Rickettsia canadensis McKiel: A1E_04675
Help
Entry
A1E_04675 CDS
T00603
Name
(GenBank) Outer membrane protein B
Organism
rcm
Rickettsia canadensis McKiel
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
rOmpB_passenger
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV73860
UniProt:
A8EZS7
LinkDB
All DBs
Position
complement(943592..948505)
Genome browser
AA seq
1637 aa
AA seq
DB search
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVAGFAGSAMGAANRNINAHVNLNAVGMPGIVTGDSL
TYVVQAGGPFIATADGGNDNVGNPTVLFGSMNMLQSGVFAVNGAADMAIGSVSGTAGQLL
TLNIIAGNTLTLNGAPGVAALPVNTYTNLGPVNFTDANSVFKVNLAANGADGTKTAVFGN
TATFNSIVPGGKGHINIDDGNIAIFNGTIGNTNGIQGFILGANAQVTLNANAKLDGTVGA
DGIVLGNDAVLNVADRVNITGITAANNINICGVAANNGTVNFLGDSTVSTDIGNKNSVAA
VNVAGTLIFQGGNNGNGSNFAAQAINLTSADSFIKFTTQDHQVAGNILNTSGTNNQGGFS
VNGGDVTVAGNVGANGNSLATINFETDNTLVVHKADTNAIFVQNVDTATANTGILKLQGA
NFAINGNIGGNNALKIVNLEDNDNGAATNFTLKQGSKINAQNIYLSSAFDNSLTLEEGTT
VTGNIINKLAAGNGTIALTGNAAINGNIGVDAAIGGNVGNAIKNINLAGNNLSYGGSSIL
LVNNPANAITFGANETLTLTNTTDAALQIKANLAITTDKQGILDASSLTNAQTLTISGNI
GTIVPGANKTLGQLKVGSSKTILNAGDVAINELDIGNNGSVQLGHNTYLITKTINAAGQG
KIIVAGDPANPTTTLSAGTNLGSAANALAEINFAVPVAQNDSILEFGKGVNLYATNITTA
VADTGSFSFTAGGINIVSGIVGGQQGNKFNTVELDNGTTAQFLGSAIFNGKSTIDGNSTL
QIGSNYTASFIKSADNTGIVEFVNADNITVTLQTQAAAVDALKQITVSGPGNVVFNETGN
LAEHGINTTKIAFENASLGTRLFLPSKIPFDGLTITSTVGNGLVGDFSVPAVIVSDIDSK
IVPGQVIGDQNNIVGLGLASDDTITVDDITLNAGLFTVHDGQGTIELNGGIPNTPGTIYG
LGIKPEGEAALKLKLVTVATDYKNLGSTFVNNLIVNDGLTYQAGGVVGKDFDGTITLGSA
NGNSNVIFADGTNSTSTSTVATVKANNGVVTYLGSAFVGNIGCSNTPVASVQFTGPVGSL
EKLQGNIYSTATNFGNVNLNVAASNVILGGGTTAINGNIDLATNILTFASGTSTWGDNTS
LSTTLTLASGNIGHIVIAEGVQVNATTTGTTTINVQDSANANFSGTQTYTLIQGGARFSG
TLGDPKFNVTGSNIFVRYGLIRADNKDYVLTRTNDVANVVTKAIGNSQFAGIGQNVLTFV
NSNTAAYNNLLLAKNTTDAANFVGAITTDTSAVVTNAQLDVAKDIQAQLSNRLGALRYLG
TYDSSKMAGAECGLVSTPQSPVTAGEEAIDNVAYGIWAKPFYTDAHQSKKGGLAGYKAKT
TGVVIGLDTLANDNLMIGAALGITKTDIKHQDYKKGDKTDINGFSFSLYSAQQLVKNFFA
QGSAIFSLNHVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGNLIVGYDYNAMEGVLVTP
MAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLILGVRVMGNTMNFSDLAVYPEAHA
FVVHKVNGRLSKTQSQLDGQVTPFISQSDSSAKTSYNLGLSASIRPDSKMEYGIGYDAQI
ASKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq
4914 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttcggcagggttggtaactgcttcc
accgctaccatagtagctggttttgcaggctcagctatgggtgctgctaaccgcaatatt
aatgcacacgttaatttaaatgctgttggtatgcctggaatagtaacaggtgattcttta
acttatgttgtgcaagcaggcggccctttcattgccacagctgatggaggcaatgataac
gttggtaatcctactgtgcttttcggatcgatgaatatgttacaaagtggtgtttttgca
gttaatggtgctgcggatatggctattggttctgtttccggtactgcaggtcaattatta
acgctcaatattattgcaggaaataccttgactttaaacggtgctcctggagttgctgct
ttgcctgtaaatacttatactaacctcggacctgttaattttacagatgctaattctgta
ttcaaagttaaccttgcagctaatggtgcagatggtactaaaacagctgttttcggtaat
actgctactttcaacagtattgttccaggaggtaaaggtcacattaacattgatgatggg
aatatagcaatatttaatggtacgattggtaatactaatggtatacaaggtttcatatta
ggggcaaacgcacaagttactttaaatgctaatgctaaacttgacggtactgttggagct
gatggtattgttttaggtaatgatgctgtattaaatgttgcagatagagttaatataacc
ggtattactgctgctaataatataaatatttgcggtgtagctgctaataatggtacggta
aatttcttaggtgattctacggttagtacagatatagggaataaaaattctgtagctgca
gttaatgttgctggaacattaatcttccaaggtgggaacaatgggaatggcagtaatttt
gctgctcaagctattaatttaactagtgctgattccttcatcaaatttacaacacaagat
catcaagtagcaggtaatatacttaatactagtgggactaataaccaaggtggtttcagt
gttaatggtggtgatgtgacagttgccggtaatgttggtgctaatggtaatagtttagct
acaattaattttgaaacagacaatactttagtagtgcataaagcagatacaaatgctatt
ttcgttcaaaatgtagatactgctacggctaatacaggtatattaaagttacaaggtgcc
aatttcgccattaacggtaatatcggtggcaataatgctttaaaaattgttaatttagaa
gataatgataatggtgctgctacaaactttactttaaagcaaggtagcaaaattaatgct
caaaatatatatttatctagtgcatttgataatagccttaccttagaagaaggcacaact
gtaactggtaatattataaataagctagcagcaggtaatggtacaatcgctttaactggt
aacgcagctattaatggcaatataggtgttgatgctgctattggtggtaatgttggtaat
gccataaaaaatattaatttagccggtaacaatttatcttacggtggaagcagtatttta
ttagttaacaatcctgctaatgctattacttttggagctaacgaaacattaactctaact
aatactacagatgcagctttacaaattaaagctaatttagccataactaccgataaacaa
ggtatattagatgcgagtagtctaacaaatgctcaaactttaactattagcggtaatatc
ggtactattgtaccaggtgctaataaaacccttggacaattaaaagtcggatcaagtaaa
acaattttaaatgctggtgatgttgctattaatgagttagatatcggtaataacggttca
gtacaacttggtcacaatacttatttaataacaaaaactatcaatgctgcaggtcaaggt
aaaataatagttgccggcgatcctgctaaccctactactactctttctgcgggtacaaat
ttaggtagtgcagcaaatgcacttgctgagattaattttgcagttccggtagctcaaaat
gattctatattagagtttggtaaaggtgttaatttatatgccactaatattactactgct
gttgctgatacaggttcgttcagctttactgccggtggaataaatatagtgagtggtata
gtaggtggacagcaaggtaataagtttaatactgtagaattagataacggtactactgct
cagttcttagggagtgctatttttaacggcaagagtacaattgatggtaattctacctta
caaatcggtagcaattatactgcaagctttatcaaatctgccgacaataccggtatagta
gaattcgttaatgctgataatattaccgtaacattacaaacacaagctgctgctgttgat
gctttaaaacaaataacagtttctggtcccggtaacgtagtatttaatgagaccggtaat
ttagctgagcatggtattaataccactaaaattgcttttgaaaatgcaagcttaggtacg
cgtttattcttacctagtaaaattccatttgacggtttaacaattacaagtacagttggt
aacggtctggtcggtgactttagtgttcctgcagttattgtttcagatattgatagtaaa
attgtcccaggtcaagtaatcggtgatcagaataatatagtaggtcttgggcttgcaagt
gatgatacgatcactgttgatgatattacattaaatgcaggtctgtttactgtacatgac
ggtcaaggtactatagagcttaatggcggtattcctaatacacctggtacaatttacggt
ttagggataaagccagaaggtgaggctgctctaaaattaaagcttgtaactgttgctaca
gactataaaaacttaggaagtactttcgttaataatttaatagttaatgatggtttaaca
tatcaagcaggtggtgtagtcggaaaagattttgatggtacaatcactcttgggagtgct
aacggtaactctaatgtaatttttgctgatggtacaaactctacttctacaagtacggtt
gctaccgttaaagctaataatggtgtcgtaacttacttaggtagtgcatttgtcggtaat
ataggttgctctaatactcctgtagcttccgtacaatttacaggtcctgttggttcatta
gaaaaattacaaggaaatatatattctacggcaaccaattttggtaatgttaacttaaat
gttgcagcatcgaacgtaattttaggcggcggtacaactgctattaacggtaatatagat
cttgctacaaatatcttaacatttgcaagcggtacttcaacatggggagacaatacttct
cttagtacaacgctaacattagcaagtggtaatataggtcatattgttatcgcagaaggt
gttcaagttaatgcaacaactacaggaactacaactattaacgtacaagatagtgctaat
gcaaatttcagcggtacacaaacttatactttaatccaaggcggggctcgtttttcaggt
actttaggtgatcctaagtttaacgtaactggaagtaatatttttgtaaggtatggatta
atacgtgccgataataaagattatgtattaacacgtactaacgatgtagcaaatgtagtt
acaaaggctatcggaaatagccagtttgcaggtataggtcagaatgttctaacatttgta
aattctaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaacactactgatgcagct
aactttgtcggagctattactaccgatacaagtgcggttgtaactaatgcccaattagat
gtagctaaagatatccaggctcaacttagtaacaggttaggcgctcttagatatcttggt
acttatgattcttctaaaatggcaggagctgaatgtgggttagtatctacaccgcaaagt
ccggttacagcaggtgaggaagctattgacaatgtagcttatggtatatgggcaaaacct
ttctatactgatgcacatcaaagtaagaaaggcggtttagcaggttacaaagctaaaacc
accggtgttgtaatcggtttagatacgctagctaatgataacttaatgattggtgctgct
cttggtatcactaaaaccgatataaaacaccaagattataagaaaggtgataaaaccgat
attaacggtttctcattttctctatacagtgcacagcagcttgttaaaaacttctttgct
caaggtagtgcaatatttagcttaaatcacgtgaagaacaaaagccagcgttatttcttc
gatgctaacggtaatatgagtaagcaaattgctgctggtcattatgataacatgacattc
ggcggtaacttaatagtcggttatgattacaatgcaatggaaggtgtgttagtaactcca
atggcaggacttagctacttaaagtcttctgatgaaaactataaagaaaccggtacaaca
gttgcaaacaagcaagttaacagcaagtttagcgatagaaccgatttaatattaggcgtt
agagtaatgggcaatactatgaactttagtgatcttgcagtatatccggaagctcatgct
tttgtggttcacaaagtaaacggtaggttatctaaaactcagtctcagttagacggacaa
gtgactccattcatcagccagtctgatagcagcgctaaaacatcttataatttaggttta
agtgcaagtataagacctgattctaagatggaatacggaatcggttatgatgctcagatt
gcaagtaaatatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system