Riemerella columbina: NYR17_00740
Help
Entry
NYR17_00740 CDS
T09247
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rcl
Riemerella columbina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
SpvB
FG-GAP_3
FG-GAP
DUF6443
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKS95298
LinkDB
All DBs
Position
169341..176306
Genome browser
AA seq
2321 aa
AA seq
DB search
MKKNYFLLFIIFTQFLLGQTILNQPEVQGRTVQDPVAIILTPGFQAKGNKTFVAKIGEGS
TVPSSPSDSKAGADLPKGTVSHGPFGFHDTQGSIDVSPQGQLQYTLPIALPPGIKSVAPQ
VNLFYDSGSGNGIAGYGWSISGVTAINRVGKTIEKDGKLEGIKLNYDDVYSFNGQRLVLK
SGSYGKDGAEYTTEKYSNVKIKSIGAISGKAWQGPDYWEVTFEDGSQAWYGNAVNAKTPT
EYNIVKWQDAQGNYITYHYQQTYNVSRISMIEWGGNTILNQPHFNKILFTYQNRALKETS
YVMGERFLQDQLLSEVQVTTQGEQFKKYVINYNSEGSSQGYQRVENIIEYNSNNEPANPV
RFEYESLDLSGFKFSSFTDSNSNKLVGDFDGDGKLDFIKYFKSFKECKKESEPEWVCDER
DYDGCFYETHCLEEETYPEGLYLFRGALDDVKKERLSIGNSDFSEQDFNNTAIPVTVKDS
QGFINTSQGFALYKKIYNPEIDKFDLEIQVYQLGNNNQIIKAYSRIIPNEMYDRTEGSLY
PLPKDPSEESNFAIETIVMKLRELDINGDGNPKLVLSLKDKSCVALIKLPNPKYPPSEPE
EPEIECSEFYRYLIIDENNAYNLYSNSITDIFNSHKTGDFDGDGKIDLLTDSRYPTIVKI
ESEQDSNGAIVYSMNRSPFYSDGELEGLVKDSFTGDFNGDGKTDLLIPQGHNNRNWLLYI
SDGKKFRKQNLENFNSVYRPVSDNYSAKGRHYYYNRNYLIQDINQDGKDDFIEIGVHTRI
NRKPNNHYATFVINLYENIGSNQEGNILFSKKNIDSHQEMAFQPSLIMGRSEYSDYPFFY
TDENGKQYASIPNPAYKVGIKSFDVFYPLVGTHLINNQYHQLMMMIRGKMFKYTANSIKN
KSRISAIYQGGIATRVEYKELDPQANPHLYQPIKKEVYPLVELDRLSQSYVVAQLKQMIN
ENLVRKQDFLYRGALAHLHGKGMLGFRQIARSSWYTEVTENSKIWSGVEIDPHTESVPIK
EWTIKTNQETEVFPKDLSLTNTQLLSLKTTFYTTDLLVNGNKIAAITASNRDKIVKAIVP
TNIISKDYLKDTTTNSSISYDHYYLPIKTITKTMSGASVCGTSTTSLEYLPPNLSATGKD
YHIGRPRSKTDLMQAYGDTKGAKEEYIYENNLLKTLKTWNRDNLGWLQETYEYDGFGNLI
QKTVSNSTDAQTQTTKTEYDSKGRFVIKKIDHLGLITRITYNHWGQVLTQTDPLGNQLTN
TYDAWGKLLSAKTNLGGTITYTYEKLRNLDSKITEYHPDGGVVAKYSNTIGQNYLSSTKA
FGNQWIFTKIEYDDLGRKVKESEPYFEGQNPTQWNTIAYDDYSRPIKSVAFTGKIIETQY
TTNTVITTETNANNRFKKQTFDALGNIISSQDKGGTITFKYNAAGEQIEAKYGTNIVTTK
YDAWGRKIEFNDPSNGVYRYEYNGFGQPTKTISPKGTKTYAYNAKGQLIAQREISTDDSH
ATDKNINFIYNNQGLLIQKLGTSKGKTYRSVITYDAFGRVLSTSEENNGRYFMQKDIIYD
DKNRVTSYEKSLYSGGIYTKAQIENVYDTWSGELHQIKDKNSKKILWQLTEANARGQVQR
AQLGAVHIENTYDRNGFLSNINHSSAQKPSLLQIGYRFDAIKNELLSRITGGDFDISETF
KYDENNRLINWTNPRTGQLHHNVYDAQGRIIENDQLGKIIFGNHHKIYQPTALTLNTAGA
QNLKNNWVQEISYNENNDPVLIQGEKGDVFFEYGLTAMRQVVHFGGKITPEHKSRYTRYY
SEDGSYEVTTNNQTGKEKHILYIGGTPYESQIIYLKNENESIGSYKFLHKDYLGSILAIS
DEAGNKVEQRHYDAWGNLTHLKIANNATITDKNQINNYLASGNLVTDRGYTSHEHLAEVG
LIHMNGRLYDPLLRRFLNADENIQDAFNTQNYNKYSYVLNNPLMYNDPSGEFFAFLGLGV
LFWKAVFIGAAVGLASYTVGLAVTGNLHQWNIGSALKSMLWGAVGGAATFGIGSIFSSSA
GTLTSFASGLKNTLGGVGLAVVQAGTHAISQGVLGLMQGQDFLSSAVGGFAGSLGASGWS
SIIGSTGASMIAFGALSGGIGAELSDGNFWQGAVTGGIVSGLNHGLHKLGNEDNPRKPIK
TKRLVSKSQNHSLSKGSRGGQSVITPENPGNQVGNGKGMFAPTGSQSMVTSNLTYYDDGT
VDITMTTQVARMNTTGSYIANYNIIGPNGNIIDAGFLVNKAFGITRMDYNVYTVQGSAAV
LSTAKFSVPLNSTIKINVGLTYKIPAGGTGAIITTHIIKIR
NT seq
6966 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaactattttttattatttataattttcacacaatttcttttaggtcagact
atattaaatcagccagaagtacaagggcgtacggtgcaagatccggttgctattatttta
acacctggatttcaggcaaagggaaataaaacttttgtagctaaaataggagagggatct
actgtacctagtagtccttctgattcaaaggcaggagcagatcttcctaaaggaacggta
agtcatggaccatttggatttcatgacactcaaggaagtattgatgtttcaccacaaggt
cagctacaatatacgcttcctatagccttaccccctggaataaaatcagtagcccctcag
gttaatttattctatgatagtggcagtggcaatggtatagcagggtatggttggagtata
tcgggtgtaacagccataaatagagtaggaaaaacaatagagaaagatgggaaattagaa
ggtattaaacttaattatgatgatgtctatagttttaacggtcagagattagttttaaaa
tcaggctcttatggaaaggatggtgcagaatatacgacagagaaatattctaatgtaaaa
attaaatctataggagctatctcgggcaaggcatggcaaggtccagactattgggaagtg
acctttgaagatggctcacaagcgtggtatggaaatgcagtaaatgctaagacccctact
gagtataatatcgtaaagtggcaagatgctcaaggcaattatattacttatcactatcag
caaacttataatgtctctcgtatttctatgatagagtggggaggtaatactattttaaat
caaccgcatttcaataaaattttatttacatatcaaaatagagcgctaaaagaaacatct
tatgttatgggagagcgctttttacaggatcaattattatctgaagttcaagttactact
caaggagagcaatttaaaaaatatgtaatcaactataattcagagggtagtagccagggg
tatcagcgagtagaaaatattatagaatataactctaataatgagcctgctaatccagtg
agatttgagtatgaaagtttagatttgtcaggatttaaattttcaagttttacagatagc
aatagtaataaattggtaggagattttgatggagatggcaagttggattttataaagtat
tttaaatcatttaaagaatgtaaaaaagaatctgagccagagtgggtttgtgatgaaagg
gattatgatgggtgtttctatgaaacacattgtttagaagaagaaacataccctgagggg
ctatatctctttagaggcgcccttgatgatgttaaaaaagaacgcttaagtatcggtaat
tctgatttttcagagcaagattttaataacacagccatccctgttacagtaaaagatagc
caagggtttataaatacttcacagggctttgcactatataaaaaaatatataacccagag
atagacaagttcgatttagaaattcaagtatatcaattaggaaataataatcaaatcatc
aaagcgtattccagaattattcctaatgaaatgtatgatcgaacagaaggttcattatat
cccttacctaaagatccttcagaagaatctaattttgctattgagacaatagtaatgaaa
cttagagagttagatattaatggagatggtaaccctaaacttgtattatccttaaaggac
aaatcatgtgtagctttaataaaattaccaaatcccaaatatcctccttctgaacctgaa
gagccagagatagaatgttcggaattttatcggtatttgattatagatgaaaataatgca
tataatttatattccaattcaattacagatatttttaactctcataaaacaggagatttt
gatggagatggaaaaatagatttattaacagatagtagataccctacgatagtaaagata
gagagtgagcaagattcaaatggagctattgtttactcaatgaatcgtagtcctttttac
tctgatggagaattggaaggacttgtaaaagactctttcacaggagactttaatggagat
ggtaagacagatttactaatcccacaaggacataataatagaaattggttactttatata
tcagatggaaagaaatttagaaagcagaatttagaaaattttaattctgtttatcgtcct
gtatcagataattatagcgctaaaggtaggcattattactataatagaaattacttaatt
caagatattaatcaagatggaaaagatgattttatagagatcggtgttcatacccgtatc
aatagaaagccaaacaatcactatgctacttttgttattaatttatatgaaaatataggt
tctaatcaagagggtaatattcttttttcgaagaaaaatattgattcacatcaggaaatg
gcatttcagcctagtttgattatgggtcggtcagaatatagtgattatccatttttttat
actgatgaaaatggaaagcagtacgcaagcattcctaatcctgcatataaagtaggcata
aaatcatttgatgtattttatccattggttggaacccatttgattaataaccaatatcat
caactcatgatgatgattcgcggtaaaatgtttaaatatacagccaatagtattaaaaat
aaatcccgtatatcggctatttatcaagggggtatagctacgagggtagaatataaagaa
ttagacccacaagcaaatcctcatttatatcaaccgataaaaaaagaagtgtatcctttg
gtggagctagatcgtctttcgcagtcttatgtcgttgctcagcttaaacaaatgatcaac
gaaaaccttgtaagaaaacaagacttcttatatagaggggcattagcacatcttcatggt
aagggaatgttaggctttagacaaatcgctcgttcttcatggtatacagaagttaccgag
aatagcaaaatatggagtggcgtagaaatagatccccatacagaaagtgttcctataaag
gaatggaccataaaaaccaatcaagagacagaagtatttcctaaagatttatctctgact
aatacgcaattacttagtttaaaaacgacattctatactacagatttactagttaatggc
aataaaatagcagctataacagcatcgaatagagataaaatcgttaaagccatagtgcct
actaatatcatatctaaagattatctcaaagatacaacgaccaatagtagtatcagttat
gatcactattatttaccgattaagaccataaccaagaccatgagtggagcatcagtctgt
ggcacatctaccactagtttagagtatcttccacccaacctctcagctacaggtaaagac
taccatataggaagaccacgctctaagacagatctgatgcaagcctatggagatactaaa
ggagcaaaagaagaatatatttacgagaataatctcctcaaaactctcaaaacctggaat
agagataacttgggttggttacaggaaacttatgagtatgatggctttggcaaccttatt
caaaaaacagtgagtaatagtaccgatgcccaaacccaaaccactaaaacggaatacgat
tctaaaggtcgctttgttattaaaaagatagatcatttaggtttaatcactcgtataacc
tataaccattgggggcaagtccttacgcaaacagatccgttaggtaaccaattaaccaat
acctatgatgcttggggaaaactgctaagtgctaaaaccaatttaggaggtaccatcact
tacacttacgaaaaactaagaaatttagactctaaaattacggagtatcacccagatgga
ggtgtggttgctaaatacagcaatactataggacagaattacctttcttctaccaaagct
tttggaaatcaatggatatttacaaaaatagaatatgatgatttaggtagaaaggttaaa
gaatctgagccttattttgaaggtcaaaacccaactcaatggaatacaattgcatatgat
gattattcacgacctataaaatccgtcgcctttacaggtaaaataatagaaacccaatac
accacaaataccgtaattactacggaaaccaatgccaataatcgtttcaaaaaacaaacc
tttgatgcgttaggaaatatcatctcttctcaagataaaggaggaactattacattcaaa
tacaatgcagcgggagagcaaatagaagctaagtatggcaccaatatcgtcaccactaaa
tatgatgcttggggcagaaaaatagagtttaatgatccctctaatggagtttaccgctat
gaatacaatggttttggtcagcctacaaaaaccataagtcctaaaggaactaaaacttat
gcctataatgctaaagggcaacttattgcccaaagagaaatctctacagatgatagtcat
gcaacagataaaaacatcaactttatctataataatcaagggctactaatacaaaaatta
ggtacctccaaaggaaaaacctatcgctcagtgatcacatatgatgcgtttgggcgggta
ctttctacctcagaagagaataatgggcggtattttatgcagaaagacattatttatgat
gataaaaaccgtgtaacctcttatgaaaaaagcctctattctggtggtatttataccaaa
gcccaaatagagaatgtttatgatacatggtcaggagaactccatcaaatcaaagataaa
aactctaaaaaaatcttatggcaacttacagaagccaatgccagagggcaagtacagcgg
gcacagctgggagccgtgcatatagagaacacctatgatagaaatggtttcttgtctaat
atcaaccatagttctgcccagaaaccgagccttttgcagattggttataggtttgatgca
attaaaaatgaattactaagcagaattacaggcggagattttgacatctcagaaaccttt
aagtatgatgaaaataaccgtttaatcaattggactaaccctcgcacagggcagctgcat
cataacgtttatgatgcacaagggcgtattatagaaaacgaccagttagggaaaattata
ttcggtaatcaccataaaatatatcaaccaaccgcccttacgctcaatacagcaggtgct
cagaatctaaaaaacaattgggtccaagagatttcttataatgagaataatgaccctgtt
ctgatccaaggtgagaaaggcgatgtcttttttgaatatggacttactgctatgaggcag
gtggttcattttggtggtaaaataaccccagagcacaaaagccgatacacccgctactat
tcagaagatggcagttatgaagtaaccaccaataaccaaaccggaaaagagaagcacata
ttatacataggaggtacgccttacgaaagccaaattatctatcttaaaaatgaaaacgaa
agcataggaagttataaattcttgcacaaagactatttaggcagtattttagcgattagt
gatgaggcaggcaacaaggtagaacaacgccactatgatgcttggggaaatcttacccat
ttaaaaatagccaataatgcaactataacggataaaaaccaaattaataactatttagcc
agtggcaatttagtaacagatagaggttatacaagccacgagcatctggcagaagtagga
ttgatccatatgaatggcaggctatacgatccattattacgaagattcctaaacgccgat
gaaaacatacaagacgcctttaacacccaaaactacaacaaatacagctatgtactaaac
aacccgctgatgtacaatgacccaagtggagagttctttgcgttccttgggcttggagta
ttattttggaaagctgtttttattggtgcggcagttggtttagcaagctacaccgtaggt
ctagccgttaccggcaatctacaccaatggaatataggcagtgcattaaagtctatgctt
tggggtgccgtaggaggagccgctacatttggaataggaagtatatttagcagttctgcc
ggcacactaacctcctttgcgagtggtttaaaaaacaccctagggggcgttggtttagct
gtagtacaagccggtacgcatgctatctcccaaggggtattaggcttaatgcaagggcaa
gattttttaagctcagcagttggaggctttgcaggaagtttaggtgctagcggttggagt
agtattataggtagcacaggagcatctatgatagcttttggagcattgtcaggcggtata
ggcgcggaactaagcgatggcaacttctggcaaggagcggtaactggtgggatagtatca
gggctgaatcatgggttgcataaattggggaatgaagataatccgcgtaaaccaattaaa
actaaaagattggtaagtaaaagccaaaatcattcattatcaaaggggagccgaggcggg
caatctgttattactcccgaaaaccctggaaatcaagttggaaatggtaagggaatgttt
gcaccaacaggctcacaaagtatggttacttccaatttaacctattatgacgatggaaca
gtcgatattactatgacaacacaagttgcaagaatgaatacgacaggttcttatatagct
aattacaatattattggacctaatggaaatataattgatgcaggttttttggttaataaa
gcatttggaattacaaggatggattataatgtgtatacagttcaaggaagtgctgcagtt
ttatctacagctaagttttcggttcctttaaattccacaataaaaataaatgtgggactt
acatacaaaattccagcaggaggaacaggagcaataataaccacccatataataaaaatc
aggtaa
DBGET
integrated database retrieval system