Rhodamnia argentea (silver malletwood): 115743328
Help
Entry
115743328 CDS
T10595
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
rarg Rhodamnia argentea (silver malletwood)
Pathway
rarg03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rarg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
115743328
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
rarg03019
]
115743328
Messenger RNA biogenesis [BR:
rarg03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
115743328
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115743328
NCBI-ProteinID:
XP_030533919
UniProt:
A0A8B8PGV1
LinkDB
All DBs
Position
1:2608760..2614849
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETNEDRLKEYFGQYGDVMQAVVMRDKVTGRPRGFGFVVFADPAIL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTNARSGNQNPDRGSGAGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTDEGFRQYFEAYGHVNDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLGGKQV
EVKRALPKDANPSGGGRSMGGGGGGGYQGYGGSSGNSGTAYDGRMDSNRYIQPQNAGGSF
PPYGSSGYSAPGYGYGPASNGMGYGGYGSYAGSTGYGGPAGAAYGSMPTSGYGGGPQGGP
RSSWGSQPPTGYGAMGYGGAAPWGAAGAGGGSTGGGPGSAPAGHSPSGGAGYGNQGYGYG
GYGGSDVSYGNQGGYGAVGGRSGSTPNSGSGGEMQPSAGSYMGSGYGDAAYGNAGWRSDP
SQTSGNYGSQSNGPHGGQAAYGGGYGGGQTRQAQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaagctgttcatcggggggatttcgtgggagaccaacgaggat
aggctcaaggagtacttcggccagtacggcgacgtcatgcaggccgtcgtcatgagggac
aaggtcaccggccggcctcgcgggttcgggttcgtggtcttcgcggatccggcgatactc
gatagggttttgcaggataagcacaccatcgacggaaggacggttgaggctaagagggct
ttgtcaagagaggagcagcaaactaatgcaagatctggaaaccaaaatcctgatagaggc
agtggagctggtggaaatataagaacaaagaagatctttgtgggaggtttgcctcctact
ttgactgacgagggctttcgtcagtattttgaggcttatggtcatgtaaatgatgtagta
atcatgtatgatcagaatactcaacgaccccgaggttttgggtttatatcttttgacaca
gaagaggctgtagatagggttttgcacaagacattccatgatttgggtgggaagcaagtg
gaagttaagcgggcacttccaaaagatgctaatcctagtggaggtggccgtagtatgggt
ggtggaggtggtggtggttaccaaggttatggtggttctagtggtaattcaggcactgca
tatgatggtcggatggattcgaataggtatattcagccacagaatgctggaggtagtttc
ccgccatatggttcttctggatacagcgcacctggctacggctatggtcctgccagtaac
ggcatgggttatggcggctatggaagttatgctggaagcactggatatggtggtcctgct
ggtgcagcttatggtagcatgcccacttctggttacggaggtggtccacagggtgggcct
agaagctcatggggctctcaacctcccacaggatatggagctatggggtatggtggtgct
gctccatggggtgctgcaggggctggtggtggttcaactggcggtggtcctggttcagca
cctgctggtcattcccctagtggtggagcaggatatggcaatcaaggttatgggtatggt
ggttatggtggaagtgatgtatcttatggaaatcagggtgggtatggtgctgttggaggg
cgctctggaagtactccaaacagtggttctggtggagaaatgcagccaagcgctggtagc
tacatgggaagtggttatggtgatgcagcttatggaaatgcaggatggagatcggaccca
tcacaaacttctggaaattatggttctcagtcaaatggtcctcatggtgggcaggctgct
tatggtggtggttatggtggtggacagacccgccaagctcagcagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
