KEGG   Rickettsia africae: RAF_ORF0990
Entry
RAF_ORF0990       CDS       T00979                                 
Symbol
ompB
Name
(GenBank) Outer membrane protein rOmpB
Organism
raf  Rickettsia africae
SSDB
Motif
Pfam: rOmpB_passenger Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACP53821
UniProt: C3PLI1
LinkDB
Position
complement(1017088..1022052)
AA seq 1654 aa
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVASFAGSAMGAAIQQNRTTNADATTVDGAGFDQTAV
PANVAVPLNAVITASVHKGINLNTPAGSFNGLFLNTANNLAVTVSEDTTLGFITRAVNNA
NFFNLTLNAGKTLTITGQGITNVQAAATKNAQNVVVQVNNGAAIENNDLQGVGTIDFGAA
ASTLVFNLANPTTQKAPLILGDNAVIVNGANGTLNVTNGFIKVSSKSFATVNAINIGDGQ
GIIFNTDADNANALNLQAGGTTINFNGTDGTGRLVLLSKNAAATDFNVTGSLGGNLKGII
EFNTVAVDGQLKANAGPANAVIGTNNGAGRAAGFVVSVDNGKVATIDGQVYAKDMVIQSA
NAVGQVNFRHIVDVGTDGTTAFKTAASKVAITQNSNFGTTDFGNLAAQITVPNTMTLKGN
FTGDASNPGNTAGVITFDANGTLASASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELR
LGNAGSVFKLADGTVINGKVNQTALVAGALAAGTITLDGSATITGDIGNAGGAAALQGIT
LANDATKTLTLGGANIIGANGGMIDFQANGGTIKFTSTQNNIIVDFDLAITTDQTGVVDA
SSLTNAQTLTINGKIGTIGANNKTLGQFNIGSSKTALSGGDVAINELVIGNNGAVQFAHN
TYLITRTTNAAGQGKIIFNPVVNNNTTLAAGTNLGSATNPLAEINFGSKGVNVDTVLNVG
EGVNLYATNITTTDANVGSFIFNAGGINIVSGTVGGQQGNKFNTVALDNGTTVKFLGNAT
FNGNTTIAANSTLQIGGNYTADFVASADGTGIVEFVNTDPITVTLNKQAAPVNALKHITV
SGPGNVVINEIGNAGNYHGAVTDTIAFENSSLGAVVFLPRGIPFNDAGNIIPLTIKSTVG
NKTAAGFDVPSVIVSGVDSVIADGQVIGDQNNIVGLGLGSDNDIIVNATTLYAGIGTINN
NQGTVTLSGGIPNTPGTVYGLGTGIGASKFKQVTFTTDYNNLGNIIATNATINDGVTVTT
GGIAGIGFDGKITLGSVNGNGNVRFVDGILSNSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIGG
SDTPVASVRFTGSDGGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGILNSNVILGGGTTAINGKINLLTN
TLTFASGTSTWGNNTSIETTLTLANVNIGNIVILEGAQVNATTTGTTTIKVQDNANANFS
GTQTYTLIQGGARFNGTLGGPNFVVTGSNRFVNYGLIRAANQDYVITRTNNAENVVTNDI
ANSPFGGAPGVGQNVTTFVNATNTAAYNNLLLAKNSANAANFVGAIVTDTSAAITNAQLD
VAKDIQAHLGNRLGALRYLGTPETAEMAGPEAGAIPAAVAAGDEAVDNVAYGIWAKPFYT
DTHQSKKGGLAGYKAKTTGVVIGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDVNG
FSFSLYGAQQLVKNFFAQGSAIFSLNQVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGN
LTVGYDYNAMQGVLVTPMAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKVA
GSTMNITDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTPCISQPDRTAKTSYNLGLSAS
IRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq 4965 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttccgcagggttggtaactgcttct
acagctaccatagtagccagttttgcaggttcagctatgggtgctgctatacagcagaat
agaacaacaaacgcagatgctacaactgttgatggtgcgggatttgaccaaactgcagtt
cctgcaaatgttgcagttcctctaaatgcagttattactgctagtgttcataagggtatt
aatttaaatactccagccggtagttttaacggtttgtttttaaatactgcaaacaattta
gcagtgacagtgagtgaagatactaccttagggttcatcactcgtgctgttaataacgct
aacttctttaaccttacgcttaatgccggtaaaactcttactataacaggtcaaggtatt
actaatgtacaagctgctgctacaaaaaatgctcaaaatgttgttgtacaagttaataat
ggtgctgctattgaaaataatgatcttcaaggtgtaggaacaatagacttcggtgctgcg
gcttctacattagtatttaatttagcaaatcctacaactcaaaaagctcctcttatactt
ggagataatgctgtaatagttaatggtgctaacggtacattaaatgttactaatggattt
attaaagtttcaagtaaaagttttgctactgttaatgcaattaatatcggtgacggtcaa
ggtatcatattcaatactgatgctgataatgctaatgctttaaatttacaagcaggtggt
actactattaattttaatggaacagacggtacgggtagattagtattattaagtaagaat
gctgctgctaccgactttaatgttacaggaagtttaggcggtaatctaaaaggtattatt
gaatttaacactgttgcagtagacggtcaacttaaagctaatgcaggccctgctaatgca
gtaataggtactaataatggcgcaggtagagctgcaggatttgttgttagcgtagataat
ggtaaggtagcaacaatcgatggacaagtttatgctaaagacatggttatacaaagtgct
aatgcagttggacaagtaaattttagacacatagttgacgttggtacagacggtactact
gcctttaaaacagcagcttctaaagttgcaataacccaaaactcaaactttggtactact
gattttggtaatcttgcagcacagattacagttcctaatactatgacccttaaaggtaat
tttacaggtgatgctagcaatcccggtaacactgcaggtgtgataacttttgatgctaac
ggtactttagcaagtgctagtgcagatgcaaatgttgcggtgacaaataatattacagca
attgaagcatcaggtgccggagttgtccaattatcaggaacacatgctgccgagttacgt
ttaggaaatgccggttctgtctttaaacttgctgatggtacagttataaacggtaaagtt
aaccaaactgctcttgttgccggtgctcttgcagccggtactattaccttagacggtagt
gctacaattaccggcgatatagggaacgctggcggtgctgctgcgttacaaggcattact
ttagctaacgatgctacaaaaacattaacacttggtggagcaaatattatcggtgctaat
ggtggaatgattgatttccaagctaacggtggtactattaaattcacaagcactcaaaat
aatattatagttgattttgatttagctataactactgatcaaacaggcgttgttgatgcg
agtagcctaacaaatgctcaaactttaactattaacggtaaaatcggtactattggagct
aataataaaactcttggacaatttaatattggctcaagtaaaacagctttaagtggcggt
gatgttgctattaacgagttagttattggaaataacggtgcagtacaattcgctcataat
acttatttaataacaagaactacaaatgctgccggtcaaggtaaaataatatttaatcct
gttgtaaataataatacaactcttgcagccggtacaaatttaggtagtgctacaaatcca
cttgcagaaattaattttggatctaaaggggttaatgttgatactgtattaaatgttggt
gaaggtgtaaatttatatgctactaatattactactaccgatgctaacgtaggttctttc
atctttaatgccggtggaataaatatagtaagcggtacagtcggtggacagcaaggtaat
aagtttaatactgtagcattagataacggtactactgttaagttcttaggtaatgcaaca
tttaacggtaacactacaattgcagctaattctaccttacaaatcggtggtaactatact
gcagactttgttgcatctgccgatggtaccggtatagtagaattcgttaacaccgatcct
attaccgtaacattaaacaaacaagctgcacctgttaatgctttaaaacacataacggtt
tctggtcccggtaacgtagtgattaatgagataggtaatgcaggtaattatcatggtgcc
gtgactgatacgattgcttttgaaaattcaagtttaggtgcagttgtattcttacctaga
ggcattccattcaatgatgcaggcaacataattcctttaacaattaaaagtaccgtaggt
aataaaacagctgcaggttttgatgttcctagcgtgattgtttcaggtgttgatagtgtc
atcgctgacggtcaagtaatcggtgatcaaaataatatcgtaggtctaggtcttggaagc
gataacgatataatcgttaatgctactacattatatgcaggtatcggtactataaacaat
aatcaaggtactgtcacacttagcggtggtattcctaatacccctggtacagtttatggc
ttaggcacaggtattggcgcttcaaagttcaagcaagtaacgtttactacagactataac
aatttaggtaatattattgcaactaacgcaacaattaatgacggtgtaactgttactaca
ggcggtatagccggaataggttttgatggtaaaattactcttggaagtgttaacggtaac
ggtaatgtaagatttgttgacggtatattgtctaattctacaagtatgattggtactact
aaagctaataatggtactgtaacttatttaggtaatgcattcgtcggtaatataggtggt
tcagatactcctgtagcttctgttagatttacaggtagtgatggtggtgcaggattacaa
ggaaatatttattcacaagtcatagactttggtacttataacttaggtattttaaattct
aatgtaattttaggcggcggtactactgctattaacggtaaaatcaatcttcttacaaat
actttaacatttgcaagtggtacttcaacatggggaaacaatacttctattgaaactact
ttaacattagcaaacgttaatataggtaacatcgttattttggaaggtgcgcaagttaat
gcaacaaccacaggaactacaaccattaaagtacaagataatgccaatgcaaatttcagt
ggtacacaaacttatactttaatccaaggtggtgctagatttaacggtactttaggaggt
cccaactttgttgtaaccggaagtaatcgtttcgtaaattacggtttaatacgtgctgct
aaccaagattatgtaataacacgtactaacaatgcagaaaacgtagttactaatgatatc
gcaaatagtccgtttggaggtgcaccgggtgtaggtcagaacgttacaacatttgtaaat
gcaactaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaatagtgctaatgctgct
aactttgttggagctatcgttaccgatacaagtgcggccataactaatgcacaattagat
gtagctaaagatatccaagctcaccttggtaacagattaggtgctcttagatatttaggt
actcctgaaactgctgaaatggctggacctgaagctggagcaataccggctgcggttgct
gcaggtgacgaggctgttgataatgtagcttacggtatatgggcaaaacctttctatact
gatacacatcaaagtaagaaaggtggtttagctggttataaagctaaaaccaccggtgtc
gtaatcggtttagatacgctagctaacgataacttaatgataggtgctgctattggtatc
actaaaactgatataaaacaccaagattataagaaaggtgataaaaccgacgttaacggt
ttctcattctctctatatggtgcccagcagcttgttaagaacttctttgctcaaggtagt
gcaatatttagcttaaaccaagtgaagaacaaaagtcagcgttacttcttcgatgctaac
ggtaatatgagcaagcaaattgctgccggtcattacgataacatgacattcggtggtaac
ttaacagtcggttatgattacaatgcaatgcaaggtgtgttagtaactccaatggcagga
cttagctacttaaagtcttctgacgaaaactacaaagaaaccggtacaacagttgcaaac
aagcaagttaacagcaaatttagcgatagaaccgatttaatagtaggtgctaaagtagcc
ggcagtactatgaacataactgatcttgcggtatatccggaagttcacgcttttgtggtt
cacaaagtaaccggtagattatctaaaactcagtctgtattagacgggcaagttactccg
tgtatcagccagcctgacagaaccgctaaaacatcttataatttaggtttaagtgcaagc
ataagatctgatgctaagatggagtacggaatcggttacgatgctcagatttcaagtaaa
tatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa

DBGET integrated database retrieval system