KEGG   Rickettsia australis: MC5_07150
Entry
MC5_07150         CDS       T01783                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
rau  Rickettsia australis
Pathway
rau03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rau00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    MC5_07150
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:rau03021]
    MC5_07150
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:rau03400]
    MC5_07150
Enzymes [BR:rau01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     MC5_07150
Transcription machinery [BR:rau03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     MC5_07150
DNA repair and recombination proteins [BR:rau03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      MC5_07150
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 RPOC_hybrid Biotin_lipoyl_2 Peptidase_M23 RnfC_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFC71660
UniProt: H8K8R7
LinkDB
Position
complement(1262279..1266397)
AA seq 1372 aa
MSVVNFYGQLSNTQQFDQIRINIASPDQVRSWSFGEVTKPETINYRTFKPEKDGLFCARI
FGPVKDYECLCGKYKRMKNRGITCEKCGVEVTVSRVRRERMGHIELAAPVAHIWFLKSLP
SRISTLLDMTMRDVEKILYFENYVVVDPGLSILQKGELLTEEELQKAKDKYGEDAFTASI
GAEVIQQMLKELDFSKLKQELYEELQTTSSEVKKKKLVKRLKLVEDFLESENKPEWMIMD
VLPVIPPEIRPLVMLDGGRFATSDLNELYRRVINRNNRLKKLIESKAPDIIVRNEKRMLQ
EAVDALFDNGRRGRAAKNANKRPFKSLSDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPE
LKLHQCGLPKKMALELFKPFIYSKLELYGIATTIKAAKRMVEAEKPEVWDVLEEVIREHP
VLLNRAPTLHRLGIQAFEPLLIEGKAIQLHPLVCAAFNADFDGDQMAVHIPLSIEAQLEA
RVFMMSTNNILSPANGRPIIVPDKDIVLGLYYLTLAFDNEVGEGMMFSDLAEMEHALYNK
FITIHAKIKYRRNQLNAEGKMVPVIIDTTYGRLMVGELLPSNPNIEFKFINKQLTKKDIS
LVIDLVYRHCGQKATVIFADQLMKLGFKYACSSGISFGMDDMVVPKSKSTHINETQLEIK
EFEQQYSNGLITYGEKYNKVVDAWSRCTDRVANDMMKEIATPPVSDNPNHQKINAIYMMA
ISGARGSFQQIKQLGGMRGLMTKSNGQIIQTPIISNFKEGLTEFECFNSANGMRKGQIDT
ALKTASSGYLTRKLVDVAQDCIITEKDCGTDKGIEVKSVIEGGEVIVPLAEKILGRTAAI
DIFHPVTNALILNKSELINEAKLEQIESAGLDRIMIKSVLTCESTTGICSICYGRDLATG
TLVSEGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAATKGAEVSSVEASYGAKVKIINRNVV
INSEERKIVMSRNCELLLIDNNGNEKARHKIPYGARLLVDEGDMVIKTQKLAEWDPYTIP
IITEKSGKVLFKDMVDGISIRDVTDEATGIPSKVIIESKQYSRGAELRPRIQLLDAKGEV
ITLSNGLEARYYLPVGAVLSVEDGVQISVGDIIARIPKESTTTKDITGGLPRVAELVEAR
RPKDHAVIAEVDGRVEFGKDYKSKRRIIIHPIDETMSIEYMVPKGKHVVVNEGDFVKKGD
LLIDGNPVLQDILKVMGVEVLANYIVKEVQAVYRLQGVKIDDKHIEVIIRQMLQKVEITD
SGGTTLLAGEKIDRHEFEEINEKAIKNGLKPAEAQLILQGITKASLQTRSFISAASFQET
TRVLTEAAIAGKIDKLRGLKENVIVGRLVPAGTGYFMDKMRKAAVKLDEENV
NT seq 4119 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcgtagtaaatttttacggacaattaagtaatactcaacaatttgatcaaataagg
attaatatagcaagtcctgatcaggtacgttcgtggtctttcggtgaagtaacaaaacct
gaaacaattaactaccgaacttttaaacctgaaaaagatggtttattttgtgcaagaatt
tttggtccagtaaaagattacgaatgtctttgcggtaagtataagcggatgaaaaaccgt
ggtattacgtgtgagaaatgcggtgttgaagttacggtttctagagtaagacgtgaaaga
atggggcatattgaacttgctgctcccgttgctcatatttggtttttaaagtcactacct
tcaagaattagtacgcttcttgatatgacaatgcgagatgtagagaagattctttatttt
gaaaattatgtagtagttgatccagggttatctattttacaaaaaggcgaactcttaaca
gaggaagaattacagaaagcaaaagataagtacggtgaagatgcatttactgcctctata
ggtgcagaagtaatacaacaaatgcttaaagagcttgatttttcaaagttaaagcaagaa
ttatatgaggaattacaaactacttcttcagaagtcaaaaagaaaaaattagtaaagcgt
ttaaaattagtagaggattttttagagtcggaaaacaagccggaatggatgattatggat
gttttaccggttattcctcctgaaattagaccgcttgtgatgcttgacggcggaagattt
gctacttcggatttaaatgaactctatagaagagtaattaatagaaataatcgtttaaag
aaattaatagagtcaaaagctcctgatataatagtcagaaacgaaaaaagaatgttacaa
gaagcggtggatgcgttatttgataacggtcgtcgcggtagagcagcgaaaaatgctaat
aagcgtccatttaagtcattaagtgacatgcttaaaggtaagcagggtcgtttccgtcag
aacttacttggtaaaagggttgactattcaggacgttcggttatcgtggtcgggcctgag
cttaagctccatcagtgcggtttacctaaaaaaatggcattggagctatttaagccgttt
atttattctaagcttgagttgtacggtattgctacgactattaaagccgcaaaaagaatg
gtggaagctgaaaagcctgaagtttgggatgtgcttgaagaagtcataagagagcatccg
gttttacttaatagagctccgacattgcatagattaggtattcaagcatttgagccacta
ttaatcgaaggtaaagcgattcagcttcatccgcttgtttgtgctgcgtttaatgcagac
tttgacggtgatcagatggcggtacatattccgttatcgattgaagcacagcttgaagct
agggtatttatgatgtctacaaataatatcttaagccctgcaaacggacgtcccattatt
gtaccggataaagatatagtacttggtttatattatctaacccttgcatttgataatgaa
gtaggcgaagggatgatgttctcagatttagctgagatggaacatgctttatataataaa
tttataactattcatgcaaagataaaatatcgtagaaatcagctaaatgccgaaggtaaa
atggtccctgttattattgatactacttacggtaggttaatggttggtgaattattgcct
tctaatcctaatatagagttcaagtttattaataaacaactaactaaaaaagatatatca
ttagttatagatttagtttatcgccactgtggtcaaaaagctacagtaatttttgccgat
cagctaatgaaactaggttttaaatatgcttgttcttcaggtatttcttttggaatggac
gatatggtagtaccgaaatctaagagtactcatatcaatgaaactcagcttgaaataaaa
gaatttgaacaacaatattcaaacggtttaattacttatggagagaaatacaataaagta
gttgatgcttggtcaagatgtaccgatagagtagcaaacgacatgatgaaagagattgct
acgccgccggttagtgataatccgaatcatcaaaaaataaatgctatatatatgatggcg
atctccggagcaagaggttctttccagcaaattaagcagttaggcggtatgcgaggctta
atgaccaaatcaaacggtcaaattatacaaactcctattatctctaactttaaagaagga
ttaactgaatttgagtgttttaattctgctaacggaatgcgtaaagggcaaatagatacg
gctttaaaaacggcaagctcaggttacttaacaagaaaattagtagacgttgcacaagat
tgtattattaccgaaaaagattgtggcactgataaagggattgaagtgaagagtgttatt
gaagggggagaagttatagtacctttagctgaaaagattttaggtcgtactgctgctatc
gatatatttcatcctgtaactaatgctctaattctcaataaaagcgagcttattaatgaa
gcaaagttagagcagattgagtcggctggactcgacagaattatgataaaatccgtatta
acctgtgaaagtactaccggtatatgtagcatatgttacggtagggatcttgctaccggt
acgttggtgtcagagggtgaggcaatcggggttattgctgctcaatctatcggtgaacca
ggtacgcagcttacaatgagaactttccatatcggaggagcggcaacaaaaggtgctgaa
gtttcttccgtagaagcttcctatggcgcaaaagtaaaaattataaatcgtaacgttgtt
attaattcagaagaacgcaaaattgttatgagccgaaattgtgaattattattaattgat
aataatggtaatgaaaaggctcgtcataaaattccatacggtgctagattacttgttgat
gaaggtgatatggttattaaaactcaaaaactagcggagtgggatccttatactataccg
attatcacggagaaatcaggtaaagttttattcaaagatatggttgatggtatttctatt
cgtgatgtaactgacgaagctactggaataccgagtaaagttattattgaatcaaagcag
tattcacgcggtgcagaattacgtccgcgtatacagcttttagatgctaaaggtgaagtt
atcaccttatcaaatggtttagaagctagatattacttgccggttggagcagttttaagc
gtagaagacggagtacaaatatctgtaggtgatattattgcacgtataccaaaagaatca
accactactaaagatattaccggtggtttaccgagagttgccgagcttgtagaagcaaga
cgccctaaagatcacgcagttattgctgaggttgatggtagagtagaattcggtaaagac
tataaatctaagagacgtattattatacatcctattgatgaaacaatgtctattgagtat
atggtacctaaaggtaagcatgttgtagttaacgaaggtgactttgttaaaaaaggcgat
ttattgattgatggtaatccagtacttcaagatattttaaaagtaatgggtgtagaggtt
cttgcaaattatattgttaaagaggttcaagccgtttatcgtctacaaggtgtaaagatt
gatgataagcacatagaagttattattcgtcagatgttacaaaaagtagaaatcacggat
tcaggtggcactaccttattagcaggtgaaaaaatagatagacatgaattcgaggagata
aatgaaaaagctattaaaaacggtttaaaacctgctgaagcacaattaatattacaaggt
attactaaagcttctctgcaaactagatcgtttatctctgcggcatcattccaagagact
actagagttttaacggaagcagctattgcgggtaaaatagataagttacgaggattaaaa
gaaaacgtgatagttggacgattagtacctgctggaaccggttactttatggataaaatg
cgtaaagcagctgtgaagcttgatgaagaaaatgtataa

DBGET integrated database retrieval system