Rickettsia africae: RAF_ORF0083
Help
Entry
RAF_ORF0083 CDS
T00979
Symbol
abcT1
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K06020
energy-dependent translational throttle protein EttA
Organism
raf
Rickettsia africae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
raf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
raf03016
]
RAF_ORF0083 (abcT1)
Transfer RNA biogenesis [BR:
raf03016
]
Prokaryotic type
tRNA transport factors
tRNA export factors
RAF_ORF0083 (abcT1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
AAA_21
SMC_N
ABC_tran_Xtn
AAA_29
MMR_HSR1
Dynamin_N
AAA_18
RsgA_GTPase
MeaB
AAA_23
AAA_28
AAA_15
Rad17
MukB
nSTAND3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACP53058
UniProt:
C3PM98
LinkDB
All DBs
Position
81358..83025
Genome browser
AA seq
555 aa
AA seq
DB search
MSYQYVYEMVGLSKIINGKRILKETNLSFLPKAKIGIIGPNGAGKSTLLKIMAGIDKEFE
GKATAKIGIKVGYLPQEPYLDASKNVFDNIIEGLHEKKKLIDEFNYISNKFAAEIADEEM
QKLFDKQAELQEKIDNCDGWNLEREIEIAMLALRCPPKEADITKISGGEKRRVALCKLLL
EKPDMLLLDEPTNHLDAESVSWLEDYLKHYEGTVIVITHDRYFLDNVTEWILEIDRGNCI
PWESNYSSWLEQKQKKLALESKEDDDRKKQLNRELEWIRQTPKARQSKNKARITAYQELL
NKQQEQKTDPTQIIIPNGPRLGDFVIEAEHITKKFNNKILLSDFSFKVPRGAIVGIIGPN
GAGKSTLFNIITGKIMPDSGSIKIGQTVKLGYVDQSRDHLDDNKTIWEEISEGLDELQLG
NRIIKSRAYCAAFNFRGGDQQKKVGQLSGGERNRVHLAKLLKEGANVILLDEPSNDLDID
TLRALEDAILDFAGCVLVISHDRWFLDRITTHIISYDKENNATWFEGNYQDYHEYMLSTN
GESILNPKYKHKKLI
NT seq
1668 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatatcaatatgtttatgaaatggttggtttaagcaaaattataaatggtaaacga
attttaaaagaaacaaatttatcatttttaccaaaagctaaaatcggtataataggtcca
aatggagcaggcaaatcgactttattaaaaataatggcaggtattgataaagagtttgaa
ggtaaagcaacagctaaaattggtataaaagtaggatatttacctcaagaaccgtatctt
gatgctagtaaaaatgtttttgataatatcatagaaggtcttcatgaaaagaaaaaactt
attgatgaatttaattatataagtaacaaatttgctgctgaaatcgctgatgaagaaatg
caaaagctttttgataaacaagcagaattgcaagaaaaaatagacaattgtgatggatgg
aatctagaacgtgaaatagagatcgcaatgcttgctttacgttgcccaccaaaagaagca
gatattacaaaaatttccggtggagaaaaaagaagagtggctttatgtaaattgctttta
gagaaacctgatatgttgttacttgatgaacctacaaatcatttggatgcagaatcagtt
tcttggcttgaggattatttaaagcattatgaaggtactgtaatagtaattacccatgat
cgttattttttagataatgttacagaatggatattagaaatagatcgtggaaattgtata
ccgtgggaatcaaattatagttcttggcttgagcagaagcaaaaaaaattagctttagaa
agtaaagaagacgatgatagaaaaaaacaattgaatcgtgaacttgaatggattcgtcaa
actccaaaagctagacaatcaaaaaataaagcacgtattacagcatatcaagagttatta
aataaacaacaagaacaaaaaactgatcctactcaaataattatacctaacggacctcgt
ttaggtgattttgttattgaagcagaacatataactaaaaaatttaataataaaatatta
ttatcagattttagttttaaagttccacgtggagctattgtaggaattattggaccgaat
ggagcaggtaagtctactttgtttaatattattacaggtaaaataatgccagatagtggt
tctattaaaattggtcaaacggtcaaattaggttatgtcgatcaatcacgggatcattta
gatgataataagactatatgggaagaaatttcagaaggtctagatgaattacaacttggt
aatagaataattaaaagtagagcttattgtgcagcttttaattttagaggcggtgatcaa
caaaaaaaagttggacaactttcaggtggagaacgtaacagagtacatttggcaaaatta
ctaaaagaaggagcaaatgttatattattagatgagccgtctaatgatttagatattgat
acgttaagagcacttgaagatgctattttagattttgcaggttgtgtattagtgattagt
catgatagatggtttttagatagaataactactcatattatatcatatgataaagaaaat
aatgctacatggtttgaaggaaattatcaagattatcatgaatatatgctaagtactaac
ggggaaagtattttaaatccaaaatataaacataagaaattaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
