Rodentibacter abscessus: THUN1654_16850
Help
Entry
THUN1654_16850 CDS
T10998
Name
(GenBank) TRAP transporter large permease
KO
K11690
TRAP-type transport system large permease protein
Organism
rabs Rodentibacter abscessus
Pathway
rabs02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rabs00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
THUN1654_16850
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rabs02000
]
THUN1654_16850
Transporters [BR:
rabs02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
THUN1654_16850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
CitMHS
DcuC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFU60848
LinkDB
All DBs
Position
1938712..1939983
Genome browser
AA seq
423 aa
AA seq
DB search
MLWLFLGSLFLLLFLGVPVALSMLLSASFMLFQLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPF
FMLTGEIMKHGGISERIINFAMSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAI
LIPMMVAKKYDSARSTGLLCSAGIISVVIPPSIPMIVYGITAGASITKLFMGGTVPGLLM
VVGLWFMWKLLYRKEKLTIEEKQTGKQRWCAFKQAFWPLLLPVIIIVGLRGGIFTPTEAG
VVAAIYAAIVSILYRGLTWNTVQEVFINTIKTTSMVMFVAAAAMISAFAITVAQIPAELV
DVIKGITDSPTVLMLILMVFFLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPILRAYHIDPAYFGIMMV
INLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGQISKGILPFLLVYFAILFLMVFFPDVVIVPMN
WLS
NT seq
1272 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtggttatttttaggaagtttattcttactactctttcttggtgtacctgttgca
ctgtctatgttgcttagtgctagttttatgctttttcaactggatatgtttgatactcaa
ttgattacagaaaactttgtaatgggtacaaacaattttccattaatggctataccattt
tttatgctaacgggcgagataatgaaacatggtggtatttccgaacgaattatcaatttt
gcgatgagtatggttggacatattaaaggagggctaggttatgtagcgattatctcaggt
ttaatttttgctggactttctggttcggcggtagcagatacagcggcacttggtgcaatt
ttaattccgatgatggttgcaaaaaaatatgattccgcacgttcaacaggattgctttgc
tcagctgggattatttctgtcgtcattcctccaagtattccgatgattgtttatggcatt
actgccggtgcatcgatcacaaaattatttatgggaggaacagttcccggattattaatg
gtcgttggattgtggtttatgtggaagcttttatatcgtaaggaaaagttaactattgaa
gaaaaacaaacaggaaaacaacgttggtgtgcatttaaacaagcattttggccactttta
ttacccgtgattattattgtaggattacgtggtggtatttttactccaactgaagctggt
gttgtagctgctatttatgcggcaattgtgagtattttatatagaggactaacttggaat
acagttcaagaagtttttatcaatacaatcaaaacgacatcaatggtaatgtttgttgct
gcagcagctatgatttctgcttttgcaattaccgttgctcaaattccagcagaattggtt
gatgtaattaaagggatcaccgatagtccaacagttttaatgttgatcttaatggtattt
ttcttgctggttgggtgcgttatggatttaatccccgcagtattaatttttgttcctgta
ttattaccaattctgagagcatatcatatcgatcctgcttactttggcattatgatggta
attaatttatctattggtttaattacaccgcctgttggtacagtactctatgtagggtct
ggcatttctaaattaggtatcggacaaatttctaaaggaattttacctttcttactcgta
tattttgccattctattcttaatggtatttttccctgatgttgtaattgtgccaatgaac
tggctgtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
