Ruminococcus albus: Rumal_3828
Help
Entry
Rumal_3828 CDS
T01387
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ral
Ruminococcus albus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU24258
UniProt:
E6UKR2
LinkDB
All DBs
Position
pRUMAL02:146704..156981
Genome browser
AA seq
3425 aa
AA seq
DB search
MKNKSNNKRRSNLFKRVVCLVLSAAILISDSYILTVLDDIGINLLPVVYAEETRNISTIS
ELVQYSKEYDASHAKDTLNISIASNGVGTYQTSDTQYSYDEFISIGNSSSNAFEGTVNIT
VLASSYFNFSKPLFGYIKDSAQVTVSGGSSSGYLELRRPMTSNLMPIFAENVIHDTDTTK
YDPADESQYTNWRIRINYFHEEGEASVVTNFPSVIGRIDDNSKLSLDILNDAQYTNNGEE
YKADIQATASGVNAGLICGTLGENAEIKVSVGGSNTNFSVTSASGNAGGLIGEMESGSRV
ILDGSNITGGSNRTITASNGYAGGLVGKATNASIVFDNGFNVNEHINGKNGAGSIAGYYI
SGSGTTFDLDKAQISCTVTSANAGGLFGVLETSGDFSLAGAKDAETGDDSYSISTTVANQ
PQNAVYGGLIGLYKTSALVNTLTIGEIALTTNGTGNCAGLVGKIDDSNPAYITVNGSSVT
NNIKSSFCGVVNNAGNAGHFLDIGDFTLSGSSHSGLVGTMNCGVIRLTGTTDLSGTTSSD
AQLVNKRGNTLIYGVGDGSTSGWLFKRGTAAAVDDIGNWGEVVRVASDGSGDVFEFDSSA
HTVTVASSTTSISTPAQFIATAVNMQINQGDRGALQFAQDSNDDTKTVSDTLLSSLTTIS
ISGTINLAGTGVMGLMRDDGKKTTFSGNTATETDVAFSGTINGGGIVNLAIGEPYGIRGT
SALTTNGDGNGRLHGHAKVGLLSVSDDATISSLTIGGTIDTKASIEMYLGGFVGQSKGDL
SLTSVTNTIRIDGSFSSDKSQYIGGMIGEVEGNGSVISISGSNKSVISLNGHKTTYASNG
IGFVEDNTVTVSFSDYTLGNTSSTSSASLSNTSGADYARCGGMIGVINGSTKNKTVNFND
VSISYYDLNLTASECAGGVLGYKWDNTEVNIGNTGTTGIVVSYGDVDQTAVSAAGLVHTA
TGHWAVSKLKINNTDFGLINTTNYGVLVNKGDGLFMEIKSSSGSNNGFDLSTGNTVTNTG
STLTVYDELVAYSASVDDSGNSNVLNNGNGVVSIHTASGTVVGGKYSNQITSPNSLNNNK
FTRYYYDLDVIRAAVTSGSYPSGSTTAEQNAYKLMMWNLKQYASSGIQSYFTSSNNATEP
LTGDFDLSKVSYYPINRASSDVSIGAASFTFNNKNIEDSVVAGTTYRSTVSNNSQHYLMH
SGLFNNVTSNLSIGDNITLSGSIGKHENGSGAIVTGTLGGLTEGTTSFSNTTGKLITLNG
LTVNAADNYTPEGESSAVTTYKPVLINRINNHVSLSLNGVKTAANSYVATGGGVNTAGSS
LIGTVGTRDGDNKATSDSISLTFNDIRLDARTDSNKSVEALSGLSTAYGTTQGVFTRATL
LEEFIFNNNSDCKGVYNYRLSEDWNSSTKAAIHNVTYGYEITGTSEFVGMQDHYVDLLGK
TDPTSYDNTQDETEYSFADFLPYVAVRNYSEASDTQRSREIMVNHTNVSITDGCGTYNDP
YIIDTNGQIEVIAKILEQGEVSDGFTINVPNITAVSGTNFTYETWHTNDHILLTFNNGTY
KASTATYNHTTAQLAKYLAGAYYKITKVEKEGEDDTVTYESITISSASFNGLGGTSNEYA
FHGVIVGDTDTATYPLVNNTGSPLIKTSHGSVVKDLNINVRNENISRTQENNTQKFVISG
GCSNYGAVIGQILGGDNIIDNVAVDFTDSTIKVEGSSANVIPVGGYVGVVASGALIFRGM
NGKNHAGLTTGIVKDGTTSIAMDSTDWLYVNPIIGRVLNGYAVYEAGTNSSSNDYKYSES
NVTMKNGTKNYSIADIDPDIDKVEVSAYTQKGTTGYYTTNVTIPNAQSLYVLSLLMQSRT
IGNDKYGTALKVLNSDSYDSTVKQAMHHGKYDKVGTADNSDYNSYAKYDTVGVDTVNGIK
YAPYIVERYTSAVGEKYYVLSLTNNKTVCNMTLTGSDADWYLPDGFKGVGYIGYDKSTSD
GISLHKFNGNEKTIHLNMSLNHYSDSTDNYCPSSGNVGFGLFSSIKHNSQAQGGAVTADN
LETDDYKIKNLNLTGTIDYNVADVTEYSSSNVYKDKYIDVGGFAGYCGYSEANDLRIEGI
DLSGLTINGFKTAGGLFGYLKMAASNVYLAKISNITASNGTLTVTSKDYVGGIVGRCEQI
GLTIDSLTLDNLSIVSYFYETGTITYNNGAGGIIGWAANASTNQPITLSNITVGSSTAIS
NLRIGYPNKAPYTNTNNVDNYYQIAVGGLVGRSMTNKNSSYSYSMIIEHCYVYNVDFYGH
RVAGIIGHDAAGSGKTASGSYLLMSDVHVVSSNSASINGIKKLSNLGDRGCGGLVGVMWN
DKNKDFIDCSVEGYTLRSYNDTGGISSNMQTGGTVTIKNFKATDLNIYSNYHGSLFGYLK
CTTNGYNILLDNIQFNNYVDEEGVVHKHSNGYIEKKYGYLVGNNGGCVIKLVGLTRQHLE
NTAHDHLNRIVGAKNSDSNYNYGSGGYIIFADTLGKSTTTATAGTKQSDLSDKTNVTAKS
PWVTVSPSINISGTEADSTQVLTGDSIMSNYLAADTLSNYNGVDTAGIISSLADVNSTAK
TNYAGFRDAQLFSTYEDEMGDGSLPEGVSNFAVIAVDNNGLRDDLNTAINSYVQMLTHTT
DVYSRTNNNGNVYKVQIYRCTYDSTEQVFVKTASSDGLTRDTNGFYPSVEHPDTDADTAC
FTLVDIQFLNPSNSNEVAYHVYVPVLIKKLLKFNFKASSLPGTVYDYTNYVYKTSSHTTE
DKWGTPSVTNLGTPVTMYFRYDYTSNVSEWQEMINNGESLMWHTNNKLQLKTAASNLPFN
TRMVLVDANNNDRAYFAKASDTGVFTKNTNSDQNDYFVDLTKFKNGSDYFAAKNFGERLL
ISASTTSSSAATKAYVISAAGESVYVTATIGSETTRSNFRPATDAEISDSSKTKYYLTVD
GVTSLPPAGLTESYYITFFTDTADDPLRVIIGGSAPSLSSSPQNSEISKHTLKCTNQTES
ALILGNIFKQEFTKFETENAQSGLVNNSCDYFEADITVKISVNNDNDEAETIIRYLNNDS
IEVYHSILLGLTKNDGTTVENTIYGTPTYTVNTAKAASGIYGTISSTFSDSAVDISGFSI
PSPNNTSSFIQIGDLDYNIKPLLVEKIGSTYGGAIISVNGLRVHFDYLNIPNQFPYQPST
VEGQNTVGTTVKAYSTLDSDYTNIAYSSIREEMADSNAVKYHSETPSSATLVYVVDTSDD
IDIVKNYNMLGINPIDEAEYFNNIITADGTYNAVSFVDSAQAGKIRWTLSLEKKNESGAY
ETVKMSDYVSGNVTVGNRTSGAVFSASGNTFIYDEDYTTPMDITKLTTIYAMKTGDDLEA
LVDGDGNPVTGVYANYKVTLSATLYTGSEALSGDLSSRKIDNSTVSDYIKYTNAKVKSSW
VNPSN
NT seq
10278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaatcgaataataagagacgctcgaatttgtttaagcgtgtagtgtgcctt
gttttgtcagctgcaattcttatatcagattcgtatatcttaactgttttagatgacatt
ggaataaatttgcttcctgttgtatatgctgaggaaacgagaaacattagtactattagt
gagttggttcagtattctaaagaatatgatgcttctcatgcgaaagatactcttaatatt
tctattgcttccaatggagttggaacatatcaaacctctgatacacagtattcttatgac
gaattcattagtattggcaatagttcatctaatgcatttgagggaacagtcaatataacg
gttttggctagttcttatttcaatttttcaaaaccattatttggatatattaaggatagt
gcgcaagtaacagtttcaggtggaagcagtagtgggtatttggagttgagaagaccgatg
acctcaaaccttatgccaattttcgccgaaaatgttattcatgatacagatactacaaaa
tatgaccctgctgatgaaagtcaatatactaattggagaattaggatcaattattttcat
gaagaaggcgaagcttcggttgtcactaactttccaagtgtaattggtcgtattgatgat
aacagcaaattaagtcttgatattttaaatgatgctcaatatacaaataatggagaagaa
tataaagctgatattcaagcgacagcttccggtgtaaacgcaggattgatttgtggcaca
ttgggggagaatgccgaaattaaggtatcagttggcggttcaaacaccaatttttctgtc
acatccgcaagtggaaatgctggtggtttgatcggtgaaatggaatctggctccagagta
attcttgatggttcaaacataacaggaggttctaatagaactataacggcttcaaatggt
tatgcaggtggtttagttggaaaagccaccaatgcttccatagtatttgacaacggtttt
aacgttaatgaacacattaatggcaaaaacggtgccggaagtattgccggttattatatt
agtggaagcggaacaacatttgatcttgataaagcacagattagctgtacagtaacctca
gcaaatgccggaggtctttttggtgtgcttgaaacatcaggtgatttttctttggctgga
gctaaagatgctgaaacaggtgatgattcttattcaatttctacaactgtagcaaatcaa
ccccaaaatgcagtttatggaggattgattggtttatataaaacaagcgcacttgttaac
acacttactattggcgaaatagctttaacgacaaatggtactggcaattgtgcgggatta
gttgggaaaattgatgactccaatcctgcttatattacggttaatggctcttcggttaca
aataacattaaaagctcattttgcggtgttgtaaacaatgccggaaatgcaggtcatttt
ttggatataggcgattttacgctatcaggttcgtctcattccggtcttgtaggtactatg
aattgtggtgttattagacttactggaactactgatctttcaggtactaccagctctgat
gctcagcttgtcaacaagagaggaaataccctaatttatggagtaggcgatggcagcaca
agcggttggcttttcaaacgaggaaccgctgccgctgttgatgatattggaaattggggc
gaagttgttcgcgttgcaagtgatggttcaggagatgtttttgagtttgattcttctgcg
catactgtaactgtggcatcttcaacgacttcaatttcaacaccagctcagtttattgct
actgctgtaaatatgcagatcaatcagggagatcgtggtgctttacaatttgctcaggac
tcaaatgatgatactaaaactgtatctgatactcttctcagcagtttaaccactatttct
atatcaggaacgattaatctcgcaggtacgggagtaatgggattaatgcgcgacgatggc
aaaaaaaccactttttccggtaatactgcaactgaaactgatgttgctttttccggaact
ataaatggtggtggaattgttaatcttgcaattggtgaaccttatggaataagaggaaca
tctgcattaactactaacggcgatggtaatggtagacttcatggtcatgctaaagtaggt
ttactttctgtatctgatgatgcaactatttcgagtcttacgattggaggaacaattgat
actaaggctagcattgaaatgtacttaggaggatttgtcggtcaatcgaaaggtgatctt
tctttgacaagtgtcaccaacacaattagaatagatggtagcttcagttcggataaaagc
cagtatattggtggaatgattggtgaagttgaaggtaatgggtcagttatctcaataagt
ggaagtaataaatctgttatttctttaaatgggcataaaacgacctatgcatcaaatgga
ataggttttgttgaagacaatacagttactgtaagtttcagtgattatactttaggaaat
accagttctacaagttcagcaagtttatctaatacttctggtgcagattacgcaagatgt
ggtggaatgataggtgttatcaacggttccacaaagaataaaactgtcaattttaatgat
gtatcgatttcctactatgatttgaatttaacagcaagtgagtgtgcaggtggagttctt
gggtataaatgggataatacagaggttaatattggtaataccggaacgacaggaatagtt
gtttcttacggagatgttgatcagacagctgttagtgctgctggtttggtacacaccgca
acggggcattgggctgtatcaaaattaaaaattaataacactgactttggtttaattaac
actactaattatggtgtccttgtaaataaaggagatggactttttatggaaataaagagt
tcatcaggttctaacaatggatttgaccttagtacaggtaacactgtaacaaacacagga
agtactttaactgtttatgatgaattggttgcatacagcgcttcggttgatgatagtggg
aattctaatgtgctgaacaacggtaatggagttgtatctattcatactgctagcggaact
gtagttggtggtaaatattcaaatcagataacttctccgaacagtttaaacaataataaa
ttcacaagatattattatgatttagatgttattcgtgcagctgttacatcgggttcatac
ccatcaggcagtacaacggctgaacagaacgcatataaactgatgatgtggaatcttaaa
cagtatgccagttccggtattcagtcatattttacgtcttcaaataatgcaacagagccc
ctgacaggtgattttgatttatcaaaagtatcttattatccaattaatagagcatcatct
gatgttagtataggtgcggctagttttactttcaataataagaatatagaagattctgtt
gttgcaggaactacctaccgctcaacagttagtaataattcccagcattatttgatgcat
tccggattatttaataatgttactagtaatttaagtataggtgataatatcacattgtct
ggtagtattggtaaacatgaaaatgggtcaggtgctatagttaccggcactttaggcgga
cttacggaaggaacaacttcgttttccaatacaacaggaaagctaataaccttaaacgga
ttaactgtcaatgctgctgataactatactcctgaaggggaatcgagtgcggttactact
tataaaccggttctgataaacagaatcaataatcacgtttcattatctcttaatggagta
aaaacagctgctaatagctatgttgctactggcggcggtgttaatactgcgggttcaagt
ttgataggaacggttggtacaagagatggagataataaagccacctcagattcaatcagt
ttaacatttaatgatataagacttgatgcgagaacagattcaaacaagagtgtggaggca
ttatcgggtctttcaacagcctatggaactactcaaggtgtatttacaagagctactctt
ttagaagagtttatctttaataacaatagcgactgtaaaggagtgtataattatagactt
tccgaggactggaatagttccacaaaagcagccattcataatgtaacttacggttatgaa
ataaccggaacaagtgaatttgtaggtatgcaggatcactatgtagacttgctgggaaag
actgacccaacatcgtatgataatacacaagatgaaacagaatatagttttgctgacttt
cttccttatgtagctgttcgaaattattctgaggcaagtgatacacagcgttcaagagaa
ataatggtcaatcacaccaatgttagtattactgacggctgtggcacgtataatgatcct
tatataattgatactaatggtcagatagaagttattgcaaagattttggaacaaggcgaa
gttagtgatggttttactatcaatgttcctaatattactgctgtttcgggcaccaatttc
acttatgaaacttggcataccaacgatcacattctcttaacgttcaataacggcacctat
aaagcgagtactgcaacatataatcatactacggcacagcttgcaaagtatcttgctggt
gcatattataagatcaccaaggttgaaaaagagggtgaagatgatactgtaacttatgag
agtattacaataagcagcgcttcgtttaatggtcttggcggtacctctaatgagtatgct
tttcatggcgtaatagtaggagatactgatactgcaacatatcctcttgtcaataatacc
ggttctccgcttatcaaaacaagccatggtagtgttgtgaaagatttgaatattaatgtc
agaaatgagaatatctctagaacacaggaaaacaatactcagaaattcgtaattagtggt
ggctgctctaactacggagctgttatcggtcagattcttggtggagataatatcatagat
aatgttgctgtagattttacagattcaaccattaaagttgaaggttcatctgcaaatgtt
attccggtaggcggatatgttggtgttgtagccagcggtgccctgattttcagaggaatg
aacggtaaaaaccatgccggacttacaacaggcattgttaaggacggtacaacaagtata
gctatggatagcactgattggctttatgtcaacccaattattggacgagtccttaatggc
tatgcagtttatgaagcaggaaccaacagtagtagtaatgattataaatatagtgaaagt
aacgttactatgaaaaatggtacaaagaattattctattgctgatattgaccctgacatt
gacaaggttgaagtttcggcctatacgcaaaaaggaacaacaggatattacacgactaat
gtaaccattcctaatgctcagtcgctttatgtactttcgctattaatgcaaagcagaact
ataggtaatgataaatatggtactgcacttaaagtgttaaatagtgatagctatgattca
acagttaaacaggcaatgcatcatggaaaatatgacaaagtcggcacggctgataacagc
gattataattcctatgctaaatatgatactgttggtgtagacacggtaaatggcattaag
tatgctccttatattgttgaaagatatacaagtgcagtcggtgaaaagtattatgtatta
tctcttacaaacaataaaaccgtttgcaatatgactcttacaggaagcgacgctgactgg
tatttacctgatggatttaagggagttgggtacatcggttacgataaatccacatccgat
ggaattagtcttcataaattcaacggtaatgagaaaactattcatttgaatatgtccttg
aaccattactctgatagtacagataactactgtccaagtagtggtaatgtaggttttggt
ctctttagttcgattaagcataattcacaggcgcagggaggtgctgtaacagctgataat
cttgaaacagatgattacaaaattaagaaccttaatttaacaggtactattgactataat
gtagctgatgttacagaatatagttcttcaaatgtttataaggataaatacatagatgtt
ggtggatttgcaggttattgtggatacagtgaggcaaatgatttaagaatagaaggcata
gatctttcagggcttactatcaatgggtttaaaactgccggcggcttgttcggctatctg
aaaatggcagcaagtaatgtgtatttagccaaaatatcaaatataacagcttcaaatggc
actttgactgtcacttccaaagattatgttggaggtattgtgggacgatgtgaacaaatt
ggcttaactattgacagtttgactcttgataaccttagtattgtttcctacttttatgaa
acaggcactattacatataataatggagctggtggtattatcggttgggcagcaaatgct
tcaactaatcaaccaataacgctgagtaatataactgtaggtagtagtacagcaatatct
aatcttcgtataggataccctaataaagcaccatatactaatactaacaatgtcgataat
tattatcagattgctgtaggtggacttgttggcaggagcatgacaaataagaacagcagt
tatagttattcgatgataatagagcattgctatgtttacaatgttgatttttatggtcat
agagttgcggggattattggacatgatgcagctggttcaggtaagacagcatctggatcc
tatttgctgatgtcagatgtccatgttgtaagtagtaatagcgcatcgattaatggaatc
aaaaagttgtcaaacctaggtgatagaggttgtggcggattagttggtgttatgtggaac
gataagaataaagattttattgattgtagtgttgagggttatacgttacgttcttataat
gatactggtggaatttcatcaaatatgcaaactggaggaactgtaacaataaaaaatttc
aaagctacagatttgaatatctattctaattatcatggctcattatttggatatttaaaa
tgtactacaaatggatataacatactacttgataacattcagttcaataattatgttgat
gaggaaggggtagttcataagcatagtaatggatatatcgaaaaaaaatacggttatttg
gtcggtaataatggcggctgtgtaattaaacttgtaggtttaacaagacaacacttagaa
aatacagctcatgatcacctgaacagaattgttggagctaaaaactccgactcaaattac
aattatggttcaggcgggtatattatctttgctgacactcttggaaaaagcacaactaca
gcaactgctggaaccaagcaatctgatttgtcagataaaacaaatgtcacagcgaagtca
ccgtgggtaactgtaagcccaagtatcaacattagcggaacagaagcagatagcactcag
gtattgacaggcgacagtattatgtcaaattaccttgctgcggatactctgagcaattac
aatggtgttgatacagctggtattatttcctcacttgctgatgtaaattcaactgccaaa
acgaattacgcaggctttagagatgctcaactattctcaacctatgaggacgaaatgggt
gatggttctctgcctgaaggagtctcaaactttgctgtaattgcggttgataataacgga
ttaagagatgatttaaataccgcaataaatagttatgttcagatgcttacgcatacaaca
gatgtttattctcgaacaaataataatgggaatgtatataaggttcaaatttacagatgt
acttatgactcaactgagcaagtattcgtaaagactgccagcagtgatggattaactaga
gatactaatggtttttacccttctgttgaacaccctgatactgatgcagatacagcgtgc
tttactttggttgacattcagttcttgaacccgagcaattctaacgaagtcgcatatcat
gtatatgtaccggtactcataaagaaattattgaagtttaatttcaaggcttcttctttg
ccgggtacggtatatgattatactaactatgtttacaaaacttcatcacacacaacggag
gataaatggggaacaccaagtgttactaatctcggaacaccggtcaccatgtatttccgt
tatgattacacttcaaatgtaagtgagtggcaggagatgattaacaatggcgaaagtttg
atgtggcatactaacaacaagctgcaattaaagactgctgcaagtaatcttccgttcaat
acaagaatggttttggtcgatgcaaataataacgatagagcgtattttgctaaggcaagc
gacacgggagtttttactaaaaataccaactctgatcaaaatgattattttgttgatctt
accaagtttaaaaacggttctgattattttgcggcaaagaattttggagagaggctgcta
atttcagccagtacgacatcatcgtcagcagctactaaggcctatgtaatatcggctgct
ggtgaatcggtatatgtaactgcaacaattggaagtgaaacaactcgctccaactttaga
cccgcaacggacgctgaaatatcggatagttcaaaaaccaagtattacttaacagttgat
ggagtaacttctttacctccggctggattaacggaaagctattacattactttctttaca
gatacggcagatgatccgctaagagtaattataggtggttctgcgccttcgctttcctca
tctcctcagaattcggagattagcaaacatactttgaaatgcacaaatcaaactgaatct
gcattgattttaggaaatattttcaagcaagaatttacaaagtttgaaacggaaaatgct
caaagtggtttggtgaataacagctgtgattattttgaagctgacataactgtaaaaatc
tcagttaacaacgataatgatgaggctgaaacgataattaggtatttgaataatgattca
attgaagtgtaccatagtattctgttgggattaacgaagaatgatggtaccaccgttgaa
aacactatttatggaacacctacttatactgtaaatacggctaaagcagcgtcagggatt
tatggaactatatcttcaacattttccgatagtgctgttgatatatctggattcagtatt
ccgtcaccaaacaatacatctagttttattcaaattggtgatttggattataatattaag
ccgcttttagttgaaaaaatcggatcaacatatggaggtgcaataatatctgtcaatggt
ttacgagttcattttgactatctgaatattcctaaccaatttccctatcaacccagtact
gtggaaggacaaaacaccgtaggcacaactgtcaaagcatattcgaccttagattcagat
tatactaatatagcttacagcagtataagagaagaaatggctgattctaatgcagtaaag
tatcatagcgagaccccctcatcagcaacgcttgtttacgttgttgatactagtgatgat
atagatattgtaaagaattataatatgcttggcataaacccaatagatgaggctgaatat
ttcaataatattataactgctgacggaacatataatgcggtttcatttgttgattcagct
caagccggtaagattagatggactctttctttagaaaagaagaatgaatccggtgcttat
gaaactgtaaaaatgtctgattatgtttctggaaatgttactgttggtaatcgaacttct
ggcgctgtattttcggcttctggtaatacgtttatttatgatgaagattatacaacgcca
atggacattacaaaacttacaaccatttatgcaatgaaaaccggagatgatcttgaagct
cttgttgacggtgacgggaatcctgttactggtgtatatgcaaattacaaggtaacattg
tcagctacattatatacaggttcggaagcattgtctggagatttaagtagccgaaaaatc
gataattcaactgtttctgattacattaagtatacaaatgctaaggttaaatcaagttgg
gttaatcctagcaattag
DBGET
integrated database retrieval system