNIGSNVAGTARNIGDGGGNKFNTLLIYN
AVTITDDINLEGIQNVLINNNADFTSSTAFNAGAIQIHDATYTIDANNGNLNIPAGNIQF
AHADAQLILQNSSGNDRTITLGANIDPDNDNEGIVTLNSVTAGKRLTIAGGKTLGGAHKL
QAIVFKGAGDCGAAGTTFNTTNIVLDTTGQLELGATTANVVLLNDVVQLTQTGNIGGFLD
FNAKNGTVTLNNNVNVAGAVQNTGGTNNGTLIVLGASNLNSVNRIAMLKVGAGKVTIAKG
GDVKIGEIQGTGTNTLTLLANFNLTGSINKTGGQALKLNFTNGGSVSGVVGTAANSVGDI
TTAGATSFARSVNAKGTATLGGTTSFADTFTNTGAVTLAKGSITNFAKNVTATSFVANSA
TINFGNSLAFNSNITGSGTTLTLGANQVTYTGTGSFTDTLTLNTTFDGAAKSGGNILIKS
GSTLDLSGVSALAVVVTATNFDINNISPDTKYTVISAETAGGLKPTSEENVKITINNDNR
FVDFTFDTSTLTLFAEDIAADVIGEDFKPGGPLANISNAANIKKSLELMEDAPNGSDAHQ
AFNNFGLMTPLQEADATTHLMQDVVKPSDTIAAVNNQVIASNISSNITALNARMGKVQAA
NKGPVSSGDEDMDAKFGAWISPFIGNATQKMCNNISGYKSDTTGGTIGFDGLVSDDLALG
LAYTRADTDIKLKNNKTGDKNKVESNIYSLYGLYNVPYENLFVEAIASYSDNKIRSKSRR
VIATALETVGYQTANGKYKSESYTGQLMAGYTYMMPENINLTPLAGLRYSTIKDKGYKET
GTTYQNLIVKGKNYNAFDGLLGAKVSSNINVNEIVLTPELYAMVDYAFKNKVPAIDARLQ
GMTAPLPTNSFKQSNTSFDVGVGVTAKHKMMEYGINYDTNIGSKYFAQQGSVKVRVNF
NT seq
7017 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaatatttctccaaaattatttcaaaaagcaatacaacaaggtcttaaggccgct
ttattcaccacctcaaccgcagcgataatgctgagtagtagcggggcactcggtgttgct
gcaggtgttatttctactaataatgcagcatttaatgatcttgctgctgtcaataattgg
aatgagataacggctgaaggggtagctaatggtactcctgctaacggtcctcaagacaat
agggcatttacttacggtggtgatcatactatcactgcaaatgaagccggtcgtattatt
acggctataaatgttgcgggtactactcccgtaggtctaaatattactcaaaataccgtc
gttggttcgattgtgacgggaggtaacttgttgcctgttactattactgccggcaaaagc
ttaactttaaacggtactaatgctgttgctgcaaatcatggttttgatgctcctgccgat
aattatgcaggtttaggaaatataactttagggggagcgaatgctgcactaattatacaa
tctgtaaccccggcaaagataacacttgcaggaaatatcgatggaggaggtataataact
gtcaagacagatgctgccattaacggaacaataggtaatgttaacccagcagctcaaata
agtgttggggcaagcatcctttctcttgggggagcggttattaaagctactacgactaaa
ttaacaaatgatgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcg
attgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagt
caagtaactgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggt
acagccaagttagagggagcggtcattaaagctactacgactaaattaacaaatgatgcg
tcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccaca
ggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaactgggaat
ataggtaatgcaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggtacagccacgttagag
ggagcggtcattaaagctactacgactaaattaacaaatgctgcgtcggtattaaccctt
acaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccacaggcggtgataatgta
ggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaactgggaatataggtaatgcaaat
tcattagccacgataaatgtaggagcaggtacagccacgttagagggagcggttattaaa
gctactacgactaaattaacaaatgatgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgca
gtattaacaggtgcgattgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaattta
aatggtgaattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatacaaattcattagccacgata
agtgtaggagcaggtacagccacgttagagggagcggtcattaaagctactacgactaaa
ttaacaaatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcg
attgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagt
caagtaaccgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggt
acagccaagttagagggagcggtcattaaagctactacgactaaattaacaaatgctgcg
tcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccaca
ggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaaccgggaat
ataggtaatacaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggtacagccacgttagag
ggagcggttattaaagctactacgactaaattaacaaatgctgcgtcggtattaaccctt
acaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccacaggcggtgataatgta
ggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatgcaaat
tcattagccacgataagtgtaggagcaggtacagccacgttagagggagcggttattaaa
gctactacgactaaattaacaaatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgca
gtattaagaggtgcgattgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaattta
aatggtgaattgagtcaagtaactgggaatataggtaatacaaattcattagccacgata
aatgtaggagcaggtacagccaagttagagggagcggtcattaaagctactacgactaaa
ttaacaaatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcg
attgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagt
caagtaactgggaatataggtaatgcaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggt
acagccacgttagagggagcggttattaaagctactacgactaaattaacaaatgctgcg
tcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccaca
ggcggtgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaactgggaat
ataggtaatacaaattcattagccacgataaatgtaggagcaggtacagccacgttagag
ggagcggtcattaaagctactacgactaaattaacaaatgctgcgtcggtattaaccctt
acaaatgcaaatgcagtattaagaggtgcgattgataacaccacaggcggtgatgatgta
ggtgtcttaaatttaaatggtgaattgagtcaagtaaccgggaatgtaggtaatacaaat
tcattagccacgataaatgtaggagcaggtacagccacgttagagggagcggttattaaa
gctactacgactaaattaacaaatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgca
gtattaagaggtgcgattgataacaccacaggcggtgataatgtaggtgtcttaaattta
aatggtgaattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatacaaattcattagccacgata
aatgtaggagcaggtacagccacgttagagggagcggttattaaagctactacgactaaa
ttaacaaatgctgcgtcagcagtgacatttacgaatcctgtagtggtgaccggggcgata
gataatactggtaatgcaaataatggtatagcaacgtttaccggtaatagtacagtaact
ggcaatataggtaatacggcagcattagcaacagtgaatgtaggagtaggtttgctacaa
gtacaaggcggagtggtaaaagcgaatgcaataaacttaacggataatgcgtcagcagtg
acatttacgaatcctgtagtgatgaccggagcgatagataatactggtaatgcaaataat
ggtatagcaacgtttaccggtaatagtacagtaactggcaatataggtaatacggcagca
ttagcaacagtgaatgtaggagcaggaataacattacaagctggaggaagcctagctgcg
aataatatagattttggagtcgggagtactttagagtttaacggacctcttgatggtggt
ggtaacacaattccttattattttaaaggcgctatagcaaacggcaataacgctatatta
aatgttaatacaaagtcacttacggcatatcattcaactataggaacagttgcagaaatc
aatattggagccggtaatcgttttgcaattgatgcaagtgctggtgatgttactatatta
aatgctcaagatattaattttggagctccagattctgctttagcactttctaacttaact
ggagtcggggtaaaaaatatattattagcagctgatttagtagctcccggtgctaatgaa
ggtgatgtagtctttgatggtggggttaatggcctgaatatcgggagtaatgtagcaggt
accgctagaaatatcggtgatggaggcggtaataaatttaacactttacttatttataat
gccgttacaataaccgacgatataaatttagaaggtatacagaacgtgcttattaacaat
aatgcagattttactagtagtacggcatttaatgctggtgctatacaaatacacgatgct
acttatacgattgatgcaaataatggtaatttaaatataccggcaggaaatattcaattt
gcacatgcggatgctcaattaatattacaaaatagttcaggaaacgaccgtacgatcaca
ctaggtgcgaatatagaccctgataatgacaatgagggtatagtaacattaaattctgta
actgcaggaaaaagattaacgatagccggaggcaagacgcttggtggagctcataagtta
caagctatagttttcaaaggagcgggcgattgcggcgcggcaggtaccacttttaataca
acaaatatagtgcttgatactacaggtcaattagaacttggagctactacggcaaacgta
gttttacttaatgatgttgttcaattaactcaaaccggtaatattggcggtttcttagat
tttaatgcaaaaaacggtacggtaacattaaataacaatgtaaatgttgcgggagcagtc
caaaataccggcggtactaataacggtacgttgatagttttaggtgcaagtaatcttaat
agcgtaaacaggattgctatgttaaaagtaggtgcaggaaaggtaactattgccaaaggc
ggtgacgttaaaatcggcgaaatccaaggtacaggcacaaatactttaacattacttgca
aactttaacttaacaggcagcataaataaaaccggtggtcaggccctgaagctaaacttc
acgaatggcggtagtgttagcggtgttgtagggactgcggctaattcggttggtgatatc
acaacggcaggtgctacaagttttgcacgcagtgttaacgcaaaaggtacggcgacactt
ggcggtactacaagttttgccgatacattcactaatacaggtgcggttactttagccaaa
ggttctatcactaattttgctaaaaatgtaacggctaccagctttgtagctaacagtgct
actattaatttcggcaatagcctagcctttaatagtaatataacaggtagtggtactaca
cttactttaggtgcaaatcaagtaacatatactggcaccggtagttttaccgatacgcta
accttaaatactacttttgacggagcagctaagtcaggtggtaatatcttaattaaatca
ggtagtactcttgatttatcaggggtttcagctttagcagttgttgttactgctactaat
ttcgacattaataatataagcccagatacaaaatatacggtaatatctgcagaaacagca
ggtggtttaaagcctacttctgaagagaatgttaaaataactattaataatgacaaccgt
tttgttgactttacttttgatacatcgactttaacgttatttgcagaggatatagctgca
gatgttataggtgaagattttaaaccgggtggaccgcttgcaaatatctcaaatgctgca
aatataaagaaatcgcttgagttaatggaggatgctcccaatggttcagatgcacatcaa
gctttcaataactttggtctaatgacaccgctacaggaagcagatgctacaactcacctc
atgcaagatgttgtaaaacctagcgatactatagctgccgttaataatcaagttatagcg
agtaatatatcaagtaatataacggctctaaatgctagaatgggtaaagtacaagcagcg
aataaaggtcctgtttcttccggtgatgaagatatggatgctaagtttggtgcgtggata
agcccgtttatcggtaatgcaacgcagaagatgtgtaacaatataagtggttataagtct
gatacaactggtggcactataggttttgacggcttagttagcgatgatctagcactcgga
cttgcatatacaagagccgatactgacattaagctaaaaaataataaaacgggcgataag
aataaggtagagagcaacatctattctttatacggtttatataatgtaccttatgaaaat
ctcttcgttgaagctatagcatcttactcagataataagataagaagcaaatcaagacgt
gttattgcaacggcactagagactgtcggttatcaaactgcaaacggtaagtataaatcc
gaaagctatacaggtcagttaatggctggttatacctatatgatgcctgagaacattaac
ttaacaccgctagctgggcttagatattcgactatcaaagataagggctataaggaaacc
ggtactacttaccaaaatcttatcgttaaaggcaagaactataatgctttcgacggttta
ctcggtgctaaagtatcaagtaatatcaatgtcaatgaaatagtgctaacacctgagctt
tacgcaatggtcgattatgcattcaagaataaagttccggcgattgatgcaagattacaa
ggtatgactgctcctctcccaaccaacagctttaagcaaagcaacacaagttttgatgtc
ggtgtcggtgttactgctaagcataaaatgatggaatacgggattaactacgataccaat
atcggaagtaagtatttcgctcagcaaggtagtgtaaaagttcgtgttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
