Rickettsia asembonensis: PG979_000504
Help
Entry
PG979_000504 CDS
T09987
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rase
Rickettsia asembonensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCR56447
LinkDB
All DBs
Position
420252..425402
Genome browser
AA seq
1716 aa
AA seq
DB search
MANISPKLFQKAIQQGLKTALFTTSTAALMLSSSGALGGTTIDANTNFTVGAGLNPAVPF
GGGVLQYGNDAVTVDADAAVNISTIDVHGFAPGLFTVNENISLGSVELGGGTAFPVSISD
TFTLTLIGEDGVGFGADIYAGLGAITLNGATAGLTINSGTQDLITLGGTIDGGAAGQGVL
RVSTDTTFTAAVGATKSLASITVDAGVTVNAITLAATNIVVNGGEVVATGAVNGAINLAA
GGTLFNAGGLVTGTAVFNDNGKLTLGNGISADITAAGDGINGTVVVGNGNIQNVEANGNS
LVLVQFNNTAASTAGNIFATNVKVNSATANVVTGTVNGAINFAAAGKLKANGLVTGAVEF
DADGTLTLGNGIAGNITTTVDDQGTLIITGGNNVGNIGVIGNEGLKLVTFNNGNNNGGNG
IAAGNIVATTITIGEDNGNNASIVTANQIEGAIEFANAGNLKAAGLVTGIALFNADGTLT
LGNGITGAITATGDGANGTVIVTAGNVQNIGANGNSIKQLTFNNAVASNAGNIFAVGVAI
NNANANVTAGTVNGAINFADDGALTANNGITGAVTAAGGNGTLTTAGVGVTGAIGTNAAS
LKVLNAKVNNGAADLVFGSDIYAQTVNFDDIAGGGAVGTIQVGGNLVATNVNFSADANGG
TLEFNGPGGNTYNLSGIIANGATGILNINAGGTVVANDASIGTVAQIDIQDNKSFAINAK
NADVDILNAQAINFKGANSKLFLLNDSTTDNRVITLKNDLPAFATGGGTLLLAGTTKLVT
LQGDGGAKTIGTAGSELASLNVLGSVAFNNIDTTNVLAFNILGTTNFVDVGGITNQINVI
NIGAAGVGPTGAAIAAAVGSYTIDANGGNVGILANGQTINFAHEDAELVLQNSAAGNGTI
TLNAVLDPLTPSKGKLAVDSGAAGGKVIIASVGNATYGTAVNKLKELEFRGNGTFQIDTE
IFVNDLELLVPTITYNKDINSNLSFSAATALTQNGNINGNVDFNNQAAVITLGANKNITG
SVTSSNGVNGTIIATGASTINGPITNIAMLKVGAGAVSITKGGNTSITEIQGNGTALLTL
PANFNLTGSINKTGGQALKLNFTNGGSVSGVVGTAANSVGDITTAGTTNFASSVNAKGAA
TLGGTTSFADTFTNTGAVTLAKASITNFAKNVTATSFTVNNATINFGNSLAFNSNITGSG
TTLTLGTNQVTYTGTGSFTDTLTLNTTFDGAAKSGGNILIKSGSTLDLSGVPTLALVVTA
TNFDINNISPDTKYTVISAEAAGGLKPTPEENVKITINNDNRFVGFTFDASTLTLFAEDI
AEDVIDEDFEPGGPLANIPNAANIEKSLKLMAAAQNGSDARQALDNFGLMMPQQEADAVN
LMQDVVKPSDTIAAINNQVILSNISSSLINLNARMDAIQPAAVAAGDEDRDAKFGAWISP
FVGNATQKMRNNISGYKSDTTGGTIGFDGLVNDDLALGIAYTRADTDIKLKNNKTGDKNK
VESNIYSVYGLYNIPYENLFVEAIASYSDNRIKSKSRRVIATALETVGYQTASGKYKSES
YIGQLMAGYTYMMPENINLTPLAGFRYSAIKDKGYKETGTTNQNLTVKGKNYNSFAGLLG
AKVSSNINVAEVVLTPELYAMVDYAFKNKVPAIDARLQGMTAPFPTNSFKQSKTSFYVGV
GVTAKHKMMEYGINYDTNIGSKYFAQQGSVKVRVNF
NT seq
5151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaatatttctccaaaattatttcaaaaagcaatacaacaaggtcttaagaccgct
ttattcaccacctcaaccgcagcattaatgctgagtagtagcggggcgttgggaggaaca
acgatagatgcaaatacaaactttaccgtaggagcgggccttaatcctgcagtaccgttt
ggtggtggtgttttacagtatggaaatgatgctgttacggttgacgctgatgcagcagta
aatatttcgacaatagatgtacatggttttgctcctggtttatttacggtaaatgaaaat
atttctttaggttctgttgaactcggtggtggtacggcatttcctgttagcattagtgat
acctttacattaactctaatcggtgaagatggagtaggatttggtgctgatatttatgca
ggtttaggagctattaccttaaatggtgccactgcaggtttaactataaattccggaacc
caagacttgataacgcttggtgggactatagacggtggagctgccggtcagggtgtatta
agagttagcacagataccacttttactgctgcggtaggtgcaactaagagcttagcttca
ataactgttgatgctggcgtaaccgtaaatgctattacgcttgcagcaacaaatattgtt
gtgaatggtggtgaagttgttgcaacaggtgcagtaaatggagctataaatttagctgca
ggtggaacattatttaacgcaggcggtttagtcacgggtactgcagtatttaatgataac
ggtaaattaacattaggaaatggaatatcagcagacataacggctgccggtgatggtatt
aacggtactgtagtagttgggaatggcaatatacagaatgtagaagcaaatggcaattcc
ttagtgctggtacaatttaataacactgcggcaagtactgctggtaatatatttgcaacc
aatgtaaaggttaatagtgccacagcaaatgtagtaacaggtacagttaatggagcgatt
aattttgcagctgccggtaaattaaaggcaaacggtttagttacaggtgcagtagaattt
gatgctgatggtacattaactttaggaaatggaatagcggggaatataacaacaactgta
gatgatcaaggtacacttattattacaggcggtaataatgtaggaaatataggtgttata
ggtaatgaagggctaaaattagtaacttttaataacggtaacaataatggcggtaatgga
atagcggctggtaatatagttgcaacaacaataacaataggagaagataacggaaataac
gcatctatagtaactgctaaccaaatagaaggagcaatagaatttgcaaatgccggtaat
ctaaaagcagccggtttagttaccggtatagcactatttaatgctgacgggacattaact
ttaggtaacggtattaccggggctataacagcaaccggtgacggtgctaacggtacggtt
attgtaacagcaggtaatgtacagaatatcggtgctaatggtaactcaataaagcaatta
acatttaataacgcagttgcaagcaatgcaggtaacatatttgcagtcggtgtagcaatt
aataatgcaaatgcaaatgtaacagcaggaacagtaaatggagcaattaattttgcagat
gacggtgcgttaacggcaaataacggtataaccggagcagtaactgcagcagggggtaac
ggtacattaacaacagctggagtaggggttaccggagcgataggtacaaatgcagcatct
ctaaaagttcttaatgctaaagttaataatggtgctgcggaccttgtgtttggtagtgat
atttatgcacaaaccgtaaattttgacgatattgccggcggtggagcagtaggtacgata
caagtcggcggtaatttagtagctacaaatgtaaacttcagtgctgatgcaaatggtggt
acgttagagtttaacggtcccggcggtaacacttataacttaagcggaattatagcaaat
ggtgctactggtatacttaatattaatgccggtggtacagtggttgcaaatgatgctagt
ataggcacagttgcacaaattgacattcaagataataagtcttttgcaataaatgctaag
aacgctgatgttgatatattaaacgctcaagcgattaattttaaaggagcaaactcaaag
cttttcttacttaacgatagtactacagataatagagttataactcttaaaaatgattta
ccggcgtttgcaaccggtggcggtacgttacttcttgctggtacaacaaaacttgtaacc
ttacaaggtgacggtggagctaaaacaataggtacggcaggaagtgaattagcatcatta
aatgttttaggtagtgtagcctttaataatatagatactacgaatgttctcgcatttaat
atcttaggtactacaaattttgttgatgtaggcggtattactaaccaaattaatgtaata
aatatcggtgctgcaggtgtagggcctacaggtgcagcgattgctgccgctgtcggttct
tatacgattgatgcaaatggtggtaatgtaggaattttagccaacggtcagactattaat
tttgctcatgaagatgcagagttagtattacaaaatagtgcagccggtaacggtacgata
acactaaatgccgtgcttgatcctcttactccaagtaaaggtaagcttgctgtagattca
ggagctgcgggcgggaaagtaattattgcaagtgtcggaaatgctacttatggtactgca
gtaaataaattaaaagaattagaatttagaggaaacggaacattccaaatagatactgag
atatttgttaacgatttagaattattagtgccgacaattacctataataaggatatcaac
tctaatttatcattcagtgctgctactgctttaactcaaaacggtaatattaacggtaat
gtagatttcaataatcaagcagcagttataacacttggtgcaaataaaaatatcaccggt
agcgttacaagcagcaatggagttaacggtacaatcattgcaaccggtgcaagtactatt
aatggacctattactaatattgctatgttgaaagtaggtgccggggctgtaagcataacc
aaaggcggtaatactagtattactgaaatccaaggtaacggtactgcactcttaacatta
cctgcaaactttaacttaacaggcagcataaataaaactggcggtcaggctctgaagtta
aacttcacgaatggcggtagtgttagcggtgttgtagggactgctgctaattcggttggt
gatatcacaacggcaggcacaacaaactttgcaagcagtgttaatgcaaaaggtgcggcg
acgctcggcggtactacaagttttgccgatacatttactaacaccggtgcagttacttta
gctaaagcttctatcactaattttgctaaaaatgtaacggctaccagctttacagttaac
aatgctactattaatttcggtaatagcctagcctttaatagtaatataacaggtagcggt
actacacttactttaggtacaaatcaagtaacatataccggtaccggtagctttaccgat
acgctaaccttaaataccacttttgacggagcagctaagtcaggcggtaatatcctaatt
aaatcaggtagtactcttgatttatcaggggttccaactttagcacttgttgttactgct
actaatttcgacattaataatataagtccggatacaaaatatacggtaatatctgcagaa
gcggcaggtggattaaagcctactcccgaagagaatgttaaaataactattaacaatgat
aaccgttttgtcgggtttacttttgatgcatcaactttgacgttatttgctgaagatata
gcggaagatgttatagatgaagattttgaaccgggcggaccgcttgcaaatattccaaat
gctgcaaatatagagaaatcacttaaattaatggcagcagcacaaaacggttcagatgca
cgtcaagcattggataactttggtttgatgatgccccaacaagaagcagatgctgtaaac
ctcatgcaagacgttgtaaagcctagcgatactatagctgctattaataatcaagttata
ctaagtaatatctcaagtagcttaattaatctaaatgctagaatggatgcaatacagccg
gctgccgtagctgccggtgatgaggacagagatgctaagtttggtgcatggataagtccg
tttgtcggtaatgcaacgcagaagatgcgtaacaatataagcggttataagtccgataca
accggtggcactataggttttgacggtttagttaacgatgatttagcactcgggattgca
tatacaagagccgataccgatattaagttgaaaaataataagacgggcgataagaataag
gtagagagtaacatctattccgtatacggtttatataatataccttatgaaaatctcttc
gttgaagctatagcatcttactcggataataggataaaaagcaaatcaagacgtgttatt
gcaacggcactagagactgtcggctatcaaaccgcaagcggtaagtataaatctgaaagc
tatataggtcagttaatggctggttatacctatatgatgcctgagaacattaacttaaca
ccgcttgcagggtttagatattcggctatcaaagataagggttataaagaaaccggtact
actaaccaaaaccttacagttaaaggcaaaaactataatagcttcgctggtttacttggt
gctaaagtatcaagtaacatcaatgtagctgaggtagtgctaacacctgagctttacgca
atggttgattatgcattcaagaataaagttccggcgattgatgcaagattacaaggtatg
actgctcctttcccaaccaacagctttaagcaaagcaaaacaagcttttatgtcggcgtc
ggtgttactgctaagcacaaaatgatggaatacggtattaactatgatacaaatatcgga
agtaagtattttgctcagcaaggtagtgtaaaagttcgtgtaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
