Riemerella columbina: NYR17_04555
Help
Entry
NYR17_04555 CDS
T09247
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
Organism
rcl
Riemerella columbina
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKS96010
LinkDB
All DBs
Position
945892..950508
Genome browser
AA seq
1538 aa
AA seq
DB search
MANLENNNDKKKSTEQLDAHPPKTPERKQNRWYRFFKIAFLSFLGLLVALWIILSLSSTR
NWAAQRVVNILNKDLKTQISFDKIDLSIFGNITIYGLKIKDYKGLDFIKAKEVYADSDWF
SLITNTDHLDFQSLKVSDMEMKVITYKGDSIANFNRFIALFDNGKKRDPNKPPFELDARI
SILNSQLSIVNQNHAGDEGRWLDAQRLNVQIPRLKVKGSDVSAQVNNFSLVTERWGKKHL
IETFSTNFTLNKEYLWLENLVLNTDHSLLQGDLKLLLNEGKFEDFAHKVRWDMQLDRGSQ
MNGYDLSYFVKDWDNYKPINVSGKMDGVLNDFYLTQFQLGNHDTHIATQKIRVAKILEKS
FAIETQNLATDFTYQGLKQMFPSFIANKMGNVADDFGRMKFNGALTANPNAITTKGTLIS
GVGQAAIKHLTLLEYSTPQPKYTGELSLSQLNVAAITKNNQVGLVSGHFNAKGEGFNLNT
MHLNTQSQITSIEILDKTLTNVLLDGTLAQKQYNGLVSIKDPHAQANVKGRFDFSNPRLV
ADVLADVAHLDIAYFTGKAERQVVSGLFDVKMAMKDLNDLNLDAKMKSVQLISANQTVNL
PEADVKAYLDGNNRIVDIDAPQAVKGKVSGHFNIKDVAGMVQNSMDKILAGTAPRQYYRG
QYFNFDFDIAQGLVNFFEPRLKIRDGVKVSGNYDGNANNLVLSAEAPHLKYMITKEDAKA
ANEVLAQSDIDYQIETSSVANESVTVNQLALNINTASSTEQVVLSVDKLAFSDHIVRDLS
LKGSNENGEILHLAASLKHGNPDDDEHNRLKEYAVNLSQTTDAQGDYVIRFEPTEVRFNN
FVWRVDTSPELNHSITYKRKTGAIDLHNLKFYSDNSEILVNGIFNNGKDFDINAEVKNVE
VSKLMALKGGGDTQMEMGGTINGTIDIKMNKSILEPLVDLKVEQLSMNRQAMGDIIINAQ
KTEKRNIFAMEARVLSPELLGADKLKLTGTINNNTASPTLDLLADMNEFDLAFAQEFVKS
VFSNFRGKASGQLKIGGTIKDVDYQGDIALKDFGLKLNFSGVDYAFDDTVIPLTKGYAVL
NNIGVKDGRGNSQGTISGAIQFADAASMGLNLIMRADNLLLLNTTQKDFDTFWGRVYGRG
DIFVEGPVTALNIDANMDVLNNSTFTLNSNSASAVDEFKMLRFVEKGKDGLLTVAEKKKS
GANMNIKFDISIDKGSTVNVLVGDDVGDISVRGMAEHLKFNLRRNGQMSMSGTFVVDNGT
FVSKAILERTFQIAKGSSMGWDGNVMNPSLNISADYFRTVTNAGEYLNIGKLPPINVMLT
THITQSLQNPKIDFNVSAPDVSSQIKEALAFKMSNSDEKIVQFGAILALNNFNVADTGGV
DFNVGNTLVSQGYNLLFKQLGSVLNTISNQFQVDLNYIKGDQASNTGDRANAGVNIALSP
RVNIKTGLGVPLSKTEYTDANFLSGEGILEYDWSKKNDGSRLFRVYSKPSNVTNISGQAG
ANQTWGGGVVYSKSFNRFFPKKKKDSMRQPKDTTAVAR
NT seq
4617 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatttagagaataataacgacaagaaaaaatctacagaacaattggacgcacat
ccgcctaaaacacccgagagaaagcaaaaccgctggtaccgtttttttaaaatcgcattc
ctttcttttttaggtttgttggtagcgctgtggattattctgagcttatcttctacccga
aattgggcggcacagcgggtggttaatattctcaacaaagatctgaaaacccaaataagc
tttgacaaaatagaccttagcatttttggaaacatcaccatatatgggcttaaaatcaag
gattataaaggtttagatttcattaaagccaaagaagtttatgccgattctgactggttt
tcactcatcaccaataccgatcatcttgatttccaatcgttgaaggtgagtgatatggag
atgaaagtgattacttataaaggcgatagcattgctaattttaatcgatttatcgcattg
tttgataatggcaaaaagcgtgatcccaataaaccgccttttgagttggatgcccgcatt
agcattctgaattcccaactctccattgtgaatcaaaaccacgctggcgatgagggcaga
tggctggatgctcagcgtttgaatgtccaaattccacgcttgaaggtcaaaggttccgat
gtttctgcgcaggtgaataattttagcttggtcacagagcgctggggcaaaaaacacttg
atagaaactttttccactaattttacccttaataaggaatatttatggttagaaaatttg
gtgctaaataccgaccatagccttttgcaaggggatttaaagcttctcctcaacgaaggt
aagtttgaagattttgcccacaaagtacgctgggatatgcagttggaccgaggcagccaa
atgaacggttatgatttgagttatttcgtgaaggattgggacaattataaacccatcaat
gtctctggaaaaatggatggcgtgctcaatgatttctaccttacgcagttccagttgggc
aaccacgatacccacatagcgacacaaaaaataagagtagctaaaattttagagaagagt
ttcgctatagaaacgcagaatttagccacagattttacctaccaagggcttaaacagatg
ttcccaagttttatcgccaataaaatgggaaatgtcgcagatgatttcggtagaatgaaa
ttcaacggggcgctcacagccaatccgaatgctatcaccactaagggaaccctgatttct
ggcgtggggcaggcggcaattaagcatttgactttattagaatacagcacgcctcagcct
aaatatacgggagaactcagccttagtcaactgaatgtagctgccatcacgaagaacaac
caagtggggttagtttctgggcattttaatgccaagggcgaaggtttcaatcttaataca
atgcacctcaacacccaatcgcagattaccagcatagaaattttggataaaacgctgacc
aatgtgttgttagatgggactttggcgcagaaacaatacaacggcttggtgagcatcaaa
gatcctcacgcccaagcgaatgtaaagggtaggtttgatttcagcaatccgagattggtt
gccgatgttttagctgatgtagcccatttggatatcgcttatttcacagggaaagcggaa
cgccaagtggtgagtggtctttttgatgttaaaatggcgatgaaagatctcaacgatttg
aacttagatgctaaaatgaaatcggtgcagctgatctctgccaaccaaaccgtgaacctt
ccagaggcagatgtgaaagcctatttagatggcaacaacagaatcgtggatattgatgca
ccgcaggcggttaagggtaaagtttcagggcatttcaatattaaagatgtggctggaatg
gtgcagaacagtatggataaaattttagcaggcaccgcgcctcgccaatattaccgtgga
caatatttcaattttgattttgatatagctcaaggtttggtcaacttttttgaacctcgc
cttaaaataagagatggcgttaaagtttcagggaattatgatggcaatgccaataatctc
gtgctgagtgctgaagcgccacaccttaaatatatgatcacgaaagaagatgccaaagcc
gccaacgaggtgctggcacaatcagatattgattatcaaatagaaacttcatctgttgct
aatgagagtgttacggtaaaccaattggcgctaaacatcaacacagcgagtagcaccgag
caagtggtattgagtgtggataaattggcgtttagcgatcacattgtgcgagatttaagc
ctaaaaggaagcaatgaaaacggcgaaattctacatttggcagcctcgctaaagcatggt
aatccagatgatgatgagcacaataggcttaaagaatatgccgttaatcttagccaaacc
acagatgcacaaggggattatgtaattcgctttgaacctacggaggttagatttaacaat
tttgtttggcgtgtggatacttcgccagagcttaaccactccattacttataagagaaaa
acaggtgctatagacctccataaccttaaattttactctgataatagtgagattttggtg
aatggtatttttaataatggtaaagattttgacatcaatgctgaggttaaaaatgtggaa
gtcagcaagttgatggcgctgaaaggcggcggcgatacccaaatggaaatgggcggcacc
attaacggaacgattgacatcaagatgaataaaagcatcttggagccgctggtagattta
aaagtagagcaactgagtatgaaccgccaagcgatgggggatatcatcatcaatgcccaa
aaaaccgaaaaaaggaatatttttgcgatggaagcgcgcgtgctatcgccagaattgtta
ggcgcggataaactgaaactcacagggactattaacaacaataccgcatcaccaacgctg
gatttattggcagatatgaacgagtttgatttggcttttgcacaagagtttgtgaagtct
gtattcagcaacttccgaggcaaagccagtggtcagctcaaaataggtggtacgattaaa
gatgtggattatcaaggggatattgcactaaaagactttgggttaaaactcaacttttcg
ggggtagactacgcttttgatgatacggtcattccgttgaccaaaggctatgcggtactc
aataacattggagtgaaagatggcagaggcaattctcaggggacgatttctggagctata
cagtttgcggatgctgcgtctatggggctcaacctcattatgcgggcagataacttgttg
ttgctcaataccactcaaaaagattttgataccttctgggggcgtgtgtatggcaggggc
gatatcttcgtggaaggtcctgtaacggcgctcaacattgatgctaatatggatgtcctt
aataatagtacctttacgctgaatagcaattcggcatcggcagtagatgagtttaagatg
cttcgttttgtagagaaaggcaaagatgggctcctcacggtggcagaaaagaaaaaatct
ggcgctaatatgaacattaaatttgatattagcatagataaaggctctacggttaatgtt
ttggtgggcgatgatgtgggcgatatcagcgtgcgcggtatggcagagcatttgaagttt
aatttgagaagaaacggacaaatgtcaatgagcggtactttcgtggtggataacggaacc
ttcgtttcaaaagccattctggagcggactttccaaatcgcgaagggcagtagtatgggt
tgggacggaaatgtgatgaatccgtcgcttaacatttctgccgattatttccgtacggtg
accaacgctggcgagtaccttaatataggaaaattgccgccaatcaatgtgatgctcacc
acgcatatcacacaatctctacaaaatccgaaaattgattttaatgtttcggcaccagat
gtatccagccaaattaaggaagctttggcgtttaagatgagcaattctgatgagaaaatt
gtgcaatttggagcgatattggcattaaataactttaatgtcgcggatacagggggggta
gattttaatgtggggaatacactggtatcgcagggttataacttgttattcaagcagttg
ggttctgtgctgaatactattagcaaccagtttcaagtggatttaaactatatcaaaggt
gaccaagcctctaacacaggcgaccgtgccaatgctggcgtgaatatagcactatcacca
agggtaaacataaaaacaggtttgggggtaccgctttctaaaaccgagtataccgatgcc
aatttcctttctggagaagggattttggagtacgattggtctaagaaaaatgatggcagt
cgcttatttagagtgtattctaagccatctaatgtgaccaatatttctggacaggctggc
gctaaccaaacttggggtggcggtgtggtttatagcaaaagttttaatagatttttccca
aaaaagaaaaaagacagcatgcgccaacctaaggataccacggcagttgcaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system