KEGG   Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868: RA0C_0571
Entry
RA0C_0571         CDS       T02107                                 
Name
(GenBank) protein translocase subunit secf, protein translocase subunit secd
  KO
K12257  SecD/SecF fusion protein
Organism
rai  Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868
Pathway
rai02024  Quorum sensing
rai03060  Protein export
rai03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rai00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03060 Protein export
    RA0C_0571
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RA0C_0571
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    RA0C_0571
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:rai02044]
    RA0C_0571
Secretion system [BR:rai02044]
 Sec (secretion) system
  Prokaryotic Sec-SRP core components
   RA0C_0571
SSDB
Motif
Pfam: SecD_SecF_C SecDF_P1_head SecD_1st Sec_GG MMPL ACR_tran
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFD55546
UniProt: E4T949
LinkDB
Position
complement(540892..543768)
AA seq 958 aa
MQGKGLITVVAIVLGLICLNEMLPTFYASKVEKEARAIAGDNQVKYQKEIDRLSKDTLNL
GFTKLYYTAAKEREMKLGLDLKGGINVLLEINQRDLVMDLTNYSSNPILIEALDKTDVAQ
RNSTKSYIEDFFVQFDNVNKSKAANLKLASPEIFGTQKLSGEIKFNTTDDEVKSIIRKKI
DAAVGSAYEVIRTRIDKMGVTQPNVQRVPGTGRILVEMPGIKDIDRVKKMLQTSAKLQFW
EVQQVPEVAPYFEQLSKLVLAKGDSMGVAKTTNFPALLNLNTLRSNGVGNIKLSDTATVN
KILNSSVALNARPGNIKYTKFLWAYKPESTDPDHLVLYAIRSNISGKAPVDGAVDKANIS
YDQIGRVVVDMQMDSEGTKDWKILTEKNVGKPVAVTLDDKVYTAPNVVNAIPNGRTQISG
NFTQDEAQDLVNVLNTGKLPASAKIVQADVVGPSLGQASIDAGMWSFIIAFVFIVVYIIF
YYGGAGVFAVIAMIINLFYIFGIMDSMDATLTLPGIAGIVLTMAMAVDTNVIIYERTKEE
LFAGKNIREAYHDGFKHALSAIVDGHLTTLLTAVVLYIFGTGPIQGFAVTLIIGLIMTFF
TSVLLSRVMIFSRLNKGKGLSVWTPATKNIFRNVWVAFIEKRKFAYIISGILTVICLASI
VVNGFKLGVDFEGGRNYVVKFDKTVDAAQAEASLSQLFQTKDGKNNSVDVKTFGTSNQLK
ITTDYKIDDESLAADQEIEAKLFEGLKSNYPTGYTLDKFKSAEGDNLGIVSSTKVGPSVA
DDIKIGGTFAVLASLLGIFIYILFRFRRWQFSLGAVLALFHDAIIILGAYSLFYKVSPFN
MEINQDFIAAILTVLGYSINDTVIVFDRIREYLRERKSTTLAGLFNDSISSTLGRTINTS
LTVLMVILAIFIFGGDSLRGFMFALLLGIGFGTYSSIFIASGIAYDFLKGKKQEDIKI
NT seq 2877 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaggaaaaggacttattacagttgttgcgattgttctagggcttatttgtcttaac
gaaatgctccctactttttatgcgagcaaggtagagaaagaagctagagctatagcagga
gacaatcaggtaaagtatcaaaaagagatagatcgtctgtctaaagatacgcttaattta
gggtttactaagctttactacacggctgctaaagagcgtgaaatgaagttaggtctagac
ttaaaaggtggtatcaatgtgcttttagagattaaccaaagagatttggtgatggattta
actaactattcatctaacccaatactcatagaagcactagataaaacagatgtagctcag
agaaattctactaaatcttatatagaggacttctttgttcagtttgataatgtaaacaag
agcaaagcagcaaacttaaagttagcgagtccagaaatatttggaactcaaaaattaagt
ggcgaaatcaaatttaatacaactgatgacgaggttaagtctatcattagaaagaaaata
gatgctgcggtaggttctgcttacgaagttattagaactcgtatagacaaaatgggggtt
actcagcctaatgttcagagagtacctggtacaggtagaatattggttgagatgccaggt
attaaagatattgatagagtaaagaaaatgcttcagacttctgctaagcttcagttttgg
gaagttcagcaagtgccagaagttgctccttactttgaacaactttcaaaattagtgttg
gctaaaggagattctatgggagttgctaaaacaactaatttcccagcgttgctcaatcta
aatacgcttagaagtaatggagttggtaacattaagttaagcgacacagctactgttaac
aaaattcttaatagttcagtagctttaaacgctagaccaggtaatattaaatacactaag
tttctgtgggcttataagccagaatctacagatcctgaccacttggtattgtatgctatt
cgttctaatatttcaggtaaagctccagtagatggtgcggtagataaggcaaatatcagc
tacgaccaaataggtagagtagtggtagatatgcagatggatagtgagggtactaaagac
tggaagattctaactgaaaaaaatgtaggtaaaccagtagcggttactttagatgataag
gtatatacagctcctaatgttgtaaatgcgatacctaacgggcgtacacaaatttcgggt
aactttactcaagacgaagctcaagatttagtaaatgttttaaatacaggtaagttgcct
gcaagcgctaaaattgtacaggcagatgttgtagggccatctttaggtcaagcttctatt
gacgctggtatgtggtcatttattattgcatttgttttcattgtagtttatattatattt
tactatggaggagcaggtgtttttgcggtaattgctatgattatcaatttgttctatatc
ttcggtattatggattctatggacgctacgcttactttaccaggtattgctggtattgtt
ttaacgatggcgatggcagtggataccaatgtaatcatctatgaaagaactaaagaagag
ctttttgcaggtaaaaacatcagagaggcttaccatgatggtttcaaacatgcactttct
gctattgtagatgggcatttaactacattgcttacagcggtggtgctttacatctttggt
acaggccctatccaaggttttgcagttacgctgattataggtcttattatgactttcttt
acatctgtattactttctagagtaatgatatttagtaggcttaataaaggtaaagggctt
tctgtatggactcctgctactaaaaatatattcagaaatgtatgggtggcttttatagag
aagagaaagtttgcttatattatctcgggtattcttactgtaatatgtttagcttctata
gtggtaaacggctttaagctaggtgtagattttgaaggaggaagaaactatgtagttaaa
tttgataaaacggtagatgctgcacaagcggaagctagtctatcacaattatttcaaact
aaggatggaaagaataattcagtagatgtaaaaacatttggtacttctaaccagttaaaa
atcacaactgactataagattgatgatgaatcattagcggcagaccaagagattgaggct
aaattgtttgaaggattgaagtctaattatccaactggttatacgctagataaatttaag
agtgctgaaggggataatttaggtatagtttcatctactaaagtaggaccatctgtagca
gatgatatcaagataggtggtacttttgcagtactagcctctttattaggaatatttatt
tatatcttattccgtttcagaagatggcagttctctttaggtgctgtgttggcattgttc
catgatgctattattattttaggagcttattctttattctataaagtttctcctttcaac
atggaaattaatcaggactttatcgcagcgatacttacggtgctaggatattctatcaat
gatactgtaattgtatttgaccgtattcgtgaatatctaagagagagaaaatctactact
ttggcagggctgttcaatgattctatcagcagtactttgggtagaacaatcaatacctca
cttactgtactaatggtgattttagctatatttatatttggtggagatagtttgagagga
tttatgtttgcattgttgctaggtataggttttggtacttattcatctatatttatagca
tcgggtattgcgtatgatttcttaaaaggcaaaaaacaggaagatatcaaaatttaa

DBGET integrated database retrieval system