Riemerella anatipestifer RA-CH-1: B739_0584
Help
Entry
B739_0584 CDS
T02331
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
rag
Riemerella anatipestifer RA-CH-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rag02000
]
B739_0584
Transporters [BR:
rag02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B739_0584
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFR35188
UniProt:
J9R460
LinkDB
All DBs
Position
complement(616551..619463)
Genome browser
AA seq
970 aa
AA seq
DB search
MNVKLRVLTAGAVFFIGAQSVVAQKTKKDSVKTREIEEVVMVGYGVQKKSEVTASISKIK
GGEIADLNTPSFEAQLAGRAAGVQVTQNTGVLGSAPRVRIRGVNSISSGTSPLYVIDGVP
MISGDTGGGYASSNALADINPNDIESMEVLKDGAAAAIYGSRAANGVILITTKKGKGGKF
TFNYNNLLSIASPVKYFDLLKTNDFLAISAEKVRPYGLPGNYWAEGAEFDTDWQKAVTRS
SLQQDHYLSFGGGLAKGKYFMSLGYTDQEGVILQNSMRRFTVRANVDQKLTDRVDVGGNF
SVSKTDFAGINNGANTNSGVMNNALRQLPNTPVFDPSTPTGYNITNESGKSFIGRWTNNA
NIANDLPNIVYVLNNNRMTSELTRILGNVYTNVKFTDWLTYRLQASVDNSITDGRLYYNK
VHGDGFSREGVVEGNNLNLLRWNLQNIFTVDKSFNDHKVNLTLVHEEQYQKARYIFGGGT
GLAADYFGKDGPVTNSYKVQSSGGSITENALTSYIARFNYNYARKYFLQASIRRDGLSQL
PSETRWGTFPGLSVGWTVSNEKFMEALKPTLSDFKLKASYAKVGNTDIGNYPFRSLYGNA
RYADNTGLALVQAGNPNLKWETSVKYDYGVELGFFRNRLTFTADYFINNQDGIILDRPTS
PILGIPGNTISQNIGSSKNSGFEFSLNADVIRKDNFSWSIGSNVSFVNNEVTGLVSQGSD
IFYNIDSGREQVGIIRVGESIRSIYGYKYWGVNKQNGNPVYYKTDGSLVQHNINDGKYYV
FDLAKPSSLEKASTLTSADKQILGRTLPKYFGSFSTNIKWKNFDLSTLVRFSGGNKILNL
TRRNLLSMDFYNNSTEILGRWQSLDNPGDGMTPRIVGSKGNIINMEGVATSRFVEDGSFI
KIDNINFGYSLPKDLVNSFGMTNLRIFASVQNAFVFTKYSGMDPELEVNGVDYNNAPRQR
TYSLGLNLSF
NT seq
2913 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtgaaattaagggtgcttaccgctggagctgttttctttataggagcccaaagt
gtagtggcacaaaaaacaaaaaaagactctgttaaaactagagagatagaagaggttgta
atggttggatatggagttcagaagaagagtgaggttacggcgtctatttctaaaattaaa
ggaggggaaatcgctgatttaaatacgccttcctttgaagcacaattggctggtagagct
gctggtgtacaggtaactcaaaatacaggcgtattaggatctgctccgcgtgtaaggatt
agaggggttaattccatttcgtctggtacctctccgctttatgttatagatggtgttcct
atgatatctggagatacaggcggaggatatgcttcttctaatgctttggcggatattaat
ccaaatgatatagagtctatggaggtgttgaaagatggtgcagctgcagctatttatggt
tcgcgtgccgcaaatggggttattttaattactacaaagaaaggaaaaggggggaagttt
acgtttaactacaataatttgctcagtatagcttctccagttaaatattttgatttgttg
aagacaaatgacttcttggctatttctgctgaaaaagtaagaccttatggtttaccaggt
aattattgggcagaaggagccgagtttgatacggattggcagaaagctgttacaagatcc
tctttacaacaggatcattatctttcttttggtggaggtttagctaagggtaaatatttt
atgtctttaggatacacggatcaagagggtgttattttacaaaattctatgagaagattt
acggtaagagctaatgttgatcaaaaattaactgatagagtggatgtaggggggaatttt
tcggtatcaaagacagattttgctggtataaataatggagcaaatacgaattctggtgtt
atgaataacgctcttagacagttgcctaatactccagtttttgatcctagtacacctaca
ggctataatataactaatgaaagtggaaaaagctttattggaagatggactaataatgct
aatatagcaaacgatttgccaaatatagtttatgttctcaataacaatagaatgacctct
gagttgactcgtatattgggtaatgtttatacaaatgttaaatttacagattggttaact
tataggcttcaggctagtgtagataactctatcactgatggtagattatactacaataaa
gttcatggtgatggtttctctagggaaggtgttgttgagggtaataatttgaatttgtta
agatggaatttacaaaacatttttacagttgataagagcttcaatgaccataaggtgaat
ttaacattagttcatgaagagcaatatcagaaagctcgttatatatttggtggaggaact
ggattagctgcggattattttggtaaagatggaccagtaactaactcttacaaagttcag
tcatcaggaggaagtattacagaaaatgctctcacatcctatatagctagattcaattat
aattatgcaaggaagtattttttacaagcttctattagacgagatggattatctcagttg
ccatcagagacgagatgggggacttttccaggtttatcagttggatggacggtatctaat
gaaaagttcatggaagctctaaagcctaccttgtctgacttcaaattgaaagcatcttat
gctaaagtgggtaatacagatataggtaactatccgtttaggtctctttatgggaatgca
agatatgcagataatacaggtttagcacttgtacaagcaggaaatcctaatttgaaatgg
gagacaagtgtgaaatatgactatggagtagagttaggtttctttagaaatagattaact
tttacagcagattatttcataaataaccaagatggtattattttggatagaccgacttca
cctattttgggtattccaggtaatacaataagtcaaaacataggaagttctaaaaactca
gggtttgaattttcattaaatgctgatgttattaggaaggataatttttcttggagtata
ggttccaatgtttcatttgttaataatgaggttacaggacttgtgtcacaaggtagtgat
attttctataatatagattctggtagagagcaggtagggattataagagttggtgagtct
ataagatcaatttatggatataagtattggggagtaaataagcaaaatggaaatcctgtg
tattataagaccgatggtagcttggttcagcataacataaatgatgggaagtactatgtg
tttgatttggctaaaccatcttcattggaaaaagcttcaaccttgacgagtgcagataag
caaatattagggagaactcttccaaagtattttggctcttttagtacaaatatcaaatgg
aagaattttgatttatccactttagttagatttagtggaggaaataagattcttaacctt
actagaagaaatttattaagtatggacttttataacaactctacagagatattaggtaga
tggcagagtttagataatcctggtgatgggatgactcctagaatagtaggatctaagggt
aatattatcaatatggagggggtagctacctctaggtttgtggaagatggtagcttcatt
aaaattgataatataaattttggttattcattgcctaaggatttagtaaattcatttgga
atgactaatctaagaatatttgctagtgttcagaatgcatttgttttcactaagtattct
ggaatggatccagagctagaagtgaacggagtagattataataatgctcctaggcaaaga
acatactcattagggttaaatttatcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system