Riemerella anatipestifer CH3: M949_0304
Help
Entry
M949_0304 CDS
T03250
Name
(GenBank) tonb-dependent receptor plug
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
rat
Riemerella anatipestifer CH3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rat00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rat02000
]
M949_0304
Transporters [BR:
rat02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
M949_0304
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIH01475
LinkDB
All DBs
Position
complement(302919..305642)
Genome browser
AA seq
907 aa
AA seq
DB search
MKNYSVLKVAPAFLLAGAMLQAQKVDSAKTKSIDEVVLIGYGKKKKSDLTGSVTSISSKD
FNDGMLSSPEQLIQGKAAGVQITTNGGAPGSGSTIRVRSGASLNASNDPLIVIDGMPLDT
KGIDGAANPLALINPNDIESFNILKDASAAAIYGNRASNGVIIITTKKGTRGKLRVGYNS
TTSVSQRFGTVNMMDANEFRTLVKDKASADYISKLGNANTNWQEAFYQLATGFDNNLTLS
GGIGKVPFRLSLGYLNQDGIIRTNNIERSTAGLNLNPKLFNNHLDINFNLKGTYVENRFT
DGEAINAAIAFDPTQNIYDASNQAMGGYWEWMDNGIPNQNATRNPLSMLYQRRDVSYVKR
LLGNVQFDYKFHFLPELRANLNLGLDLSNSNGTVTTLPTLASSYFQKGTNRNYEQEKKNR
LLEFYLNYSKKLPSIDSDIDVMAGYSYQKWNETKPFAPTIYGDGTKDPASGVDFFTQNLL
LSYYTRLNYTFKNRYLLTASVRRDGSSRFNSNNRWGYFPSVSLAWRIDQENFLKGNTTIS
TFKLRGGWGVTGQQDISGDYPYLAVYSISNSGANYLFGGVPYTLYRPEGYDPNIRWETTR
TTNIGLDFGVLKDRLLFNVDAYKRYTVDLLSEAPTPGGANFTNLLLSNIGNMESKGLEIG
ALWKAIQNENFSWDISANATFQDAKITNLAANEGAGQRVLVGGISGITGGLIQTHSVGYK
PNSFYVYQQKYDASGRPIEGDYVDRNGDGIINEQDLYEYQSSMPKALFAFTSRMTYKNWD
MGFALRASLGNYVYNNANARYGNLQNIGTNGYLQNLTRDYLNTGFTTSQYFSDYYVEDAS
FLRMDNINIGYNFPQFIGNARLRVNASVNNVFVITKYSGVDPEVFNGIDNNFYQRPRVYS
LGFNLQF
NT seq
2724 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactattcagtactaaaggttgcacccgcttttctgttggcaggggcaatgcta
caagcacaaaaggtagattctgccaaaaccaaaagtatagatgaggtagtgcttataggt
tacggaaagaagaaaaaatcagatcttacagggtccgtaacatctatttcttctaaagat
tttaatgatggtatgttatcttctccagaacagcttattcaaggtaaagcggcaggtgta
cagattacaactaatggcggtgctcctggtagtggctctacaattagagtaagaagtgga
gcgtctcttaatgcatctaatgacccacttatcgttatagacggaatgccattagatacc
aaaggtattgatggagcggctaatccactagcccttattaaccctaatgatatagagtct
tttaacattcttaaagacgcttctgcagcagctatctatggtaatagagcttctaatggg
gttatcatcattaccactaagaaaggaactagaggaaaacttagagtaggctataattcc
acaacatctgtttctcaaagatttggaacggtgaatatgatggatgctaacgaattcaga
actttagtaaaggataaagcatcggcggattatatttctaaattaggtaatgcaaatacc
aactggcaagaagctttttatcaattagcgacaggctttgataataatttaacgttatct
ggagggattggtaaagtgccatttagactatctttaggataccttaaccaagatggtatt
attagaactaataatatagaaagaagcaccgcaggtttaaacttaaatccaaaattattt
aataatcatttggatattaattttaacttaaaagggacttatgtagaaaataggtttact
gatggagaggccatcaatgcggctattgcgtttgatccaacacaaaacatttatgatgct
tctaatcaggcgatgggcggttattgggaatggatggacaatggaatacctaaccaaaat
gcaacgagaaaccctctttctatgctctatcaaaggagagatgtttcttatgtaaaaaga
ctcttggggaatgttcagtttgactataaatttcatttcttaccagagctcagagctaac
ttaaatttaggtctagacctatctaactctaacggaacagttactactttacctacatta
gcatcatcatacttccaaaaaggaacgaacagaaactatgaacaggaaaagaaaaatagg
cttttagaattttatttaaattattccaaaaaactaccttctatagactctgatattgat
gtaatggcggggtattcttaccaaaaatggaatgaaactaaaccttttgcacctacaatc
tacggagatggaactaaagaccctgcgagtggtgtagatttctttacgcaaaacttatta
ctttcttactatactagattaaattatacatttaaaaatagatacttactaacggcttct
gtgcgtagagatggttcttctaggtttaatagtaataatagatggggctattttccatcc
gtatcattagcttggagaattgatcaagagaacttccttaaaggtaacactacaatctct
acttttaaactgagaggaggttggggggtaacaggtcaacaggatatttcaggcgattat
ccttatttggcagtatatagtatctctaactctggagctaattatctttttggaggtgta
ccttacactctttatcgtccagaaggctatgacccaaacattagatgggaaactacaaga
actaccaatataggattagactttggtgttttgaaagatagattactatttaatgtagat
gcttacaagagatatacagtagatttactaagtgaggctccaaccccaggaggtgctaac
tttaccaatttacttttatcaaacataggaaatatggaatctaaagggcttgaaattggt
gcattgtggaaggctattcaaaacgaaaatttctcttgggatatttctgctaatgcaaca
ttccaagatgctaaaattaccaatttagcagctaatgaaggagctggtcaaagagtgctt
gtaggtggtatatcaggcattacaggtggtttgatacaaacacattctgtaggttataaa
ccaaattctttctatgtttatcagcagaaatatgatgctagtggaagaccaatagaaggc
gattatgtagatagaaacggagatggcattataaacgagcaagatttgtatgaataccaa
tcgtctatgccaaaagccttgtttgcatttacatctagaatgacttataaaaattgggat
atgggatttgcacttagagcaagtttaggcaactatgtttataacaatgctaatgctaga
tacggaaatctacaaaacataggtaccaatggctatcttcaaaatcttacaagagactat
cttaatacaggatttacgacatctcaatatttttcagattattatgtagaagatgcttca
ttcctaagaatggataatatcaacataggttataatttccctcagtttataggaaatgca
agactgagagtgaatgcctctgtaaacaatgtttttgtgattaccaagtatagcggggta
gatccagaagttttcaatggtattgataacaatttctaccaaagacctcgtgtgtattca
ttaggtttcaaccttcagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system