Riemerella anatipestifer CH3: M949_1037 Help Entry M949_1037         CDS       T03250                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor, plug   KO K21573   TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC Organism rat  Riemerella anatipestifer CH3 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rat00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:rat02000]     M949_1037 Transporters [BR:rat02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    M949_1037 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AIH02206 LinkDB All DBs Position complement(1050212..1053124) Genome browser AA seq 970 aa AA seqDB search MNVKLRVLTAGAVFFIGAQSVVAQKTKKDSVKTREIEEVVMVGYGVQKKSEVTASISKIK GGEIADLNTPSFEAQLAGRAAGVQVTQNTGVLGSAPRVRIRGVNSISSGTSPLYVIDGVP MISGDTGGGYASSNALADINPNDIESMEVLKDGAAAAIYGSRAANGVILITTKKGKGGKF TFNYNNLLSIASPVKYFDLLKTNDFLAISAEKVRPYGLPGNYWAEGAEFDTDWQKAVTRS SLQQDHYLSFGGGLAKGKYFMSLGYTDQEGVILQNSMRRFTVRANVDQKLTDRVDVGGNF SVSKTDFAGINNGANTNSGVMNNALRQLPNTPVFDPSTPTGYNITNESGKSFIGRWTNNA NIANDLPNIVYVLNNNRMTSELTRILGNVYTNVKFTDWLTYRLQASVDNSITDGRLYYNK VHGDGFSREGVVEGNNLNLLRWNLQNIFTVDKSFNDHKVNLTLVHEEQYQKARYIFGGGT GLAADYFGKDGPVTNSYKVQSSGGSITENALTSYIARFNYNYARKYFLQASIRRDGLSQL PSETRWGTFPGLSVGWTVSNEKFMEALKPTLSDFKLKASYAKVGNTDIGNYPFRSLYGNA RYADNTGLALVQAGNPNLKWETSVKYDYGVELGFFRNRLTFTADYFINNQDGIILDRPTS PILGIPGNTISQNIGSSKNSGFEFSLNADVIRKDNFSWSIGSNVSFVNNEVTGLVSQGSD IFYNIDSGREQVGIIRVGESIRSIYGYKYWGVNKQNGNPVYYKTDGSLVQHNINDGKYYV FDLAKPSSLEKASTLTSADKQILGRTLPKYFGSFSTNIKWKNFDLSTLVRFSGGNKILNL TRRNLLSMDFYNNSTEILGRWQSLDNPGDGMTPRIVGSKGNIINMEGVATSRFVEDGSFI KIDNINFGYSLPKDLVNSFGMTNLRIFASVQNAFVFTKYSGMDPELEVNGVDYNNAPRQR TYSLGLNLSF NT seq 2913 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaatgtgaaattaagggtgcttaccgctggagctgttttctttataggagcccaaagt gtagtggcacaaaaaacaaaaaaagactctgttaaaactagagagatagaagaggttgta atggttggatatggagttcagaagaagagtgaggttacggcgtctatttctaaaattaaa ggaggggaaatcgctgatttaaatacgccttcctttgaagcacaattggctggtagagct gctggtgtacaggtaactcaaaatacaggcgtattaggatctgctccgcgtgtaaggatt agaggggttaattccatttcgtctggtacctctccgctttatgttatagatggtgttcct atgatatctggagatacaggcggaggatatgcttcttctaatgctttggcggatattaat ccaaatgatatagagtctatggaggtgttgaaagatggtgcagctgcagctatttatggt tcgcgtgccgcaaatggggttattttaattactacaaagaaaggaaaaggggggaagttt acgtttaactacaataatttgctcagtatagcttctccagttaaatattttgatttgttg aagacaaatgacttcttggctatttctgctgaaaaagtaagaccttatggtttaccaggt aattattgggcagaaggagccgagtttgatacggattggcagaaagctgttacaagatcc tctttacaacaggatcattatctttcttttggtggaggtttagctaagggtaaatatttt atgtctttaggatacacggatcaagagggtgttattttacaaaattctatgagaagattt acggtaagagctaatgttgatcaaaaattaactgatagagtggatgtaggggggaatttt tcggtatcaaagacagattttgctggtataaataatggagcaaatacgaattctggtgtt atgaataacgctcttagacagttgcctaatactccagtttttgatcctagtacacctaca ggctataatataactaatgaaagtggaaaaagctttattggaagatggactaataatgct aatatagcaaacgatttgccaaatatagtttatgttctcaataacaatagaatgacctct gagttgactcgtatattgggtaatgtttatacaaatgttaaatttacagattggttaact tataggcttcaggctagtgtagataactctatcactgatggtagattatactacaataaa gttcatggtgatggtttctctagggaaggtgttgttgagggtaataatttgaatttgtta agatggaatttacaaaacatttttacagttgataagagcttcaatgaccataaggtgaat ttaacattagttcatgaagagcaatatcagaaagctcgttatatatttggtggaggaact ggattagctgcggattattttggtaaagatggaccagtaactaactcttacaaagttcag tcatcaggaggaagtattacagaaaatgctctcacatcctatatagctagattcaattat aattatgcaaggaagtattttttacaagcttctattagacgagatggattatctcagttg ccatcagagacgagatgggggacttttccaggtttatcagttggatggacggtatctaat gaaaagttcatggaagctctaaagcctaccttgtctgacttcaaattgaaagcatcttat gctaaagtgggtaatacagatataggtaactatccgtttaggtctctttatgggaatgca agatatgcagataatacaggtttagcacttgtacaagcaggaaatcctaatttgaaatgg gagacaagtgtgaaatatgactatggagtagagttaggtttctttagaaatagattaact tttacagcagattatttcataaataaccaagatggtattattttggatagaccgacttca cctattttgggtattccaggtaatacaataagtcaaaacataggaagttctaaaaactca gggtttgaattttcattaaatgctgatgttattaggaaggataatttttcttggagtata ggttccaatgtttcatttgttaataatgaggttacaggacttgtgtcacaaggtagtgat attttctataatatagattctggtagagagcaggtagggattataagagttggtgagtct ataagatcaatttatggatataagtattggggagtaaataagcaaaatggaaatcctgtg tattataagaccgatggtagcttggttcagcataacataaatgatgggaagtactatgtg tttgatttggctaaaccatcttcattggaaaaagcttcaaccttgacgagtgcagataag caaatattagggagaactcttccaaagtattttggctcttttagtacaaatatcaaatgg aagaattttgatttatccactttagttagatttagtggaggaaataagattcttaacctt actagaagaaatttattaagtatggacttttataacaactctacagagatattaggtaga tggcagagtttagataatcctggtgatgggatgactcctagaatagtaggatctaagggt aatattatcaatatggagggggtagctacctctaggtttgtggaagatggtagcttcatt aaaattgataatataaattttggttattcattgcctaaggatttagtaaattcatttgga atgactaatctaagaatatttgctagtgttcagaatgcatttgttttcactaagtattct ggaatggatccagagctagaagtgaacggagtagattataataatgctcctaggcaaaga acatactcattagggttaaatttatcattttaa

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