Rickettsiales bacterium Ac37b: NOVO_02780
Help
Entry
NOVO_02780 CDS
T03234
Symbol
addA
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase/nuclease subunit A
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
rbt
Rickettsiales bacterium Ac37b
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rbt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rbt03400
]
NOVO_02780 (addA)
Enzymes [BR:
rbt01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
NOVO_02780 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
rbt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
NOVO_02780 (addA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
UvrD_C_2
AAA_19
PDDEXK_1
AAA_30
Molybdopterin
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIL64947
LinkDB
All DBs
Position
complement(569831..573190)
Genome browser
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
MFEQQLKASDPYISTWVKASAGTGKTKILTDRVLRLLLTGNNPAKILCLTFTKAAATEMA
TRINKELSEWAIIEENKLISRLTHITGATPTSDMLYLARQLFLIILDSPDILKIQTIHAF
CQSLIQQFPIEAGLSIRHEVIEENKVKELLQEAKLSLLNDLEQTNNTKLHEAIKYMAWYL
HEKTFNELLTEIVNNQKAFQYLFDYYEDLDSLIENTYRVLGLETNITTYEALKSFYTSID
QAKLAEIIQVMLLGTKTDEKLGKQLLYWLNLNNEQKLVNFEIYKGFFCTKENQPRKALMT
QNLVKKYPEFDEYLQLELKKILDFVPYYSSIKVAHLTEHVLHISYALLERYKILKQYNNC
LDYDDLISITYELLESDTVNSWILYKLDGGVNHVLIDEAQDTSPKQWEIIQKLVTEFFVG
VNETDRTLFVVGDEKQSIFSFQGADPLHFSYMQNYFKEYIANNGFAFNVIKLPLSFRSTS
AILNVVDTIFNNPEILKHVTYSESFIEHKAYRKDSPGLVTLWPITTVSDPEKQEAWSLPL
YYKAEETVEAKLAEDIAFTIKNWLDNKRILQSKNRPITPGDILILVRRRKELSQLLISKL
KKYDIPVAGLDRIKLNDNLAIMDLIALGQFMIVPVDDYSLACVLKSPLIGLGEEELFQLA
SSRGKNSLWQQLENLSAKNLIFQNAFIYLKDLLSKLEYGPYEFFSYIIDTKLGRRKFLER
FGPEVLDPINSFLDILIEYEGYYIPSLQGFIEFFTKSDTEIKRDLEHGINQVRIMTVHSA
KGLQAPIVFLPDTTFTTTNKDLLLWTIGQNLVFLSTKISNSSYCYDLKNIRAEKDKAENL
RLLYVALTRAEDELIICGTQTKSNTKNKCWYDIIEEAVVKLGKIEEDGSWHVVSGYNEKI
YIDNDIINADTLDSLPKFLNDKIPLELPYSYIAPTTLYREEKNYGSLLDYSSVSLLKGKL
LHKLLQFLPKIGYTQREQFLKSFFIQNNYAPLSEIMKREIVNKSLALIDSPDLCSLFSAN
SRKELPLIGILNEKVIVTGQIDNLVTNKDEVIILDYKTTKYVPKNAQEIPVNYLRQLLLY
RNLLHGIYNDKKVSCAIIWTYTATIMYIDDQLLNSVNIT
NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgaacaacaattaaaagcatctgatccttatatttccacttgggtaaaagcttct
gccggtacaggtaaaactaaaatccttacagatagagtattaagattgttacttactggt
aataatccagccaaaatattatgccttacttttactaaagcagctgcaactgagatggcc
actcgtatcaataaagaattgagtgaatgggcaattattgaggaaaataagcttatctca
cgtctgacacatattacaggagcaacgccaacttcagatatgctatatctagcacgtcag
ttgtttttgataatactagattcaccagatatactaaaaatacagactatacatgctttt
tgtcaatcgttgatacaacaatttccgattgaggcgggtttatcgatacgtcatgaagta
attgaagagaataaagttaaagaattattgcaggaagcaaaattaagcttattaaatgat
ttagaacaaactaataataccaaattacatgaagctataaaatatatggcatggtattta
catgaaaagacgttcaatgaattattaactgaaattgtaaataatcaaaaggcttttcaa
tatttatttgattattatgaagatttagattcacttatagaaaatacttatagagtttta
ggactggaaacaaatattactacctatgaagccttaaaaagtttttatacttctattgat
caagcaaaattagctgaaataatacaagtaatgttactgggaaccaagactgatgagaag
ctaggaaagcaattattatattggttgaatttgaataatgaacaaaaattagttaatttc
gaaatatataaaggatttttttgtactaaagaaaatcagccaagaaaagcattaatgact
caaaatttggtaaaaaaatatcctgaatttgatgaatatttgcagctagaattaaagaaa
attttagattttgtaccatattacagctctattaaagtagcacatttaacagagcatgta
ctccatattagttatgcattattagaaagatataaaatattaaagcagtataataattgc
ctagattatgatgatttaatatctattacatatgagttgttagaatcagatacagttaac
tcgtggattttatataagctagatggaggagttaatcatgttttaatagatgaagcacag
gatactagtccaaagcaatgggaaataattcaaaagcttgtgacagagttttttgttggt
gtaaatgaaactgatagaactctatttgttgtgggagatgaaaaacaatctatttttagt
ttccaaggcgctgatcctttacatttttcatatatgcaaaattattttaaagaatatata
gctaataatggatttgcttttaatgttataaaactacctttatcttttcgttctacttct
gcaatattaaatgtagtagatacaatatttaataatccagaaatcttaaagcatgttaca
tatagtgaatcatttattgaacataaggcttataggaaagatagtcctggtttagtaact
ctgtggccaatcacaactgtttcagatcctgaaaagcaagaagcatggagtttgccttta
tactataaagctgaggagacggtagaagcaaaactcgcagaagacatagcttttactatt
aaaaattggttagataataagcgtattctgcaatctaaaaatagaccaataactccaggt
gatattttaatattagttagaagacgtaaggagttaagccaattactaattagcaaattg
aaaaaatatgatatccctgtagcagggttagatcggataaagcttaatgataatttggca
attatggatttaattgctttagggcaatttatgattgtaccggttgacgattattccttg
gcttgtgtgttaaaatcacccttaattggtttgggtgaagaagaattatttcaattagca
agttccaggggaaagaattctctatggcagcagttagaaaatttaagtgctaaaaattta
atttttcaaaatgcttttatatatctgaaagatttattatctaagttagaatatggtcct
tatgaattcttttcttatattatagatactaagcttgggcgtcgtaaatttttagaacgt
tttggcccagaagtattagatccaatcaattcatttcttgatatattaatagaatatgaa
ggatattatatcccatcattacaaggatttatagagttttttactaaaagcgatacggaa
attaagcgagatttagagcatgggataaatcaagttaggataatgacagtacattctgct
aaaggattacaagctcccatagtatttttacctgatacaacgtttaccactaccaataaa
gatttattactatggactattggtcagaatttggtatttctctctactaaaattagtaat
agtagttactgttatgatttaaaaaatattagggcagaaaaagataaggcagaaaaccta
agattactttatgtggcgcttactcgtgctgaagatgaattaataatatgtggtactcaa
actaaaagtaataccaaaaataaatgttggtatgacattatagaagaagcagttgttaaa
cttggcaaaatagaggaggatggaagttggcatgtagtttctggatataatgaaaaaata
tatatagataatgatattataaatgctgatactttagatagtttacctaaatttcttaat
gataaaatacctttagaactaccttacagctatattgcacctactactctctaccgagaa
gaaaaaaattatggttcattactagattattcttctgtttctttattaaaaggaaaatta
ttgcacaaattattacaattcttgccgaaaattggatatactcagagagaacagttttta
aaaagtttttttatacaaaataattatgctcctttgagtgagataatgaaacgtgaaata
gtcaataaaagtttagcacttatagactctccagatctctgctctttattttcagcaaat
tctaggaaagagttacctttaattggaattttaaatgaaaaagttatagtgactggccaa
attgataacttagttaccaataaggatgaagtaataattctggattataaaactaccaag
tatgttccaaagaatgctcaagaaattccagtgaattatttacgacaattactgctctat
agaaatctattacacggtatatataatgataaaaaggtaagttgtgcaataatatggact
tacacagccacgataatgtatattgatgaccagttattaaattcagttaatataacttag
DBGET
integrated database retrieval system