Rosa chinensis (China rose): 112180870
Help
Entry
112180870 CDS
T06020
Name
(RefSeq) probable phosphoribosylformylglycinamidine synthase, chloroplastic/mitochondrial
KO
K01952
phosphoribosylformylglycinamidine synthase [EC:
6.3.5.3
]
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
Pathway
rcn00230
Purine metabolism
rcn01100
Metabolic pathways
rcn01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Module
rcn_M00048
De novo purine biosynthesis, PRPP + glutamine => IMP
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcn00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00230 Purine metabolism
112180870
Enzymes [BR:
rcn01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.3 phosphoribosylformylglycinamidine synthase
112180870
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GATase_5
FGAR-AT_PurM_N-like
AIRS_C
FGAR-AT_N
FGAR-AT_linker
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112180870
NCBI-ProteinID:
XP_024175205
LinkDB
All DBs
Position
7:21711688..21717160
Genome browser
AA seq
1412 aa
AA seq
DB search
MAGVREITAGEFIKGGHKQGLFSHRGALKGRSPMLWGTLHSSVRGSANRRNASLRCRAQE
KPTAVVSAVSSSVEALPTVVEKPSSSVIHFYRVPLIQESAASELLKTVQSKISSQIVGLK
TEQCFNIGLISQLSSDKLLVLNWLLQETYEPENLGVDSFLEKKRQEGLNTVIVEVGPRLS
FTTAWSSNAVSICRACGLTEVTRLERSRRYLLFSKGNLQDQQINEFAAMVHDRMTECVYT
QQLTSFETSLVPDKVRHIPVMERGRKALEEINQEMGLAFDEQDLQYYTRLFKEEIKRNPT
TVELFDIAQSNSEHSRHWFFTGKIFIDGQPMDKTLMQIVKSTLQANPNNSVIGFKDNSSA
IRGFLVKQLRPVQPGSTSPLHMSARDLDILFTAETHNFPCAVAPYPGAETGAGGRIRDTH
ATGRGSFVVASTAGYCVGNLNMEGSYAPWEDPSFLYPSNLASPLQILIDASNGASDYGNK
FGEPLIQGYTRTFGMRLPSGERREWLKPIMFSAGIGQIDHTHITKGEPDIGMLVVKIGGP
AYRIGMGGGAASSMVSGQNDAELDFNAVQRGDAEMAQKLYRVVRACIEMGESNPIISIHD
QGAGGNCNVVKEIIYPKGGEIDIRAIVVGDYTMSVLEIWGAEYQEQDAILVKPESRELLQ
SICERERCSMAVIGTINGEGRIVLIDSLAIEKSKSSGLPPPDPAVDLELEKVLGDMPQKS
FKFERMADAREPLDIAPGITVMDALKRVLRLPSICSKRFLTSKVDRCVTGLVAQQQTVGP
LQIPLSDVGVIAQTFTGLTGGACAIGEQPIKGLLDPKAMARLAVGEALTNLVWAKVTSLS
DVKASGNWMYAAKLDGEGAAMYDAANALSEAMIKLGIAIDGGKDSLSMAAHAAGEVVKAP
GNLVISVYCTCPDITKTVTPDLKLGDDGVLLHIDLAAGKRRLGGSALAQVFDQIGNDCPD
LEDVPYLKRVFEGVQGLLDDELISAGHDISDGGLLVCALEMAFAGNRGINLDLTTHRKSL
FQTIFSEELGLVIEVSKKNLDMVIGKLSSGGISAEIIGQVTATPSIVLKVDGVTHLNEST
SFVRDMWEDTSFQLEKFQRLASCVDLEKEGLKDRHEPSWQLSFTPSFTDEKYMTTTSKPK
VAVIREEGSNGDREMAAAFYAAGFEPWDITMSDLLNGAVSLQEFRGIVFVGGFSYADVLD
SAKGWSASIRFNQPLLNQFQEFYKRHDTFSLGVCNGCQLMALLGWVPGPQVGGVHGGGGD
PSQPRFIHNESGRFECRFTSVKIEDSPSIMLKGMEGSTLGVWAAHGEGRAYFPDDGVFDR
VLHSKLAPVRYCDDDGIGTELYPFNLNGSPLGVAAICSPDGRHLAMMPHPERCFLMWQYP
WYPKQWDVEKKGPSPWLRMFQNAREWCSRNDA
NT seq
4239 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggtgttcgggagatcactgctggtgaattcataaaaggtggccataaacagggc
ctgttttctcacagaggtgctttgaaaggaagaagccctatgctttggggcacgctgcac
agttcagtgcggggttctgccaataggagaaatgcttcattgagatgtcgtgctcaagag
aagcccacagctgttgtttcggctgtcagcagttcggtggaggcgctaccgactgtggtt
gagaagccttcttcctcagttatccatttttatcgtgtccctctcattcaggagagtgca
gcgtctgagcttctcaaaacagtgcagtcaaagatttcgagccagatagttggtttgaaa
actgagcagtgtttcaacattgggctcatttcacagctttctagtgacaagcttttagtg
cttaactggcttcttcaggagacttatgagccagagaatttgggggtcgacagctttctt
gaaaagaagaggcaggaagggctgaacacagttattgttgaggttggtcctcggttgtcg
tttacaacagcgtggtcttccaatgctgtctcgatatgtagagcttgtggcttgacagag
gtgactcgtttggaacggtcgaggaggtacttgttgtttagtaagggaaacttgcaggat
caacagattaatgagtttgctgcaatggttcatgatcggatgacggagtgtgtttacacc
cagcagctcacttcttttgaaacaagtttggttcccgacaaagtacgccatattcctgtc
atggagagaggtcggaaggcgttagaggagattaatcaggaaatgggtttggcatttgat
gagcaagatctccaatactacaccaggctattcaaggaagagatcaagcggaatccaaca
acagttgaactctttgatattgcacagtccaacagtgagcatagcaggcactggtttttt
actggtaaaatttttatagatggacagcccatggacaaaactctaatgcaaattgtgaag
agcactttgcaagcaaacccaaacaattctgtcattgggtttaaggacaactcgagtgca
atcagaggatttcttgtgaagcaattgcgaccggttcagccaggttcaacatctccattg
cacatgtctgcacgtgaccttgatatactatttactgcagagacccataattttccatgt
gctgtagcaccttaccctggtgcagagacaggtgcaggaggtagaatcagagacacccat
gcaactggaaggggctcttttgtggtagcatctactgctggttattgtgtcggaaatctc
aatatggaaggatcttatgctccttgggaagatccgtctttcctgtatccatcaaatttg
gcctcacctttgcagatcctcatagatgctagtaatggtgcatcagactacggcaacaaa
tttggtgagcccttgattcagggttacactagaacctttggaatgagactcccaagtggt
gagaggcgggaatggttgaagccaatcatgttcagtgcaggaattggacagattgatcac
acccatataacaaagggagagcctgatattggcatgctagttgtaaagattggaggccct
gcttatcgtattggtatgggtggtggggctgcatcgagcatggttagtggccaaaatgat
gcggagcttgatttcaatgctgtacagcgtggggatgcagagatggcacaaaaattgtat
cgtgttgttcgtgcctgcattgagatgggggagagtaacccaatcattagcattcatgac
caaggagctggtggaaactgcaacgtggttaaggaaattatttatccgaagggtggtgag
attgatatccgggcaattgtggttggtgattacacaatgtctgtcttggagatatggggc
gcagaatatcaggaacaagatgccatcttggttaaacctgaaagtcgcgaacttttgcaa
tcaatatgtgaaagagaaaggtgttctatggctgttattggaacaataaatggtgaggga
cgtattgttttaattgatagcttagctattgaaaaatctaaatcaagtggcctccctcca
cctgatcctgctgtcgatttggagcttgagaaagtacttggtgatatgccacaaaaaagc
tttaaattcgagcggatggcagatgcacgagagccacttgatattgcccctggaatcaca
gtaatggatgctcttaagagagttttaagacttccatccatctgttcaaagcgcttcttg
acctcgaaagtagacaggtgtgttacaggtctggtagctcagcagcaaactgtcgggccc
ctgcaaattcctctctctgatgttggagtaattgctcagacttttaccggcttgactgga
ggtgcatgtgccattggggagcagccaatcaaaggtttgttggatccaaaagcaatggct
agattggcagttggagaagcactcacaaatcttgtttgggctaaggtcacttctctatct
gatgttaaagcaagtgggaattggatgtatgcagccaagcttgatggtgaaggagcagcc
atgtatgatgctgctaatgctctttcagaggcgatgatcaaacttggtattgctattgat
gggggaaaggacagtctttccatggcagcccatgctgcaggagaagttgttaaggctcct
ggaaatcttgtaatcagtgtttattgtacttgtcctgacataacaaaaacagtaacccca
gatttgaagcttggagatgatggtgttctgcttcacattgatttagccgcaggaaagcgg
cgattaggtggctctgctcttgctcaggtttttgaccagattgggaacgattgtcctgac
cttgaggatgttccgtatctgaagcgagtgtttgagggagttcaaggccttcttgatgat
gaactgatctctgctggccatgatatcagtgatggtgggcttctggtctgtgcccttgag
atggcatttgctggcaatcgtggcattaatttggacttgactacgcaccggaaaagcctc
ttccaaacaattttttctgaagagcttggtctggttattgaggtcagcaagaaaaactta
gatatggtaataggaaagctaagcagtggaggtatttctgcagagattattggacaggta
actgccacaccttcaatagtgttaaaggtggatggggtaactcatttgaacgaaagtact
tcttttgtaagggacatgtgggaggatactagttttcagctggaaaaatttcagagattg
gcttcttgtgttgatctagagaaagaagggttgaaagataggcatgagccttcatggcag
ttgtcttttactccatccttcacagatgaaaagtatatgaccacgacctccaaaccgaag
gtggctgttattcgagaagaaggaagcaatggggatagagaaatggctgcggcattttat
gctgctggctttgagccatgggatattacaatgtcagaccttcttaatggagctgtatca
ctgcaagagttccgtggaattgtgtttgttggaggttttagctatgctgatgtccttgat
tctgcaaaaggttggtctgcttcaattagatttaatcagccccttctaaatcaatttcag
gagttttacaagaggcacgacactttcagtcttggcgtttgcaatgggtgtcagcttatg
gctcttttgggctgggtcccaggtcctcaagttgggggtgtgcatggtggtggtggggat
ccatcacagccgaggttcattcacaatgagtcaggccggtttgagtgtcgctttactagt
gtaaaaattgaggactcaccttctataatgttaaaaggaatggaaggcagtactttgggc
gtgtgggctgcccatggtgagggaagagcctattttcctgatgatggtgtttttgatcgt
gtgctccactccaagttggctccagtaagatattgtgatgatgatgggattggaacggaa
ctttatcccttcaacctgaatggctctcccttgggagttgcggcaatttgttcaccagat
gggaggcatcttgccatgatgcctcatccagagcgctgcttcttaatgtggcagtaccca
tggtatcccaagcagtgggatgttgaaaagaaaggccctagtccatggctacggatgttc
cagaatgccagagagtggtgctccagaaatgatgcctga
DBGET
integrated database retrieval system