Rosa chinensis (China rose): 112176349
Help
Entry
112176349 CDS
T06020
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
rcn01003
]
112176349
Glycosyltransferases [BR:
rcn01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
112176349
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
Glyco_trans_2_3
zf-UDP
IBR
Glyco_tranf_2_3
zf-C3HC4_3
zf-C3HC4
Baculo_IE-1
zf-C3HC4_2
zf-RING_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112176349
NCBI-ProteinID:
XP_024169991
LinkDB
All DBs
Position
7:29223276..29228481
Genome browser
AA seq
1122 aa
AA seq
DB search
MMASNYPNGSSRFNHLKQTSNDLDSDDIGSVEFATYTVQIPATPDNQSAGIPLQRSTSQR
VEDQYASSSLFTGGYNCVTRAQLKDKVIESETNHPQMTWAKGSYCTVPGCDAQVVTDERG
LDIVPCECGYKICMDCYRDAMRNGESVCPGCREPYKEMDMNEYGVTSRQPLLSTDGMSKT
DRRMSLMKSKSMKSKALVESQAIEMDQNQWLFETKGSYGYGNAMWPKEDVSGSLDGMSGD
LKMFKDKQWKPLTREVKISAAILSPYRLLVLARLAVLGLFLYWRVTNPNDDAVWLWLMSV
ICEFWFAFSWILDQLPKLCPINRIAYVDVLKEKFETPNPSNPTGKSDLPGIDIFVSTADP
EKEPPLVTANTILSILATDYPVEKLACYVSDDGGALLTFEAMAEAASFANLWVPFCRKHD
IEPRNPESYFSMKRDPYKNKVKSDFVRDRRQVKREYDEFKVRINGLPDSIRRRSDAFNAR
EEIKAMKLRRETRDDEPLENLKFPKATWMTDGTQWPGTWVVSAPEHSKGDHASIIQVMLK
PPSDEPLKGTEVDSNSMNLSEVDIRLPMLVYVSREKRPGYDHNKKAGAMNALVRASAVMS
NGAFILNLDCDHYIYYSQAMREGMCFMMDRGGERLCYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVF
FDVNMRALDGIQGPVYVGTGCLFRRTALYGFDPPPMKERDGCCSGFFAKRKKTSSVASAP
EVDSQDGSVELDNDNEEMGLALIPKTFGNSSLFVDSIRVAEFQGRPLADHPSMKNGRPIG
ALTLPRELLDASTVAEAISCISCWYEDKTEWGQRVGWIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSI
YCVTKKDAFRGSAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNALLASSRMKFLQRIAYLNVG
MYPFTSIFLIVYCFLPALSLFTDQFIVQQLNVTFLVYLLGITITLILLAVLEIKWSGIEL
EEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVIAGIEISFTLTSKSGGDDADDDFVDLYIFKW
TSLMVPPITIIMVNLIGIGVAVCRTIYSDNPKWSSLLGGSFFSFWVLAHLYPFAKGLMGR
RGRTPTIVFVWSGLLAITISLLWVAIDPPSGSSGIGGSFQFP
NT seq
3369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggcctctaattacccaaatggatcctccaggtttaaccatcttaagcaaactagc
aatgaccttgacagtgatgatattgggagtgttgagtttgcaacctacactgtccagata
ccggccacaccggacaaccagtccgccggaattcccttgcagcggtccacttctcagaga
gttgaggaccagtatgcatccagttctttgtttacaggtggctacaactgcgttacacga
gcccagttgaaggacaaagtgattgaatccgaaacaaaccatccccagatgacatgggcc
aaggggtcttattgtaccgtgcctggatgtgatgctcaggtggtgactgatgagagggga
ttggatatagtcccttgtgaatgcggttacaagatttgtatggattgttatagggatgct
atgagaaatggtgagagtgtttgtccgggctgcagagaaccttacaaggagatggatatg
aatgagtatggtgtgactagtcggcagcctttgctgtcaacggatgggatgtcaaagacg
gacaggaggatgtcgcttatgaaatcaaaatcgatgaagtcaaaagcgttggtggagagt
caggctattgaaatggatcagaatcagtggttgtttgagacaaaagggagttatggatat
gggaatgctatgtggccaaaggaagatgtgagtgggagtcttgatgggatgagtggtgat
cttaaaatgttcaaagataagcaatggaagccactaacgcgtgaagtgaaaatctcagct
gcaattctcagtccatatcggcttctagtactagctcgactggcggtccttggattattt
ttgtattggagagtcacaaaccctaatgatgatgcagtgtggttgtggcttatgtctgtg
atttgtgaattctggtttgccttctcttggatacttgatcagcttccaaagctgtgcccc
ataaatcgcattgcttatgttgatgttttaaaggagaagtttgaaactccaaatccaagc
aatcctactggaaaatctgatcttccaggaatagacatttttgtatctacagcagatcca
gagaaagaacctcctcttgtaactgcaaacacgattctctcgatacttgcaactgactac
cctgttgagaagcttgcctgttatgtttctgatgatggaggtgcacttttgacctttgag
gccatggcagaagctgctagttttgccaacttgtgggtaccattttgtcggaagcatgat
attgagccaaggaacccagaatcttacttcagcatgaagagagatccttacaagaataaa
gtaaagtccgattttgtaagggatcgcaggcaggtaaagcgagagtatgatgaatttaag
gttaggattaatggccttcctgattcaatccggagacgttccgatgcctttaatgctaga
gaggagatcaaagctatgaaacttcggagagagactagagatgatgaaccactggaaaat
ttaaagttcccaaaagcaacttggatgactgatggaacacaatggcctggtacttgggta
gtttctgcccctgagcattccaagggtgatcatgccagtatcatacaggtaatgttaaaa
ccccctagcgatgagccacttaaaggaacagaagtagattcaaattccatgaatctaagt
gaggttgatatccgtcttcccatgcttgtttatgtttctcgtgaaaagaggcctggttac
gatcataacaagaaagccggagctatgaatgccttggttcgagcctcagccgtcatgtcc
aacggcgccttcattctcaatcttgactgtgaccactacatctactactcccaagcaatg
agagaaggcatgtgcttcatgatggaccgcggtggtgaacgcctttgttatgtccaattt
cctcagaggtttgaaggaatagacccttctgatcgctatgccaaccacaacactgttttc
tttgacgtcaacatgcgtgctcttgatggaattcagggtccagtatatgtgggaacagga
tgtctctttcgtcggactgccttatatggctttgatccacctccaatgaaagaacgtgat
ggttgctgtagtggtttctttgccaagcgcaagaaaacttcttcagttgcttctgctcct
gaagttgactcccaagacggatcagttgaactagacaatgacaatgaagaaatgggtctt
gctcttattcctaaaacatttgggaactcaagcctctttgttgactccatccgagttgca
gagttccaaggtcggccccttgctgatcatccatccatgaaaaatggacgccccattggt
gcccttactcttccccgggaacttcttgatgcatcaacagttgcagaggcaattagttgc
atctcatgctggtatgaggacaagactgaatggggccaacgagttgggtggatttatggt
tcagtgactgaagatgtggtcacaggttacaggatgcacaaccgtggatggaaatctatc
tactgtgtcactaagaaggatgcctttcgaggaagtgccccaatcaatctcactgaccgg
cttcaccaggttttgcggtgggctactggctctgttgaaatattcttttctcgtaacaat
gctcttctggccagctccaggatgaaatttctccaaaggattgcctacttgaatgtcgga
atgtaccctttcacatccattttcctcattgtttactgcttccttcctgcactctcactc
tttactgatcagttcattgttcagcaactaaatgtaaccttcctggtatatctcttgggc
attacaattaccctcattcttcttgccgtgcttgagatcaagtggtccggaattgaactt
gaggagtggtggaggaatgagcagttttggttgattggaggcacaagtgcccaccttgct
gctgtgctccaaggtcttctaaaggttatagcaggaattgagatctcattcactttgaca
tcgaaatcgggaggcgatgatgcggatgatgattttgttgatctttatatcttcaagtgg
acatctctgatggtaccacctattactatcataatggttaacttgattggaataggtgtt
gctgtttgtcgaacaatatacagtgataacccaaagtggagcagcttgcttggaggttct
tttttcagcttctgggtgttggctcatctataccccttcgccaaaggacttatgggaaga
cgagggaggacccccacgattgtatttgtctggtctgggcttctagcaatcaccatatct
ctcctttgggtggctattgatcccccatcaggcagtagtggaattggaggttcattccag
tttccttga
DBGET
integrated database retrieval system
