KEGG   Rickettsia canadensis McKiel: A1E_04675
Entry
A1E_04675         CDS       T00603                                 
Name
(GenBank) Outer membrane protein B
Organism
rcm  Rickettsia canadensis McKiel
SSDB
Motif
Pfam: rOmpB_passenger Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABV73860
UniProt: A8EZS7
LinkDB
Position
complement(943592..948505)
AA seq 1637 aa
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVAGFAGSAMGAANRNINAHVNLNAVGMPGIVTGDSL
TYVVQAGGPFIATADGGNDNVGNPTVLFGSMNMLQSGVFAVNGAADMAIGSVSGTAGQLL
TLNIIAGNTLTLNGAPGVAALPVNTYTNLGPVNFTDANSVFKVNLAANGADGTKTAVFGN
TATFNSIVPGGKGHINIDDGNIAIFNGTIGNTNGIQGFILGANAQVTLNANAKLDGTVGA
DGIVLGNDAVLNVADRVNITGITAANNINICGVAANNGTVNFLGDSTVSTDIGNKNSVAA
VNVAGTLIFQGGNNGNGSNFAAQAINLTSADSFIKFTTQDHQVAGNILNTSGTNNQGGFS
VNGGDVTVAGNVGANGNSLATINFETDNTLVVHKADTNAIFVQNVDTATANTGILKLQGA
NFAINGNIGGNNALKIVNLEDNDNGAATNFTLKQGSKINAQNIYLSSAFDNSLTLEEGTT
VTGNIINKLAAGNGTIALTGNAAINGNIGVDAAIGGNVGNAIKNINLAGNNLSYGGSSIL
LVNNPANAITFGANETLTLTNTTDAALQIKANLAITTDKQGILDASSLTNAQTLTISGNI
GTIVPGANKTLGQLKVGSSKTILNAGDVAINELDIGNNGSVQLGHNTYLITKTINAAGQG
KIIVAGDPANPTTTLSAGTNLGSAANALAEINFAVPVAQNDSILEFGKGVNLYATNITTA
VADTGSFSFTAGGINIVSGIVGGQQGNKFNTVELDNGTTAQFLGSAIFNGKSTIDGNSTL
QIGSNYTASFIKSADNTGIVEFVNADNITVTLQTQAAAVDALKQITVSGPGNVVFNETGN
LAEHGINTTKIAFENASLGTRLFLPSKIPFDGLTITSTVGNGLVGDFSVPAVIVSDIDSK
IVPGQVIGDQNNIVGLGLASDDTITVDDITLNAGLFTVHDGQGTIELNGGIPNTPGTIYG
LGIKPEGEAALKLKLVTVATDYKNLGSTFVNNLIVNDGLTYQAGGVVGKDFDGTITLGSA
NGNSNVIFADGTNSTSTSTVATVKANNGVVTYLGSAFVGNIGCSNTPVASVQFTGPVGSL
EKLQGNIYSTATNFGNVNLNVAASNVILGGGTTAINGNIDLATNILTFASGTSTWGDNTS
LSTTLTLASGNIGHIVIAEGVQVNATTTGTTTINVQDSANANFSGTQTYTLIQGGARFSG
TLGDPKFNVTGSNIFVRYGLIRADNKDYVLTRTNDVANVVTKAIGNSQFAGIGQNVLTFV
NSNTAAYNNLLLAKNTTDAANFVGAITTDTSAVVTNAQLDVAKDIQAQLSNRLGALRYLG
TYDSSKMAGAECGLVSTPQSPVTAGEEAIDNVAYGIWAKPFYTDAHQSKKGGLAGYKAKT
TGVVIGLDTLANDNLMIGAALGITKTDIKHQDYKKGDKTDINGFSFSLYSAQQLVKNFFA
QGSAIFSLNHVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGNLIVGYDYNAMEGVLVTP
MAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLILGVRVMGNTMNFSDLAVYPEAHA
FVVHKVNGRLSKTQSQLDGQVTPFISQSDSSAKTSYNLGLSASIRPDSKMEYGIGYDAQI
ASKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq 4914 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttcggcagggttggtaactgcttcc
accgctaccatagtagctggttttgcaggctcagctatgggtgctgctaaccgcaatatt
aatgcacacgttaatttaaatgctgttggtatgcctggaatagtaacaggtgattcttta
acttatgttgtgcaagcaggcggccctttcattgccacagctgatggaggcaatgataac
gttggtaatcctactgtgcttttcggatcgatgaatatgttacaaagtggtgtttttgca
gttaatggtgctgcggatatggctattggttctgtttccggtactgcaggtcaattatta
acgctcaatattattgcaggaaataccttgactttaaacggtgctcctggagttgctgct
ttgcctgtaaatacttatactaacctcggacctgttaattttacagatgctaattctgta
ttcaaagttaaccttgcagctaatggtgcagatggtactaaaacagctgttttcggtaat
actgctactttcaacagtattgttccaggaggtaaaggtcacattaacattgatgatggg
aatatagcaatatttaatggtacgattggtaatactaatggtatacaaggtttcatatta
ggggcaaacgcacaagttactttaaatgctaatgctaaacttgacggtactgttggagct
gatggtattgttttaggtaatgatgctgtattaaatgttgcagatagagttaatataacc
ggtattactgctgctaataatataaatatttgcggtgtagctgctaataatggtacggta
aatttcttaggtgattctacggttagtacagatatagggaataaaaattctgtagctgca
gttaatgttgctggaacattaatcttccaaggtgggaacaatgggaatggcagtaatttt
gctgctcaagctattaatttaactagtgctgattccttcatcaaatttacaacacaagat
catcaagtagcaggtaatatacttaatactagtgggactaataaccaaggtggtttcagt
gttaatggtggtgatgtgacagttgccggtaatgttggtgctaatggtaatagtttagct
acaattaattttgaaacagacaatactttagtagtgcataaagcagatacaaatgctatt
ttcgttcaaaatgtagatactgctacggctaatacaggtatattaaagttacaaggtgcc
aatttcgccattaacggtaatatcggtggcaataatgctttaaaaattgttaatttagaa
gataatgataatggtgctgctacaaactttactttaaagcaaggtagcaaaattaatgct
caaaatatatatttatctagtgcatttgataatagccttaccttagaagaaggcacaact
gtaactggtaatattataaataagctagcagcaggtaatggtacaatcgctttaactggt
aacgcagctattaatggcaatataggtgttgatgctgctattggtggtaatgttggtaat
gccataaaaaatattaatttagccggtaacaatttatcttacggtggaagcagtatttta
ttagttaacaatcctgctaatgctattacttttggagctaacgaaacattaactctaact
aatactacagatgcagctttacaaattaaagctaatttagccataactaccgataaacaa
ggtatattagatgcgagtagtctaacaaatgctcaaactttaactattagcggtaatatc
ggtactattgtaccaggtgctaataaaacccttggacaattaaaagtcggatcaagtaaa
acaattttaaatgctggtgatgttgctattaatgagttagatatcggtaataacggttca
gtacaacttggtcacaatacttatttaataacaaaaactatcaatgctgcaggtcaaggt
aaaataatagttgccggcgatcctgctaaccctactactactctttctgcgggtacaaat
ttaggtagtgcagcaaatgcacttgctgagattaattttgcagttccggtagctcaaaat
gattctatattagagtttggtaaaggtgttaatttatatgccactaatattactactgct
gttgctgatacaggttcgttcagctttactgccggtggaataaatatagtgagtggtata
gtaggtggacagcaaggtaataagtttaatactgtagaattagataacggtactactgct
cagttcttagggagtgctatttttaacggcaagagtacaattgatggtaattctacctta
caaatcggtagcaattatactgcaagctttatcaaatctgccgacaataccggtatagta
gaattcgttaatgctgataatattaccgtaacattacaaacacaagctgctgctgttgat
gctttaaaacaaataacagtttctggtcccggtaacgtagtatttaatgagaccggtaat
ttagctgagcatggtattaataccactaaaattgcttttgaaaatgcaagcttaggtacg
cgtttattcttacctagtaaaattccatttgacggtttaacaattacaagtacagttggt
aacggtctggtcggtgactttagtgttcctgcagttattgtttcagatattgatagtaaa
attgtcccaggtcaagtaatcggtgatcagaataatatagtaggtcttgggcttgcaagt
gatgatacgatcactgttgatgatattacattaaatgcaggtctgtttactgtacatgac
ggtcaaggtactatagagcttaatggcggtattcctaatacacctggtacaatttacggt
ttagggataaagccagaaggtgaggctgctctaaaattaaagcttgtaactgttgctaca
gactataaaaacttaggaagtactttcgttaataatttaatagttaatgatggtttaaca
tatcaagcaggtggtgtagtcggaaaagattttgatggtacaatcactcttgggagtgct
aacggtaactctaatgtaatttttgctgatggtacaaactctacttctacaagtacggtt
gctaccgttaaagctaataatggtgtcgtaacttacttaggtagtgcatttgtcggtaat
ataggttgctctaatactcctgtagcttccgtacaatttacaggtcctgttggttcatta
gaaaaattacaaggaaatatatattctacggcaaccaattttggtaatgttaacttaaat
gttgcagcatcgaacgtaattttaggcggcggtacaactgctattaacggtaatatagat
cttgctacaaatatcttaacatttgcaagcggtacttcaacatggggagacaatacttct
cttagtacaacgctaacattagcaagtggtaatataggtcatattgttatcgcagaaggt
gttcaagttaatgcaacaactacaggaactacaactattaacgtacaagatagtgctaat
gcaaatttcagcggtacacaaacttatactttaatccaaggcggggctcgtttttcaggt
actttaggtgatcctaagtttaacgtaactggaagtaatatttttgtaaggtatggatta
atacgtgccgataataaagattatgtattaacacgtactaacgatgtagcaaatgtagtt
acaaaggctatcggaaatagccagtttgcaggtataggtcagaatgttctaacatttgta
aattctaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaacactactgatgcagct
aactttgtcggagctattactaccgatacaagtgcggttgtaactaatgcccaattagat
gtagctaaagatatccaggctcaacttagtaacaggttaggcgctcttagatatcttggt
acttatgattcttctaaaatggcaggagctgaatgtgggttagtatctacaccgcaaagt
ccggttacagcaggtgaggaagctattgacaatgtagcttatggtatatgggcaaaacct
ttctatactgatgcacatcaaagtaagaaaggcggtttagcaggttacaaagctaaaacc
accggtgttgtaatcggtttagatacgctagctaatgataacttaatgattggtgctgct
cttggtatcactaaaaccgatataaaacaccaagattataagaaaggtgataaaaccgat
attaacggtttctcattttctctatacagtgcacagcagcttgttaaaaacttctttgct
caaggtagtgcaatatttagcttaaatcacgtgaagaacaaaagccagcgttatttcttc
gatgctaacggtaatatgagtaagcaaattgctgctggtcattatgataacatgacattc
ggcggtaacttaatagtcggttatgattacaatgcaatggaaggtgtgttagtaactcca
atggcaggacttagctacttaaagtcttctgatgaaaactataaagaaaccggtacaaca
gttgcaaacaagcaagttaacagcaagtttagcgatagaaccgatttaatattaggcgtt
agagtaatgggcaatactatgaactttagtgatcttgcagtatatccggaagctcatgct
tttgtggttcacaaagtaaacggtaggttatctaaaactcagtctcagttagacggacaa
gtgactccattcatcagccagtctgatagcagcgctaaaacatcttataatttaggttta
agtgcaagtataagacctgattctaagatggaatacggaatcggttatgatgctcagatt
gcaagtaaatatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa

DBGET integrated database retrieval system