KEGG   Riemerella anatipestifer RA-CH-1: B739_0584
Entry
B739_0584         CDS       T02331                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
rag  Riemerella anatipestifer RA-CH-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rag00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rag02000]
    B739_0584
Transporters [BR:rag02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   B739_0584
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFR35188
UniProt: J9R460
LinkDB
Position
complement(616551..619463)
AA seq 970 aa
MNVKLRVLTAGAVFFIGAQSVVAQKTKKDSVKTREIEEVVMVGYGVQKKSEVTASISKIK
GGEIADLNTPSFEAQLAGRAAGVQVTQNTGVLGSAPRVRIRGVNSISSGTSPLYVIDGVP
MISGDTGGGYASSNALADINPNDIESMEVLKDGAAAAIYGSRAANGVILITTKKGKGGKF
TFNYNNLLSIASPVKYFDLLKTNDFLAISAEKVRPYGLPGNYWAEGAEFDTDWQKAVTRS
SLQQDHYLSFGGGLAKGKYFMSLGYTDQEGVILQNSMRRFTVRANVDQKLTDRVDVGGNF
SVSKTDFAGINNGANTNSGVMNNALRQLPNTPVFDPSTPTGYNITNESGKSFIGRWTNNA
NIANDLPNIVYVLNNNRMTSELTRILGNVYTNVKFTDWLTYRLQASVDNSITDGRLYYNK
VHGDGFSREGVVEGNNLNLLRWNLQNIFTVDKSFNDHKVNLTLVHEEQYQKARYIFGGGT
GLAADYFGKDGPVTNSYKVQSSGGSITENALTSYIARFNYNYARKYFLQASIRRDGLSQL
PSETRWGTFPGLSVGWTVSNEKFMEALKPTLSDFKLKASYAKVGNTDIGNYPFRSLYGNA
RYADNTGLALVQAGNPNLKWETSVKYDYGVELGFFRNRLTFTADYFINNQDGIILDRPTS
PILGIPGNTISQNIGSSKNSGFEFSLNADVIRKDNFSWSIGSNVSFVNNEVTGLVSQGSD
IFYNIDSGREQVGIIRVGESIRSIYGYKYWGVNKQNGNPVYYKTDGSLVQHNINDGKYYV
FDLAKPSSLEKASTLTSADKQILGRTLPKYFGSFSTNIKWKNFDLSTLVRFSGGNKILNL
TRRNLLSMDFYNNSTEILGRWQSLDNPGDGMTPRIVGSKGNIINMEGVATSRFVEDGSFI
KIDNINFGYSLPKDLVNSFGMTNLRIFASVQNAFVFTKYSGMDPELEVNGVDYNNAPRQR
TYSLGLNLSF
NT seq 2913 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgtgaaattaagggtgcttaccgctggagctgttttctttataggagcccaaagt
gtagtggcacaaaaaacaaaaaaagactctgttaaaactagagagatagaagaggttgta
atggttggatatggagttcagaagaagagtgaggttacggcgtctatttctaaaattaaa
ggaggggaaatcgctgatttaaatacgccttcctttgaagcacaattggctggtagagct
gctggtgtacaggtaactcaaaatacaggcgtattaggatctgctccgcgtgtaaggatt
agaggggttaattccatttcgtctggtacctctccgctttatgttatagatggtgttcct
atgatatctggagatacaggcggaggatatgcttcttctaatgctttggcggatattaat
ccaaatgatatagagtctatggaggtgttgaaagatggtgcagctgcagctatttatggt
tcgcgtgccgcaaatggggttattttaattactacaaagaaaggaaaaggggggaagttt
acgtttaactacaataatttgctcagtatagcttctccagttaaatattttgatttgttg
aagacaaatgacttcttggctatttctgctgaaaaagtaagaccttatggtttaccaggt
aattattgggcagaaggagccgagtttgatacggattggcagaaagctgttacaagatcc
tctttacaacaggatcattatctttcttttggtggaggtttagctaagggtaaatatttt
atgtctttaggatacacggatcaagagggtgttattttacaaaattctatgagaagattt
acggtaagagctaatgttgatcaaaaattaactgatagagtggatgtaggggggaatttt
tcggtatcaaagacagattttgctggtataaataatggagcaaatacgaattctggtgtt
atgaataacgctcttagacagttgcctaatactccagtttttgatcctagtacacctaca
ggctataatataactaatgaaagtggaaaaagctttattggaagatggactaataatgct
aatatagcaaacgatttgccaaatatagtttatgttctcaataacaatagaatgacctct
gagttgactcgtatattgggtaatgtttatacaaatgttaaatttacagattggttaact
tataggcttcaggctagtgtagataactctatcactgatggtagattatactacaataaa
gttcatggtgatggtttctctagggaaggtgttgttgagggtaataatttgaatttgtta
agatggaatttacaaaacatttttacagttgataagagcttcaatgaccataaggtgaat
ttaacattagttcatgaagagcaatatcagaaagctcgttatatatttggtggaggaact
ggattagctgcggattattttggtaaagatggaccagtaactaactcttacaaagttcag
tcatcaggaggaagtattacagaaaatgctctcacatcctatatagctagattcaattat
aattatgcaaggaagtattttttacaagcttctattagacgagatggattatctcagttg
ccatcagagacgagatgggggacttttccaggtttatcagttggatggacggtatctaat
gaaaagttcatggaagctctaaagcctaccttgtctgacttcaaattgaaagcatcttat
gctaaagtgggtaatacagatataggtaactatccgtttaggtctctttatgggaatgca
agatatgcagataatacaggtttagcacttgtacaagcaggaaatcctaatttgaaatgg
gagacaagtgtgaaatatgactatggagtagagttaggtttctttagaaatagattaact
tttacagcagattatttcataaataaccaagatggtattattttggatagaccgacttca
cctattttgggtattccaggtaatacaataagtcaaaacataggaagttctaaaaactca
gggtttgaattttcattaaatgctgatgttattaggaaggataatttttcttggagtata
ggttccaatgtttcatttgttaataatgaggttacaggacttgtgtcacaaggtagtgat
attttctataatatagattctggtagagagcaggtagggattataagagttggtgagtct
ataagatcaatttatggatataagtattggggagtaaataagcaaaatggaaatcctgtg
tattataagaccgatggtagcttggttcagcataacataaatgatgggaagtactatgtg
tttgatttggctaaaccatcttcattggaaaaagcttcaaccttgacgagtgcagataag
caaatattagggagaactcttccaaagtattttggctcttttagtacaaatatcaaatgg
aagaattttgatttatccactttagttagatttagtggaggaaataagattcttaacctt
actagaagaaatttattaagtatggacttttataacaactctacagagatattaggtaga
tggcagagtttagataatcctggtgatgggatgactcctagaatagtaggatctaagggt
aatattatcaatatggagggggtagctacctctaggtttgtggaagatggtagcttcatt
aaaattgataatataaattttggttattcattgcctaaggatttagtaaattcatttgga
atgactaatctaagaatatttgctagtgttcagaatgcatttgttttcactaagtattct
ggaatggatccagagctagaagtgaacggagtagattataataatgctcctaggcaaaga
acatactcattagggttaaatttatcattttaa

DBGET integrated database retrieval system