Rosa chinensis (China rose): 112174060
Help
Entry
112174060 CDS
T06020
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X1
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
rcn04131
]
112174060
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
rcn04040
]
112174060
Membrane trafficking [BR:
rcn04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
112174060
Ion channels [BR:
rcn04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
112174060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_cap
Piezo_THU9_anchor
THU_Piezo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112174060
NCBI-ProteinID:
XP_024167525
LinkDB
All DBs
Position
6:55001207..55014765
Genome browser
AA seq
2470 aa
AA seq
DB search
MGRFLGGFLLPLLLLAAAFMHWSLISLGDLISFLLILFHAPKLGFHFGRRLLLLWFVIIF
SLCAIFSQVLYLVLWAIEWSTAEEWWGKLIGLLIAESWKSPSVVYFVVLQLSIVAVSLVD
LYGNRFGPFSSFDSCWGQFLSTVDRLVCSHIRVASCLLLPAIQLVVGISHPSWVSLPFFI
GSCVGLVDWSLTSNFLGLFRWWRPFHLYAGFNIVLLYLYQLPVEFPDMLQWVADFIGLFK
ITSGSQWTEVCSSFSLVLFYIMLSCVKCDLEEMDFILSMKENNLTEHLLPSKHSFFIRQS
RSGVRHTNVMLTGAVFRTFSINFFTYGFPVSLVALSFWSFHFASVCAFGLLAYVGYIIYA
FPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVAFTFLNWKIGKNMDIWEMVGLWHYPIPGFF
LLAQFCLGMLVALGNLVNNSVFLCLSDEDGRSSTDNSTIEGEGETKVLIVATIAWGLRKS
SRAIMLALIFLIAMKPGFIHAVYVIFFLIYLLSHNVNRKLRQSLILLCEVHFALLYIIRI
NPISSSLEQEGSLSAEVLLQLGLLEKESSWDFLEIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAIVQ
HTPSLPFGFGILKAGLNKSVLLSVYASSSTNYSHDNPSYERRIALFLSAIGQKFLSMYRS
CGTYIAFLTILVSVYLMRPNYISFGYISLLLVWIIGRQLVERTKKRLWFPLKAYSITVFI
FIYSLSSFPSIEVWLSRLIDLDFYLGYDSKASSLENVWESLAVLIVMQLYSYERRQSRYN
RSDDPDWTEFGVLGFVKRFLIWHSNKILFIALFYASLSPICAFSFLYLLGLVICSTLPKA
SRIPSKSFLAYTGFLVTAEYLFQMLGSQAAMFPGQKHSNIALLLGFREFKAGFWGLESGL
RGKVLVIAACTLQYNVFHWLEKMPSTILSNGMGEPCPLFVSAEDTNISAPIPSEDNRPST
PLSVKREAARSHSWPFFSPGLLQSLNPSTPKAGSSEGSSGSKYSFGYIWGSTKESHKWNT
KKILALRKERFETQKLISKIYMKFWMENLFNLFGLEINMIALLLASFALLNAISMLYIAL
LAACIILNRQIIRKLWPIFVFLFASILVLEYFAIWKSAWPPNHPDATNPHCHDCWQKSTM
YFSYCKYCWLGLNVDDPRMLISYFIVFMLACFKLRADHLSSFSGLSTYREMISQRENTFV
WRDLSFETKSMWTFLDYVRLYCYCHLLDLVLALVLITGTIEYDILHLGYLAFALVFFRVR
LQILKKRNKMFKFLRIYNFALIVLSLAYQSPFVGCSGKCETVYEMIGFYKYDYGFQMTAR
SALVEIIIFMLVSLQSYMFSSKEFDYVSRYLEAEQIGMIVREQEKKAAWKTAQLQHVRES
EEKKRQRNLQVEKMKSEMLNLQIQLHSTNSVTDCGDSSPVSEGLRRRRSTSLNLNNDAWT
PDKEGFPMKKEQIIRETSSNELHESPATGNLENPTVVDSMKNSMQSIHCEITEIEEDVAD
GTFSDSEKKEKGKGKSTDNPLISAVHLIGDGVSQVQSIGNQAVNNLVSFLNIDQESDIHE
HSAEDGVYDEMESQKIKYASFHRSSSLQSDVSSDATSLQLGRIFRHIWSRMRSNNDVVCY
CCFVIVFLWNFSLLSMVYLAALFLYALCVNSGPSYIFWVIMLIYTEVYILLLYLYQIIIQ
HYGTRIASDLLRELGFPARKMSSFVISSLPLFLVYLFTLVQSSITAKDGEWMSSTDFNFY
RRNALQGKEVPVSYSWSERAKDPLHIIVNVIQLICRSFFRYWVSLTQGAESPPYFVQVSM
DVCSWPEDGIQPERIESGVNQLLRIIHDERCKAKDPKRCPFASRVHVQSIERSRENANVA
LVVFEVVYASPITDCGSVEWYKSLTPAADVAKEILKALHAGFVEEIGFPYPILSVIGGGK
RDIDLFAYVFGADLSVFFLVAIFYQSIIKNKSDFLDVYQLEDQFPKEFVFILMIIFFLIV
LDRIIYLCSFATGKVIYYLFNLILFTYSVTKYAWHMESSRQHAGGLALRAIFLAKSISLA
LQAIQLRHGIPHKSTLYRQFLTSEISRINYLGYRLYRALPFLYELRCVLDWSCTTTSLTM
YDWLKLEDIHASLYLVKCDAVLNRATHKQGEKQTQMTKCCNGICLFFILICVIWAPMLMY
SSGNPTNIANPIKDASVQVDIKTMSGRLTLYQSTLCEKIDWDNVNTDVNLDPQGYLETYN
KKDVQLICCEADASVLWLVPDVVQTRFIRSLNWESNMAITFTLVLSRERPKGKEVVKYEN
TLGVEDLPKQSDVQKVLNGSINSFRIHNVYPRYLRVTGSGDVRPLEAGETFVTADLVINR
ASYQWWWSFSDINSSDVNGCGGLRGPMAIIMSEETPPQGILGDTLSKFSIWGLYITFVLA
VGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLLAICEDIYAARAEGELGIEEILYWTLVKIYRSP
HMLLEYTKPD
NT seq
7413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagatttctcggtgggtttttgttgcctctgctgctgcttgcagctgctttcatg
cactggagcttgatctctcttggtgatctcatatcttttcttcttattctatttcatgca
cccaaactaggatttcattttggaaggaggcttttattgttgtggttcgtcatcatattt
tctttatgtgctattttttctcaagttctatatctggttctatgggctatcgagtggagt
acagcagaagagtggtggggaaagctcattggactcttgatagctgagtcatggaaatca
ccatctgtggtatactttgtggtccttcaactctccatagttgctgtttcattagttgat
ttgtatgggaacagatttggtcctttttcatcatttgattcgtgttgggggcaattctta
tcaactgttgatcgtttagtctgttctcatataagggttgcttcttgcttgctgttgcct
gctattcaactggttgttggaatcagccatccctcatgggtttctctaccattttttatt
gggagctgtgttggtcttgtggattggtccttgacgagcaattttctaggacttttcagg
tggtggaggccttttcacttgtatgcaggcttcaacattgtcttgctttatctgtatcag
ctccctgtggagtttccagatatgttacaatgggtagctgatttcattggtctcttcaaa
ataacttcaggttcccaatggaccgaagtttgttcaagcttctctcttgtacttttttac
ataatgttatcctgtgttaaatgtgatctagaggagatggattttattttgtctatgaaa
gaaaataacttgacggagcatcttcttccttcaaagcattcattttttattcgtcaatct
agatctggcgtaaggcataccaatgtcatgttgacaggggcagttttccggaccttcagt
atcaactttttcacatatggttttccggtatccttggttgctctttccttctggagtttt
cattttgcaagtgtttgtgcttttgggctacttgcatatgttggctacatcatatatgca
ttcccttccttattccgtttgcatcgactgaatgggctgcttcttgtcttcattctcttg
tgggctgttagcacatatatcttcaatgttgctttcacattcttgaattggaaaattggg
aagaacatggacatatgggagatggttggcttgtggcattatcccatacctggattcttt
ttgcttgcacaattttgtcttggaatgttggttgctttgggtaatcttgtgaataactca
gttttcctttgcttgtctgatgaggatgggcgatcatcaactgacaatagtactattgaa
ggtgagggagagaccaaagtattgattgttgccacaatagcttggggactgcgcaaaagc
tctcgggctatcatgctggcactaatatttctcattgccatgaaacctggtttcatccat
gctgtgtatgtgatattctttttgatatatcttttgagccacaacgttaacagaaaatta
cgccagtctttgattctcctatgtgaggttcactttgcactattgtatatcattcggatc
aatccgatctccagtagtttggagcaagaaggctctttgagtgcagaagtcttattacag
ttaggtctccttgaaaaggaaagctcgtgggatttcttggaaatagctttgcttgcttgt
ttctgtgcaattcataaccatggttttgaaatgcttttttcgttctcagcaatcgtgcaa
catacacctagccttccatttggatttggcattttgaaagctggtctgaacaaatcagta
ttgttgtcagtgtatgcctcctcgtccactaattacagccatgacaatccttcttatgag
agaagaatagcattattcctcagtgcaatcgggcagaagttcctatctatgtaccgatca
tgtggaacctacattgcctttctgactattcttgttagtgtttacctgatgagaccaaat
tatatctcatttgggtacatatctcttctcctcgtttggataattggaagacaactcgtt
gagagaacgaaaaagcgcttgtggttcccattaaaagcatattcaattacagtattcata
tttatctatagcttgagcagcttccccagcattgaggtttggttgtccaggttgatagac
cttgatttctatctggggtatgactcaaaagcttcgtctttggaaaatgtttgggaatcc
ctagcagtcttgattgtgatgcaactttacagctacgagaggaggcagagcaggtacaac
aggtcagatgatcctgattggacagaatttggagtgcttgggtttgtaaagcggtttctc
atttggcacagcaacaagatcttgtttattgcattattctatgcatctttgtctccaatt
tgtgcgttcagctttttgtatctccttggccttgtcatctgttcaactttacctaaagct
tcacgaatcccgtctaaatcattcttggcttacacaggatttctagtaacagcagagtat
ctttttcagatgttgggtagccaggctgcaatgtttcctggacaaaagcactctaatatt
gctcttcttttgggtttccgtgaatttaaggctggcttctggggtctagaatctggattg
agaggaaaagtgctggtgattgctgcatgcactcttcagtataatgttttccactggttg
gagaagatgccaagtactattctaagcaatggaatgggagagccttgtccattgtttgtg
tcagcagaagatacaaatattagtgctcctatccctagtgaggataacaggccatcaact
ccactttctgtgaagcgagaagcggcgagaagccattcatggccatttttctcccctggt
ctgttgcaatcactcaatccctcaaccccaaaagcaggaagttctgagggtagtagcggt
agcaaatattcatttgggtatatttggggaagcaccaaggagagccataagtggaatacg
aaaaaaatccttgccttgcgaaaggagagatttgaaacacaaaagctcatctcaaaaatc
tatatgaaattctggatggagaatttgttcaatctctttggtcttgagataaacatgatt
gctctgcttcttgcaagctttgctttgttgaatgccatatctatgctatacattgcattg
cttgctgcttgtattattttgaatcggcagattatacgcaagttatggccaatattcgtc
ttcctgtttgcttccattctcgttcttgagtattttgccatctggaagagtgcttggcct
ccaaatcatcctgatgcaactaatccacattgccatgattgctggcaaaagtcaaccatg
tatttcagttactgcaagtactgctggttaggacttaatgttgatgatcctcgaatgctt
atcagctattttattgtcttcatgcttgcttgtttcaaacttcgtgctgatcatttgtcc
agcttctcgggcttatcaacgtaccgtgagatgatatctcaacgtgaaaatacatttgta
tggagagacctctcttttgaaactaaaagcatgtggactttccttgattatgtgaggctt
tactgctattgccatctactggatcttgtgcttgccttggttttgattactggaaccatt
gagtatgacatcctgcaccttggttatctcgcttttgcactggttttctttcgggttaga
cttcaaatactaaagaaaaggaacaagatgttcaagttcttgcgcatatacaattttgct
ctcattgttctatctcttgcatatcaatctccttttgtgggttgttctgggaagtgtgag
accgtatatgagatgattggcttttataaatatgactatgggtttcagatgactgcaaga
tcagctctcgttgaaattatcatatttatgctggtatcacttcagtcatatatgttttcc
tctaaagagtttgattatgtgtctcgatatcttgaagctgaacaaattggtatgattgtg
cgcgaacaagaaaaaaaggctgcatggaaaactgcacaattacaacatgttcgtgaatct
gaggagaagaaacgccagcgtaacctgcaagtggagaagatgaagtcagagatgctcaac
ctacaaatccagcttcacagcacgaactcagttactgactgcggtgactcttctcctgtc
agtgaaggcctaagaaggaggagaagtacttctcttaacttgaacaatgatgcttggacc
cctgataaagaaggttttcccatgaaaaaggagcagataattagagagacttctagcaat
gaattgcatgaatctcctgcaacagggaatctggaaaaccccacagttgtggattctatg
aaaaattcaatgcaatctattcattgtgagatcaccgaaattgaagaggacgttgctgat
ggtacattttctgattcagagaagaaagagaagggtaaagggaaatcaacggataaccct
ctaatatcagcagttcatctgataggtgatggtgtttcccaggtacagtctattggaaat
caagcagttaacaaccttgtcagcttcttgaatattgaccaagaatccgatatccatgag
cactctgctgaggatggggtatatgatgagatggagagccagaaaataaagtacgccagt
tttcatcgttcatcttccctgcagtctgatgtgagttctgatgccacaagtctgcagtta
ggaaggatcttccgtcacatatggtcccgaatgcggtccaataatgatgttgtctgttat
tgttgctttgtcatcgtctttttgtggaacttcagtttgctttccatggtgtatctggca
gctttattcttgtatgcactgtgtgttaattctggtccaagttacatattctgggttatc
atgctcatatacacagaagtttatattttgcttctgtatctataccagattatcatccag
cactatggtacgcgtattgcttcagacctacttcgtgagttgggatttcctgcgcgtaaa
atgtcttcatttgttatcagttcgttgcccctatttctcgtgtacttattcacccttgtc
cagagctctataaccgcaaaggatggcgagtggatgtcttcaacagacttcaacttctat
aggaggaacgctttgcagggaaaagaggttcctgtcagttatagctggagtgagagggca
aaggacccgctgcacataattgtaaatgtcatacagttgatatgtagaagcttctttagg
tactgggtatcactgacacagggagcagagtcccctccttactttgttcaggtttctatg
gatgtgtgctcctggccagaggatgggatacagccagaaaggattgagtctggagtaaat
caattgcttagaatcatccatgatgaaagatgcaaggcaaaggatcctaagcgatgccct
tttgctagcagggtgcatgtacaaagcattgaaaggagtcgagaaaatgcaaatgtggcc
ttggtcgtttttgaggtagtatatgcctcccccataacagactgtggttcagtagaatgg
tacaagtcactaactccagcagctgatgtggcaaaggagattcttaaagcactgcatgct
ggctttgttgaagaaataggattcccatatcctatactctctgttatcgggggaggcaaa
agggacattgatctgtttgcctatgtatttggtgctgatctaagtgttttctttttagtg
gccatattctaccagtccattataaaaaataaaagtgactttcttgacgtgtatcagctt
gaagatcaatttcctaaagagttcgtcttcatcttaatgattatttttttcttgattgtc
cttgatcgaataatctacctctgttcatttgccactggaaaagtgatttactaccttttt
aacctcatcctattcacatattcagttacaaagtatgcttggcatatggaatcttcccgc
caacatgctggaggattagcactccgtgctatatttcttgcaaaatcaatatctctggca
ctgcaagctatacaacttagacatggaattcctcataaaagcactttgtaccgtcaattt
ttgaccagtgaaatttcacgaattaattacttaggatatcgactatatcgtgctctgcca
ttcctttatgaattgagatgtgtacttgactggtcatgtacaaccacatctttgaccatg
tatgattggctgaaactggaggacatacatgcaagcttgtacctcgtcaaatgtgatgca
gtcttgaatagagcaacgcacaaacaaggagaaaagcaaacacaaatgaccaaatgttgc
aatgggatttgtctgtttttcatattgatttgtgttatttgggctccaatgctgatgtat
agcagtggtaacccaacaaacattgcaaatcccattaaagatgccagtgttcaagttgat
atcaagacaatgagtggaaggttgaccctgtatcagagcaccctctgtgaaaagattgat
tgggataacgtcaacactgatgttaatcttgaccctcaaggttatttggagacatataac
aagaaagatgtccagttgatatgctgtgaagctgatgcaagtgttctgtggcttgttcct
gatgtcgttcagaccagattcatacggtccctcaattgggagagcaacatggctataact
tttactttggtactttccagggagagacccaaaggcaaggaagttgtgaaatatgaaaat
actcttggtgttgaggatcttccaaaacaatcagatgtacaaaaagtccttaatggctct
atcaacagctttaggatacacaatgtctatccaagatacttgcgtgtcacaggttctggt
gatgtcaggccactggaagcaggggaaacttttgtcactgcggacctcgttataaatcgc
gctagttaccagtggtggtggtccttcagtgacatcaattcatcagatgtcaacggatgt
ggcggtttgagaggtcccatggccattattatgtctgaagaaacgccgccacagggtatt
cttggtgacacactaagcaagttcagcatctggggtctctacataacatttgttcttgct
gttggccgctttatcagacttcagtgctctgacctaagaatgagaatcccctatgaaaat
cttccctcctgtgataggttgttggccatttgtgaggatatatatgctgcaagagcagag
ggtgagcttggtattgaagagatcctttactggacactggtgaagatttacagatcacca
cacatgctgctagagtacacaaaacctgactag
DBGET
integrated database retrieval system
