Rickettsia amblyommatis GAT-30V: MCE_01310
Help
Entry
MCE_01310 CDS
T01787
Name
(GenBank) cell surface antigen Sca2
Organism
ram
Rickettsia amblyommatis GAT-30V
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Drf_FH1
GntR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFC69273
UniProt:
H8K429
LinkDB
All DBs
Position
219166..224601
Genome browser
AA seq
1811 aa
AA seq
DB search
MNLQNARSKKYVLTFFMSTCLLTSNLLSTSARAASFKDLVSKTPAWEKHNSTQQQNIWED
LTPNEKIKKWQEADLVPSFTQAQDDLGIKYKETDLSSFLDDTRHKARQARAKILLYIERV
KQQDFDTKKQEYINQGVVPTAIEAATNLGISYDPSKIDNNVENDQKVRRAAKDKKAVIEL
YISSINRDIKYKHYVDNAIIPEMKEVRTALNMNKDDAESFVALIRAEIMENAKGRYIADS
HIPTEQELKNRFGISRDDNRNSYIKSIRLKVMDKKKPQYIADNIIPTAEELEQKFGADKG
EATNYITSIATQMMLGKKSYYIANNITPNSDELMNEFKIGKIKANSYIDQIRAGIAANQF
LNNNDTTKPSAGRSQEKSGSKNDSWYMSNQGTNNTGTSSGVVSTGKKKKQKYVFNPINTF
KTYFNHKENKGNLTQSQRHISRIIQQEENIEEFKNLIKTDPIAALNLEVDSSYKQEAVTT
ILSDFNDYTIQRVLFSNDTGQLDFNTNIDVKNRPILKELLENSSSEEKTKFAARIQDYAI
RNISNSQFEEKARLDLIKLAASKDKSSVENFLALQLELKNKMQPYIVKSIYILTPEVVKE
INIELKNKGLIIDSLTKDDMIKLAKAVNKQTLNSVIKVILSDSNILSNEANKILGLVVSN
NSNNLEQTQSGIPHPPPLPLNVGIPNPPPLPLNGSMPPPPPPLNSQGFSSNSNNFDLNKL
QAEYPRIHSLYIQFTRNTTTQPKVPLQPTTSSATNTDRSTPETAYAKLYAEYRTETGGKK
ADDLQDQLIKRQADLTNVIRQILTESYANQGADEKTLVNLFSISTPEIAEKAKEAFNTLV
QDPYIQDITVNGKKTTTSEEIIKNLFNEDTDDAVKRILLSSCKISEELKRPIKLEFNKSE
LIRALQSKQNPFEQLEFAYTNAKHFDQDIFGNRVEELINNPNILTIVQQATFLITEDTNL
RKTINSDQAQAKLDDLRTAILSTIKFEELITANLPQHAFIAIVKEKEPELLKEFLKATTI
KLAGNNNLDQLRLALPSFTGMSDEQVRILASKLNMPIILKALKECSQEKAKKHIHTGNMP
PPPPPLPGSQDSELAYLTSLGITQFNAHTSTFKTTPKIYNFSSDIAVRYKELALSRHKAA
GHKAQYSDTDLLQKAIMESVACEHSKNLSKAHQNNKYFAKIQEAVNTMRSSFIGPRTEMG
QKVHNIYKSKLLELTKDKEFIQYVEDHIILSQKLTEAFTSANSDFIGPRTAIGQKIHNIY
TQQLTKYPEEAVKEAFNTANSDFIGPRTEIGQEVHNIYKSKLSELVKDEELFQYVKQLLV
ESSELKQNYGSDIQSENSNNEKKIGRLDPKKLRLFQQENEATNDESSTNDESSTNDESST
NDDTQPEDSNKKSEQSDSKTALSPRLLSSNDSKNDKSSDDKKSLLALRSSNEDDKGYETD
EEELEVSNNSTTDEELKKDIVLESEDEAIDVSFKTEAITDQDEATQRQQVSDDTSRKVAI
LVKATSTLHKPVHYNILSDRLKVAAIGAGDEEASINRGVWISGLYGINKQGTWKKIPKYQ
SRTTGITIGTDAEFINSHDVIGIAYSRLESQIKYNKKLGKTAVNGHLLSIYGLKELIKGF
SLRAITSYGHNYIKNRSQSINNIIGKYQNNNLSFQTLLNYKYRTKYDLHFIPNIGFKYDY
SRASNYKEYNVDIENLMIQKKSNQLFESSLGGKIVFKPIVTTNNIVLTPSLYGNIEHHFN
NKNIKVNAQATFKGQTLQETIIIPEQPKLGYNIGSNILMSRKNINILLEYDYYTHRKYQS
HQGLIKLQVNL
NT seq
5436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttacaaaatgcccgctcaaaaaaatatgttttaacttttttcatgtcaacatgt
ttgttgactagtaaccttttaagtacaagtgctagagcggcaagctttaaagatttagtt
agtaaaaccccagcatgggaaaagcacaattcaacacagcaacaaaatatttgggaagat
ttgactccaaatgaaaaaatcaaaaaatggcaagaagcagatttagttcctagttttact
caagcacaagatgatctgggaataaagtataaggaaacagatttatcaagttttttagat
gatactagacataaagcaagacaagcaagagctaaaattttattatacatagaaagagta
aaacaacaggattttgatacaaaaaaacaagaatatattaatcaaggtgtagttcctaca
gctatagaagcagcaacaaatcttggaataagttatgaccctagcaaaatagacaataat
gtagaaaacgatcaaaaggtacgtcgtgcagcaaaagacaaaaaagcggtaatcgagcta
tatatcagctcaataaacagagatattaaatacaaacattatgttgataatgctattatt
cctgaaatgaaagaagtaaggactgctcttaacatgaataaagatgatgcagaatctttt
gttgctttaataagagctgaaattatggaaaacgcaaagggacgatatatagccgatagc
catattcctacagaacaagagttaaaaaataggtttggtatatctcgtgatgataataga
aacagctatattaagtcaataagacttaaagttatggacaaaaaaaagccacaatatata
gctgataatattattcctacagcagaagagctagagcagaaatttggtgctgataaaggt
gaggcaacaaactatatcacatcaatagcaactcagatgatgcttggtaaaaaatcgtac
tatatagctaataatattacccctaactctgacgaattaatgaatgaatttaagataggg
aagataaaagcaaattcttatatagaccaaataagagccggaatagcagcaaaccagttt
ctaaacaacaatgatactactaaaccgtctgccggacgctctcaagaaaagagcggaagc
aaaaacgacagttggtatatgtcaaatcaaggtacaaataatacaggaacatcttcaggg
gttgtctccacgggtaaaaaaaagaaacaaaaatatgtttttaatcctataaatactttt
aaaacttactttaatcataaagaaaataagggtaatttaacgcagtctcaacgccatata
agtagaataatacaacaagaagaaaatattgaagaatttaaaaatcttattaaaacagat
cctatagcagcattaaatcttgaagtagatagtagttataaacaagaagcagtaacgact
atcttaagtgattttaatgattatactattcaaagggtattatttagcaatgatacggga
caattagatttcaataccaatattgacgttaaaaatagacctattttaaaagaattatta
gaaaatagttcttctgaagaaaaaactaaatttgctgcaagaattcaagactatgcaata
cgaaatatatctaatagtcaatttgaagaaaaggcacgattagatcttatcaaactagca
gcaagtaaagataagagttcagtagaaaactttttagctctgcaattagagttaaaaaac
aaaatgcaaccttacattgtaaaaagcatctatattttaacaccagaagtagtaaaagaa
ataaatatagaactaaaaaataaagggctaataatagatagtttaactaaagacgatatg
attaaactagccaaagcagtaaataaacaaacattaaattcagtaattaaagtaatattg
tctgatagtaacatactcagcaatgaagccaataaaattttagggttagtagtaagtaat
aattcaaataatttagaacaaacacaaagcggcattccgcatccaccacctctaccgcta
aacgtgggtattccaaatccgcctcctttacctctaaatggaagcatgccacccccacca
cctcccttaaattctcaaggctttagtagcaactctaacaattttgatttaaataagtta
caagcagaatatcctcgcatacattcattatatattcagtttactcgcaatactactact
caaccaaaagtaccacttcaacccacaacttctagtgcaaccaacacagacagaagcacg
ccagagacagcttatgccaaactatatgcagaatatagaactgagacaggaggtaaaaaa
gctgatgatttacaagatcagcttataaaaagacaagctgatcttacaaatgttatacgt
caaatattaacagaatcatacgccaaccaaggagctgacgagaaaactcttgtaaattta
tttagcatttcaacccctgaaatcgcagaaaaagctaaagaagcttttaacacccttgtt
caagacccgtatatacaagatataaccgtaaatggtaagaaaacaacaacaagcgaagag
ataattaaaaatcttttcaatgaagacactgatgatgcagtaaaacgtattttattatcg
tcatgtaaaatatctgaagaattaaagagacctattaaacttgaattcaataaatcagaa
ttgattagagcgttacagagcaaacaaaatccgtttgaacaattagaatttgcctatact
aatgcaaaacacttcgatcaagatatatttggcaatagagtcgaagagttaattaacaac
cctaatatattaactatagtacaacaagctacttttttaataacagaagatacaaactta
agaaaaacaattaattctgatcaagcacaggctaaacttgatgatttaagaacagctatt
ttaagcacaataaaatttgaagaattaattacggcaaatttacctcaacatgcgtttatt
gctatagtaaaggaaaaagaacccgaattattaaaagagtttttaaaagctactactatc
aaactagcaggtaataataatttagatcaattaagattagctttgccttcatttacaggc
atgagcgatgaacaagtacgaattcttgctagtaaattaaatatgcctataatattaaaa
gctcttaaagagtgctcgcaagaaaaagctaaaaaacacatccataccggaaacatgcca
ccaccaccaccgccactgcctggttcacaagattcggaattagcttatctaacaagttta
gggattactcaattcaatgcacatacatctacttttaaaacaactccaaaaatttataac
tttagctccgatatagctgtaagatataaagaattggctttatcaagacataaagcagca
ggacataaagcacaatactctgataccgatttattgcaaaaagctataatggaatcagta
gcatgtgagcattcaaaaaatttatctaaagctcatcaaaataataagtattttgcaaaa
atccaagaagcagtcaacactatgcgctctagctttataggtcctagaactgaaatggga
caaaaagtacataatatttataaatctaaacttttggaattaacaaaagataaagaattt
attcaatatgttgaagatcatattatacttagccaaaaattaacggaggcgtttacttcc
gctaactctgattttataggtcctagaactgcaataggacaaaaaatacataatatttat
acacagcaattgacaaaatatccagaagaagcggtaaaagaggcatttaatactgctaac
tctgattttataggtcctagaactgaaatagggcaagaagtacataatatttataaatct
aaactttcagagttagtaaaagatgaagaattgtttcaatatgttaaacaattactagta
gagtctagtgaactaaaacaaaactatggtagtgatattcaatcagaaaatagtaacaat
gaaaagaaaataggacgtttagatccgaaaaaattacgattattccaacaagaaaacgaa
gctacaaatgatgaatcctcaacaaatgatgaatcctcaacaaatgatgaatcctcaaca
aatgatgatacacaacctgaagatagcaataaaaagtcagagcaatctgattcaaaaacc
gctttatcaccaagattattgagttctaacgatagcaaaaatgataaatcatcagatgac
aaaaaatcacttctagcattaagatctagtaatgaagacgataaagggtatgaaactgat
gaagaagaattagaagtaagcaataatagcaccactgacgaagaattaaaaaaagatata
gttttagaaagcgaagatgaagcgatcgatgtgtcattcaaaactgaagcaattacagac
caagatgaggcgacacagagacaacaggtatctgatgacactagtaggaaagtagcaata
ttagttaaggcgacttcaactcttcacaaacctgttcactataatattttaagtgataga
ttaaaggttgctgcaataggggccggtgatgaagaagctagtataaacagaggggtatgg
attagcggcttatacggcatcaacaaacaaggaacttggaagaagattccaaaatatcaa
agtcgtacaaccggcataactatcgggactgatgctgaattcatcaatagtcatgatgtt
ataggaatagcttatagccgtttggaatcccaaattaaatataataaaaaactagggaaa
acagcagttaacggtcatcttttaagcatttacggtctaaaagaactaattaaaggtttc
tcattgcgggctataacatcttacggtcataattatattaagaatagatctcaaagcatt
aataatataattggaaaatatcaaaacaataatttaagttttcaaactttattaaattat
aaatatcgtacaaaatacgatttacattttattcctaatatcggttttaaatatgattat
tcaagagcgagcaactataaagagtataatgtagatatagaaaatctcatgattcaaaag
aaatcaaatcaattatttgaaagtagccttggcggtaaaatagtgtttaagcctatagtg
accacaaacaatatagtattaacaccaagtttgtatggtaatattgaacatcacttcaat
aataaaaatataaaagttaatgcacaagcgacttttaaaggacaaacattacaagaaaca
attattataccagaacaacctaagcttggatataatatcggtagtaatatacttatgagt
agaaaaaatataaatattctacttgagtatgattattatacgcatagaaagtatcaaagc
catcaaggacttattaaactacaagtcaatttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system