KEGG   Rickettsiales bacterium Ac37b: NOVO_02780
Entry
NOVO_02780        CDS       T03234                                 
Symbol
addA
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase/nuclease subunit A
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
rbt  Rickettsiales bacterium Ac37b
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rbt00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:rbt03400]
    NOVO_02780 (addA)
Enzymes [BR:rbt01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     NOVO_02780 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:rbt03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     NOVO_02780 (addA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C UvrD_C_2 AAA_19 PDDEXK_1 AAA_30 Molybdopterin DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIL64947
LinkDB
Position
complement(569831..573190)
AA seq 1119 aa
MFEQQLKASDPYISTWVKASAGTGKTKILTDRVLRLLLTGNNPAKILCLTFTKAAATEMA
TRINKELSEWAIIEENKLISRLTHITGATPTSDMLYLARQLFLIILDSPDILKIQTIHAF
CQSLIQQFPIEAGLSIRHEVIEENKVKELLQEAKLSLLNDLEQTNNTKLHEAIKYMAWYL
HEKTFNELLTEIVNNQKAFQYLFDYYEDLDSLIENTYRVLGLETNITTYEALKSFYTSID
QAKLAEIIQVMLLGTKTDEKLGKQLLYWLNLNNEQKLVNFEIYKGFFCTKENQPRKALMT
QNLVKKYPEFDEYLQLELKKILDFVPYYSSIKVAHLTEHVLHISYALLERYKILKQYNNC
LDYDDLISITYELLESDTVNSWILYKLDGGVNHVLIDEAQDTSPKQWEIIQKLVTEFFVG
VNETDRTLFVVGDEKQSIFSFQGADPLHFSYMQNYFKEYIANNGFAFNVIKLPLSFRSTS
AILNVVDTIFNNPEILKHVTYSESFIEHKAYRKDSPGLVTLWPITTVSDPEKQEAWSLPL
YYKAEETVEAKLAEDIAFTIKNWLDNKRILQSKNRPITPGDILILVRRRKELSQLLISKL
KKYDIPVAGLDRIKLNDNLAIMDLIALGQFMIVPVDDYSLACVLKSPLIGLGEEELFQLA
SSRGKNSLWQQLENLSAKNLIFQNAFIYLKDLLSKLEYGPYEFFSYIIDTKLGRRKFLER
FGPEVLDPINSFLDILIEYEGYYIPSLQGFIEFFTKSDTEIKRDLEHGINQVRIMTVHSA
KGLQAPIVFLPDTTFTTTNKDLLLWTIGQNLVFLSTKISNSSYCYDLKNIRAEKDKAENL
RLLYVALTRAEDELIICGTQTKSNTKNKCWYDIIEEAVVKLGKIEEDGSWHVVSGYNEKI
YIDNDIINADTLDSLPKFLNDKIPLELPYSYIAPTTLYREEKNYGSLLDYSSVSLLKGKL
LHKLLQFLPKIGYTQREQFLKSFFIQNNYAPLSEIMKREIVNKSLALIDSPDLCSLFSAN
SRKELPLIGILNEKVIVTGQIDNLVTNKDEVIILDYKTTKYVPKNAQEIPVNYLRQLLLY
RNLLHGIYNDKKVSCAIIWTYTATIMYIDDQLLNSVNIT
NT seq 3360 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttgaacaacaattaaaagcatctgatccttatatttccacttgggtaaaagcttct
gccggtacaggtaaaactaaaatccttacagatagagtattaagattgttacttactggt
aataatccagccaaaatattatgccttacttttactaaagcagctgcaactgagatggcc
actcgtatcaataaagaattgagtgaatgggcaattattgaggaaaataagcttatctca
cgtctgacacatattacaggagcaacgccaacttcagatatgctatatctagcacgtcag
ttgtttttgataatactagattcaccagatatactaaaaatacagactatacatgctttt
tgtcaatcgttgatacaacaatttccgattgaggcgggtttatcgatacgtcatgaagta
attgaagagaataaagttaaagaattattgcaggaagcaaaattaagcttattaaatgat
ttagaacaaactaataataccaaattacatgaagctataaaatatatggcatggtattta
catgaaaagacgttcaatgaattattaactgaaattgtaaataatcaaaaggcttttcaa
tatttatttgattattatgaagatttagattcacttatagaaaatacttatagagtttta
ggactggaaacaaatattactacctatgaagccttaaaaagtttttatacttctattgat
caagcaaaattagctgaaataatacaagtaatgttactgggaaccaagactgatgagaag
ctaggaaagcaattattatattggttgaatttgaataatgaacaaaaattagttaatttc
gaaatatataaaggatttttttgtactaaagaaaatcagccaagaaaagcattaatgact
caaaatttggtaaaaaaatatcctgaatttgatgaatatttgcagctagaattaaagaaa
attttagattttgtaccatattacagctctattaaagtagcacatttaacagagcatgta
ctccatattagttatgcattattagaaagatataaaatattaaagcagtataataattgc
ctagattatgatgatttaatatctattacatatgagttgttagaatcagatacagttaac
tcgtggattttatataagctagatggaggagttaatcatgttttaatagatgaagcacag
gatactagtccaaagcaatgggaaataattcaaaagcttgtgacagagttttttgttggt
gtaaatgaaactgatagaactctatttgttgtgggagatgaaaaacaatctatttttagt
ttccaaggcgctgatcctttacatttttcatatatgcaaaattattttaaagaatatata
gctaataatggatttgcttttaatgttataaaactacctttatcttttcgttctacttct
gcaatattaaatgtagtagatacaatatttaataatccagaaatcttaaagcatgttaca
tatagtgaatcatttattgaacataaggcttataggaaagatagtcctggtttagtaact
ctgtggccaatcacaactgtttcagatcctgaaaagcaagaagcatggagtttgccttta
tactataaagctgaggagacggtagaagcaaaactcgcagaagacatagcttttactatt
aaaaattggttagataataagcgtattctgcaatctaaaaatagaccaataactccaggt
gatattttaatattagttagaagacgtaaggagttaagccaattactaattagcaaattg
aaaaaatatgatatccctgtagcagggttagatcggataaagcttaatgataatttggca
attatggatttaattgctttagggcaatttatgattgtaccggttgacgattattccttg
gcttgtgtgttaaaatcacccttaattggtttgggtgaagaagaattatttcaattagca
agttccaggggaaagaattctctatggcagcagttagaaaatttaagtgctaaaaattta
atttttcaaaatgcttttatatatctgaaagatttattatctaagttagaatatggtcct
tatgaattcttttcttatattatagatactaagcttgggcgtcgtaaatttttagaacgt
tttggcccagaagtattagatccaatcaattcatttcttgatatattaatagaatatgaa
ggatattatatcccatcattacaaggatttatagagttttttactaaaagcgatacggaa
attaagcgagatttagagcatgggataaatcaagttaggataatgacagtacattctgct
aaaggattacaagctcccatagtatttttacctgatacaacgtttaccactaccaataaa
gatttattactatggactattggtcagaatttggtatttctctctactaaaattagtaat
agtagttactgttatgatttaaaaaatattagggcagaaaaagataaggcagaaaaccta
agattactttatgtggcgcttactcgtgctgaagatgaattaataatatgtggtactcaa
actaaaagtaataccaaaaataaatgttggtatgacattatagaagaagcagttgttaaa
cttggcaaaatagaggaggatggaagttggcatgtagtttctggatataatgaaaaaata
tatatagataatgatattataaatgctgatactttagatagtttacctaaatttcttaat
gataaaatacctttagaactaccttacagctatattgcacctactactctctaccgagaa
gaaaaaaattatggttcattactagattattcttctgtttctttattaaaaggaaaatta
ttgcacaaattattacaattcttgccgaaaattggatatactcagagagaacagttttta
aaaagtttttttatacaaaataattatgctcctttgagtgagataatgaaacgtgaaata
gtcaataaaagtttagcacttatagactctccagatctctgctctttattttcagcaaat
tctaggaaagagttacctttaattggaattttaaatgaaaaagttatagtgactggccaa
attgataacttagttaccaataaggatgaagtaataattctggattataaaactaccaag
tatgttccaaagaatgctcaagaaattccagtgaattatttacgacaattactgctctat
agaaatctattacacggtatatataatgataaaaaggtaagttgtgcaataatatggact
tacacagccacgataatgtatattgatgaccagttattaaattcagttaatataacttag

DBGET integrated database retrieval system